Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 66,539 (bp)   Positions: 303
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.002
.001
.002
.002
.114
.004
.0
.001
.0
.0
.003
.002
.023
.013
.012
.0
.001
.0
.001
.0
.0
.013
.0
.966
.332
--
--
--
.019
.066
.013
.018
.487
.001
.001
.04
.001
.009
.042
.041
.008
.002
.01
.001
.001
.0
.0
.001
.15
.097
.093
.06
.023
.007
.002
.006
.012
.627
.008
.005
.004
.001
.002
.05
.052
.016
.005
.092
.145
.183
.46
.171
.123
.336
.003
.004
.01
.018
.004
.003
.039
.01
.01
.009
.0
.001
.012
.006
.001
.017
.025
.085
.06
.104
.27
.265
.025
.027
.089
.106
.02
.072
.044
.044
.135
.056
.044
.002
.471
.004
.974
.96
.991
.94
.809
.284
.011
.152
.999
.999
.996
.99
.17
.038
.083
.0
.005
.009
.003
--
.0
.002
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.004
.009
.229
.006
.013
.028
.004
.033
.022
.002
.006
--
.032
.007
.052
.009
.02
.04
.045
.075
.025
.02
.022
.019
.024
.008
.01
.012
.002
.007
.004
.006
.046
.134
.073
.023
.022
.004
.002
.049
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.121
.002
.001
.379
.022
.001
.0
.002
.004
.64
.26
.096
.083
.17
.236
.264
.0
.002
.01
.002
.003
.004
.003
.061
.054
.026
.013
.001
.508
.105
.016
.002
.031
.206
.012
.569
.008
.008
.013
.001
.035
.006
.008
.031
.0
.084
.0
.039
.0
.008
.0
.082
.269
.29
.712
.013
.002
.004
.001
.001
.023
.001
.002
.001
.005
.013
.001
.051
.001
.001
.006
.005
.018
.166
.14
.188
.357
.008
.001
.042
.147
.0
.0
.059
.125
.738
.01
.069
.28
.242
.019
.206
.085
.007
.0
.123
.001
.018
.004
.997
.074
.155
.014
.055
.0
.0
.001
.002
.006
.0
1.0
.003
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
Jph2
A
C
C
T
G
C
C
A
G
G
C
A
A
C
G
T
C
T
A
C
C
G
G
G
C
G
C
A
T
T
6
A
G
G
G
G
4
T
A
-
C
G
T
G
C
T
T
C
-
T
A
G
-
A
A
A
A
2
43
G
2
A
2
2
2
A
G
A
A
C
A
-
2
G
-
2
G
2
-
3
G
T
T
3
A
C
G
A
2
G
2
-
C
T
T
2
-
T
-
-
-
-
C
T
A
-
-
-
G
2
T
-
C
G
-
C
-
-
3
C
-
T
-
A
-
C
G
T
G
-
A
G
A
C
T
G
G
G
T
C
G
A
G
A
T
A
-
T
4
T
C
T
A
T
G
A
-
-
-
3
C
A
4
C
A
C
A
G
4
C
C
A
T
2
C
G
C
15
C
G
A
C
A
A
A
C
T
G
G
C
-
C
A
-
A
C
T
G
G
C
G
G
A
-
A
T
A
A
A
G
C
C
G
C
-
A
-
A
T
G
A
T
T
G
A
117
T
-
-
2
-
-
T
A
C
T
C
T
C
A
A
4
T
T
10
-
A
-
G
C
T
T
-
A
G
A
T
A
C
G
T
A
C
C
4
C
T
-
G
A
C
C
C
C
30
C
G
C
C
-
A
T
G
-
T
18
-
G
T
A
A
A
G
A
A
C
C
C
T
A
C
T
A
  159,710,118
  159,710,180
  159,710,460
  159,710,481
  159,710,514
  159,710,529
  159,710,591
  159,710,754
  159,710,836
  159,710,891
  159,710,929
  159,711,181
  159,711,360
  159,711,449
  159,711,677
  159,711,686
  159,711,687
  159,711,868
  159,711,893
  159,712,512
  159,712,540
  159,712,798
  159,712,840
  159,713,232
  159,715,824
  159,716,811
  159,716,896
  159,716,927
  159,717,375
  159,717,754
  159,717,973
  159,718,374
  159,718,497
  159,718,641
  159,718,643
  159,718,992
  159,719,513
  159,719,580
  159,719,587
  159,720,555
  159,720,584
  159,721,061
  159,721,087
  159,721,487
  159,721,752
  159,722,871
  159,724,675
  159,724,733
  159,725,290
  159,725,293
  159,725,294
  159,726,794
  159,728,120
  159,728,127
  159,728,138
  159,728,143
  159,728,148
  159,728,159
  159,729,946
  159,731,513
  159,731,520
  159,731,526
  159,731,539
  159,731,554
  159,731,558
  159,731,563
  159,731,565
  159,731,573
  159,731,579
  159,731,581
  159,731,588
  159,731,606
  159,731,613
  159,731,623
  159,731,644
  159,731,655
  159,731,658
  159,731,670
  159,731,679
  159,731,682
  159,731,694
  159,731,704
  159,731,705
  159,731,708
  159,731,733
  159,731,736
  159,731,742
  159,731,745
  159,731,749
  159,731,758
  159,731,767
  159,731,784
  159,731,788
  159,731,793
  159,731,808
  159,731,810
  159,732,119
  159,732,127
  159,732,149
  159,732,157
  159,732,185
  159,732,205
  159,732,211
  159,732,212
  159,732,230
  159,732,290
  159,732,291
  159,732,300
  159,732,371
  159,732,433
  159,732,517
  159,732,531
  159,732,561
  159,732,584
  159,732,603
  159,732,628
  159,732,717
  159,732,824
  159,734,001
  159,734,025
  159,734,031
  159,734,043
  159,734,185
  159,734,210
  159,734,218
  159,734,363
  159,734,372
  159,734,483
  159,734,649
  159,735,633
  159,736,285
  159,736,625
  159,738,645
  159,739,457
  159,739,853
  159,740,051
  159,740,055
  159,740,786
  159,740,980
  159,742,116
  159,742,206
  159,742,514
  159,742,535
  159,742,549
  159,742,600
  159,742,616
  159,742,638
  159,742,662
  159,742,764
  159,742,768
  159,742,814
  159,742,846
  159,742,855
  159,742,883
  159,742,916
  159,742,922
  159,742,934
  159,742,936
  159,742,991
  159,743,008
  159,743,011
  159,743,023
  159,743,039
  159,743,043
  159,743,054
  159,743,056
  159,743,059
  159,743,069
  159,743,076
  159,743,082
  159,743,084
  159,743,089
  159,743,116
  159,743,127
  159,743,133
  159,743,137
  159,743,143
  159,743,145
  159,743,228
  159,743,516
  159,743,607
  159,743,676
  159,743,773
  159,744,068
  159,744,315
  159,744,526
  159,744,631
  159,744,668
  159,744,867
  159,744,956
  159,745,210
  159,745,648
  159,746,014
  159,746,109
  159,746,395
  159,746,883
  159,747,045
  159,747,056
  159,747,217
  159,747,342
  159,747,966
  159,747,986
  159,748,006
  159,748,017
  159,748,040
  159,748,063
  159,748,332
  159,748,791
  159,748,818
  159,748,821
  159,748,947
  159,749,044
  159,749,140
  159,749,239
  159,749,346
  159,749,474
  159,749,650
  159,749,671
  159,749,783
  159,749,971
  159,750,032
  159,750,272
  159,750,376
  159,750,561
  159,750,656
  159,750,940
  159,751,134
  159,751,322
  159,751,326
  159,751,508
  159,751,528
  159,751,943
  159,752,033
  159,752,043
  159,752,239
  159,752,273
  159,752,913
  159,753,133
  159,753,230
  159,753,435
  159,753,723
  159,753,742
  159,756,147
  159,756,148
  159,756,310
  159,756,502
  159,757,092
  159,757,631
  159,758,409
  159,759,973
  159,760,044
  159,761,036
  159,761,257
  159,761,259
  159,761,283
  159,761,431
  159,761,981
  159,762,231
  159,762,417
  159,762,442
  159,762,642
  159,762,650
  159,762,768
  159,763,026
  159,763,035
  159,763,062
  159,763,080
  159,763,581
  159,763,599
  159,764,621
  159,765,113
  159,765,343
  159,765,560
  159,766,000
  159,766,018
  159,766,204
  159,766,280
  159,766,798
  159,766,990
  159,767,231
  159,767,485
  159,767,517
  159,768,067
  159,768,589
  159,769,032
  159,770,365
  159,771,160
  159,771,452
  159,771,745
  159,772,286
  159,772,712
  159,772,714
  159,772,857
  159,773,692
  159,773,895
  159,774,189
  159,774,260
  159,775,014
  159,775,069
  159,775,178
  159,775,499
  159,775,973
  159,776,311
G
T
A
C
A
G
A
G
C
A
T
G
G
A
A
A
T
C
G
T
G
A
T
A
A
A
T
C
C
G
-
G
A
A
A
A
4/-
C
G
A
T
A
G
A
G
G
C
T
A
C
T
T
G
C
A/C
A/C
A/C
2/-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
-
2
-
T
T
-
-
-
G
-
-
-
G
-
-
G
T
-
-
-
-
T
A
-
-
-
G
G
G
A
T
A
-
A
-
T
A
G
-
-
-
T
-
-
G
T
G
T
-
-
G
-
C
-
C
-
-
-
A
2
G
A
G
T
C
A
T
A
C
A
A
-
-
-
C
-
C
-
-
C
-
-
-
C
A
-
2
2
T
-
G
-
-
T
-
-
-
-
-
A
A
-
-
-
-
-
G
-
T
A
C
T
T
T
-
G
C
A
T
G
T
T
G
2
G
T
C
A
A
G
A
A
G
2
G
C
G
G
G
A
T
T
T
A
A
C
2
T
A
A
C
C
C
C
G
117/-
A
52
2
-
2
C
A
G
T
C
T
C
T
T
T
-
C
A
-
C
G
G
C
T
C
C
5
-
A
G
C
G
T
A
A
G
G
T
-
T
C
20
A
C
T
T
T
G
-
G
A
A
T
90
T
C
C
16
C
-
A
C
G
T
-
T
A
-
G
T
A
T
A
G
T
G
G