Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 376,637 (bp)   Positions: 288
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.001
.0
.0
.004
.003
.002
.0
.002
.033
.0
.006
.0
.0
.012
.105
.099
.069
.002
.002
.002
.113
.003
.009
.001
.018
.013
.062
.005
.073
.074
.03
.008
1.0
.038
.001
.069
.071
.329
.056
.286
.927
.971
.95
.995
.999
.083
.163
.612
.996
.858
.971
.999
.998
.998
.991
.865
.768
.882
.283
.12
.13
.088
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.029
.001
.006
.013
.006
.006
.02
.111
.16
.181
.181
.162
.122
.002
.002
.006
.002
.001
.001
.001
.155
.007
.003
.824
.002
.021
.023
.065
.008
.513
.39
.152
.003
.001
.037
.0
.0
--
--
--
.041
.001
.008
.001
.0
.0
.0
.0
.027
.02
.007
.255
.396
.282
.16
.085
.029
.004
.025
.092
.059
.044
--
--
--
.001
.001
.0
.001
.001
.0
.002
.077
.001
.003
.0
.004
.025
.005
.002
.013
.011
.003
.004
.003
.134
.826
.0
.0
.0
.001
.225
.013
.988
.009
.203
.987
.997
1.0
1.0
1.0
.191
.144
.147
.017
.821
.989
.971
.903
.941
.993
.707
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.076
.169
.13
.009
.001
.002
.011
.002
.001
.002
.293
.004
.003
.003
.005
.003
.002
--
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.061
.066
.003
.008
.048
.214
.231
.372
.354
.282
.712
.684
.569
.489
--
.006
.008
.0
.035
.004
.007
.002
.001
.004
.013
.005
.147
.0
.002
.001
.017
.001
.001
.001
.0
.008
.092
.05
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
Itpr2
C
C
A
C
C
C
C
C
A
T
G
A
G
G
C
-
A
C
T
T
G
C
T
T
T
2
C
T
T
A
G
T
C
A
A
2
T
-
-
G
A
C
A
A
A
2
C
C
T
G
-
A
G
2
A
-
-
-
A
-
-
G
C
G
-
C
-
G
C
A
C
-
-
T
-
T
-
2
7
-
A
-
G
-
A
-
-
A
A
A
-
G
T
A
-
-
-
-
C
-
-
-
-
-
G
-
G
C
G
A
G
C
A
-
C
T
-
A
C
G
A
A
2
-
-
T
T
G
G
-
G
G
C
C
C
C
G
G
G
T
C
G
G
G
T
G
G
-
T
A
C
-
T
C
-
A
A
A
C
-
-
2
C
C
G
C
-
-
-
G
-
C
T
-
G
-
T
G
C
2
C
-
2
C
A
-
T
G
-
-
A
A
C
-
-
-
C
A
-
C
-
-
-
-
-
-
-
C
-
2
-
C
C
C
-
-
-
-
-
-
A
-
-
-
A
-
-
-
C
C
C
-
T
A
G
T
G
T
A
G
A
-
-
-
-
-
-
A
G
G
-
-
G
G
-
T
G
C
C
T
-
C
C
C
2
G
A
T
C
C
T
-
-
T
T
A
T
-
-
-
C
C
G
-
C
T
A
T
  180,443,200
  180,443,204
  180,443,209
  180,443,228
  180,443,232
  180,443,240
  180,443,252
  180,443,267
  180,443,273
  180,451,068
  180,451,080
  180,451,087
  180,451,089
  180,451,109
  180,454,871
  180,468,883
  180,468,885
  180,468,886
  180,469,825
  180,469,831
  180,469,835
  180,469,846
  180,469,865
  180,469,898
  180,469,905
  180,469,940
  180,469,978
  180,469,988
  180,470,005
  180,470,718
  180,470,720
  180,470,724
  180,470,729
  180,470,731
  180,470,736
  180,482,183
  180,505,397
  180,505,482
  180,505,829
  180,506,213
  180,506,217
  180,506,227
  180,507,847
  180,507,862
  180,507,863
  180,528,022
  180,534,065
  180,546,395
  180,562,499
  180,576,312
  180,581,284
  180,581,295
  180,581,334
  180,581,337
  180,581,347
  180,581,364
  180,581,382
  180,581,385
  180,581,395
  180,581,415
  180,581,434
  180,581,446
  180,581,452
  180,581,458
  180,581,492
  180,581,506
  180,581,512
  180,581,513
  180,581,514
  180,581,519
  180,581,532
  180,581,544
  180,581,552
  180,581,579
  180,581,590
  180,581,613
  180,581,616
  180,595,667
  180,595,671
  180,595,680
  180,595,687
  180,595,869
  180,595,871
  180,595,878
  180,595,882
  180,595,895
  180,595,898
  180,595,926
  180,595,931
  180,595,951
  180,595,955
  180,595,960
  180,595,964
  180,595,965
  180,595,980
  180,595,994
  180,595,998
  180,596,002
  180,596,009
  180,596,025
  180,596,039
  180,596,045
  180,596,050
  180,596,053
  180,596,057
  180,596,063
  180,596,068
  180,596,072
  180,596,213
  180,596,287
  180,596,289
  180,596,373
  180,596,396
  180,596,406
  180,596,410
  180,596,414
  180,596,447
  180,596,485
  180,596,537
  180,596,548
  180,596,579
  180,596,582
  180,596,615
  180,596,657
  180,596,658
  180,596,735
  180,617,337
  180,617,338
  180,629,419
  180,639,515
  180,640,522
  180,640,605
  180,640,723
  180,640,726
  180,640,732
  180,640,753
  180,640,815
  180,640,816
  180,640,820
  180,640,832
  180,640,839
  180,640,843
  180,640,847
  180,640,848
  180,640,849
  180,640,862
  180,640,866
  180,646,449
  180,646,549
  180,646,581
  180,646,593
  180,646,606
  180,646,607
  180,646,640
  180,646,649
  180,646,820
  180,646,847
  180,646,848
  180,646,853
  180,646,863
  180,652,661
  180,659,965
  180,659,980
  180,660,015
  180,660,058
  180,660,089
  180,660,135
  180,660,138
  180,660,144
  180,660,147
  180,660,149
  180,660,182
  180,660,183
  180,660,201
  180,663,100
  180,663,106
  180,663,112
  180,663,113
  180,663,115
  180,663,131
  180,663,136
  180,663,140
  180,663,147
  180,663,161
  180,663,168
  180,663,174
  180,663,181
  180,663,197
  180,663,231
  180,663,246
  180,663,254
  180,663,258
  180,663,262
  180,663,282
  180,663,304
  180,663,308
  180,663,322
  180,663,328
  180,663,352
  180,663,362
  180,663,371
  180,663,372
  180,663,377
  180,663,385
  180,663,390
  180,663,398
  180,663,422
  180,663,425
  180,663,433
  180,663,465
  180,663,475
  180,663,531
  180,663,537
  180,663,546
  180,663,561
  180,663,572
  180,663,573
  180,663,591
  180,663,601
  180,663,606
  180,663,612
  180,663,617
  180,663,640
  180,663,650
  180,663,660
  180,663,676
  180,663,693
  180,663,696
  180,663,711
  180,663,724
  180,663,726
  180,663,733
  180,665,995
  180,668,866
  180,668,870
  180,668,872
  180,668,874
  180,668,876
  180,668,878
  180,668,888
  180,668,895
  180,677,510
  180,677,527
  180,677,536
  180,677,540
  180,677,546
  180,677,572
  180,677,592
  180,707,504
  180,707,513
  180,723,938
  180,723,940
  180,723,951
  180,723,954
  180,723,972
  180,724,322
  180,724,338
  180,724,380
  180,724,384
  180,724,402
  180,729,520
  180,729,541
  180,729,550
  180,729,556
  180,756,832
  180,784,137
  180,786,053
  180,786,070
  180,786,083
  180,786,105
  180,786,142
  180,786,167
  180,786,181
  180,786,195
  180,786,202
  180,786,206
  180,786,246
  180,786,278
  180,786,280
  180,786,292
  180,786,300
  180,786,325
  180,786,326
  180,786,333
  180,786,362
  180,786,376
  180,786,380
  180,786,442
A
A
T
A
A
A
T
A
T
T/G
G/A
A/C
G/A
G/T
C/-
2
G
A
-
-
-
-
-
-
G
-
-
C
-
G
A
-
G
G
G
2/-
-
2
T
-
T
-
A/-
A/C
A/C
2/-
A
-
T/-
G/A
A
-
-
-
-
A
G
T
-
G
C
-
-
-
G
-
T
A
G
-
-
T
A
-
C
-
T
-
-
2
G
A
-
T
-
G
G
C
-
-
C
-
-
G
C
A
A
A
-
2
G
G
T
T
C
G
C
-
-
G
C
-
-
G
-
-
A
-
-
-
-
G
-
C
C
-
G
T
-
A
T
T
T
T
T
A
A
A
T
G
T
T
C
C
C
C
C
G
-
-
-
2
C
-
C
-
-
C
-
T
C
-
-
-
-
-
T
C
C
C
2
T
C
C
C
G
C
T
G
-
-
2
-
T
G
G
-
-
T
T
-
-
-
2
A
T
-
-
G
-
C
C
C
G
T
G
G
A
G
-
G
-
G
-
C
C
G
T
C
T
C
2
A
G
G
C
G
G
-
-
G
T
T/-
C
C
C
C
C
C
C
C
A
G
G
G
-/G
A
G
T
T
2
A
-
-
A
T/A
-
-
-
-
G
-
G
G
2/-
A
-
A
-
-
-
C
A
-
-
-
-
A
A
C
-
A
C
A
A
-
-
C