Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 333,453 (bp)   Positions: 372
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.006
.002
.002
.816
.001
.393
.0
.009
.015
.001
.101
.01
.007
.006
.002
.012
.067
.069
.0
.001
.002
.005
.0
.0
.061
.013
.02
.0
.029
.001
.0
.0
.001
.0
.001
.005
.001
.0
.01
.003
.001
.019
.033
.0
.0
.019
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.034
.292
.0
.871
.001
.0
.0
.203
.0
.0
.073
.002
.006
.003
.644
.0
.0
.001
.194
.926
.989
.006
.001
.0
1.0
.01
.024
.001
.002
.038
.0
.03
.001
.167
.05
--
.006
.255
.004
.944
.009
.002
.36
.041
.987
.0
.005
.001
.0
.0
.003
.01
.003
.002
.014
.002
.001
.001
.001
.0
.184
.0
.002
.0
.009
.002
.022
.015
.005
.136
.0
.0
.004
.0
.0
.003
.007
.005
.002
.0
.001
.0
.0
.013
.0
.003
.022
.001
.007
.004
.0
.014
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.007
.001
.0
1.0
.0
.0
.99
.0
.001
.0
.002
.01
.0
.018
.016
.031
.011
.0
.045
.0
.001
.016
.186
.0
.007
.0
.001
.002
.0
.0
.018
.119
.001
.0
.0
.0
.001
.005
.014
.032
.001
.072
.0
.006
.005
.175
.028
.02
.001
.0
.002
.001
.004
.006
.002
.003
.021
.0
.001
.0
.005
.015
.001
.0
.0
.0
.026
.0
.001
.001
.032
.001
.0
.003
.0
.008
.018
.001
.001
.001
.001
.001
.335
.242
.013
.003
.674
.0
.0
.0
.0
.0
.026
.0
.001
.007
.0
.0
.0
.0
.977
.586
.0
.004
.0
.137
.002
.002
.011
.077
.017
.001
.009
.043
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.993
.349
.954
.003
.003
.0
.005
.046
.003
.023
.001
.005
.001
.008
.012
.001
.047
.498
.0
.0
.011
.0
.002
.017
.0
.439
.001
.0
.0
.0
.012
.005
.06
.092
.004
.0
1.0
.805
.004
.027
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.021
.001
.0
.514
.969
.005
.027
.004
.0
.001
.001
.011
.003
.0
.0
.0
.003
.004
.017
.016
.14
.242
.0
.006
.012
.035
.0
.001
.0
.0
.0
.007
.0
.004
.0
.003
.406
.002
.22
.023
.0
.003
.0
.014
.456
.0
.424
.154
.468
.846
.0
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102547466
LOC102547466
T
G
T
G
A
A
A
G
C
A
G
G
T
T
T
C
T
G
G
C
G
A
T
A
T
G
G
T
A
G
T
A
A
T
G
T
G
T
G
T
A
C
C
A
G
C
T
C
T
T
A
T
C
A
A
C
A
A
C
C
C
C
G
T
T
C
T
A
C
C
G
G
A
A
C
A
G
C
C
T
G
G
A
G
A
C
A
C
C
C
G
G
T
C
C
A
A
G
A
A
C
T
T
A
G
G
T
G
G
G
G
C
C
C
C
C
T
A
T
A
A
C
G
C
T
C
C
A
G
C
T
G
T
G
C
T
G
G
A
T
A
T
T
A
A
G
T
A
C
A
G
T
T
A
C
C
C
C
T
A
T
A
C
A
T
G
C
G
A
A
T
G
A
C
A
G
A
A
G
G
T
T
T
T
G
T
C
T
G
A
G
T
T
C
G
A
C
G
G
C
G
A
T
A
A
G
C
G
C
A
G
T
T
G
A
C
C
G
C
G
C
T
G
A
G
C
T
A
C
A
C
A
A
A
T
C
A
C
A
A
C
C
T
T
T
A
A
T
C
G
G
G
A
C
A
C
A
G
C
C
A
C
C
A
C
C
G
T
G
A
A
C
A
G
G
C
C
A
A
C
A
G
T
A
C
C
C
T
A
C
A
C
G
A
C
G
T
C
T
G
A
G
G
G
T
C
C
C
A
T
A
T
C
C
C
A
C
G
C
T
G
A
C
T
G
T
C
T
G
C
C
G
G
C
A
G
G
C
A
A
C
A
A
A
G
G
G
A
T
C
A
C
T
C
T
T
G
G
T
G
C
A
T
A
A
G
C
G
C
A
G
T
  140,247,582
  140,247,795
  140,248,075
  140,248,736
  140,249,715
  140,250,706
  140,251,396
  140,251,599
  140,253,107
  140,253,438
  140,253,648
  140,254,101
  140,254,357
  140,254,556
  140,254,626
  140,254,781
  140,254,937
  140,254,938
  140,255,628
  140,256,879
  140,257,384
  140,257,592
  140,258,383
  140,258,548
  140,258,580
  140,259,754
  140,259,863
  140,260,117
  140,260,152
  140,260,687
  140,262,862
  140,263,463
  140,263,478
  140,264,144
  140,264,210
  140,264,480
  140,264,536
  140,265,184
  140,265,202
  140,266,018
  140,266,160
  140,266,542
  140,266,951
  140,267,178
  140,267,218
  140,268,669
  140,268,937
  140,269,018
  140,269,959
  140,269,960
  140,269,998
  140,270,095
  140,270,139
  140,270,151
  140,270,602
  140,270,688
  140,272,297
  140,274,018
  140,274,644
  140,274,750
  140,274,979
  140,275,082
  140,275,198
  140,276,039
  140,276,056
  140,276,374
  140,276,831
  140,277,723
  140,277,767
  140,279,245
  140,279,296
  140,280,320
  140,280,748
  140,280,981
  140,281,521
  140,282,328
  140,283,713
  140,284,375
  140,285,442
  140,285,836
  140,290,311
  140,290,513
  140,292,603
  140,293,386
  140,294,285
  140,294,423
  140,294,430
  140,294,433
  140,295,875
  140,298,098
  140,298,982
  140,300,260
  140,300,646
  140,301,113
  140,301,363
  140,302,205
  140,303,881
  140,304,567
  140,306,283
  140,315,644
  140,348,426
  140,414,930
  140,422,998
  140,423,107
  140,441,503
  140,443,520
  140,461,230
  140,468,187
  140,468,770
  140,469,035
  140,469,042
  140,469,443
  140,470,534
  140,471,781
  140,471,800
  140,471,997
  140,472,081
  140,472,781
  140,474,375
  140,475,295
  140,475,374
  140,475,420
  140,475,455
  140,475,643
  140,476,113
  140,476,129
  140,476,173
  140,476,183
  140,476,186
  140,476,238
  140,476,531
  140,476,534
  140,476,871
  140,477,371
  140,477,394
  140,477,537
  140,477,701
  140,477,744
  140,477,762
  140,477,815
  140,477,849
  140,478,067
  140,478,096
  140,478,246
  140,478,287
  140,478,478
  140,478,546
  140,478,548
  140,478,594
  140,478,600
  140,478,671
  140,478,818
  140,479,029
  140,479,179
  140,479,180
  140,479,648
  140,479,743
  140,479,872
  140,480,016
  140,480,156
  140,480,523
  140,480,593
  140,480,644
  140,480,837
  140,481,049
  140,481,179
  140,481,344
  140,481,350
  140,481,356
  140,481,459
  140,481,487
  140,481,898
  140,481,899
  140,482,385
  140,482,494
  140,483,357
  140,483,728
  140,483,788
  140,484,163
  140,484,306
  140,487,393
  140,489,744
  140,490,174
  140,491,060
  140,492,911
  140,493,286
  140,493,683
  140,494,054
  140,494,285
  140,494,742
  140,494,818
  140,494,981
  140,495,057
  140,495,306
  140,495,324
  140,495,407
  140,495,657
  140,495,932
  140,495,953
  140,495,954
  140,496,019
  140,496,062
  140,496,104
  140,496,256
  140,496,306
  140,496,355
  140,496,640
  140,496,648
  140,496,657
  140,496,866
  140,496,993
  140,497,058
  140,497,060
  140,497,122
  140,497,596
  140,497,874
  140,497,887
  140,497,891
  140,497,904
  140,498,062
  140,498,094
  140,498,102
  140,498,569
  140,498,634
  140,498,837
  140,498,972
  140,499,029
  140,499,112
  140,499,854
  140,499,900
  140,499,901
  140,499,922
  140,499,949
  140,500,427
  140,500,501
  140,500,566
  140,500,633
  140,500,708
  140,500,930
  140,501,024
  140,501,025
  140,501,056
  140,501,102
  140,501,158
  140,501,207
  140,501,581
  140,501,637
  140,501,819
  140,502,028
  140,502,104
  140,502,161
  140,502,210
  140,502,413
  140,502,570
  140,502,793
  140,503,082
  140,503,128
  140,503,612
  140,503,689
  140,503,711
  140,503,828
  140,503,849
  140,503,921
  140,503,948
  140,504,341
  140,504,739
  140,504,828
  140,504,927
  140,505,010
  140,505,012
  140,505,020
  140,505,189
  140,505,346
  140,505,430
  140,505,464
  140,505,581
  140,505,689
  140,505,780
  140,505,840
  140,505,854
  140,506,110
  140,506,413
  140,506,447
  140,506,696
  140,507,055
  140,507,574
  140,507,634
  140,507,696
  140,507,790
  140,507,953
  140,508,148
  140,508,193
  140,508,263
  140,508,407
  140,508,444
  140,508,488
  140,508,743
  140,508,774
  140,508,900
  140,508,934
  140,509,020
  140,509,125
  140,509,391
  140,509,433
  140,509,528
  140,509,962
  140,510,793
  140,510,995
  140,511,509
  140,511,828
  140,512,170
  140,514,191
  140,515,113
  140,515,395
  140,515,677
  140,516,985
  140,518,216
  140,519,854
  140,519,892
  140,523,540
  140,533,922
  140,534,026
  140,541,951
  140,542,288
  140,542,753
  140,542,853
  140,542,919
  140,542,985
  140,543,235
  140,543,531
  140,544,779
  140,546,739
  140,548,334
  140,548,401
  140,548,644
  140,552,486
  140,553,620
  140,553,862
  140,554,685
  140,554,839
  140,555,137
  140,555,931
  140,556,213
  140,557,837
  140,558,930
  140,559,419
  140,559,822
  140,560,640
  140,561,745
  140,561,922
  140,561,931
  140,562,727
  140,563,028
  140,563,423
  140,563,954
  140,564,143
  140,564,243
  140,564,983
  140,567,416
  140,567,719
  140,568,687
  140,568,993
  140,570,080
  140,572,950
  140,573,002
  140,573,909
  140,573,928
  140,574,548
  140,574,608
  140,574,770
  140,575,255
  140,575,893
G
A
C
A
G
A/C
G
C
T
G
A
C
A
G
C
T
C
A
A
T
A
G
C
G
G
A
A
G
A/T
C
C
G
G
C
A
C
C
C
A
C
C
T
T
G
A
T
C
T
G
A
C
G
T
T
T
T
G
G
T
A
A
T
C
C
G
T
A
G
T
T
A
A
G
T
A
G
T
T
T
C
A
A
G
T
G
T
T
G
A
T
A
A
C
T
T
G
T
C
T
G
T
C
C
T
A
A
C
T
A
A
A
T
T
T
T
T
C
G
C
G
G
T
T
T
C
T
T
G
C
T
C
A
C
A
A
A
A
A
G
C
G
G
C
C
T
A
C
G
T
C
C
C
C
T
A
T
T
T
C
G
C
G
T
C
G
A
T
A
G
G
G
T
C
T
G
A
G
C
A
A
C
C
G
C
A
C
G
C
T
G
A
C
A
T
A
G
T
A
A
T
C
G
C
T
G
A
T
A
A
T
C
C
C
A
G
T
T
C
T
A
T
A
C
T
T
T
A
G
A
G
T
G
G
C
C
A
G
T
T
G
A
T
C
C
C
G
T
C
T
A
C
A
G
T
G
T
T
A
T
T
T
T
A
T
T
T
A
C
C
C
G
T
G
C
A
A
A
G
C
G
T
C
C
G
A
T
T
C
G
T
G
T
A
G
T
A
C
T
A
A
T
A
A
A
A
T
T
T
G
A
G
C
T
T
T
G
T
A
T
C
T
G
T
A
A
G
A
G
A
G
T
A
A
T
G
A
A
T
G
G
A
G
G
G
A
T
A
G
G
G
G
T
A
T
A
C
A
A
A
A
T
G
G
G
G
C
T
A
T
G
A
G