Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 153,985 (bp)   Positions: 296
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.013
.005
.0
.004
.003
.004
.003
.002
.21
.479
.033
.003
.0
.003
.398
.012
.001
.001
.0
.969
.01
.218
.216
.221
.007
.011
.003
.0
.001
.0
.0
.007
.003
.005
.0
.012
.0
.0
.002
.122
.999
.08
--
--
--
.003
.007
.001
.0
.032
.003
.234
.006
.0
.002
.001
.0
.005
.006
.0
.0
.002
.035
.001
.0
.005
.003
.002
.019
.041
.128
.148
.25
.003
.019
.001
.029
.104
.001
.003
.156
.009
.001
.0
1.0
.001
.001
.01
.0
.021
.001
.001
.996
.06
.018
.0
.0
.001
.003
.002
.0
.004
.0
.0
.002
.0
.0
.001
.001
.002
.0
.0
.0
.004
.022
.052
.56
.0
.001
.0
.0
.001
.002
.121
.0
.0
.002
.001
.004
.001
.044
.002
.0
.014
.012
.001
.071
.994
.23
.02
.003
.002
.003
.001
.023
.001
.001
.0
.001
.001
.026
.001
.037
.005
.003
.01
.001
.004
.0
.0
.0
.019
.98
.023
.021
.0
.005
.01
.195
.003
.022
.035
.016
.002
.0
.004
.018
.0
.01
.013
.002
.001
.0
.108
.069
.589
.003
.02
.001
.203
.006
.091
.327
.002
.0
.003
.02
.001
.001
.001
.018
.006
.001
.003
.05
.006
.041
.072
--
--
.082
.029
.0
.291
.0
.0
.002
.0
.0
.013
.0
.002
.0
.007
.005
.03
.005
.002
.0
.0
.005
.36
.003
.0
.004
.0
.011
.0
.996
.004
--
.05
.038
.005
.006
.211
.021
.0
.029
.021
.166
.084
.008
.009
.428
.004
.0
.0
.012
.055
.0
.0
.0
.157
.006
.011
.0
.001
.018
.0
.211
.0
.012
.0
.0
.0
.0
.001
.077
.968
1.0
.002
.036
.306
.004
.002
.041
.004
.003
.148
.371
.025
.036
.006
.008
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
Itga1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
G
G
T
C
C
A
C
C
A
A
A
C
C
T
G
T
A
C
A
C
T
T
T
T
T
G
G
G
A
T
T
G
G
C
G
G
C
T
C
G
T
C
A
G
T
C
G
T
T
C
A
G
C
C
C
T
C
A
A
C
G
T
T
C
G
C
T
T
T
T
A
C
C
C
C
C
T
A
G
T
A
G
A
T
A
C
A
G
T
A
C
C
T
A
T
T
C
A
T
C
G
T
G
T
T
C
G
T
G
A
G
G
G
C
G
T
T
C
C
G
G
T
T
T
G
A
C
C
T
G
T
T
T
A
G
G
A
G
C
C
A
A
C
G
G
C
G
G
C
G
G
G
C
A
A
T
A
A
G
C
G
G
A
C
G
C
A
C
T
C
C
G
G
G
G
T
C
G
C
T
A
T
A
G
T
G
C
A
C
A
G
C
C
C
T
A
C
C
C
C
T
G
C
C
T
G
C
T
G
C
A
G
G
C
T
G
T
A
C
C
T
G
C
T
G
A
C
G
G
A
A
A
C
A
A
T
T
G
T
C
T
A
G
A
C
C
C
G
A
T
G
T
C
T
G
T
C
T
G
G
G
A
A
G
T
G
A
G
G
T
C
G
C
T
A
T
A
T
A
A
A
G
A
C
C
A
A
T
G
C
T
T
C
C
A
  47,127,630
  47,128,006
  47,128,027
  47,128,187
  47,128,304
  47,128,999
  47,129,105
  47,129,657
  47,130,787
  47,132,070
  47,133,256
  47,133,540
  47,134,593
  47,136,108
  47,137,583
  47,138,632
  47,139,377
  47,139,637
  47,140,790
  47,141,400
  47,142,012
  47,142,538
  47,142,539
  47,142,893
  47,143,096
  47,145,705
  47,145,787
  47,146,490
  47,146,671
  47,146,687
  47,146,690
  47,146,787
  47,146,807
  47,146,823
  47,146,914
  47,147,161
  47,147,221
  47,147,337
  47,147,618
  47,153,408
  47,153,777
  47,154,107
  47,157,707
  47,157,708
  47,158,261
  47,159,754
  47,159,877
  47,160,154
  47,160,222
  47,160,859
  47,161,185
  47,161,359
  47,161,440
  47,161,767
  47,161,811
  47,163,395
  47,163,406
  47,163,451
  47,163,516
  47,163,539
  47,163,645
  47,163,684
  47,164,078
  47,164,295
  47,164,383
  47,164,511
  47,164,512
  47,164,690
  47,164,700
  47,164,914
  47,164,963
  47,164,974
  47,165,032
  47,165,196
  47,165,265
  47,165,397
  47,165,512
  47,165,526
  47,165,591
  47,165,636
  47,165,705
  47,165,941
  47,165,991
  47,166,127
  47,166,414
  47,166,709
  47,166,990
  47,167,026
  47,167,440
  47,167,626
  47,168,412
  47,168,456
  47,168,499
  47,168,828
  47,170,153
  47,170,286
  47,170,708
  47,173,358
  47,173,418
  47,173,486
  47,173,838
  47,174,246
  47,174,253
  47,174,339
  47,174,389
  47,174,945
  47,174,978
  47,175,104
  47,175,398
  47,175,562
  47,175,579
  47,175,720
  47,175,932
  47,176,141
  47,176,386
  47,176,390
  47,176,659
  47,177,002
  47,177,187
  47,177,288
  47,177,289
  47,177,436
  47,177,458
  47,177,472
  47,177,750
  47,177,760
  47,177,991
  47,178,386
  47,178,655
  47,178,805
  47,178,979
  47,180,163
  47,180,474
  47,180,631
  47,181,606
  47,182,196
  47,182,312
  47,182,764
  47,183,207
  47,183,519
  47,183,634
  47,183,711
  47,184,296
  47,184,439
  47,184,470
  47,184,779
  47,184,812
  47,184,867
  47,184,915
  47,184,919
  47,185,085
  47,185,142
  47,185,258
  47,185,333
  47,185,942
  47,186,288
  47,187,065
  47,187,367
  47,188,044
  47,188,316
  47,188,328
  47,189,014
  47,189,225
  47,189,257
  47,189,300
  47,189,316
  47,189,358
  47,189,366
  47,189,672
  47,189,864
  47,190,088
  47,190,089
  47,191,014
  47,191,130
  47,191,396
  47,192,407
  47,196,555
  47,196,642
  47,197,253
  47,197,881
  47,199,034
  47,199,129
  47,200,712
  47,201,581
  47,202,457
  47,203,246
  47,203,310
  47,203,517
  47,204,654
  47,205,289
  47,205,587
  47,206,266
  47,207,107
  47,207,855
  47,208,053
  47,210,398
  47,210,478
  47,210,531
  47,210,548
  47,210,722
  47,210,748
  47,210,804
  47,210,934
  47,210,962
  47,211,242
  47,212,959
  47,213,496
  47,214,270
  47,214,926
  47,214,927
  47,215,398
  47,216,145
  47,216,249
  47,219,127
  47,219,468
  47,220,980
  47,221,089
  47,221,311
  47,221,356
  47,222,781
  47,224,102
  47,225,534
  47,227,607
  47,232,044
  47,232,739
  47,233,699
  47,233,856
  47,236,036
  47,236,461
  47,236,534
  47,237,015
  47,237,260
  47,237,621
  47,237,657
  47,237,692
  47,238,090
  47,238,154
  47,238,457
  47,239,802
  47,239,948
  47,241,552
  47,243,568
  47,244,184
  47,244,788
  47,245,552
  47,246,929
  47,249,454
  47,250,459
  47,252,532
  47,252,539
  47,252,811
  47,253,201
  47,253,415
  47,253,424
  47,253,601
  47,254,406
  47,254,618
  47,255,697
  47,261,778
  47,262,296
  47,262,417
  47,262,755
  47,263,561
  47,263,821
  47,264,011
  47,264,403
  47,265,093
  47,265,278
  47,265,471
  47,265,767
  47,265,955
  47,266,101
  47,266,202
  47,266,275
  47,266,362
  47,266,373
  47,266,589
  47,266,655
  47,267,621
  47,267,928
  47,268,108
  47,268,670
  47,269,367
  47,271,670
  47,271,842
  47,271,845
  47,272,021
  47,272,542
  47,272,580
  47,275,124
  47,276,664
  47,277,104
  47,277,107
  47,278,925
  47,280,186
  47,281,154
G
C
A
C
T
T
G
G
T
G
T
G
T
T
G
A
C
C
T
G
T
A
A
C
G
C
A
A
C
G
C
C
A
A
G
A
A
T
C
A
A
C
T
G
C
C
T
C
C
C
T
G
A
T
T
T
C
T
G
G
T
A
C
C
T
A
T
C
C
C
C
G
T
T
T
T
T
A
G
A
G
G
A
T
C
T
T
G
T
C
T
A
T
A
G
C
C
T
T
C
T
A
C
A
C
A
T
A
G
A
C
C
A
A
T
A
C
C
G
T
T
T
C
C
C
C
C
A
T
C
A
C
C
C
G
T
C
C
A
T
T
G
G
T
A
T
T
A
T
G
A
T
A
T
G
G
C
G
T
A
G
A
A
G
A
A
G
C
T
A
A
A
C
C
A
A
C
T
A
G
C
G
A
C
T
C
T
T
G
T
G
A
T
G
T
C
G
A
T
T
T
C
T
T
A
C
C
T
C
A
T
C
A
A
T
G
A
C
G
T
A
C
A
A
G
A
G
A
T
A
G
G
T
A
G
G
C
C
A
C
T
C
C
A
T
T
T
T
T
G
C
A
C
T
A
T
A
A
C
C
A
A
G
T
A
C
T
C
A
A
A
T
A
T
C
T
A
G
C
G
G
T
A
G
A
A
T
C
C
C
T
G
C
T
T
G