Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 133,888 (bp)   Positions: 287
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.004
.07
1.0
.03
.002
.0
.011
.021
.003
.0
.031
.577
.002
.966
.006
.015
.0
.001
.002
.01
.01
.003
.002
.062
.01
.001
.003
.002
.944
.482
.634
.931
.933
.642
.499
.595
.505
.008
.183
.066
.012
.001
.001
.179
.326
.037
.057
.001
--
--
--
--
--
--
--
.006
.027
.06
.0
.149
.006
.001
.002
.005
.016
.069
.959
.015
.004
.026
.038
.011
.021
.0
.0
.0
.067
.056
.071
.355
.029
.152
.011
.638
.001
.006
.043
.053
.045
.047
.029
.02
.062
.071
.147
.155
.101
.003
.01
.23
.36
.026
.218
.049
.084
.031
--
--
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.022
.028
.156
.004
.001
.486
1.0
.057
.086
.326
.045
.697
.033
.005
.045
.051
--
--
--
--
--
--
.198
.116
.01
.233
.916
.655
.006
.001
.0
.0
.008
.023
.001
.004
.003
.007
.0
.01
--
.026
.002
.402
.002
.007
.006
.594
.102
.011
.042
.338
.111
.002
.002
.744
.022
.0
.001
.009
.018
.007
.005
.012
.017
.024
.005
.127
.349
.002
.003
.023
.07
.156
.029
.001
.004
.005
.001
.528
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.016
.0
.022
.046
.013
.006
.399
.002
.194
.633
.877
.896
.049
.056
.001
.493
.005
.45
.167
.002
.221
.921
.856
.008
.02
.569
.423
.212
.08
.019
.003
.004
.009
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
G
C
4
C
G
A
T
T
G
2
C
G
T
C
G
-
C
C
A
G
C
C
C
C
G
G
A
G
2
4
8
7
19
16
15
7
18
T
-
C
C
T
C
4
A
G
-
A
A
2
T
C
G
T
2
A
C
A
T
C
A
G
A
A
T
G
C
G
T
C
C
G
G
A
A
C
A
T
C
G
T
G
G
T
A
C
2
4
A
T
-
G
2
-
T
T
C
A
A
6
G
C
G
A
A
C
C
C
T
A
G
C
-
T
2
-
T
-
T
C
T
C
C
G
T
T
C
-
-
T
-
-
G
A
4
A
C
A
A
-
2
T
C
C
A
G
T
G
C
T
G
T
-
2
4
2
G
T
G
4
G
T
G
A
A
A
8
-
C
T
4
C
G
T
G
C
G
T
A
A
A
-
A
G
C
C
G
-
G
A
27
G
G
G
A
C
-
-
G
A
A
C
G
C
A
-
A
T
G
C
A
T
C
G
C
-
-
-
G
T
G
A
T
C
G
T
G
T
A
A
C
A
A
A
C
A
-
C
A
A
A
C
G
G
G
A
G
C
A
A
A
T
A
C
2
-
C
C
A
T
G
4
3
A
A
C
C
C
A
A
-
G
C
A
T
-
C
C
G
G
A
T
-
A
-
C
-
  1,682,658
  1,685,580
  1,689,145
  1,692,009
  1,692,766
  1,693,184
  1,693,963
  1,694,338
  1,694,634
  1,694,648
  1,694,773
  1,696,543
  1,698,607
  1,699,341
  1,703,937
  1,704,625
  1,705,686
  1,706,448
  1,707,369
  1,709,607
  1,709,653
  1,709,660
  1,709,946
  1,709,986
  1,710,168
  1,710,802
  1,710,865
  1,711,899
  1,711,956
  1,712,133
  1,712,140
  1,712,150
  1,712,158
  1,712,180
  1,712,199
  1,712,216
  1,712,225
  1,712,279
  1,712,479
  1,712,730
  1,713,433
  1,713,439
  1,713,472
  1,713,484
  1,713,655
  1,713,852
  1,714,695
  1,714,718
  1,714,721
  1,714,732
  1,714,736
  1,714,738
  1,714,757
  1,715,025
  1,715,071
  1,715,281
  1,715,302
  1,715,438
  1,715,662
  1,716,068
  1,716,351
  1,716,444
  1,716,578
  1,716,590
  1,718,120
  1,718,701
  1,719,040
  1,721,212
  1,721,726
  1,722,057
  1,723,984
  1,724,391
  1,724,899
  1,725,406
  1,725,407
  1,725,974
  1,727,250
  1,727,403
  1,727,468
  1,727,518
  1,727,608
  1,728,229
  1,728,309
  1,728,791
  1,729,197
  1,729,705
  1,729,741
  1,729,747
  1,729,771
  1,729,772
  1,729,780
  1,729,783
  1,729,792
  1,729,798
  1,729,820
  1,729,822
  1,730,494
  1,730,513
  1,730,754
  1,731,349
  1,731,705
  1,731,849
  1,732,289
  1,732,355
  1,732,526
  1,732,708
  1,733,266
  1,733,503
  1,734,954
  1,736,108
  1,736,167
  1,736,442
  1,736,585
  1,736,647
  1,736,660
  1,736,675
  1,736,722
  1,736,753
  1,736,756
  1,736,788
  1,736,830
  1,736,836
  1,736,872
  1,736,890
  1,736,922
  1,737,020
  1,737,050
  1,737,064
  1,737,065
  1,737,078
  1,737,082
  1,737,148
  1,737,861
  1,737,896
  1,737,899
  1,737,947
  1,738,096
  1,738,678
  1,739,340
  1,739,946
  1,740,408
  1,740,708
  1,741,049
  1,742,619
  1,743,556
  1,743,801
  1,744,322
  1,744,489
  1,744,633
  1,744,898
  1,745,108
  1,747,711
  1,748,368
  1,748,428
  1,749,390
  1,749,462
  1,749,517
  1,749,520
  1,749,521
  1,749,592
  1,751,127
  1,751,184
  1,751,211
  1,751,745
  1,752,694
  1,752,699
  1,753,194
  1,753,326
  1,753,338
  1,753,346
  1,754,315
  1,754,425
  1,754,708
  1,755,021
  1,755,635
  1,757,100
  1,757,977
  1,758,629
  1,759,613
  1,761,654
  1,761,790
  1,762,751
  1,762,834
  1,763,155
  1,763,539
  1,764,319
  1,764,466
  1,765,069
  1,765,555
  1,765,729
  1,766,196
  1,766,477
  1,766,915
  1,767,038
  1,767,316
  1,768,039
  1,768,899
  1,768,903
  1,770,649
  1,772,053
  1,772,457
  1,772,465
  1,773,508
  1,774,417
  1,774,659
  1,774,997
  1,775,240
  1,775,581
  1,775,913
  1,775,986
  1,776,378
  1,776,425
  1,776,480
  1,777,083
  1,777,189
  1,777,764
  1,778,070
  1,778,407
  1,779,037
  1,779,045
  1,779,049
  1,779,050
  1,779,063
  1,779,066
  1,779,115
  1,779,140
  1,779,141
  1,779,144
  1,779,151
  1,779,152
  1,779,161
  1,779,162
  1,779,168
  1,779,169
  1,779,173
  1,779,174
  1,779,609
  1,781,143
  1,781,144
  1,781,669
  1,781,917
  1,782,744
  1,782,768
  1,782,902
  1,783,114
  1,783,125
  1,783,136
  1,783,139
  1,783,166
  1,783,840
  1,783,986
  1,783,988
  1,784,601
  1,785,004
  1,785,502
  1,786,651
  1,786,783
  1,788,667
  1,789,049
  1,789,759
  1,790,057
  1,792,091
  1,792,351
  1,792,363
  1,792,365
  1,792,732
  1,792,736
  1,792,910
  1,793,831
  1,796,620
  1,796,976
  1,797,437
  1,797,931
  1,798,792
  1,799,351
  1,800,093
  1,800,791
  1,801,254
  1,802,351
  1,802,773
  1,805,189
  1,805,463
  1,809,585
  1,810,256
  1,811,370
  1,812,450
  1,813,484
A
T
-
G
T
G
G
C
T
-
-
-
C
A
A
72
A
A
G
A
T
T
G
T
C
C
G
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
5
T
T
G
T
-
T
C
A
-
-
2/-
T/C
C/-
T
C
-
G
T
G
C
T
-
A
G
T
C
A
T
A
C
T
T
-
A
G
C
T
G
A
T
T
G
A
A
G
G
G
-
-
G
C
2
A
-
2
G
G
T
G
G
-
A
T
A
G
G
T
T
A
C
T
A
T
A
A
-
A
-
A
C
-
-
-
-
-
-
-
A
G
C
-
C
A
C
G
-
G
A
T
C
10
-
G
A
A
G
A
C
A
T
C
C
C
G
-
-
-
T
C
A
-
A
C
T
G
-
G
-
A
G
-
-
T
A
C
A
T
A
C
G
G
G
3
G
A
G
T
A
2
T
G
-
C
A
A
-
T
-/4
6
A
G
G
G
C
T
G
4
G
G
A
G
C
C
T
A
-
2
-/2
T
G/A
T/C
G/C
A/G
T/G
C/A
G/A
T/C
G/A
T/G
A/G
A/G
C/T
A/T
A/G
A/G
C/G
A/G
A
T
G
-
G
C/G
G/-
A
G/C
A/T
G/A
C/T
A/C
G
T
C
C
T
-
2
T
T
G
C
A
-
-
C
-
T
T
T
G
G
4
A
T
G
A
C
A
-
-
-
G
A
4
T
17
G
3