Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 1,564,042 (bp)   Positions: 315
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.037
--
--
--
.042
--
.381
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.026
.063
.039
.037
.008
.001
.011
.979
1.0
1.0
.998
1.0
1.0
.993
.995
.011
.214
.014
.01
--
--
--
--
--
--
.099
.0
--
--
--
--
--
--
--
.003
.002
.002
--
--
--
--
.028
.0
.601
.536
.536
.562
.6
.514
.518
.563
.602
.0
.127
--
--
--
--
--
--
--
.537
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.023
.105
.032
.001
--
--
--
--
.086
.005
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.015
.796
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.001
.001
.001
.002
.162
.0
--
--
.011
.003
.005
.08
.002
.064
.039
.021
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.001
--
.013
.007
.102
.018
.008
--
--
--
--
--
--
.002
.003
.008
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.261
--
--
--
--
--
--
.004
--
--
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.029
.047
.023
.006
.001
.953
.934
.007
.004
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
Il1rapl2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Hnrnpa1-ps22
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Setd3-ps1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
A
G
G
A
A
C
T
A
G
T
G
C
A
C
C
G
G
T
G
G
T
C
T
C
A
G
G
A
T
A
G
C
G
A
G
C
T
C
C
C
A
C
A
A
C
A
T
G
A
A
C
G
T
G
T
T
T
G
A
T
A
G
G
C
G
A
G
T
T
T
T
C
A
G
C
G
A
G
C
A
T
G
C
C
G
A
A
A
C
T
G
G
T
A
T
G
T
G
G
T
G
A
A
A
C
C
A
C
A
G
A
G
G
A
C
C
C
C
C
C
G
A
A
C
C
G
C
G
G
C
T
A
A
G
C
G
C
G
A
C
T
G
A
A
C
G
G
A
C
G
A
G
C
G
T
C
C
C
T
T
A
G
A
G
C
A
G
G
T
A
T
A
T
A
A
C
T
T
T
C
T
C
C
C
T
C
G
T
G
C
T
G
T
T
G
A
A
C
T
A
G
C
T
A
G
T
T
C
G
T
C
C
G
C
T
T
T
C
C
T
C
C
A
A
T
G
T
C
A
A
G
T
G
C
C
T
G
T
A
C
C
T
A
T
C
T
T
T
G
C
G
A
A
C
T
C
A
C
G
G
T
C
T
G
C
G
A
C
A
T
T
T
T
A
C
C
C
T
C
C
G
C
G
G
T
G
G
G
G
A
G
G
C
T
A
G
G
C
C
G
G
G
A
T
G
G
C
C
T
G
A
A
T
  108,310,855
  108,310,865
  108,310,876
  108,310,880
  108,310,892
  108,310,922
  108,311,506
  108,314,348
  108,314,356
  108,314,405
  108,316,119
  108,316,133
  108,316,187
  108,316,193
  108,324,061
  108,324,062
  108,324,105
  108,324,118
  108,334,345
  108,343,504
  108,351,344
  108,352,032
  108,352,096
  108,377,013
  108,419,972
  108,439,998
  108,440,402
  108,440,416
  108,442,666
  108,442,685
  108,442,731
  108,442,782
  108,443,264
  108,443,301
  108,443,329
  108,443,372
  108,444,837
  108,444,982
  108,444,993
  108,444,997
  108,445,105
  108,445,170
  108,445,815
  108,446,002
  108,446,006
  108,480,424
  108,480,433
  108,480,434
  108,480,466
  108,480,467
  108,480,519
  108,480,547
  108,480,548
  108,502,929
  108,502,996
  108,503,745
  108,538,111
  108,540,188
  108,540,224
  108,540,236
  108,540,263
  108,540,267
  108,540,272
  108,566,664
  108,575,283
  108,630,577
  108,630,593
  108,630,596
  108,630,611
  108,630,675
  108,630,696
  108,630,722
  108,641,982
  108,644,784
  108,644,839
  108,672,368
  108,672,381
  108,672,392
  108,672,416
  108,675,848
  108,675,878
  108,682,423
  108,739,519
  108,739,525
  108,739,538
  108,739,546
  108,739,575
  108,739,579
  108,739,594
  108,739,601
  108,745,814
  108,752,806
  108,810,838
  108,810,842
  108,846,656
  108,847,106
  108,847,109
  108,847,114
  108,847,122
  108,887,480
  108,960,920
  108,960,960
  108,960,966
  108,960,999
  108,961,008
  108,961,025
  108,961,034
  108,967,870
  108,970,999
  108,971,513
  108,971,518
  108,971,529
  108,971,538
  108,971,563
  108,971,581
  108,971,926
  108,972,991
  108,973,023
  108,973,083
  108,973,112
  108,973,115
  108,973,121
  108,973,485
  108,979,758
  108,979,762
  108,979,770
  108,980,340
  108,980,349
  108,980,363
  108,980,368
  108,980,380
  108,980,691
  108,980,701
  108,982,215
  109,011,346
  109,011,363
  109,013,641
  109,013,707
  109,013,719
  109,013,733
  109,018,873
  109,042,975
  109,086,509
  109,086,554
  109,111,166
  109,111,207
  109,111,290
  109,111,305
  109,111,581
  109,111,602
  109,112,151
  109,112,173
  109,112,196
  109,112,205
  109,112,208
  109,112,212
  109,130,273
  109,157,382
  109,157,387
  109,157,412
  109,157,424
  109,167,212
  109,167,232
  109,167,816
  109,168,157
  109,168,263
  109,168,274
  109,168,426
  109,179,438
  109,182,553
  109,219,599
  109,219,688
  109,220,018
  109,221,995
  109,222,025
  109,222,103
  109,238,545
  109,238,560
  109,256,023
  109,287,837
  109,287,932
  109,288,160
  109,288,198
  109,288,241
  109,288,267
  109,288,273
  109,289,408
  109,289,412
  109,289,413
  109,289,426
  109,289,429
  109,289,462
  109,295,658
  109,315,279
  109,315,362
  109,316,201
  109,316,248
  109,316,407
  109,316,578
  109,326,276
  109,339,087
  109,353,497
  109,373,371
  109,395,092
  109,395,240
  109,395,449
  109,395,587
  109,396,032
  109,396,538
  109,396,599
  109,397,932
  109,406,377
  109,406,393
  109,406,421
  109,406,423
  109,406,465
  109,427,469
  109,429,433
  109,429,439
  109,429,476
  109,429,512
  109,429,564
  109,429,711
  109,429,775
  109,429,826
  109,429,877
  109,429,879
  109,429,891
  109,429,977
  109,430,034
  109,430,089
  109,430,173
  109,431,684
  109,431,715
  109,432,510
  109,432,531
  109,432,551
  109,432,561
  109,432,626
  109,432,647
  109,463,738
  109,471,738
  109,471,820
  109,471,833
  109,472,621
  109,472,630
  109,472,656
  109,472,669
  109,473,350
  109,477,522
  109,477,524
  109,477,566
  109,511,489
  109,554,399
  109,589,587
  109,590,769
  109,590,772
  109,591,413
  109,591,965
  109,597,490
  109,597,501
  109,597,547
  109,630,442
  109,630,446
  109,630,467
  109,630,505
  109,630,519
  109,630,537
  109,639,881
  109,640,232
  109,659,217
  109,668,774
  109,670,753
  109,672,229
  109,672,246
  109,680,686
  109,689,726
  109,689,802
  109,689,811
  109,690,020
  109,708,574
  109,708,583
  109,708,599
  109,735,702
  109,739,678
  109,739,842
  109,739,878
  109,739,983
  109,741,002
  109,752,432
  109,757,723
  109,785,844
  109,786,028
  109,799,625
  109,812,064
  109,813,427
  109,813,439
  109,813,475
  109,813,516
  109,813,522
  109,813,531
  109,813,532
  109,813,536
  109,813,547
  109,813,591
  109,813,599
  109,824,599
  109,824,650
  109,824,655
  109,824,657
  109,824,668
  109,824,688
  109,824,690
  109,824,697
  109,824,700
C/G
G/A
A/G
G/T
G/A
A/T
C
C/T
T/C
A/C
G/A
T/C
G/C
C/T
G
T
G
T
G/T
A
G/A
G/T
T/A
G
T/C
C/G
A/G
G/A
G/A
A/G
T/A
A/G
G/A
C/A
G/A
A/G
G/A
C/A
T/C
C/A
C/G
C/T
A/T
C/G
A/G
A/G
C/T
A/G
T/C
G/A
A/G
A/G
C/T
C
G
T
A
G
G
T
G
G
G
T
A
C/A
G/A
A/C
G/T
T/A
T/C
T/A
A
G
C
G/A
C/A
G/A
A/T
T
A
A/G
T/A
G/A
C/A
C/T
G/A
A/G
A/G
A/T
A
C
G/A
G/A
A
T
A
C
C
G/A
G/A
T/A
G/A
A/G
A/C
A/G
C/T
T
A/G
C/T
A/G
G/C
A/G
G/T
G/T
A/T
A
A
A
A
A
A
A
A/C
A/G
C/T
C/G
G/A
C/T
G/C
G/A
C/A
T/C
G
C
T
C/G
G/C
C/G
G/C
G
A
T/C
G/C
A/G
A/C
C/T
G/A
G/C
A/T
C/G
G/T
A/T
G/T
C/A
G/A
T/C
C/T
C/A
C/A
T/A
T/G
A/G
G/C
A/G
G/A
C/T
A/T
T
A
T/A
A/C
T/C
A/G
T/C
A/G
A/C
C/A
T/A
T/C
T/G
C/T
T/C
C/T
C/G
C/G
T/C
C/T
G/T
T/G
G/A
C/G
G
C
G
A
C
C
C
A
A
A/G
T
A
A
T
T
C
C
T
G/A
T/C
C/T
C/A
G/T
C/T
T/C
T/G
T/A
C/T
C/T
T/G
C/T
C/T
A/G
A/G
T/G
G/T
T/C
C/T
A/C
A/C
T
C
G/A
C/T
C/T
T/G
G/C
T/A
A/T
C/T
C/T
T/G
A/G
T/A
C/G
T/A
C
T/C
G/A
C/G
G/T
A/T
A/T
G
G
A
G
C/T
G/T
G/A
T/A
C/T
T/C
G/C
C/A
G/A
C
A
G
T/C
T/G
T/C
T/C
C
G
T
T
A
C/T
C/G
G/A
A
G/A
G/T
T/G
G/C
G/C
A
A
G
G/T
A
C/G
T/C
A/G
G/C
G/T
C/T
C/T
G/A
G/A
G/A
A/T
T/A
G/A
G/A
C/T
C/T
T/A
G/C
A/T
A/T
T/A