Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 233,521 (bp)   Positions: 533
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.642
.996
.058
.001
.005
--
.498
.247
.008
.002
.006
.005
.153
.001
.002
.008
.011
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.376
.001
.018
.019
.857
.952
.001
.019
.002
.01
.016
.008
.003
.0
.0
.0
.0
.017
.002
.001
.07
.416
.592
.03
.051
.973
.998
.002
.004
.17
.803
.061
--
.052
.259
.0
.711
.968
.001
.0
.005
.001
.0
.004
.067
.004
.002
.001
.0
.002
.0
.007
.0
.001
.018
.023
.039
.296
.764
.001
.002
.0
.001
.004
.011
.007
.002
.002
.001
.248
.303
.226
.066
.003
.004
.001
.005
.001
.0
.0
.016
.036
.002
.002
.005
.006
.007
.001
.001
.003
.001
.0
.001
.002
.001
.026
.073
.123
.009
.02
.044
.003
.001
.007
.0
.0
.016
.004
.005
.005
.004
.001
.053
.023
.001
.01
.01
.0
.202
.299
.339
.923
.998
.993
.983
.983
.95
.002
.919
.002
.019
.006
.002
.852
.0
.001
.001
.0
--
--
.371
.0
.0
.004
.001
.0
.111
.004
--
--
--
--
--
--
.002
.001
.001
.012
.024
.077
.248
.282
.233
.166
.082
.038
.005
.027
.033
.008
.017
.028
.06
.512
.093
.037
.007
.016
.013
--
--
.133
.003
.012
.007
.0
.002
.0
.011
.012
.327
.001
.002
.027
.003
.001
.0
.009
.006
--
--
--
.043
.02
.624
.25
.071
.04
.001
.002
.003
--
--
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.0
.0
.0
.001
.005
--
--
--
.0
.001
.285
.004
--
--
--
.002
.552
.004
.015
.0
.007
.007
.0
.03
.007
.001
--
--
--
--
--
.012
.004
.123
.016
.0
--
.025
.0
.005
.016
.019
--
--
--
.001
.001
.001
.066
.005
.0
.003
.001
.016
.001
.912
1.0
.987
.924
.902
.932
1.0
.0
.0
.0
.0
.0
.053
.602
.001
.001
.001
.002
.005
.009
.016
.026
--
.02
--
.019
.012
.002
.107
.002
.018
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.018
.017
.005
.005
.006
.003
.0
.235
.271
.324
.022
.008
.071
.006
.272
.005
.005
.034
.008
.006
.01
.013
.005
.009
.011
.004
.007
.003
.0
.059
.341
.001
.002
.006
.048
.008
.048
.013
.113
.02
.108
.144
.118
.043
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.005
.0
.003
.001
.005
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
.042
.006
.002
.031
.009
.0
.001
.001
.004
.0
.0
.002
.001
.006
.026
.01
.0
.066
.315
.012
.001
.003
.014
.013
.008
.018
.024
.016
.005
.0
.001
.009
.011
.009
.005
.002
.024
.005
.004
.019
.025
.014
.009
.016
.003
--
--
--
.005
.02
.003
--
.012
.003
.003
.018
.006
.005
.009
--
.014
.025
--
--
.008
.154
.096
--
.008
.003
.001
.0
.0
.021
.008
.025
.016
.0
.056
--
--
--
.025
.384
.007
.0
.095
.086
--
--
.074
.008
.267
.0
.003
.0
.248
.005
.0
--
--
--
.608
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
12
10
G
-
G
T
A
A
T
C
A
A
G
A
T
3
2
C
4
4
C
T
T
C
G
C
G
G
C
T
G
C
A
T
C
T
5
C
C
T
A
C
A
A
A
-
A
-
-
A
-
G
G
-
6
G
2
C
C
A
T
A
A
T
G
G
A
G
2
T
G
-
G
-
A
C
T
C
T
C
A
C
A
A
-
A
T
100
C
A
A
T
C
G
G
A
-
-
G
T
-
-
T
A
T
C
C
T
-
G
T
3
C
G
C
-
-
A
G
-
-
C
C
-
A
2
A
3
G
-
-
T
A
G
T
G
A
A
G
A
T
T
C
G
G
3
T
C
4
5
5
-
C
T
10
G
A
T
T
C
C
G
G
G
A
T
A
-
G
T
2
G
G
T
-
T
T
A
A
A
G
-
G
-
-
2
G
C
G
-
C
-
-
G
A
-
-
-
A
A
A
G
C
T
G
A
3
G
-
T
G
-
-
-
G
G
G
C
-
-
T
C
C
T
A
T
C
-
C
G
-
12
C
C
C
C
C
C
T
A
A
C
G
A
33
A
G
T
2
T
A
G
G
T
G
C
C
T
C
-
G
A
-
C
G
T
C
T
T
-
T
T
C
-
-
T
T
T
A
A
G
T
-
G
T
G
T
C
T
C
A
T
G
G
G
G
G
C
A
8
2
-
T
C
C
-
5
C
-
2
G
G
C
C
-
-
A
G
G
G
G
G
G
G
G
12
T
A
T
C
G
-
C
A
A
T
T
G
C
2
A
T
G
C
A
C
C
C
G
C
G
C
A
G
A
G
G
T
A
C
G
T
C
T
A
3
T
T
A
G
C
T
A
A
G
A
A
C
A
T
C
T
A
G
T
A
G
-
-
G
T
A
G
-
G
A
G
A
T
C
C
C
-
3
G
T
C
C
A
G
C
C
T
G
-
T
C
T
A
A
G
A
T
-
C
C
C
T
T
T
-
T
T
T
G
G
A
A
A
T
G
T
G
C
-
G
T
T
T
-
T
-
T
T
T
-
A
G
4
-
-
3
T
-
-
A
A
3
-
-
A
C
C
-
C
G
C
C
-
A
C
C
-
G
G
-
A
G
-
T
T
T
T
T
A
G
T
A
C
A
-
G
T
2
G
T
C
C
A
-
C
T
C
G
C
G
T
A
C
C
A
C
T
A
2
A
A
-
-
T
A
6
T
  118,086,825
  118,086,851
  118,087,621
  118,087,741
  118,088,205
  118,090,130
  118,090,498
  118,090,502
  118,091,043
  118,092,114
  118,092,145
  118,092,152
  118,092,737
  118,093,261
  118,093,787
  118,094,798
  118,094,804
  118,094,813
  118,094,844
  118,094,892
  118,094,901
  118,094,905
  118,094,912
  118,094,913
  118,094,953
  118,094,973
  118,094,976
  118,094,986
  118,094,993
  118,094,996
  118,095,030
  118,095,048
  118,095,053
  118,095,638
  118,096,728
  118,096,733
  118,096,796
  118,096,823
  118,097,052
  118,097,064
  118,097,078
  118,097,089
  118,097,114
  118,097,122
  118,097,134
  118,097,139
  118,097,141
  118,097,167
  118,097,169
  118,097,193
  118,097,240
  118,097,483
  118,097,535
  118,097,551
  118,097,576
  118,098,602
  118,099,007
  118,099,069
  118,100,004
  118,101,407
  118,101,585
  118,101,698
  118,102,854
  118,103,532
  118,104,282
  118,104,329
  118,104,354
  118,104,497
  118,105,041
  118,105,157
  118,105,158
  118,105,164
  118,105,185
  118,105,451
  118,105,456
  118,105,471
  118,105,480
  118,105,489
  118,105,496
  118,105,497
  118,105,504
  118,105,505
  118,105,528
  118,105,552
  118,105,559
  118,106,957
  118,106,958
  118,106,982
  118,107,092
  118,107,151
  118,107,163
  118,107,165
  118,107,169
  118,107,207
  118,107,214
  118,107,243
  118,107,254
  118,107,279
  118,107,289
  118,107,301
  118,107,326
  118,107,340
  118,107,343
  118,107,348
  118,107,354
  118,107,370
  118,107,385
  118,107,391
  118,107,424
  118,107,439
  118,107,450
  118,107,456
  118,107,473
  118,107,482
  118,107,485
  118,107,492
  118,107,495
  118,107,501
  118,107,502
  118,107,517
  118,107,521
  118,107,525
  118,107,529
  118,107,535
  118,107,548
  118,107,558
  118,107,562
  118,107,573
  118,107,594
  118,107,607
  118,108,042
  118,108,199
  118,108,229
  118,108,273
  118,108,392
  118,108,504
  118,108,830
  118,108,899
  118,109,202
  118,110,092
  118,110,226
  118,110,245
  118,111,247
  118,111,257
  118,111,262
  118,111,273
  118,111,282
  118,111,376
  118,111,380
  118,111,386
  118,111,393
  118,111,466
  118,111,583
  118,111,714
  118,111,879
  118,112,447
  118,112,459
  118,113,546
  118,114,137
  118,114,200
  118,114,396
  118,114,988
  118,115,911
  118,116,355
  118,116,826
  118,117,668
  118,120,005
  118,120,926
  118,121,006
  118,122,839
  118,123,789
  118,124,535
  118,125,647
  118,125,650
  118,125,662
  118,125,664
  118,125,675
  118,125,676
  118,125,684
  118,125,687
  118,125,688
  118,125,692
  118,125,694
  118,125,712
  118,125,732
  118,125,739
  118,125,748
  118,125,753
  118,125,757
  118,125,767
  118,125,779
  118,125,785
  118,125,790
  118,125,806
  118,125,825
  118,125,847
  118,125,849
  118,125,858
  118,125,892
  118,125,900
  118,125,929
  118,125,943
  118,125,951
  118,125,957
  118,125,958
  118,125,968
  118,126,004
  118,126,008
  118,126,032
  118,126,060
  118,126,065
  118,126,070
  118,126,079
  118,126,084
  118,127,037
  118,127,178
  118,127,948
  118,128,179
  118,128,296
  118,128,848
  118,129,778
  118,130,041
  118,134,078
  118,135,020
  118,135,709
  118,136,255
  118,136,726
  118,138,618
  118,142,437
  118,142,753
  118,142,786
  118,142,823
  118,142,875
  118,142,888
  118,143,080
  118,143,246
  118,143,249
  118,145,105
  118,145,810
  118,145,819
  118,145,821
  118,145,864
  118,146,461
  118,146,501
  118,146,520
  118,146,522
  118,146,873
  118,148,674
  118,149,481
  118,150,757
  118,151,259
  118,151,573
  118,155,252
  118,162,185
  118,162,196
  118,162,763
  118,166,218
  118,166,433
  118,166,755
  118,167,224
  118,167,527
  118,167,605
  118,167,620
  118,168,969
  118,169,142
  118,169,532
  118,169,658
  118,170,828
  118,171,116
  118,171,661
  118,171,943
  118,173,697
  118,175,736
  118,176,698
  118,176,723
  118,176,739
  118,176,797
  118,176,860
  118,177,278
  118,178,030
  118,178,176
  118,181,180
  118,182,006
  118,182,831
  118,183,323
  118,183,950
  118,185,077
  118,185,332
  118,185,986
  118,187,135
  118,188,578
  118,188,579
  118,189,357
  118,190,428
  118,190,528
  118,190,830
  118,191,290
  118,191,520
  118,194,401
  118,195,680
  118,195,875
  118,198,076
  118,199,900
  118,200,379
  118,200,384
  118,200,532
  118,200,551
  118,200,560
  118,200,563
  118,200,577
  118,200,586
  118,200,589
  118,200,594
  118,200,603
  118,200,612
  118,201,411
  118,201,761
  118,201,920
  118,205,019
  118,205,021
  118,205,023
  118,205,025
  118,205,027
  118,205,029
  118,205,031
  118,205,258
  118,205,966
  118,207,296
  118,207,584
  118,207,586
  118,208,074
  118,208,902
  118,209,025
  118,211,016
  118,213,948
  118,216,458
  118,216,463
  118,216,503
  118,216,507
  118,216,550
  118,216,557
  118,216,765
  118,216,766
  118,216,792
  118,216,841
  118,217,373
  118,217,374
  118,217,456
  118,217,490
  118,217,497
  118,217,532
  118,217,537
  118,217,574
  118,217,584
  118,220,758
  118,220,980
  118,221,048
  118,221,664
  118,222,361
  118,225,486
  118,226,430
  118,226,497
  118,228,400
  118,229,196
  118,229,611
  118,230,771
  118,230,801
  118,230,815
  118,230,984
  118,230,993
  118,231,032
  118,231,154
  118,231,195
  118,231,261
  118,231,262
  118,231,650
  118,231,724
  118,231,726
  118,231,847
  118,232,176
  118,232,184
  118,232,335
  118,232,484
  118,232,652
  118,232,798
  118,233,342
  118,233,353
  118,233,886
  118,233,931
  118,234,091
  118,234,255
  118,234,286
  118,234,435
  118,234,532
  118,234,554
  118,235,092
  118,235,341
  118,235,852
  118,236,256
  118,236,630
  118,237,643
  118,237,928
  118,238,535
  118,238,550
  118,238,659
  118,238,682
  118,238,690
  118,238,814
  118,239,149
  118,239,249
  118,240,238
  118,240,510
  118,241,280
  118,241,500
  118,241,586
  118,242,786
  118,242,905
  118,243,128
  118,244,283
  118,244,596
  118,244,830
  118,245,514
  118,245,649
  118,245,652
  118,245,681
  118,245,683
  118,245,689
  118,245,706
  118,245,892
  118,246,361
  118,248,166
  118,248,298
  118,248,311
  118,248,401
  118,248,660
  118,248,721
  118,248,752
  118,248,753
  118,248,947
  118,249,011
  118,249,444
  118,249,817
  118,250,004
  118,250,053
  118,250,486
  118,251,042
  118,251,796
  118,253,203
  118,254,096
  118,254,592
  118,254,596
  118,254,598
  118,254,602
  118,254,603
  118,254,605
  118,254,608
  118,254,609
  118,254,612
  118,254,621
  118,254,627
  118,254,630
  118,254,635
  118,254,638
  118,254,642
  118,254,644
  118,254,674
  118,254,679
  118,254,713
  118,254,741
  118,254,775
  118,254,784
  118,254,791
  118,254,803
  118,254,829
  118,254,861
  118,255,831
  118,256,670
  118,256,971
  118,257,002
  118,259,338
  118,259,534
  118,260,255
  118,260,351
  118,260,381
  118,260,398
  118,260,504
  118,260,918
  118,263,446
  118,264,317
  118,265,346
  118,267,072
  118,268,793
  118,269,050
  118,269,573
  118,269,969
  118,270,828
  118,270,837
  118,270,876
  118,271,366
  118,271,713
  118,271,841
  118,272,137
  118,272,430
  118,273,090
  118,273,470
  118,273,510
  118,273,578
  118,274,398
  118,275,290
  118,275,819
  118,276,028
  118,276,056
  118,276,678
  118,278,641
  118,286,872
  118,290,271
  118,294,609
  118,298,774
  118,299,409
  118,299,685
  118,302,260
  118,302,384
  118,302,694
  118,303,431
  118,305,427
  118,306,526
  118,307,471
  118,307,872
  118,309,266
  118,309,967
  118,310,245
  118,310,807
  118,315,631
12/-
10/-
A
A
T
C
G
G/G
C
T
C
T
A
T
-
-
-
G
-
-
A
A
G
A
A
T
-
A
G
C
A
T
T
A
-
-
-
A
-
-
-
-
-
-
-
C
-
C
C
-
A
-
-
C
-
A
-
T
A
G
A
G
T
G
C
C
G
A
-
A
T
A
A
T
-
-
-
-
C
T
C
A
-
-
T
C
A
-
-
-
T
A
-
-
-
-
T
A
-
-
T
T
-
-
-
-
G
-
T
-
-
-
G
-
-
T
C
G
T
T
G
-
-
A
-
-
-
-
T
T
3
C
G
A
G
A
T
G
A
C
A
G
-
-
-
-
-
-
-
-
-
T
T
C
-
T
T
A
G
T
G
A
-
A
T
C
T
2
A
C
-
C
A
-
2
A
A
C
C
G
C
4
-
A
G
-
-
-
-
A
-
T
A
C
-
A
T
A
-
-
-
-
-
-
A
-
-
C
2
-
-
A
C
C
A
A
T
T
8
-/G
G
G
T
C
G
C
-
T
A
-
A
-
-
-
A
-
A
T
T/A
A/G
A/G
C/T
G/A
A/T
33/-
A/G
G/T
A
-
G
-
C
A
T/G
G/C
C/T
T
-
T
11
-
-
T
A
A
C
T
C
C
T
A
C
T
14
G
-
C
G
G
C
C
-
A
A
C
T
-
T
G
T
C
A
A
A
A
A
T
T
G
-
-
A
G
A
A
3
-
T
2
-
-
-
-
A
4
3
G
A
C
C
C
C
C
C
C
-
C
G
-
A
A
12
T
G
C
A
G
A
T
-
G
C
A
T
T
T
T
G
A
T
A
T
G
A
G
G/A
G/A
C
-
T
A
A
T
G
G
-
C
G
G
A
G
-
C
G
A
G
T
C/T
G
G
G
C
C
T
C
-
-
-/14
4
T
C
G
T
A
A
G
A
G
C
G
T
T
A
-
A
C
T
T
G
A
T
A
C
C
A
C
T
C
T
T
T
G
T/C
-/T
C/A
C/A
C/T
C
C
C
T
G
G
C
T
A
-
T
T
C
T
G
T
T
A
A
A
-
C
T
A
3
C
C
A
2
T
C
-
CA/C
C
-
C
A
8
-
-
-
T
T
-
-
-
G
A
A
T
G
8
-
T
T
C
T
C
T
G
T
A
G
G
C
C
A
T
A
-
C
T
T
T
A
C
-
A
-
A
T
G
16
T
C
G
C
G
A
A
G
G
G
G
T
C
G
-
C
G
3
T
G
-
-
-