Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 309,066 (bp)   Positions: 533
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.0
.0
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.002
.0
.0
.002
.001
.006
.0
.022
.0
.007
.0
.0
.006
.0
.001
.003
.039
.0
.002
.0
.119
.028
.018
.0
.02
.002
.0
.025
.001
.002
.0
.993
.0
.0
.0
.0
.003
.0
.009
.263
.0
.0
.001
.0
.001
1.0
.0
.014
--
.002
.028
.004
.0
.933
.939
.996
.067
.014
.151
.228
.006
--
--
--
--
--
--
.001
.001
.244
.001
.001
.001
.002
.003
.001
.001
.195
.005
.024
.001
.0
.0
.034
.001
.001
.0
.0
.002
.005
.001
.002
.0
.0
.559
.002
.0
.04
.053
.083
.041
.001
.008
.0
.0
.139
.028
.128
.927
.0
.002
.229
.311
.0
.0
.0
.045
.001
.001
.002
.006
.07
.029
.033
.368
.008
.007
.99
.968
.0
--
--
.006
.002
.007
.009
.001
.97
.0
.0
.011
.993
.987
.051
.0
.001
.0
.092
.005
.042
.0
.0
.129
.0
.001
.0
.0
.001
.049
.932
.063
.106
.976
.927
.0
.005
.0
.0
.006
.001
.007
.073
.0
.002
.0
.0
.0
.001
.02
.576
.001
.237
.0
.001
.025
--
--
--
.227
.0
.068
.0
.002
.016
.001
.001
.001
.0
.002
.0
.074
.0
.002
.0
.006
.001
.0
.009
.001
.52
.0
.015
.0
--
--
.066
.004
.001
.003
.005
.001
.027
.145
.003
.002
.004
.002
.0
.001
.114
.008
.001
.021
.26
.028
.01
.0
.0
.002
.026
.002
.003
.035
.0
.005
.0
.0
.0
.001
.002
.001
.001
.0
.001
.006
.006
.001
.009
.004
.003
.002
.007
.201
.0
.001
.002
.007
.01
.91
.091
.091
.001
.001
.0
.002
.0
.003
.002
.011
.137
.027
.001
.01
.001
.002
.0
.0
.0
.047
.08
--
.09
.046
.001
.622
.19
.008
.002
.0
.0
.007
.002
.001
.004
.925
.904
.603
.011
.062
.269
.0
.001
.006
.016
.001
.001
.001
.002
.001
.003
.004
.002
.0
.0
.023
.017
.001
.998
.073
.0
.008
.0
.0
.001
.001
.011
.001
.007
.104
.163
--
.006
.001
.08
.059
.044
.015
.001
.064
.0
.002
.04
.041
.008
.009
--
.001
.987
.059
.794
.008
.002
.016
.011
.429
.4
.554
.0
.0
.355
.0
.005
.0
.008
.025
.002
.0
.0
.0
.939
.988
.012
.991
.0
.999
.998
.001
.022
.996
.915
.001
.001
.006
.019
.0
.029
.001
.054
.0
--
--
--
--
.053
.0
.061
.0
.003
.001
.005
.0
.669
.029
.0
.0
.001
.06
.017
.0
.0
.011
.0
.001
.053
.037
.108
.166
.006
.0
.0
.04
.007
.049
.084
.003
.129
.051
.001
.001
.003
.004
.262
.086
.003
.0
.002
.0
.003
.001
.02
.012
.048
.067
.0
.02
.048
.004
.004
.0
.001
.0
.384
.004
.0
.004
.006
.001
.0
.0
.003
.0
.0
.001
.003
.001
.005
.002
.0
.0
.003
.0
.004
.003
.003
.003
.0
.001
.003
.007
.006
--
--
--
--
--
.0
.028
.03
.852
.001
.0
.872
.0
.021
.177
1.0
1.0
.441
.86
.964
.001
.0
.067
.0
.999
.963
.983
.952
1.0
.64
.99
.816
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
Hs3st5
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
A
G
G
T
G
G
A
G
A
C
C
T
C
T
G
C
C
C
G
G
T
A
A
G
C
T
G
A
C
G
T
T
G
A
T
C
C
A
C
A
A
G
C
C
T
A
G
T
A
A
G
T
A
G
C
G
G
C
G
T
G
A
C
T
G
G
C
A
G
T
C
C
G
A
C
T
C
C
G
A
A
T
G
A
T
C
C
T
A
A
T
G
T
T
C
C
A
T
T
A
A
T
G
C
G
A
T
A
T
T
A
A
A
T
T
T
A
A
T
T
T
G
T
C
C
G
C
A
A
G
C
G
C
T
C
T
G
G
T
C
C
G
G
T
G
G
T
A
G
A
C
G
T
C
A
A
C
C
G
G
G
A
A
T
G
C
G
A
C
G
A
G
C
C
G
A
G
A
T
G
T
T
T
C
T
T
G
G
C
G
G
G
G
G
T
A
A
G
T
G
T
G
T
C
T
A
A
C
A
T
C
T
G
C
T
T
A
T
G
G
A
T
C
C
C
A
G
A
C
T
T
T
G
A
T
T
T
A
G
C
C
T
G
A
G
A
T
A
T
C
G
A
T
A
A
T
T
A
G
G
G
C
T
A
T
G
A
T
G
T
A
C
G
T
C
G
T
C
A
T
A
A
C
A
G
A
A
T
A
T
A
A
G
A
C
C
A
A
A
G
C
T
G
T
C
T
A
G
A
T
G
T
C
G
C
A
C
T
T
C
A
A
C
T
A
T
C
C
C
G
A
G
G
C
G
C
G
G
A
G
C
A
T
G
G
A
T
G
G
G
T
T
T
C
T
T
T
T
C
A
G
C
G
A
G
T
G
C
C
A
A
C
G
T
T
C
C
G
A
T
C
A
C
T
A
A
G
A
T
G
A
T
G
G
C
C
A
A
A
C
A
A
T
G
A
G
G
C
T
G
A
A
C
A
G
C
G
A
A
C
A
A
T
T
A
G
C
A
C
G
T
A
C
T
T
T
A
G
A
T
A
G
T
A
A
A
C
C
C
G
G
T
C
G
T
C
G
G
A
A
C
T
A
G
G
A
C
G
G
A
T
A
T
G
G
C
C
T
G
A
A
T
G
C
A
C
G
G
A
T
C
G
T
C
A
C
C
C
C
C
A
G
G
G
T
T
C
A
A
C
A
C
C
G
G
A
G
C
A
T
G
G
T
T
A
T
C
G
G
C
C
A
  40,236,703
  40,237,554
  40,237,644
  40,237,929
  40,237,938
  40,238,027
  40,238,159
  40,238,181
  40,238,703
  40,238,752
  40,238,754
  40,238,889
  40,238,939
  40,238,996
  40,239,030
  40,239,055
  40,239,321
  40,239,773
  40,240,003
  40,240,237
  40,240,375
  40,241,112
  40,241,260
  40,241,439
  40,241,452
  40,241,486
  40,241,711
  40,241,895
  40,243,590
  40,243,827
  40,243,935
  40,244,156
  40,244,432
  40,245,987
  40,246,933
  40,249,207
  40,249,447
  40,249,711
  40,250,053
  40,250,119
  40,250,771
  40,250,909
  40,251,240
  40,251,532
  40,251,883
  40,251,945
  40,252,519
  40,252,930
  40,253,709
  40,253,990
  40,254,002
  40,254,334
  40,254,792
  40,255,491
  40,255,570
  40,255,917
  40,257,385
  40,258,633
  40,260,156
  40,260,636
  40,261,187
  40,261,384
  40,261,739
  40,261,785
  40,262,048
  40,262,049
  40,262,062
  40,262,690
  40,262,962
  40,263,030
  40,263,033
  40,263,069
  40,263,153
  40,263,354
  40,263,416
  40,264,077
  40,265,717
  40,266,082
  40,266,723
  40,267,180
  40,267,829
  40,268,515
  40,268,575
  40,268,667
  40,269,611
  40,269,623
  40,269,776
  40,270,529
  40,270,927
  40,271,326
  40,272,060
  40,273,127
  40,273,205
  40,273,327
  40,273,633
  40,273,706
  40,273,833
  40,275,773
  40,275,844
  40,275,935
  40,275,944
  40,276,009
  40,276,040
  40,276,206
  40,276,303
  40,276,451
  40,276,509
  40,276,543
  40,276,563
  40,276,583
  40,277,111
  40,277,318
  40,277,412
  40,277,434
  40,277,971
  40,279,027
  40,279,128
  40,279,175
  40,279,462
  40,279,758
  40,279,848
  40,279,979
  40,280,016
  40,280,034
  40,280,200
  40,280,268
  40,280,715
  40,280,990
  40,281,145
  40,281,206
  40,281,817
  40,282,596
  40,282,942
  40,285,221
  40,285,707
  40,287,921
  40,288,747
  40,290,285
  40,290,823
  40,290,897
  40,291,800
  40,293,484
  40,294,236
  40,295,063
  40,295,113
  40,295,261
  40,295,394
  40,296,135
  40,296,938
  40,297,546
  40,297,561
  40,297,677
  40,303,094
  40,303,644
  40,303,787
  40,304,348
  40,304,369
  40,304,582
  40,304,997
  40,305,196
  40,305,210
  40,305,476
  40,305,921
  40,306,267
  40,306,692
  40,306,710
  40,306,974
  40,307,027
  40,307,321
  40,307,893
  40,308,268
  40,308,440
  40,308,597
  40,308,742
  40,308,744
  40,308,967
  40,309,169
  40,309,391
  40,309,447
  40,309,564
  40,309,636
  40,309,686
  40,309,840
  40,309,852
  40,309,965
  40,310,613
  40,310,689
  40,310,702
  40,310,792
  40,310,810
  40,311,140
  40,311,558
  40,312,090
  40,312,126
  40,312,526
  40,312,788
  40,313,061
  40,313,866
  40,314,717
  40,316,563
  40,318,067
  40,319,070
  40,319,750
  40,320,294
  40,320,501
  40,320,555
  40,320,724
  40,321,102
  40,321,631
  40,321,826
  40,322,087
  40,322,776
  40,323,110
  40,323,245
  40,324,347
  40,324,482
  40,325,022
  40,325,053
  40,325,279
  40,325,602
  40,325,622
  40,325,841
  40,326,607
  40,327,222
  40,327,406
  40,327,412
  40,327,648
  40,328,224
  40,328,964
  40,328,984
  40,329,021
  40,329,138
  40,329,187
  40,329,513
  40,329,591
  40,329,704
  40,329,874
  40,329,878
  40,329,882
  40,329,948
  40,329,985
  40,330,074
  40,330,202
  40,330,232
  40,330,261
  40,330,282
  40,330,284
  40,330,295
  40,330,312
  40,330,426
  40,330,464
  40,330,475
  40,330,487
  40,330,562
  40,330,593
  40,330,689
  40,330,831
  40,330,895
  40,330,907
  40,330,953
  40,330,956
  40,331,290
  40,331,404
  40,331,477
  40,331,486
  40,331,797
  40,331,806
  40,332,063
  40,332,088
  40,332,250
  40,332,282
  40,332,319
  40,332,661
  40,332,713
  40,332,756
  40,332,820
  40,332,860
  40,333,238
  40,333,452
  40,333,904
  40,334,369
  40,334,873
  40,334,967
  40,335,202
  40,335,818
  40,335,964
  40,336,219
  40,336,399
  40,336,496
  40,336,611
  40,336,844
  40,336,896
  40,336,921
  40,337,056
  40,337,607
  40,337,775
  40,337,786
  40,338,242
  40,338,294
  40,339,398
  40,342,611
  40,347,169
  40,347,605
  40,348,198
  40,348,263
  40,349,229
  40,349,356
  40,349,498
  40,351,325
  40,351,561
  40,353,230
  40,354,090
  40,354,177
  40,354,191
  40,354,224
  40,354,517
  40,354,525
  40,354,574
  40,356,362
  40,356,387
  40,356,879
  40,357,860
  40,364,573
  40,453,898
  40,478,635
  40,478,722
  40,478,723
  40,478,770
  40,479,446
  40,479,504
  40,480,026
  40,480,163
  40,480,200
  40,480,220
  40,480,319
  40,480,377
  40,480,499
  40,480,552
  40,480,783
  40,480,868
  40,481,533
  40,481,709
  40,481,846
  40,481,889
  40,481,890
  40,481,891
  40,483,016
  40,483,757
  40,483,981
  40,484,024
  40,484,461
  40,489,852
  40,492,028
  40,492,055
  40,492,577
  40,492,873
  40,494,164
  40,494,648
  40,495,182
  40,496,304
  40,496,333
  40,496,730
  40,496,917
  40,497,718
  40,497,829
  40,497,861
  40,497,974
  40,498,193
  40,498,343
  40,498,369
  40,498,691
  40,498,769
  40,498,824
  40,498,979
  40,499,371
  40,499,817
  40,499,837
  40,499,854
  40,499,890
  40,500,526
  40,500,841
  40,500,934
  40,501,103
  40,501,117
  40,501,329
  40,501,628
  40,501,773
  40,501,826
  40,501,851
  40,502,407
  40,502,804
  40,503,123
  40,504,017
  40,504,172
  40,504,739
  40,505,471
  40,505,473
  40,505,988
  40,506,284
  40,506,417
  40,506,767
  40,507,929
  40,507,986
  40,508,666
  40,508,722
  40,508,991
  40,509,205
  40,509,309
  40,509,320
  40,509,617
  40,511,503
  40,511,506
  40,511,509
  40,513,587
  40,514,964
  40,514,989
  40,515,616
  40,515,881
  40,516,690
  40,516,734
  40,516,852
  40,516,877
  40,516,930
  40,517,255
  40,517,407
  40,517,520
  40,517,742
  40,517,828
  40,518,143
  40,518,256
  40,518,265
  40,518,508
  40,518,524
  40,518,664
  40,518,793
  40,518,805
  40,519,168
  40,519,282
  40,519,423
  40,519,845
  40,520,703
  40,522,395
  40,522,682
  40,523,151
  40,523,205
  40,523,267
  40,523,412
  40,523,439
  40,523,488
  40,523,540
  40,523,570
  40,523,599
  40,523,656
  40,523,736
  40,523,976
  40,523,983
  40,524,052
  40,524,092
  40,524,098
  40,524,447
  40,526,748
  40,528,692
  40,529,250
  40,529,410
  40,529,577
  40,529,585
  40,530,142
  40,530,204
  40,530,488
  40,530,883
  40,531,068
  40,531,172
  40,531,229
  40,531,518
  40,531,625
  40,531,738
  40,531,906
  40,532,004
  40,532,055
  40,532,060
  40,532,078
  40,532,117
  40,532,131
  40,532,142
  40,532,162
  40,532,179
  40,532,180
  40,532,187
  40,532,244
  40,532,253
  40,532,282
  40,532,348
  40,532,371
  40,532,493
  40,532,525
  40,532,526
  40,532,584
  40,532,596
  40,532,642
  40,532,656
  40,532,707
  40,533,489
  40,533,505
  40,533,583
  40,533,689
  40,534,197
  40,535,086
  40,536,968
  40,537,288
  40,537,528
  40,537,595
  40,538,244
  40,538,601
  40,538,764
  40,539,284
  40,539,326
  40,539,530
  40,539,614
  40,539,860
  40,540,216
  40,540,244
  40,541,568
  40,542,498
  40,542,826
  40,543,319
  40,543,612
  40,543,729
  40,544,973
  40,545,139
  40,545,175
  40,545,244
  40,545,252
  40,545,291
A
C
C
A
C
T
A
G
A
G
T
T
G
T
C
C
G
T
T
A
A
C
G
G
A
T
C
T
T
T
A
C
C
A
T
G
T
A
C
T
G
G
A
G
G
C
G
A
C
G
T
T
C
T
A
T
A
A
T
A
A
A
C
T
C
A
A
G
G
A
C
T
T
A
G
G
C
T
T
A
T
G
C
T
G
C
T
T
C
G
G
A
C
C
C
T
T
G
C
G
G
G
C
C
A
T
T
G
G
C
C
G
C
T
C
C
C
T
G
C
A
C
A
C
A
T
A
A
G
G
A
T
A
A
C
G
A
A
T
G
T
T
T
A
A
A
T
A
G
T
T
G
A
G
A
C
G
T
A
C
C
A
G
G
G
A
T
A
T
G
A
C
C
T
T
T
C
C
G
C
A
C
C
C
T
C
C
T
A
G
A
T
A
A
T
G
G
T
A
C
A
C
A
A
T
A
T
G
T
G
C
T
C
A
A
C
A
T
C
T
C
G
C
T
G
A
C
A
G
A
C
A
C
A
C
C
C
C
G
T
T
T
G
A
T
A
T
C
G
A
T
A
G
C
G
G
A
C
C
A
A
A
T
G
G
C
A
G
A
A
A
C
T
T
A
T
A
A
T
G
C
G
G
T
G
A
G
C
C
G
A
T
G
C
G
T
T
G
G
T
A
G
G
C
C
T
C
G
C
G
G
T
G
G
A
G
G
T
A
G
T
G
C
T
C
T
A
A
T
T
T
G
C
A
T
A
T
A
A
G
A
T
C
C
A
C
G
G
A
A
A
C
C
A
T
C
C
C
C
G
G
A
T
T
G
A
C
A
T
T
G
T
T
A
C
C
T
T
A
G
C
G
G
A
A
G
G
A
T
C
A
G
C
A
A
T
T
G
T
G
G
G
G
C
A
G
T
A
T
C
G/A
A/G
A/G
T
G
A
A
A
G
G
A
G
G
C
A
G
A
T
G
A
A
C
G
A
C
G
C
T
A
G
C
G
A
A
G
G
G
T
A
T
A
C
A
T
C
C
G
A
A
G
T
T
A
G
C
A
G
G
T
A
T
C
G
A
A
A
T
G
G
A
G
G
C
A
G
T
G
A
A
C
C
T
A
G
T
G
T
T
T
A
T
G
A
C
A
C
C
G
G
G
T
T
T
T
T
A
G
A
T
G
C
A
A
C
G
G
C
T
T
A
A
A
G