Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 80,543 (bp)   Positions: 350
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
--
--
--
.047
.011
.018
.06
.098
.265
.082
.01
.994
.043
.005
.002
.007
--
--
--
.006
.001
.015
.023
.001
.106
.02
.0
.006
.004
.0
.012
.071
.206
--
--
--
--
.963
.408
.412
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.043
.289
.302
.006
.063
.084
.096
--
--
--
--
--
--
--
.021
.0
.968
.237
.197
.08
.223
.159
.017
.015
.109
.105
.042
.021
.054
.116
.013
.095
.041
.146
.002
--
--
--
--
.009
.004
.026
.722
1.0
.852
.989
1.0
1.0
1.0
.998
1.0
.995
1.0
1.0
1.0
.997
1.0
.988
.782
.574
.095
.101
.189
--
--
--
.001
.043
.309
.096
.157
.181
.835
.569
.208
.0
.009
.243
.087
.544
.139
.122
.01
.002
.0
.0
.041
.121
.031
.0
1.0
.022
.0
.003
.004
.006
.0
.003
.284
.37
.281
.562
.001
.029
.001
.006
.042
.159
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.006
.993
.0
.0
.001
.0
.035
.088
.019
.02
.01
.243
.245
.004
.001
.013
.945
.0
.001
.003
.244
.225
.186
.767
.009
.017
.0
.001
.421
.398
.005
.001
.001
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.005
.01
.307
.003
.049
.141
.01
.001
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.0
.339
.002
.012
.006
.001
.001
.002
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
Hibch
G
C
A
-
T
A
C
C
G
C
T
A
T
C
T
C
G
-
G
-
C
-
-
C
A
A
A
15
96
T
G
C
G
-
24
C
C
-
G
A
A
G
C
T
G
A
A
A
G
T
T
C
T
A
A
T
T
T
T
T
A
A
A
-
A
T
A
C
C
A
-
G
C
G
T
A
T
G
T
C
A
T
C
A
G
T
4
A
C
-
A
A
A
T
-
A
A
C
A
A
A
G
T
G
G
C
-
2
C
G
-
G
C
C
G
C
21
G
G
G
T
C
T
-
-
-
C
A
T
G
G
A
A
C
C
C
13
G
G
G
G
G
A
17
A
-
-
-
G
C
-
A
A
G
G
21
-
T
T
C
T
T
G
T
-
G
A
C
T
C
A
T
A
T
C
A
T
G
G
A
A
T
T
G
A
8
C
T
T
A
T
A
G
-
T
C
T
T
C
T
C
C
G
G
T
G
A
C
G
A
A
T
A
G
C
T
G
A
T
G
G
C
G
C
-
-
A
2
C
C
G
C
G
C
G
G
A
T
T
G
T
C
C
A
C
A
T
-
T
C
C
C
C
T
A
G
4
A
A
A
A
T
G
C
T
C
T
A
A
G
C
T
2
T
A
C
T
A
C
G
-
A
C
A
T
G
C
C
C
G
T
T
T
T
C
C
C
A
T
C
G
G
A
-
7
C
G
A
G
T
A
C
A
A
C
A
T
G
G
C
A
A
A
G
G
C
A
C
C
G
T
A
C
G
G
G
C
-
T
-
T
A
10
C
G
A
A
A
T
C
  53,466,110
  53,466,320
  53,466,403
  53,466,908
  53,467,011
  53,467,107
  53,468,067
  53,468,813
  53,468,831
  53,468,850
  53,469,421
  53,469,554
  53,470,797
  53,470,805
  53,470,978
  53,471,722
  53,473,169
  53,473,566
  53,473,779
  53,474,285
  53,474,339
  53,474,521
  53,474,523
  53,474,854
  53,475,641
  53,475,650
  53,476,334
  53,476,504
  53,476,522
  53,476,617
  53,476,783
  53,477,035
  53,477,119
  53,477,572
  53,477,733
  53,477,771
  53,477,795
  53,478,029
  53,478,199
  53,478,259
  53,478,666
  53,478,792
  53,478,921
  53,479,104
  53,479,968
  53,480,075
  53,480,171
  53,480,304
  53,480,423
  53,480,854
  53,480,856
  53,480,986
  53,480,987
  53,481,012
  53,481,013
  53,481,016
  53,481,018
  53,481,019
  53,481,053
  53,481,069
  53,481,091
  53,481,094
  53,481,248
  53,481,526
  53,481,790
  53,481,929
  53,481,967
  53,482,008
  53,482,148
  53,482,299
  53,482,412
  53,482,421
  53,482,519
  53,482,573
  53,482,681
  53,482,711
  53,482,928
  53,483,101
  53,483,207
  53,483,717
  53,483,898
  53,483,987
  53,484,289
  53,484,303
  53,484,487
  53,484,654
  53,484,698
  53,485,072
  53,485,262
  53,485,439
  53,485,596
  53,485,669
  53,485,744
  53,486,131
  53,486,149
  53,486,266
  53,486,411
  53,486,474
  53,486,490
  53,486,582
  53,486,662
  53,486,663
  53,486,755
  53,486,760
  53,486,842
  53,486,904
  53,486,912
  53,486,942
  53,487,060
  53,487,148
  53,487,186
  53,487,230
  53,487,300
  53,487,574
  53,487,722
  53,487,723
  53,487,732
  53,487,815
  53,488,073
  53,488,096
  53,488,104
  53,488,248
  53,488,367
  53,488,390
  53,488,451
  53,488,456
  53,488,460
  53,488,465
  53,488,498
  53,488,622
  53,488,734
  53,488,739
  53,488,751
  53,488,833
  53,488,849
  53,488,936
  53,489,046
  53,489,106
  53,489,131
  53,489,273
  53,489,348
  53,489,492
  53,489,516
  53,489,572
  53,489,596
  53,489,700
  53,489,786
  53,490,034
  53,490,218
  53,490,251
  53,490,438
  53,490,484
  53,490,521
  53,490,792
  53,490,835
  53,490,854
  53,490,977
  53,490,995
  53,491,090
  53,491,127
  53,491,345
  53,491,393
  53,491,462
  53,492,432
  53,492,475
  53,492,492
  53,492,695
  53,492,805
  53,492,948
  53,493,177
  53,493,236
  53,493,486
  53,493,487
  53,493,610
  53,493,614
  53,493,616
  53,493,683
  53,493,692
  53,493,869
  53,493,920
  53,494,009
  53,494,359
  53,494,633
  53,494,698
  53,494,900
  53,495,449
  53,496,001
  53,496,669
  53,497,178
  53,497,297
  53,497,370
  53,497,488
  53,497,523
  53,497,579
  53,497,602
  53,497,901
  53,497,910
  53,497,964
  53,498,122
  53,498,203
  53,498,235
  53,498,242
  53,498,252
  53,498,285
  53,498,287
  53,498,331
  53,498,615
  53,499,055
  53,499,080
  53,499,133
  53,499,253
  53,499,453
  53,499,925
  53,500,158
  53,500,228
  53,500,312
  53,500,342
  53,500,492
  53,500,495
  53,500,514
  53,500,518
  53,500,577
  53,501,022
  53,501,047
  53,501,115
  53,501,124
  53,501,352
  53,501,700
  53,502,322
  53,502,410
  53,502,631
  53,502,643
  53,503,421
  53,503,907
  53,503,922
  53,503,938
  53,504,284
  53,504,742
  53,504,748
  53,505,735
  53,507,705
  53,508,023
  53,508,026
  53,510,122
  53,510,779
  53,511,861
  53,511,989
  53,512,171
  53,512,340
  53,512,406
  53,512,535
  53,512,554
  53,512,601
  53,512,678
  53,512,875
  53,513,106
  53,513,129
  53,513,360
  53,513,782
  53,513,976
  53,514,481
  53,514,493
  53,514,854
  53,514,956
  53,516,289
  53,516,336
  53,516,651
  53,517,293
  53,517,851
  53,517,883
  53,517,981
  53,518,009
  53,518,038
  53,518,319
  53,518,349
  53,518,368
  53,518,410
  53,518,460
  53,518,511
  53,518,876
  53,518,958
  53,519,017
  53,519,053
  53,519,436
  53,519,443
  53,519,450
  53,519,592
  53,519,737
  53,519,773
  53,519,774
  53,519,776
  53,519,788
  53,519,833
  53,519,837
  53,520,233
  53,520,305
  53,520,316
  53,520,320
  53,520,540
  53,520,541
  53,520,663
  53,520,713
  53,521,108
  53,521,459
  53,521,519
  53,521,545
  53,521,863
  53,522,151
  53,522,173
  53,522,652
  53,522,782
  53,523,164
  53,523,308
  53,523,698
  53,523,793
  53,523,794
  53,523,827
  53,523,832
  53,523,835
  53,523,843
  53,523,847
  53,523,986
  53,523,995
  53,524,022
  53,524,133
  53,524,176
  53,524,216
  53,524,238
  53,524,277
  53,524,366
  53,524,464
  53,524,580
  53,524,684
  53,524,688
  53,524,852
  53,524,855
  53,524,860
  53,524,867
  53,524,927
  53,524,984
  53,525,045
  53,525,144
  53,525,281
  53,525,408
  53,525,513
  53,526,085
  53,526,272
  53,526,316
  53,526,327
  53,526,522
A
T
G
2
A
G
G
G
A
A
C
G
C
T
C
G
A
2
C
17
A
-/36
-/6
T
G
G
G
15/-
96/-
C
A
T
T
3
-
T
T
T
A
G
T
T
T
C
A
G
G
G
T
C
C
-
G
G
G
G
C
A
C
-
G
G
T
2
G
C
C
T
G
G
3
A
T
A
A
-
G
A
C
G
G
A
T
G
A
C
-
C
T
T
T
G
G
C
A
G
C
T
T
G
G
T
G
A
A
G
G
-
T
A
A
A
T
T
T
T
-
A
A
C
C
T
C
29
A
A
A
C
C
A
A
G
T
-
G
A
-
C
A
T
-
A
G
17/-
G
5
4
C
A
T
10
G
G
A
A
-
A
G
C
A
C
G
A
C
G
A
-
T
C
G
G
C
T
C
G
G
A
A
A
G
G
G
G
C
G
-
G
A
A
G
G
C
A
A
C
G
A
T/G
T
A
T
C/T
A
C
C
A
G
T
T
A/T
A/G
A
G
A
T
C
A
T
C
A
A
G
C
T
8
C
C
-
A
A
A
T
A
-
A
A
G
-
C
C
C
-
-
G
T
G
G
15
C
C/-
C/T
C/T
C/T
C
A/-
A
-
A/C
T
T
G
C
G/A
C/T
G
C/T
C
G
A/G
G/A
C/A
T/A
-
T/C
A/C
C/T
T/C
G
T
A
A
G
C/T
A/T
T/A
G/A
G
C/T
C/G
G/T
T/G
A
T/G
T/C
T
C/T
C/T
A/G
G
T
A
C
G
3
-
T
C
T
T
C
C
A
G
G
C/T
A/G
T/A
G/A
G/A
C/T
A/G
A/G
A/C
G/A
G/T
C/G
A/C
C/T
C/A
G/C
T/G
A/G
C/T
G/C
G/C
G/T
C/T
G
C
2
C
G
-
T
A
C
G
G
C
T