Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 89,354 (bp)   Positions: 245
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.57
.15
.037
.005
.006
.145
.417
--
.088
.097
.105
.097
.088
.971
1.0
.044
.002
.031
.042
.001
--
--
--
--
--
.027
.002
.002
.01
.045
.008
.006
.012
.0
.008
.001
.0
.054
.002
.002
.0
.001
.03
.0
.122
.083
.008
.021
.01
.002
.008
.009
.651
.015
.001
--
.074
.196
.0
.0
.004
.0
.0
.004
.816
.829
.94
.859
.963
.484
.574
.019
.001
.008
.001
.001
.0
.001
.076
.001
.002
.001
.0
.001
.222
.314
.364
.148
.084
.08
.005
.007
.001
.002
.003
.002
.0
.001
.001
.001
.005
.004
.118
.034
.011
.005
.174
.016
.797
.0
1.0
.576
.0
.017
--
--
--
--
.121
.018
.001
.002
.0
.001
.983
1.0
.999
.001
.01
.006
.251
.005
.009
.049
.015
.031
.001
.028
.115
.0
.036
.019
.015
.015
.017
.021
.001
.614
.001
--
--
.008
.0
.001
.01
.006
.0
1.0
.03
.003
.011
.0
.0
--
.001
.081
.002
.024
.0
.0
.001
.006
.001
.011
.011
.323
.003
.746
.001
.0
.065
.0
.507
.505
.059
.005
.0
.0
.025
.0
.0
.0
.001
.002
.0
.022
.481
.016
.002
.008
.005
.025
.003
.021
.004
.006
.038
.047
.04
.015
.022
.001
.053
.024
.033
.002
--
--
--
--
--
--
.002
.008
.019
.011
.022
.038
.004
.003
.037
.013
.001
.26
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.009
.002
.518
.086
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
4
G
A
2
-
G
A
G
G
G
2
-
T
A
A
G
G
G
T
108
G
T
2
A
-
-
G
C
3
C
-
T
T
C
T
A
T
T
C
G
A
A
A
C
-
C
T
T
T
A
G
A
C
C
2
G
G
C
G
-
-
C
C
G
G
-
-
C
-
C
C
-
-
C
C
C
C
C
C
-
-
G
C
C
C
C
C
C
C
3
-
C
T
C
2
-
2
-
A
G
A
C
C
5
C
G
G
A
T
G
G
C
C
G
2
T
T
A
T
C
C
C
C
T
T
C
T
T
G
-
C
T
C
C
T
T
G
G
G
T
7
T
T
T
T
T
T
A
T
T
A
C
A
76
C
-
C
-
-
-
2
T
A
C
C
C
C
G
G
A
C
A
2
G
2
-
T
G
C
-
A
C
G
C
A
A
C
-
A
T
T
C
T
C
A
-
-
A
T
3
-
-
C
G
G
A
2
C
3
4
T
A
T
-
2
T
T
G
G
-
G
G
A
A
A
-
C
C
G
-
G
A
T
C
-
A
C
C
A
A
A
A
T
C
  31,529,673
  31,529,898
  31,530,242
  31,531,879
  31,533,294
  31,533,631
  31,533,715
  31,537,378
  31,537,458
  31,537,461
  31,537,465
  31,537,483
  31,537,486
  31,537,825
  31,537,995
  31,538,949
  31,539,440
  31,539,522
  31,539,551
  31,540,296
  31,541,852
  31,541,991
  31,541,997
  31,542,013
  31,542,026
  31,542,090
  31,542,125
  31,543,240
  31,543,313
  31,544,767
  31,544,770
  31,544,775
  31,544,779
  31,545,053
  31,545,211
  31,546,140
  31,546,264
  31,546,306
  31,546,386
  31,546,587
  31,546,799
  31,547,187
  31,547,473
  31,547,589
  31,549,046
  31,549,090
  31,549,153
  31,549,691
  31,549,693
  31,549,695
  31,553,069
  31,553,527
  31,554,177
  31,554,504
  31,554,810
  31,555,063
  31,555,286
  31,555,358
  31,555,397
  31,555,398
  31,555,459
  31,555,484
  31,555,491
  31,555,492
  31,555,511
  31,555,512
  31,555,527
  31,555,539
  31,555,553
  31,555,559
  31,555,564
  31,555,608
  31,555,615
  31,555,628
  31,555,629
  31,555,631
  31,555,634
  31,555,637
  31,555,676
  31,555,685
  31,555,718
  31,555,765
  31,555,770
  31,555,774
  31,555,793
  31,555,795
  31,555,808
  31,555,812
  31,555,814
  31,555,842
  31,555,918
  31,555,926
  31,555,931
  31,555,953
  31,555,971
  31,556,036
  31,556,040
  31,556,126
  31,556,130
  31,556,198
  31,556,211
  31,556,217
  31,556,228
  31,556,243
  31,556,247
  31,556,255
  31,556,429
  31,557,496
  31,557,786
  31,559,423
  31,567,408
  31,567,516
  31,567,534
  31,567,835
  31,568,371
  31,568,373
  31,568,436
  31,568,442
  31,568,683
  31,569,307
  31,569,747
  31,569,848
  31,570,094
  31,572,138
  31,572,540
  31,572,553
  31,572,735
  31,572,933
  31,573,041
  31,573,197
  31,573,591
  31,573,881
  31,574,357
  31,574,533
  31,574,620
  31,575,581
  31,575,654
  31,575,896
  31,578,052
  31,578,325
  31,579,874
  31,579,878
  31,579,886
  31,579,888
  31,579,890
  31,579,892
  31,580,259
  31,580,873
  31,581,090
  31,582,508
  31,582,697
  31,583,498
  31,583,817
  31,583,932
  31,584,661
  31,585,014
  31,585,546
  31,586,833
  31,587,680
  31,587,697
  31,587,722
  31,587,728
  31,587,755
  31,588,587
  31,588,744
  31,589,640
  31,589,704
  31,590,972
  31,591,260
  31,591,493
  31,591,759
  31,592,164
  31,592,376
  31,592,612
  31,592,614
  31,594,070
  31,594,111
  31,594,221
  31,595,539
  31,595,676
  31,596,784
  31,602,079
  31,602,867
  31,602,868
  31,602,924
  31,603,834
  31,604,378
  31,604,757
  31,605,318
  31,605,713
  31,605,729
  31,605,838
  31,606,293
  31,606,514
  31,606,556
  31,606,837
  31,607,220
  31,607,454
  31,607,778
  31,608,118
  31,608,413
  31,608,422
  31,608,432
  31,609,599
  31,609,616
  31,609,619
  31,609,644
  31,609,646
  31,609,651
  31,609,655
  31,609,887
  31,609,902
  31,610,161
  31,610,223
  31,610,286
  31,610,303
  31,610,335
  31,610,339
  31,610,343
  31,610,353
  31,610,357
  31,610,365
  31,610,416
  31,610,571
  31,610,597
  31,610,601
  31,610,654
  31,610,672
  31,610,677
  31,610,788
  31,610,913
  31,611,186
  31,611,193
  31,611,950
  31,612,270
  31,612,341
  31,612,447
  31,612,634
  31,613,126
  31,613,313
  31,613,546
  31,613,599
  31,613,601
  31,614,211
  31,614,244
A
-
A
-
-
C
A
-
T
A
A
-
2
C
-
G
T
T
A
C
-
T
C
-
T
10
4
A
T
-
T
A
-
A
T
C
G
C
C
T
A
G
G
G
T
A
T
A
A
A
G
A
G
A
G
-
A
-
G
C
A
A
-
T
A
A
A
A
-
2
A
-
A
2
A
A
T
-
-
-
C
C
A
-
A
-
A
-
-
-
-
A
-
-
-
-
C
-
C
-
-
-
-
T
-
T
C
A
-
C
T
A
G
T
C
-
G
G
C
G
T
T
A
T
G
C
T
C
A
A
8
T
C
T
T
C
A
T
A
T
C
-
C
C
C
C
C
G
G
C
C
G
T
G
-
G
5
T
A
C
3
-
A
C
-
T
T
T
A
-
G
T
C
2/-
G/A
-
10
C
A
G
4
G
G
C
T
G
-
A
A
G
C
C
A
C
T
-
A
A
-
A
-
T
A
G
-
-
-
-
-
-
-
G
T
-
2
-
A
-
-
A
A
G/-
-
G
-
-
2
-
-
A
2
A
G
A
A
2
G
T
G
G
-
C
G
C
T