Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 89,354 (bp)   Positions: 268
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.15
.037
.0
.004
.005
.0
.006
.241
.002
.022
.088
.097
.105
.097
.088
.971
1.0
.01
.006
.001
.0
.007
.003
.223
.008
.002
--
.002
.0
.019
.045
.008
.006
.012
.0
.001
.001
.01
.054
.028
.002
.001
.035
.03
.0
.008
.0
.005
.0
.008
.436
.009
.651
.045
.001
--
.074
.196
.0
.0
.004
.0
.0
.004
.816
.829
.94
.859
.963
.484
.574
.019
.001
.008
.001
.001
.0
.001
.076
.001
.002
.001
.0
.001
.222
.314
.364
.148
.084
.08
.005
.007
.001
.002
.003
.002
.0
.002
.001
.003
.002
.006
.003
.001
.001
.009
.003
.004
.007
.001
.006
.007
.027
.017
.002
.002
.012
.033
.028
.002
.002
.003
.004
.007
.125
.797
.201
.733
.002
.0
.877
.0
.002
.012
.0
1.0
.015
.001
.009
.011
.576
.0
.017
.004
--
--
--
--
--
.121
.001
.018
.001
.0
.024
.018
.01
.194
.009
.049
.015
.028
.001
.119
.029
.001
.005
.0
.001
.007
.024
.001
.0
.543
.025
.001
.05
.16
.014
.005
.383
.001
.001
.001
.003
--
.002
.001
.0
.306
.03
.003
.011
.0
.0
--
.008
.001
.972
.323
.003
.997
.0
.507
.505
.059
.005
.0
.0
.025
.0
.0
.0
.001
.002
.0
.022
.481
.016
.002
.008
.005
.025
.003
.04
.051
.021
.004
.006
.038
.047
.04
.015
.022
.001
.053
.024
.033
.002
--
--
--
--
--
--
.002
.008
.019
.011
.022
.038
.004
.003
.037
.013
.001
.26
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.009
.002
.086
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
Hhip
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
4
G
C
G
A
C
2
-
C
T
G
G
G
2
-
T
A
15
-
T
T
C
-
-
T
-
-
-
A
C
3
C
-
T
T
T
T
T
T
C
T
A
-
A
A
C
C
A
T
A
-
G
A
A
C
2
G
G
C
G
-
-
C
C
G
G
-
-
C
-
C
C
-
-
C
C
C
C
C
C
-
-
G
C
C
C
C
C
C
C
3
-
C
T
C
2
-
-
-
-
A
-
3
-
C
G
-
-
G
G
C
A
C
A
-
A
-
-
-
T
C
-
A
G
A
A
T
T
G
T
C
C
A
A
A
G
A
G
A
T
G
C
C
T
2
A
G
2
T
A
G
T
C
C
-
4
C
8
T
C
C
G
G
-
A
4
G
C
C
C
G
G
G
A
C
A
-
-
T
T
C
T
A
T
T
T
G
C
-
T
-
-
-
2
T
2
5
G
G
2
-
C
A
C
G
C
A
A
C
-
A
T
T
C
T
C
A
-
-
A
T
3
-
-
A
T
C
G
G
A
2
C
3
4
T
A
T
-
2
T
T
G
G
-
G
G
A
A
A
-
C
C
G
-
G
A
T
C
-
A
C
C
A
T
A
A
A
C
  31,529,898
  31,530,242
  31,531,218
  31,531,832
  31,531,879
  31,533,008
  31,533,294
  31,534,301
  31,535,292
  31,537,244
  31,537,458
  31,537,461
  31,537,465
  31,537,483
  31,537,486
  31,537,825
  31,537,995
  31,539,634
  31,539,690
  31,540,296
  31,540,802
  31,540,997
  31,541,093
  31,541,279
  31,541,317
  31,541,428
  31,542,083
  31,542,101
  31,542,132
  31,542,641
  31,544,767
  31,544,770
  31,544,775
  31,544,779
  31,545,053
  31,546,033
  31,546,140
  31,546,173
  31,546,306
  31,546,308
  31,546,386
  31,547,187
  31,547,402
  31,547,473
  31,547,589
  31,549,153
  31,549,921
  31,550,062
  31,552,267
  31,553,069
  31,553,122
  31,553,527
  31,554,177
  31,554,564
  31,554,810
  31,555,063
  31,555,286
  31,555,358
  31,555,397
  31,555,398
  31,555,459
  31,555,484
  31,555,491
  31,555,492
  31,555,511
  31,555,512
  31,555,527
  31,555,539
  31,555,553
  31,555,559
  31,555,564
  31,555,608
  31,555,615
  31,555,628
  31,555,629
  31,555,631
  31,555,634
  31,555,637
  31,555,676
  31,555,685
  31,555,718
  31,555,765
  31,555,770
  31,555,774
  31,555,793
  31,555,795
  31,555,808
  31,555,812
  31,555,814
  31,555,842
  31,555,918
  31,555,926
  31,555,931
  31,555,953
  31,555,971
  31,556,036
  31,556,040
  31,556,723
  31,557,531
  31,557,542
  31,557,543
  31,557,548
  31,557,564
  31,557,569
  31,557,581
  31,557,591
  31,557,599
  31,557,603
  31,557,611
  31,557,616
  31,557,625
  31,557,626
  31,557,634
  31,557,652
  31,557,659
  31,557,670
  31,557,681
  31,557,691
  31,557,697
  31,557,721
  31,557,722
  31,557,727
  31,557,734
  31,557,736
  31,557,761
  31,557,786
  31,558,003
  31,558,189
  31,558,870
  31,559,423
  31,559,671
  31,562,258
  31,562,344
  31,562,552
  31,562,875
  31,564,210
  31,565,997
  31,566,641
  31,566,785
  31,566,786
  31,567,516
  31,567,534
  31,567,835
  31,568,142
  31,568,358
  31,568,363
  31,568,371
  31,568,373
  31,568,436
  31,568,683
  31,568,841
  31,569,307
  31,569,747
  31,570,094
  31,570,217
  31,570,267
  31,573,148
  31,573,579
  31,574,357
  31,574,533
  31,574,620
  31,575,896
  31,576,460
  31,576,741
  31,576,823
  31,576,900
  31,577,271
  31,577,437
  31,577,505
  31,577,709
  31,577,805
  31,578,197
  31,578,325
  31,579,054
  31,579,213
  31,579,280
  31,579,538
  31,579,683
  31,579,743
  31,579,916
  31,580,014
  31,580,259
  31,581,090
  31,581,301
  31,581,473
  31,582,508
  31,583,331
  31,583,463
  31,585,546
  31,587,331
  31,587,680
  31,587,697
  31,587,722
  31,587,728
  31,587,755
  31,588,674
  31,590,637
  31,590,936
  31,593,282
  31,594,070
  31,594,111
  31,601,041
  31,602,079
  31,602,867
  31,602,868
  31,602,924
  31,603,834
  31,604,378
  31,604,757
  31,605,318
  31,605,713
  31,605,729
  31,605,838
  31,606,293
  31,606,514
  31,606,556
  31,606,837
  31,607,220
  31,607,454
  31,607,778
  31,608,118
  31,608,413
  31,608,422
  31,608,432
  31,609,580
  31,609,584
  31,609,599
  31,609,616
  31,609,619
  31,609,644
  31,609,646
  31,609,651
  31,609,655
  31,609,887
  31,609,902
  31,610,161
  31,610,223
  31,610,286
  31,610,303
  31,610,335
  31,610,339
  31,610,343
  31,610,353
  31,610,357
  31,610,365
  31,610,416
  31,610,571
  31,610,597
  31,610,601
  31,610,654
  31,610,672
  31,610,677
  31,610,788
  31,610,913
  31,611,186
  31,611,193
  31,611,950
  31,612,270
  31,612,341
  31,612,447
  31,612,634
  31,613,126
  31,613,313
  31,613,512
  31,613,546
  31,613,599
  31,613,601
  31,614,244
-
A
T
A
-
T
-
T
T
C
T
A
A
-
2
C
-
-
-/A
C
C
T
2
T
C
2
4
2
T
T
-
T
A
-
A
C
C
C
C
G
C
G
T
G
G
T
T
C
A
G
2
A
G
G
G
-
A
-
G
C
A
A
-
T
A
A
A
A
-
2
A
-
A
2
A
A
T
-
-
-
C
C
A
-
A
-
A
-
-
-
-
A
-
-
-
-
C
4
G
2
G
2
-
A
-
A
G
C
-
C
A
C
-
-
T
-
A
A
G
C
T
G
-
-
G
-
C
A
A
C
T
A
G
G
G
A
G
A
-
C
A
G
T
C
-
G
C
-
G
C
A
G
T
A
8
-
G
-
C
T
T
T
A
TT/T
-
-
A
T
T
T
A
A
T
C
-
T
9
4
C
C
-
C
G
G
A
C
A
T
5
C
A
C
3
-
A
-
-
T
A
-
10
T
G
G
C
T
G
-
A
A
G
C
C
A
C
T
-
A
A
-
A
-
T
A
-
-
G
-
-
-
-
-
-
-
G
T
-
2
-
A
-
-
A
A
-
-
G
-
-
2
-
-
A
2
A
G
A
A
2
G
T
G
G
C
-
C
G
T