Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 200,755 (bp)   Positions: 343
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.001
.001
.01
.04
.001
.003
.038
--
.272
.004
.042
.364
.004
.002
.0
.006
.006
.017
.014
.185
.0
.848
.002
.096
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.118
.067
.08
.007
.01
.017
.003
.006
.002
.032
.046
.095
.014
.016
.001
.004
.015
.201
.206
.066
.0
.049
.001
.03
1.0
.227
.0
.007
.006
.005
--
.002
.0
.039
.012
.003
.001
.001
.0
.0
.0
.003
.016
.003
.0
.0
.007
.005
.002
.025
.03
.997
--
--
--
--
--
--
--
.063
.002
.995
.001
.001
.0
.003
.063
.078
.067
.021
.018
.01
.008
.002
.008
.011
.0
.043
.0
.001
.0
.967
.018
.0
.031
.113
.027
.03
.095
.053
.003
.215
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.028
.109
.003
.001
.0
.001
.006
.03
--
--
.497
.004
.0
.133
.003
.992
.008
.369
.998
.216
.053
.015
.001
.085
.0
.771
.0
.0
.999
.003
.019
.512
.0
.024
.001
.002
.001
.001
.006
.709
.001
.021
.002
.004
.001
.004
.015
.044
.001
.0
.003
.002
.096
.513
.002
.015
.005
.004
.012
.186
--
--
--
.002
.281
.0
.004
.053
.001
.039
.628
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.536
.834
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.008
.105
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.001
.029
.082
.0
.997
.997
.013
.003
.011
.001
.0
.002
.003
.037
.016
.046
.468
.0
.713
.006
--
.002
.0
.0
.004
.002
.058
.005
.019
.002
.002
.997
.005
.014
.003
.003
.078
--
.014
.142
.053
.058
.051
.024
.0
.0
.0
.0
.036
.0
.99
.917
.878
.0
.025
.0
.003
.0
.0
.0
.0
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
Herc2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
G
G
C
G
A
G
A
C
G
T
C
T
G
-
G
G
T
C
C
C
C
C
G
-
-
-
-
A
-
-
A
-
-
T
-
G
-
A
G
A
T
T
T
T
C
G
2
G
G
2
2
3
G
G
G
T
T
G
T
T
A
T
-
C
C
T
G
T
G
A
-
G
A
A
A
T
G
G
A
T
G
A
-
T
-
G
C
A
G
C
A
G
A
T
C
G
C
T
G
A
A
A
A
G
G
A
G
A
C
G
G
G
C
C
-
T
A
T
C
C
G
3
T
A
A
A
T
T
C
C
C
A
A
C
T
T
T
G
T
G
A
T
C
-
C
G
G
G
G
T
A
G
A
-
A
-
C
116
A
T
G
T
G
-
T
-
A
T
C
C
C
T
G
T
T
C
-
-
T
T
T
T
G
A
T
4
A
A
A
A
A
T
T
3
8
G
2
3
A
C
A
C
C
A
G
-
A
A
A
10
T
G
A
T
C
G
5
G
G
T
C
A
A
T
T
G
C
T
G
C
G
A
C
T
T
C
T
T
T
T
C
G
C
G
T
G
G
A
C
A
A
A
G
7
G
T
A
C
G
A
A
G
A
A
C
T
T
G
T
G
C
A
A
-
2
T
T
-
-
T
T
G
C
C
C
T
T
G
2
15
A
-
-
-
-
A
-
-
C
C
A
C
C
A
A
G
-
A
G
T
-
T
A
A
A
A
C
A
4
A
T
G
A
2
T
A
-
16
T
C
T
A
G
A
A
T
A
T
T
C
A
  114,454,995
  114,455,433
  114,456,604
  114,457,369
  114,457,515
  114,457,709
  114,458,090
  114,459,018
  114,460,218
  114,460,398
  114,461,213
  114,461,819
  114,465,851
  114,465,852
  114,470,511
  114,470,931
  114,471,452
  114,471,935
  114,472,585
  114,472,991
  114,475,010
  114,475,350
  114,476,891
  114,477,233
  114,479,219
  114,479,989
  114,480,012
  114,480,033
  114,480,041
  114,480,047
  114,480,060
  114,480,112
  114,480,152
  114,480,429
  114,480,448
  114,480,455
  114,480,470
  114,480,559
  114,480,573
  114,480,578
  114,480,614
  114,480,661
  114,480,668
  114,480,679
  114,480,684
  114,480,686
  114,480,697
  114,480,700
  114,480,711
  114,480,736
  114,480,737
  114,480,747
  114,480,789
  114,481,059
  114,482,283
  114,482,285
  114,482,556
  114,484,579
  114,484,847
  114,485,088
  114,485,232
  114,485,437
  114,486,596
  114,486,910
  114,488,218
  114,488,227
  114,488,231
  114,491,809
  114,492,922
  114,493,567
  114,493,760
  114,496,427
  114,497,386
  114,498,183
  114,498,257
  114,498,828
  114,499,136
  114,499,142
  114,500,022
  114,500,182
  114,501,306
  114,501,794
  114,501,832
  114,501,853
  114,501,856
  114,502,111
  114,502,154
  114,502,329
  114,502,906
  114,503,996
  114,504,041
  114,504,060
  114,504,162
  114,504,168
  114,504,344
  114,504,625
  114,505,064
  114,506,572
  114,506,909
  114,507,736
  114,507,761
  114,507,812
  114,508,897
  114,508,912
  114,508,917
  114,508,919
  114,508,926
  114,508,927
  114,508,929
  114,509,169
  114,509,736
  114,510,366
  114,510,439
  114,510,565
  114,511,122
  114,512,066
  114,512,086
  114,512,614
  114,512,992
  114,513,328
  114,513,894
  114,515,339
  114,515,385
  114,515,782
  114,516,634
  114,516,684
  114,517,273
  114,517,519
  114,518,079
  114,519,218
  114,519,837
  114,522,018
  114,522,074
  114,522,127
  114,522,143
  114,522,276
  114,522,575
  114,523,054
  114,523,068
  114,523,085
  114,524,163
  114,524,384
  114,524,765
  114,525,154
  114,526,052
  114,526,110
  114,526,201
  114,526,353
  114,528,185
  114,531,181
  114,532,287
  114,532,300
  114,533,515
  114,533,617
  114,535,004
  114,537,035
  114,537,316
  114,537,445
  114,537,641
  114,537,781
  114,538,093
  114,539,339
  114,540,392
  114,541,119
  114,541,994
  114,542,524
  114,544,142
  114,545,337
  114,547,091
  114,547,524
  114,547,986
  114,548,885
  114,550,875
  114,551,541
  114,552,931
  114,553,273
  114,554,303
  114,554,805
  114,555,547
  114,555,550
  114,555,553
  114,555,557
  114,555,561
  114,557,552
  114,558,276
  114,559,290
  114,559,835
  114,560,639
  114,560,650
  114,560,656
  114,560,662
  114,560,674
  114,563,122
  114,564,601
  114,566,770
  114,566,772
  114,567,710
  114,568,034
  114,569,591
  114,569,658
  114,570,702
  114,571,649
  114,573,908
  114,574,768
  114,574,994
  114,576,234
  114,576,997
  114,578,831
  114,579,440
  114,580,858
  114,581,978
  114,582,038
  114,582,678
  114,582,895
  114,583,336
  114,583,716
  114,586,154
  114,586,520
  114,587,761
  114,587,998
  114,588,934
  114,589,273
  114,589,289
  114,589,309
  114,589,339
  114,589,348
  114,589,750
  114,589,753
  114,589,844
  114,589,859
  114,589,891
  114,589,958
  114,589,992
  114,590,629
  114,590,687
  114,590,947
  114,591,028
  114,591,330
  114,591,376
  114,591,686
  114,591,975
  114,592,004
  114,592,057
  114,592,219
  114,594,313
  114,594,368
  114,596,479
  114,596,917
  114,597,287
  114,598,197
  114,599,943
  114,599,948
  114,600,008
  114,600,079
  114,600,266
  114,600,357
  114,600,379
  114,606,034
  114,606,212
  114,606,498
  114,606,505
  114,606,507
  114,606,514
  114,606,526
  114,606,535
  114,606,849
  114,606,882
  114,607,385
  114,607,516
  114,607,521
  114,607,697
  114,607,760
  114,608,032
  114,608,926
  114,609,323
  114,610,312
  114,610,313
  114,611,058
  114,611,066
  114,611,830
  114,611,837
  114,612,189
  114,613,100
  114,613,374
  114,613,878
  114,614,225
  114,614,654
  114,614,665
  114,614,988
  114,615,109
  114,615,112
  114,615,165
  114,615,213
  114,615,240
  114,615,246
  114,615,259
  114,615,264
  114,615,268
  114,615,280
  114,615,302
  114,615,599
  114,615,848
  114,616,186
  114,617,540
  114,617,675
  114,617,678
  114,617,895
  114,618,865
  114,618,925
  114,621,580
  114,622,867
  114,624,870
  114,625,700
  114,627,457
  114,630,247
  114,630,810
  114,631,236
  114,631,389
  114,631,703
  114,632,536
  114,633,614
  114,633,665
  114,633,804
  114,633,818
  114,633,867
  114,634,481
  114,635,369
  114,635,806
  114,635,933
  114,637,086
  114,637,726
  114,637,805
  114,637,917
  114,638,458
  114,638,893
  114,644,928
  114,647,325
  114,647,700
  114,647,711
  114,649,702
  114,652,308
  114,652,311
  114,652,539
A
G
A
A
G
T
G
A
-
T
A
C
A
A
C
3
A
T
G
T
G
G
G
T
A
C
C
G
A
-
G
G
C
A
G
-
G
-
T
-
-
-
-
G
-
-
-
-
-
-
A
-
2/-
-
C
C
C
C
C
T
C
C
G
C
2
G
G
T/-
A
C
A
G
T
A
G
G
G
C
A
A
T
-
T
T
T
A
-/A
A
T
A/G
G/A
C/T
A/G
G/C
A/G
T/C
A
A
T
C
T
G
C
T
A/T
G/T
G/T
A/T
G/T
-
T
C
A
T
T
A
A
C
C
C
G
A
A
-
-
G
G
G
C
C
C/A
T
T
G
G
G
G
T/C
T/C
G/T
G
C
A/G
C
T
3
G
C
A
A
T
C
G
C
G
G
G
G/G
G
-
G
G
A
-
T
2
C
A
C
C
T
T
T
C
C
T/C
C
A
G
G
G
G
G
G
A
G
C
-
G
G
G
T
G
C
-
-
-
A
-
-
G
T
G
-
G
G
T
A
T
G
T
-
C
C
C
C
T
C
-
A
A
C
T
G
G
C
A
C
T
G
T
T
A
G
T
G
G
A
G
C
C
G
A
A
G
G/A
A
A
T
T
T
C
C
G
A
-
-
C
A/C
C/T
G/C
A/G
A/G
G/T
A/G
C
G
C
A
A
G
A
A
G
G
2
-
C
C
T
A
C
G
A
A
T
T
C
C
T
-
-
-
T
A
C
C
-
G
C
T
T
-
T
-
T
G
A
2
G
A
C
2
C
G
G
G
G
T
-
-
G
C
A
G
-
-
G
5
-
G
T
G
G
C
G
-
A
G
A
C
T
G