Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 491,851 (bp)   Positions: 553
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.011
.01
.001
.001
.002
.001
.002
.001
.007
.001
.012
.004
.0
.005
.028
.014
.01
.017
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.003
.004
.003
.008
.013
.016
.054
.025
.008
.04
.094
.012
.007
.007
.002
.002
.015
.025
.037
.037
.039
.036
.002
.004
.004
.003
.002
.001
.002
.009
.046
.057
.011
.008
.003
.003
.001
.01
.212
.012
.592
.247
.206
.079
.063
.046
.017
.008
.011
.012
.007
.006
.001
.002
.004
.01
.005
.003
.027
.033
.029
.011
.019
.011
.008
.018
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.004
.001
.0
.0
.026
.0
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.012
.004
.105
.128
.034
.038
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.026
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.152
.133
--
--
--
--
.001
.075
.105
--
--
--
--
--
--
--
.047
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
Gucy1a2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
C
T
A
-
A
-
G
-
2
-
-
G
-
-
-
-
C
G
-
-
-
C
-
G
A
-
T
A
T
G
G
G
G
T
A
C
A
G
T
C
A
C
A
A
-
2
A
T
T
C
C
G
C
C
G
2
C
G
C
G
A
G
T
2
G
A
G
G
A
T
G
C
G
G
-
T
C
T
T
C
C
2
-
-
T
T
-
-
C
-
5
-
2
C
G
T
G
G
2
T
-
-
-
G
-
-
-
-
T
G
A
-
-
-
C
G
G
-
T
T
G
G
A
A
T
-
-
-
T
2
-
C
C
4
2
C
T
-
T
A
-
G
-
-
C
G
C
C
-
G
T
G
G
-
-
A
T
C
G
G
G
C
G
C
T
G
-
-
-
-
-
C
G
-
-
T
C
T
-
T
A
G
G
-
-
-
-
A
T
G
G
-
A
G
-
-
6
T
-
T
A
G
C
-
2
-
G
T
3
C
C
A
-
T
C
2
-
-
-
3
A
T
G
A
-
T
C
T
C
5
A
C
C
2
C
A
C
T
C
-
-
-
-
A
G
G
-
C
2
-
C
C
G
G
G
-
C
-
T
-
2
C
C
C
C
C
C
C
-
G
-
-
-
2
T
-
G
T
T
T
T
C
C
T
-
C
G
2
G
G
G
G
T
A
G
G
T
G
C
G
A
C
T
A
G
-
2
G
C
G
2
G
2
G
C
-
C
2
A
T
G
-
-
G
T
A
T
G
2
C
C
2
A
G
G
C
A
-
C
-
2
2
-
C
-
C
G
2
2
G
-
2
-
-
T
-
A
2
T
A
T
2
-
-
-
2
-
C
-
C
-
-
-
T
-
-
2
C
-
G
-
T
C
-
-
C
-
A
A
C
C
2
T
4
C
-
A
C
A
A
-
G
C
G
-
-
-
G
-
-
-
C
-
-
-
2
-
-
C
A
C
G
A
A
-
-
T
A
-
-
-
-
-
-
A
T
A
2
-
A
-
C
G
G
G
A
T
T
G
C
T
C
C
T
G
G
G
C
T
T
A
-
2
T
A
-
C
T
G
3
G
A
2
A
C
A
T
A
G
G
8
-
A
A
A
-
A
2
C
A
T
C
A
-
2
2
7
C
G
A
T
A
C
C
G
G
A
2
-
-
C
2
T
A
-
10
G
6
-
2
T
A
G
G
C
T
T
T
T
T
-
G
G
A
T
G
C
G
T
C
G
T
A
C
G
-
C
G
C
A
T
C
  417,376
  417,411
  417,454
  417,466
  417,483
  417,490
  417,499
  417,528
  417,554
  417,626
  417,699
  417,740
  417,770
  417,774
  417,806
  417,823
  417,867
  417,936
  417,944
  417,946
  417,969
  418,060
  418,089
  418,097
  418,106
  418,107
  418,120
  418,126
  418,127
  418,142
  418,143
  418,153
  418,160
  418,167
  418,170
  418,177
  418,194
  418,431
  418,432
  418,434
  418,445
  418,455
  418,457
  418,458
  418,486
  418,489
  418,491
  418,496
  418,534
  434,151
  434,760
  449,151
  452,388
  461,978
  461,985
  461,994
  462,002
  462,006
  462,010
  462,019
  462,021
  462,088
  462,095
  462,096
  462,103
  462,108
  462,111
  462,128
  462,148
  462,151
  462,152
  462,167
  462,177
  462,181
  462,184
  462,202
  462,209
  462,212
  462,221
  470,034
  470,042
  470,046
  470,108
  470,266
  470,313
  470,317
  470,319
  470,331
  470,350
  470,373
  470,459
  470,512
  470,525
  470,532
  470,548
  490,353
  490,357
  490,369
  490,376
  490,379
  490,386
  490,391
  490,394
  490,407
  490,413
  490,456
  490,461
  490,464
  490,476
  490,485
  490,493
  490,494
  490,501
  490,516
  490,522
  490,525
  490,527
  490,531
  490,538
  490,539
  490,542
  490,547
  490,555
  490,560
  490,564
  490,566
  490,578
  490,586
  490,591
  490,883
  490,890
  490,896
  490,899
  490,902
  490,904
  490,910
  490,921
  490,937
  490,942
  490,945
  490,949
  490,987
  491,380
  491,392
  491,400
  491,402
  491,409
  491,412
  491,420
  491,422
  491,442
  491,452
  491,470
  491,476
  491,488
  491,493
  491,497
  491,508
  491,510
  491,513
  491,519
  491,538
  491,543
  491,544
  491,546
  491,549
  491,554
  491,557
  491,570
  491,607
  491,639
  491,667
  491,670
  491,683
  491,686
  491,689
  491,695
  491,710
  491,711
  491,727
  491,732
  491,733
  491,739
  491,743
  491,753
  491,759
  491,764
  491,778
  491,789
  491,790
  491,797
  491,801
  491,805
  491,808
  491,817
  491,836
  497,414
  497,422
  497,453
  497,476
  497,496
  497,500
  497,505
  497,507
  497,526
  503,869
  503,878
  503,882
  503,906
  503,916
  503,923
  503,939
  503,942
  503,952
  503,962
  503,985
  503,992
  503,997
  504,022
  506,022
  506,027
  506,038
  506,045
  506,047
  506,057
  508,890
  508,907
  508,910
  508,913
  508,914
  508,921
  508,943
  508,944
  508,956
  520,281
  520,288
  520,297
  520,304
  520,306
  520,320
  520,336
  520,342
  520,344
  520,356
  520,365
  520,388
  520,395
  520,414
  524,582
  524,594
  524,603
  524,605
  524,608
  524,609
  524,617
  524,632
  524,645
  524,648
  524,659
  524,664
  524,670
  524,686
  524,721
  524,724
  524,734
  524,750
  524,790
  524,798
  524,804
  526,436
  526,445
  526,458
  526,489
  526,519
  526,536
  526,552
  526,592
  526,605
  526,611
  526,623
  526,647
  526,656
  526,661
  526,672
  526,673
  526,688
  527,374
  527,381
  527,390
  527,396
  527,397
  527,398
  527,406
  527,407
  527,409
  527,412
  527,417
  527,420
  527,451
  527,461
  527,474
  527,476
  527,487
  527,518
  527,523
  527,539
  527,557
  527,559
  527,562
  527,576
  527,581
  527,584
  527,594
  527,596
  527,602
  527,604
  527,608
  527,609
  527,616
  527,621
  527,633
  527,643
  527,646
  527,654
  527,664
  527,678
  527,682
  527,706
  527,713
  527,721
  527,728
  527,740
  527,744
  527,747
  527,749
  527,752
  527,764
  527,769
  528,437
  528,455
  528,461
  528,464
  528,494
  528,504
  528,510
  528,514
  528,517
  534,884
  534,886
  535,234
  535,239
  535,244
  535,248
  633,455
  633,469
  633,492
  633,517
  633,526
  633,529
  633,565
  633,577
  633,583
  633,597
  633,614
  633,615
  634,774
  634,778
  634,792
  634,814
  634,816
  634,817
  634,831
  634,835
  634,883
  634,906
  634,910
  634,933
  634,994
  634,998
  635,001
  635,004
  635,012
  635,038
  635,074
  635,077
  635,088
  635,182
  635,185
  635,225
  635,235
  635,276
  635,290
  635,371
  642,578
  642,581
  644,499
  644,525
  644,535
  644,556
  644,559
  644,587
  644,624
  644,643
  644,703
  644,759
  644,761
  644,767
  644,771
  644,781
  644,793
  644,800
  644,805
  644,811
  644,832
  644,837
  644,840
  644,867
  644,890
  644,898
  644,904
  644,928
  644,929
  644,962
  644,963
  644,977
  645,005
  645,013
  645,015
  645,018
  645,033
  645,037
  645,039
  645,048
  645,063
  645,067
  645,072
  645,073
  645,083
  645,090
  645,093
  645,098
  645,106
  645,127
  645,139
  645,142
  645,148
  645,152
  645,154
  645,157
  645,196
  645,216
  645,217
  645,240
  645,247
  645,287
  645,301
  645,325
  645,339
  645,351
  645,360
  645,402
  645,456
  645,473
  645,485
  645,543
  645,544
  645,548
  645,553
  645,567
  645,579
  645,581
  645,601
  645,618
  645,633
  645,639
  645,643
  645,659
  645,709
  645,785
  645,800
  645,805
  647,981
  647,995
  647,999
  649,341
  649,365
  649,439
  649,451
  649,490
  649,510
  649,537
  649,659
  649,672
  649,684
  649,700
  649,742
  649,781
  649,785
  655,145
  655,149
  655,166
  655,178
  655,190
  655,192
  655,194
  655,214
  655,239
  655,246
  655,252
  655,270
  655,301
  655,334
  655,340
  655,345
  655,412
  655,415
  655,426
  656,304
  656,334
  659,522
  674,209
  674,597
  710,440
  729,658
  730,013
  734,058
  734,067
  734,988
  734,989
  734,990
  734,994
  734,999
  747,918
  748,011
  788,667
  788,676
  802,200
  802,268
  817,023
  817,039
  817,044
  817,050
  855,361
  860,993
  860,995
  861,377
  861,391
  861,441
  861,905
  862,047
  864,485
  864,525
  874,275
-
-
-
-
G
-
A
A
T
-
A
C
-
2
T
T
T
T
A
T
G
A
-
T
A
T
T
A
T
C
T
-
-
-
-
-
-
G
A
C
T
G
T
T
G
2
-
C
-
-
-
T
G/A
C/T
C/G
G/A
2/-
C/G
G/C
C/-
G/A
A/G
G/A
T/C
2/-
G/A
A/G
G/T
G/A
A/C
T/G
G/C
C/T
G/T
G/C
T
G
T
C
-
T
-
-
G
G
-
G
G
C
-
C
-
G
-
-
T
-
C
-
-
-
G
T
2
A
C
C
T
2
-
A
C
A
A
4
-
T
T
4
-
A
-
A
-
-
-
3
C
A
-
-
A
T
A
-
-
-
-
A
-
G
A
-
T
T
A
-
-
T
C
-
-
A
-
T
T
G
C
A
-
-
T
T
C
-
A
T
A
C
T
T
T
A
-
A
T
-
-
A
T
-
G
-
-
C
G
A
G
C
A
-
-
A
T
C
2
A
-
-
A
-
-
T
G
C
-
G
-
-
-
-
-
-
T
-
-
-
A
C
C
-
-
-
A
-
G
C
T
G
T
-
T
A
-
-
-
-
-
-
-
A
A
C
T
-
-
T
2
-
-
G
-
T
C
-
A
A
G
G
-
T
-
-
A
-
-
-
-
-
A
-
T
G
T
-
-
T
-
-
-
-
A
-
T
C
G
-
-
-
T
T
A
T
A
G
-
T
C
-
-
T
G
-
-
-
-
A
-
-
-
-
-
-
-
-
A
T
T
-
C
-
-
2
G
-
-
-
-
T
-
-
-
-
C
A
-
-
-
4
-
A
-
-
C
-
T
-
C
-
-
-
G
-
2
T
-
T
-
-
-
-
-
-
2
C
T
-
A
A
2
G
C
C
T
C
G
G
-
-
2
C
2
C
-
T
T
-
2
C
-
-
-
-
-
-
-
2
G
-
-
-
T
-
-
T
2
G
A
T
A
G
2
-
T
G
T
-
C
T
T
G
A
A
G
-
2
G
G
T
T
G
2
G
T
T
T
A
T
-
2
T
2
-
-
-
-
G
A
-
-
T
G
T
-
-
-
-
-
-
-
-
-
T
-
A
G
T
-
-
-
-
-
G
-
-
-
-
-
-
-
-
-
T
-
-
-
T
-
-
-
-
-
-
-
T
-
-
-
G
-
-
-
-
A
-
-
-
C
-
T
A
A
-
-
-
2
-
T
-
6
2/-
T/G
-
A
A
A
A
C
A
C
A
3
G/A
G/T
A/T
T/C
G/T
C/T
A
A
T
A
-
A/T
C/T
G/T
-/G
C/A
G/C
C/A
A/G
T/G
T