Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 215,106 (bp)   Positions: 479
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.171
.004
.0
.003
.0
1.0
.002
.002
.007
.001
.0
.774
.716
.376
1.0
1.0
.999
.058
.003
.0
.003
.0
.0
.04
.002
.001
.001
.007
.0
.001
.0
.003
.002
.005
.0
.076
.0
.994
.403
.765
.0
.0
.0
.006
.0
.0
.042
.914
.996
.0
.0
.001
.003
.963
.015
.0
.006
.003
.0
.079
.005
.019
.0
.0
.001
.013
.058
.0
.001
.0
.0
.999
.722
.0
--
.004
.0
.0
.005
.0
.0
.0
.002
.046
.0
.028
.021
.053
.073
.0
.002
.0
.0
.785
.937
.998
.018
.105
.0
.281
.013
.002
.01
.001
.02
.141
.133
.499
.0
.004
.532
.011
.001
.001
.004
.002
.348
.003
.005
.0
.0
.015
.003
.009
.042
.004
.01
.031
.178
--
--
--
--
--
--
.118
.589
.004
.003
.005
.024
.0
.001
.082
.0
.003
.002
.016
.002
.0
.001
.047
.186
.0
.019
.002
.074
.0
.007
.005
.0
.0
.0
.007
.0
.014
.003
.002
.0
.005
.055
.013
.035
.261
.0
.008
.46
.001
.014
.007
.001
.003
.029
.016
.001
.003
.254
.065
.014
.07
.128
.038
.001
.007
.006
.008
.296
.963
.007
.011
.001
.051
.116
.0
.0
.0
.003
.0
.011
.008
.003
.004
.045
.18
.035
.034
.014
.005
.006
.433
.322
.01
.004
.021
.011
.044
.004
.058
.013
.323
.028
.032
.024
.014
.001
.013
.004
.001
.009
.395
.027
.015
.116
.137
.058
.605
.74
.001
.003
.107
.0
.003
.0
.002
.003
.0
.0
.007
.007
.0
.001
.0
.0
.018
.005
.001
.0
.2
.005
.0
.0
.977
.0
.0
.0
.02
.116
.001
.0
.0
.099
.0
.0
.001
.011
.001
.0
.0
.0
.014
--
--
--
.008
.018
.008
.003
.001
1.0
.003
.011
.095
.274
.18
.191
.007
.0
.004
.115
.702
.046
.0
.0
.012
.028
.002
.001
.0
.0
--
--
.048
1.0
.064
.0
.0
.001
.0
.003
.0
.0
.001
.0
.002
.001
.0
.0
.0
.001
.027
.003
.002
.001
.004
.0
.0
.0
.01
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.651
.511
.174
.371
.0
.0
.0
.002
.005
.0
.0
.021
.653
.902
.0
.027
.001
.001
.0
.017
.005
.018
.003
.0
.001
.002
.002
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.005
.002
.0
.0
.0
.001
.003
.011
.01
.0
.006
.008
.01
.0
.0
.003
.0
.174
.0
.001
.002
.001
.0
.05
.0
.0
.0
.13
.001
.0
.001
.0
.178
.014
.123
.087
.0
.005
.042
.0
.998
.0
.011
.0
.002
.016
.003
.009
.007
.004
.001
.0
.003
.002
.001
.002
.0
.0
.0
.001
.003
.001
.0
.007
.001
.068
.041
.073
.085
.0
.0
.0
.067
.0
.001
.0
.0
.009
.005
.012
.008
.0
.287
.001
.0
.229
.0
.0
.001
.002
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
Grik3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
T
A
C
G
C
G
G
T
T
C
T
G
A
2
T
G
C
T
-
-
A
A
C
A
C
T
T
G
A
A
T
T
G
T
G
A
C
-
A
T
C
G
C
A
A
T
G
G
G
-
T
C
-
C
A
T
T
G
12
T
A
C
T
G
T
G
-
T
G
G
G
T
A
14
T
A
C
C
C
-
T
G
-
T
C
T
A
A
-
T
C
C
T
-
G
C
C
2
A
C
C
A
G
-
A
T
A
C
A
A
T
A
G
A
C
G
A
G
-
G
C
-
C
C
G
-
T
A
4
C
G
G
G
A
A
G
A
T
A
C
A
G
T
C
A
G
G
C
-
-
4
G
G
G
G
G
G
C
T
A
102
G
C
C
C
-
G
-
T
C
-
G
-
A
T
A
4
G
A
-
-
-
-
-
-
G
A
A
A
T
A
A
T
C
G
T
A
C
G
A
C
G
T
G
A
A
G
C
G
T
C
A
A
C
G
C
C
T
A
C
-
A
C
G
A
G
C
-
C
-
T
G
G
G
A
C
T
A
A
A
-
C
A
A
G
C
A
T
T
C
C
-
G
C
T
T
C
A
T
A
T
A
A
A
G
C
T
G
G
A
T
A
A
A
T
C
A
C
G
T
G
G
C
G
C
T
A
G
G
2
G
G
G
4
C
A
T
T
A
A
-
9
C
G
A
T
T
A
G
C
T
A
G
T
C
G
G
A
T
A
T
G
G
A
A
A
C
A
G
T
C
G
G
C
C
4
C
G
G
T
C
C
A
G
C
T
G
A
G
A
C
C
A
T
C
T
A
T
A
G
A
C
A
A
G
G
A
-
G
G
G
C
A
C
A
C
T
A
A
C
C
T
G
T
-
C
C
C
C
C
C
A
G
T
C
G
A
T
G
C
G
-
T
G
-
A
A
19
A
A
A
T
G
C
T
A
A
G
G
G
-
A
T
A
G
A
G
G
T
T
G
A
C
A
G
G
G
C
G
C
C
A
C
C
G
C
-
-
A
-
-
A
-
A
A
A
A
G
A
-
A
T
C
C
-
C
T
-
T
2
T
C
G
T
-
T
G
  143,500,466
  143,500,873
  143,501,279
  143,501,283
  143,501,326
  143,501,372
  143,501,523
  143,501,530
  143,501,602
  143,501,997
  143,502,141
  143,502,677
  143,502,686
  143,502,893
  143,503,224
  143,503,342
  143,503,506
  143,503,583
  143,504,599
  143,504,664
  143,504,678
  143,504,853
  143,504,854
  143,505,052
  143,505,075
  143,505,126
  143,505,230
  143,505,710
  143,505,825
  143,505,841
  143,506,384
  143,507,061
  143,507,251
  143,507,326
  143,507,436
  143,507,658
  143,507,694
  143,508,343
  143,508,670
  143,508,925
  143,509,169
  143,509,877
  143,509,927
  143,510,078
  143,510,395
  143,510,986
  143,511,684
  143,512,088
  143,512,970
  143,514,057
  143,514,088
  143,514,140
  143,514,208
  143,514,850
  143,515,622
  143,517,502
  143,518,401
  143,518,573
  143,518,839
  143,519,096
  143,519,184
  143,519,236
  143,519,331
  143,520,052
  143,520,061
  143,520,071
  143,520,288
  143,520,854
  143,520,889
  143,521,264
  143,521,378
  143,521,598
  143,521,687
  143,522,526
  143,523,139
  143,523,506
  143,523,745
  143,524,098
  143,524,574
  143,524,732
  143,524,942
  143,525,105
  143,525,637
  143,526,270
  143,526,332
  143,526,808
  143,526,826
  143,527,123
  143,527,181
  143,527,863
  143,528,001
  143,528,204
  143,528,454
  143,528,769
  143,528,790
  143,528,839
  143,528,929
  143,529,152
  143,529,362
  143,530,032
  143,530,373
  143,530,387
  143,530,391
  143,530,463
  143,530,756
  143,530,809
  143,531,537
  143,531,720
  143,532,319
  143,532,567
  143,532,600
  143,532,666
  143,532,677
  143,533,090
  143,533,270
  143,533,341
  143,534,110
  143,534,209
  143,534,458
  143,534,735
  143,534,759
  143,534,949
  143,535,626
  143,535,748
  143,536,274
  143,536,294
  143,536,612
  143,536,806
  143,536,855
  143,537,338
  143,537,469
  143,537,560
  143,537,622
  143,537,624
  143,537,626
  143,537,718
  143,538,110
  143,538,331
  143,538,541
  143,538,590
  143,538,597
  143,538,695
  143,539,054
  143,539,350
  143,540,077
  143,540,142
  143,540,377
  143,540,505
  143,540,971
  143,541,061
  143,541,088
  143,541,178
  143,541,202
  143,541,290
  143,541,319
  143,541,443
  143,541,605
  143,542,660
  143,542,808
  143,543,405
  143,543,592
  143,544,036
  143,544,177
  143,544,453
  143,545,316
  143,545,748
  143,546,133
  143,546,718
  143,546,975
  143,547,019
  143,547,108
  143,547,224
  143,547,775
  143,566,542
  143,571,985
  143,578,939
  143,587,761
  143,592,387
  143,610,622
  143,616,773
  143,616,794
  143,617,138
  143,617,150
  143,617,174
  143,617,187
  143,617,193
  143,620,250
  143,620,390
  143,620,412
  143,633,356
  143,633,402
  143,633,467
  143,633,692
  143,633,698
  143,633,793
  143,633,964
  143,633,984
  143,634,025
  143,634,204
  143,634,376
  143,634,553
  143,634,654
  143,634,692
  143,634,725
  143,634,752
  143,634,823
  143,634,843
  143,634,854
  143,634,904
  143,634,938
  143,634,970
  143,634,995
  143,635,073
  143,635,084
  143,635,149
  143,635,150
  143,635,211
  143,635,245
  143,635,359
  143,635,397
  143,635,514
  143,635,553
  143,635,787
  143,635,791
  143,635,850
  143,635,889
  143,635,917
  143,635,988
  143,636,071
  143,636,153
  143,636,174
  143,636,200
  143,636,569
  143,636,680
  143,636,792
  143,636,797
  143,636,868
  143,636,874
  143,636,925
  143,637,125
  143,637,217
  143,637,219
  143,637,275
  143,637,281
  143,637,295
  143,637,327
  143,637,359
  143,638,192
  143,638,590
  143,638,738
  143,639,159
  143,639,184
  143,639,190
  143,639,223
  143,639,327
  143,639,397
  143,639,454
  143,640,945
  143,640,963
  143,641,083
  143,641,154
  143,641,168
  143,641,261
  143,641,397
  143,641,399
  143,641,457
  143,641,528
  143,641,820
  143,641,827
  143,642,415
  143,642,422
  143,642,945
  143,643,194
  143,643,272
  143,643,301
  143,644,404
  143,645,431
  143,645,627
  143,645,628
  143,646,408
  143,648,767
  143,648,795
  143,648,950
  143,649,590
  143,650,090
  143,650,499
  143,651,646
  143,651,739
  143,653,424
  143,654,030
  143,654,276
  143,654,470
  143,654,677
  143,655,587
  143,655,591
  143,655,619
  143,655,662
  143,655,670
  143,656,156
  143,656,668
  143,656,782
  143,656,962
  143,657,059
  143,657,091
  143,657,241
  143,657,300
  143,657,843
  143,658,789
  143,658,815
  143,658,872
  143,659,019
  143,659,351
  143,659,884
  143,661,106
  143,661,137
  143,661,222
  143,662,239
  143,663,480
  143,663,482
  143,665,125
  143,665,250
  143,665,502
  143,666,403
  143,666,855
  143,666,963
  143,667,180
  143,667,338
  143,667,410
  143,667,686
  143,667,689
  143,667,701
  143,667,703
  143,667,719
  143,667,740
  143,667,741
  143,667,743
  143,667,792
  143,668,294
  143,668,840
  143,668,939
  143,668,953
  143,669,149
  143,669,554
  143,669,838
  143,670,068
  143,670,090
  143,670,167
  143,670,259
  143,670,571
  143,670,619
  143,670,670
  143,670,741
  143,670,764
  143,670,765
  143,670,935
  143,671,214
  143,671,342
  143,671,429
  143,671,658
  143,672,337
  143,673,564
  143,673,584
  143,673,689
  143,673,848
  143,673,913
  143,673,945
  143,674,091
  143,674,581
  143,674,582
  143,674,878
  143,675,291
  143,675,796
  143,676,034
  143,676,304
  143,676,591
  143,676,796
  143,677,611
  143,677,728
  143,678,296
  143,678,359
  143,678,627
  143,679,283
  143,679,637
  143,679,746
  143,680,689
  143,681,031
  143,681,088
  143,681,809
  143,682,558
  143,682,642
  143,682,802
  143,682,803
  143,683,143
  143,683,171
  143,683,299
  143,683,493
  143,683,539
  143,683,872
  143,683,903
  143,684,181
  143,684,182
  143,684,265
  143,684,322
  143,684,568
  143,684,656
  143,684,862
  143,685,015
  143,685,217
  143,685,333
  143,685,335
  143,685,362
  143,685,365
  143,685,375
  143,685,384
  143,685,389
  143,685,392
  143,685,406
  143,685,752
  143,686,255
  143,686,380
  143,686,693
  143,686,898
  143,687,489
  143,687,581
  143,688,110
  143,688,535
  143,688,544
  143,688,623
  143,688,796
  143,689,603
  143,689,863
  143,690,003
  143,690,578
  143,690,749
  143,690,871
  143,691,125
  143,691,137
  143,691,327
  143,691,388
  143,691,392
  143,691,544
  143,691,618
  143,691,768
  143,691,769
  143,691,897
  143,691,914
  143,691,923
  143,692,041
  143,692,165
  143,692,170
  143,692,175
  143,692,186
  143,692,196
  143,692,202
  143,692,218
  143,692,227
  143,692,252
  143,692,259
  143,692,650
  143,693,190
  143,694,248
  143,696,248
  143,696,254
  143,698,744
  143,699,239
  143,701,444
  143,703,505
  143,703,582
  143,704,470
  143,704,677
  143,705,275
  143,706,093
  143,706,207
  143,708,798
  143,709,913
  143,712,308
  143,715,180
  143,715,183
  143,715,443
C
A
G
G
A
A
-
C
A
A
A
T
C
T
T
2/-
C
A
T
G
27
10
T
G
T
G
T
C
C
A
C
-
-
-
T
A
T
T
G
5
G
C
T
C
T
G
G
C
A
T
A
T
C
G
2
-
G
C
C
C
-
C
G
T
C
A
C
T
T
C
A
A
A
C
T
-
C
G
G
A
T
4
G
A
C
C
T
C
C
G
2
C
T
A
A
2
C
G
T
-
G
T
T
C
A
A
T
C
G
T
G
G
C
G
A
G
T
A
G
A
C
A
T
T
T
T
A
T
A
G
-
G
C
C
C
G
G
A
G
C
G
T
G
T
C
T
G
A
A
T
A
12
-
A
A
T
A
A
T
T
C
G
-
A
T
-
T
6
-
2
C
T
G
-
2
G
G
G
-
-
G
T
C
T
A
T
T
-
-
G
G
C
G
G
C
T
C
C
C
G
A
G
T
A
C
A
G
G
A
A
A
C
T
G
G
T
C
T
G
C
T
T
C
G
T
A
C
A
A
4
-
10
C
A
T
A
G
A
C
G
G
G
T
T
G
G
A
T
T
C
C
T
G
3
A
T
C
C
T
G
C
C
C
C
T
G
A
T
G
A
T
G
C
G
G
G
C
T
G
T
A
G
A
A
T
C
T
C
G
A
A
-
A
A
A
-
T
T
C
C
G
G
2
-
A
T
G
C
C
G
A
T
C
G
A
A
A
A
A
G
C
C
C
A
-
G
T
G
A
G
A
C
T
A
A
T
G
-
T
A
A
C
T
T
G
A
A
C
A
G
A
C
G
A
C
C
G
C
G
A
T
A
G
T
G
G
A
T
T
26
C
T
A
T
G
T
G
A
C
C
G
T
T
G
A
-
T
T
T
T
T
G
T
G
A
C
T
A
G
C
T
T
A
A
C
C
T
G
-
-
G
G
G
C
C
T
G
G
G
C
C
T
5
T
C
G
A
G
A
A
C
C
A
C
T
G
A
-
C
A
A
T
T
G
G
T
A
T
G
G
G
G
2
-
G
-
-
-
G
A
T
C
G
A
T
T
A
T
G
C
C
-
C
T
A
C
C
C
A