Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 497,730 (bp)   Positions: 517
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.013
.28
.168
.0
.001
.001
.001
.578
.031
.03
.007
.118
.0
.0
.0
.814
.0
.0
.006
.001
.001
.0
.111
.001
.031
.0
.005
.001
.002
.0
.003
.0
.003
.001
.0
.008
.0
.001
.0
.0
.006
.003
.003
.001
.021
.018
.042
.0
.068
--
--
.256
.0
.0
.0
.0
.0
1.0
.0
.321
.001
.0
.004
.002
.0
.0
--
.062
--
.005
.53
.008
.0
.005
.001
.001
.879
1.0
.951
--
--
.009
.01
.001
.104
.029
.0
.585
.105
.009
.003
--
--
.0
.215
.059
.093
--
--
--
--
--
--
--
--
.931
.002
--
.001
.0
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.054
.01
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
--
--
.033
.03
.062
.0
.0
.004
.001
--
--
.013
.055
.001
.014
.003
--
--
--
--
.0
.001
.0
.001
.38
.998
.0
--
1.0
1.0
.157
.0
.001
.625
.011
.038
.083
.023
.09
.001
.0
.0
.594
--
--
--
--
--
--
.404
.002
.074
--
.04
.05
.003
.002
.001
.006
.001
.001
.006
.001
.003
--
--
.005
.288
.001
--
--
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
.025
.001
.0
.004
.0
.002
.1
.001
.022
.005
.0
--
.102
.1
.807
.002
.016
.087
.001
.014
.0
--
.0
.008
.0
.0
--
--
.014
.059
.001
.01
.005
.002
.035
.001
.001
.002
.026
.0
.357
.116
.002
.004
.947
.001
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.642
.547
.018
.001
.0
.0
.003
.016
.013
.0
.003
.002
.001
.0
.0
.008
.004
.001
.022
.182
.0
.019
.0
.003
.002
.0
.011
--
.0
.004
.0
.053
.002
.001
.003
.035
.0
.015
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.0
.004
.387
.019
.0
.001
.075
.001
.018
.001
.025
.006
--
.016
.134
.016
.025
.086
.042
.048
.004
.006
.009
.001
.0
.003
.0
.28
.003
.001
.0
.007
.004
.006
.987
.01
--
.353
.018
.0
.003
.003
.0
.062
.157
.002
.279
.006
.015
.02
.022
--
--
--
--
--
.154
.277
.089
.025
.019
.0
.0
.0
.022
.003
.015
.005
.012
.001
.001
.016
.06
.251
.003
.002
.001
.001
.946
.257
.001
.0
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.039
.682
.021
.001
--
.034
.002
--
--
--
.001
.001
.002
.851
.13
--
--
--
--
.157
.157
.154
.35
.012
.017
.001
.0
.048
.011
.006
.005
.005
.0
.032
.164
.05
.003
.0
.001
--
--
.018
.885
.002
.012
.005
.0
.054
.056
--
.002
.0
.003
.0
.054
.005
.006
.018
.017
.005
.012
--
.232
.013
.015
.019
.001
.001
.016
.003
.001
.0
.0
.0
.002
.015
.013
.0
.0
.0
.021
.007
.038
.0
.788
.002
.0
.01
.001
.0
.006
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.002
1.0
.991
1.0
.015
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
C
T
A
C
C
A
T
T
T
G
T
G
T
A
C
A
G
C
C
C
A
G
A
T
T
T
C
A
A
T
T
G
A
A
C
C
A
G
C
A
T
T
C
G
T
C
A
T
T
A
G
T
T
G
C
C
G
G
T
A
C
A
G
C
T
T
G
C
T
C
T
C
C
G
A
T
C
C
A
A
A
A
A
C
T
G
A
G
A
T
A
A
T
T
G
T
C
A
C
C
G
T
T
A
T
C
C
G
C
A
G
G
T
G
G
C
A
A
A
A
A
C
A
T
G
C
C
A
C
A
C
G
A
T
C
A
A
A
A
T
G
A
C
C
C
A
G
G
A
T
C
C
T
C
A
T
T
A
A
C
G
C
C
A
T
C
A
A
A
T
G
T
G
T
T
T
C
C
T
C
G
G
T
G
C
A
T
G
T
A
C
G
C
G
G
C
A
G
G
G
G
T
A
C
T
G
C
C
C
T
C
T
G
T
A
C
C
A
A
C
T
A
G
A
A
G
G
A
G
T
C
C
T
A
T
T
C
A
T
A
A
G
T
A
C
A
G
G
C
A
T
T
G
G
C
A
A
C
G
G
A
G
T
T
A
C
A
A
G
C
A
C
A
C
A
T
C
T
A
T
C
T
A
T
C
C
T
A
C
C
G
C
C
A
C
A
C
A
C
A
C
G
T
A
C
T
T
A
G
A
G
A
A
A
G
A
T
C
C
A
C
G
C
A
A
C
T
A
C
C
G
G
G
C
C
G
G
A
G
T
C
A
G
T
C
A
A
C
T
C
A
A
G
A
G
T
T
C
T
T
C
C
T
A
C
C
A
T
A
G
A
C
A
C
T
A
A
G
C
A
G
G
T
C
A
G
A
C
G
G
C
G
G
A
C
C
A
G
G
A
T
C
G
A
C
T
T
A
T
G
T
G
G
C
A
C
T
T
A
A
A
T
C
G
C
C
T
A
G
G
G
A
G
T
T
A
A
C
G
A
G
G
G
T
C
T
T
C
C
A
C
C
C
G
C
A
C
T
G
A
G
T
A
G
G
C
T
T
G
C
T
C
C
G
T
G
T
T
C
A
T
T
G
A
A
A
A
T
C
G
C
T
C
C
A
C
T
T
G
C
G
C
A
T
C
T
C
A
T
G
T
G
G
C
T
A
A
  1,549,020
  1,550,778
  1,550,987
  1,551,009
  1,551,036
  1,552,478
  1,553,815
  1,555,043
  1,557,787
  1,557,855
  1,558,387
  1,558,654
  1,558,929
  1,558,930
  1,558,981
  1,560,339
  1,560,741
  1,561,495
  1,562,766
  1,563,046
  1,563,196
  1,565,052
  1,565,915
  1,565,986
  1,567,391
  1,568,200
  1,569,078
  1,569,504
  1,569,668
  1,570,073
  1,571,092
  1,571,319
  1,571,404
  1,572,565
  1,573,403
  1,574,648
  1,574,710
  1,575,117
  1,576,226
  1,576,601
  1,576,895
  1,577,324
  1,577,844
  1,577,922
  1,577,939
  1,578,336
  1,578,385
  1,578,658
  1,579,182
  1,579,761
  1,580,101
  1,581,965
  1,582,833
  1,582,854
  1,583,134
  1,583,717
  1,584,291
  1,584,778
  1,585,557
  1,588,261
  1,589,016
  1,589,162
  1,593,326
  1,594,091
  1,594,923
  1,595,458
  1,598,551
  1,600,786
  1,601,083
  1,601,525
  1,601,583
  1,602,409
  1,604,676
  1,606,388
  1,609,395
  1,609,543
  1,610,007
  1,610,185
  1,611,905
  1,614,238
  1,621,106
  1,621,717
  1,622,034
  1,622,072
  1,623,046
  1,623,236
  1,624,051
  1,624,603
  1,624,699
  1,624,847
  1,624,882
  1,625,317
  1,627,482
  1,631,616
  1,633,223
  1,634,821
  1,634,843
  1,635,664
  1,635,999
  1,636,953
  1,638,273
  1,639,004
  1,652,237
  1,652,372
  1,652,609
  1,652,874
  1,653,217
  1,654,815
  1,656,415
  1,656,601
  1,657,717
  1,658,118
  1,659,916
  1,660,209
  1,661,853
  1,664,135
  1,664,429
  1,664,551
  1,665,575
  1,666,470
  1,671,718
  1,676,036
  1,676,503
  1,677,315
  1,680,053
  1,680,124
  1,682,146
  1,683,449
  1,683,878
  1,684,799
  1,685,605
  1,686,143
  1,686,156
  1,686,626
  1,689,141
  1,689,149
  1,694,724
  1,694,827
  1,695,471
  1,696,667
  1,697,126
  1,699,042
  1,699,173
  1,702,880
  1,702,997
  1,703,943
  1,703,956
  1,705,081
  1,705,687
  1,707,402
  1,708,054
  1,708,167
  1,708,574
  1,710,151
  1,729,006
  1,729,232
  1,729,786
  1,729,946
  1,730,156
  1,730,520
  1,730,861
  1,732,730
  1,733,115
  1,733,311
  1,733,799
  1,736,181
  1,736,209
  1,757,769
  1,759,273
  1,759,792
  1,761,303
  1,762,390
  1,763,624
  1,763,890
  1,764,342
  1,764,364
  1,765,130
  1,767,946
  1,769,653
  1,770,207
  1,775,005
  1,775,338
  1,776,567
  1,777,680
  1,778,499
  1,778,759
  1,778,936
  1,779,684
  1,780,570
  1,781,301
  1,781,778
  1,781,780
  1,782,135
  1,783,019
  1,783,020
  1,783,087
  1,783,284
  1,783,285
  1,784,019
  1,784,140
  1,784,991
  1,793,480
  1,796,445
  1,798,034
  1,798,802
  1,801,682
  1,803,565
  1,804,067
  1,804,339
  1,804,812
  1,806,875
  1,807,241
  1,807,242
  1,807,917
  1,809,064
  1,810,672
  1,810,840
  1,811,332
  1,812,276
  1,812,463
  1,815,205
  1,815,708
  1,815,739
  1,816,304
  1,816,315
  1,825,806
  1,826,326
  1,826,327
  1,827,380
  1,828,176
  1,829,417
  1,830,277
  1,830,930
  1,830,986
  1,831,081
  1,833,817
  1,839,145
  1,839,223
  1,839,331
  1,839,484
  1,841,564
  1,841,725
  1,842,563
  1,846,671
  1,846,735
  1,846,832
  1,847,235
  1,847,872
  1,848,349
  1,849,223
  1,849,463
  1,849,605
  1,849,648
  1,850,433
  1,850,626
  1,850,998
  1,851,520
  1,851,599
  1,853,126
  1,853,624
  1,853,930
  1,854,089
  1,854,668
  1,854,676
  1,854,823
  1,854,849
  1,854,912
  1,855,218
  1,856,189
  1,856,254
  1,856,481
  1,857,703
  1,858,245
  1,858,802
  1,858,830
  1,859,139
  1,859,686
  1,860,731
  1,860,980
  1,861,165
  1,861,616
  1,862,057
  1,862,944
  1,863,421
  1,864,112
  1,864,240
  1,864,298
  1,864,411
  1,865,318
  1,865,539
  1,865,910
  1,865,915
  1,865,945
  1,866,106
  1,866,132
  1,866,782
  1,867,308
  1,868,219
  1,868,735
  1,869,469
  1,869,523
  1,869,525
  1,869,534
  1,869,958
  1,870,078
  1,870,100
  1,876,304
  1,876,610
  1,876,807
  1,877,618
  1,877,708
  1,878,422
  1,878,857
  1,880,111
  1,880,254
  1,880,405
  1,881,384
  1,881,987
  1,882,320
  1,884,550
  1,884,716
  1,885,179
  1,885,353
  1,888,750
  1,890,914
  1,891,193
  1,892,710
  1,892,952
  1,893,752
  1,893,837
  1,894,141
  1,894,406
  1,894,481
  1,895,153
  1,895,204
  1,895,666
  1,895,684
  1,895,692
  1,896,436
  1,897,695
  1,898,034
  1,898,940
  1,900,851
  1,900,853
  1,901,831
  1,901,848
  1,901,888
  1,902,823
  1,902,846
  1,903,095
  1,903,334
  1,903,997
  1,904,143
  1,904,655
  1,906,448
  1,907,257
  1,907,348
  1,907,720
  1,908,796
  1,909,376
  1,910,062
  1,910,172
  1,910,176
  1,910,619
  1,910,760
  1,911,496
  1,912,149
  1,912,217
  1,912,754
  1,913,860
  1,914,488
  1,915,032
  1,916,002
  1,916,822
  1,917,320
  1,917,334
  1,917,374
  1,917,438
  1,917,707
  1,917,725
  1,918,161
  1,918,596
  1,919,236
  1,919,379
  1,919,829
  1,920,284
  1,920,559
  1,921,247
  1,921,251
  1,921,600
  1,921,782
  1,922,112
  1,922,153
  1,922,221
  1,922,490
  1,922,711
  1,922,958
  1,923,775
  1,924,971
  1,925,073
  1,925,773
  1,933,723
  1,934,973
  1,935,015
  1,935,064
  1,956,705
  1,957,895
  1,957,992
  1,959,270
  1,959,584
  1,959,588
  1,959,740
  1,960,082
  1,962,078
  1,962,106
  1,962,338
  1,962,471
  1,962,874
  1,963,715
  1,964,759
  1,964,937
  1,966,066
  1,967,947
  1,968,022
  1,968,297
  1,969,765
  1,970,125
  1,970,420
  1,972,814
  1,975,752
  1,975,865
  1,975,909
  1,978,560
  1,978,952
  1,978,953
  1,978,954
  1,979,038
  1,979,262
  1,980,671
  1,980,829
  1,981,585
  1,981,786
  1,981,852
  1,982,906
  1,982,930
  1,983,808
  1,984,574
  2,006,463
  2,008,183
  2,008,463
  2,008,980
  2,009,682
  2,009,713
  2,010,262
  2,011,042
  2,012,359
  2,012,648
  2,012,894
  2,015,343
  2,015,987
  2,016,367
  2,017,010
  2,018,319
  2,018,659
  2,021,526
  2,022,267
  2,022,519
  2,022,659
  2,023,949
  2,024,041
  2,024,082
  2,024,251
  2,026,703
  2,027,674
  2,027,898
  2,028,409
  2,028,722
  2,028,762
  2,028,763
  2,029,673
  2,030,075
  2,030,291
  2,030,395
  2,030,738
  2,031,495
  2,031,800
  2,031,846
  2,032,044
  2,032,169
  2,032,694
  2,033,408
  2,033,913
  2,034,471
  2,034,796
  2,035,922
  2,036,146
  2,036,299
  2,037,310
  2,037,534
  2,038,445
  2,038,739
  2,038,778
  2,039,681
  2,039,694
  2,039,798
  2,040,497
  2,041,244
  2,042,135
  2,042,493
  2,042,497
  2,042,525
  2,042,572
  2,042,736
  2,042,862
  2,043,952
  2,044,429
  2,045,715
T
C
T
T
G
G
G
C
A
T
C
A
A
T
A
G
T
A
T
T
G
A
T
G
C
G
T
C
T
A
G
A
G
C
A
G
G
T
T
C
A
C
T
A
C
T
G
A
C
G
T
C
G
A
T
A
A
A
C
G
T
G
T
G
A
A
A
T
G
A
A
T
T
A
C
C
G
A
C
G
T
T
G
A
A
A
T
A
G
C
G
G
A
C
A
C
T
G
T
A
T
C
G
C
C
T
T
A
T
T
A
T
C
T
A
G
G
T
G
T
G
T
T
C
A
T
T
G
A
G
T
A
T
C
T
G
G
G
G
A
A
T
A
A
A
G
A
A
C
A
A
A
C
A
T
C
A
T
C
T
T
T
T
T
C
A
T
G
T
C
A
C
A
G
C
A
G
T
A
T
C
A
C
A
A
G
G
C
A
G
A
T
G
T
C
A
G
A
A
A
C
A
G
T
C
A
T
T
T
A
T
C
A
C
G
G
T
G
C
T
C
G
A
C
G
A
T
T
A
C
T
T
C
G
C
C
T
G
C
G
G
A
G
G
G
G
C
A
A
T
C
C
A
A
T
G
T
A
A
C
G
T
A
G
T
T
G
G
A
G
G
T
C
T
G
A
T
G
C
G
A
A
T
A
A
A
G
C
G
G
A
G
T
G
T
G
A
C
G
G
T
T
G
C
T
A
A
G
A
G
T
C
C
G
C
G
C
T
T
T
G
A
A
G
G
A
C
G
A
T
A
T
A
T
A
A
T
G
C
C
G
T
A
G
G
G
C
A
A
T
G
G
A
T
A
C
C
T
A
C
G
G
G
G
T
A
G
C
G
A
C
A
T
T
C
C
G
A
T
G
A
A
G
T
C
A
G
T
T
A
T
T
A
G
T
T
G
A
A
G
C
T
A
G
T
C
C
G
G
A
A
A
A
T
G
T
A
C
T
C
C
A
T
T
T
A
C
T
A
C
A
G
A
C
C
C
G
T
A
G
A
A
A
C
T
C
C
G
T
G
G
T
T
A
T
G
T
C
A
T
A
A
C
A
A
G
C
C
T
T
C
T
G
A
C
A
A
C
A
G
C
C
A
G
G
C
C
A
T
T
A
C
T
T
T
T
C
C
A
T
A
G
T
C
T
C
T
G
C
C
A
C
A
A
C
G
G