Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 497,730 (bp)   Positions: 219
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.005
.008
.036
.016
.001
.001
.089
.092
.089
--
.829
--
--
.074
.005
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.004
.014
.015
.01
.008
.005
.002
.001
.001
.0
.001
.002
.01
.002
.004
.029
.065
.088
.169
.169
.014
.019
.078
.067
.043
.035
.03
.005
.013
.027
.004
.001
.008
.009
.024
.007
.004
.007
.004
.006
.015
.006
.001
.003
.003
.012
.021
.022
.022
.025
.006
.002
.001
.008
.016
--
--
--
.006
.032
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.015
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Spetex2b
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
Gria4
A
C
-
3
-
A
T
T
G
3
G
A
C
A
A
T
G
2
-
T
-
G
-
G
G
G
-
T
2
G
G
-
G
G
C
G
3
-
-
3
-
A
-
C
C
C
-
A
-
-
-
-
-
A
-
-
-
C
2
-
-
G
G
G
-
2
-
-
5
C
C
G
2
C
A
A
-
-
-
C
C
G
G
T
G
-
-
A
G
-
-
-
-
-
T
-
C
G
C
G
A
-
-
-
-
T
-
-
-
-
C
A
C
G
C
-
C
A
-
-
C
A
-
-
G
-
G
G
-
G
-
C
-
G
G
C
C
C
T
-
G
T
G
T
2
T
-
-
T
G
G
2
-
-
-
G
-
C
A
A
T
A
A
T
A
T
A
T
G
C
C
T
G
C
A
T
T
C
A
T
C
C
C
G
A
A
C
G
C
T
G
-
G
A
-
-
A
A
A
G
C
G
-
13
-
A
T
C
T
C
C
G
G
A
C
A
T
-
49
  1,564,284
  1,564,295
  1,564,297
  1,564,299
  1,564,305
  1,564,315
  1,564,320
  1,564,358
  1,564,361
  1,564,380
  1,614,807
  1,614,809
  1,614,813
  1,618,223
  1,619,957
  1,621,022
  1,621,032
  1,639,722
  1,639,790
  1,639,809
  1,639,858
  1,639,862
  1,639,988
  1,640,010
  1,640,016
  1,640,035
  1,640,050
  1,640,052
  1,640,088
  1,640,103
  1,640,125
  1,640,134
  1,640,140
  1,640,148
  1,640,151
  1,640,156
  1,640,164
  1,640,168
  1,640,173
  1,640,175
  1,640,183
  1,640,768
  1,640,772
  1,640,785
  1,640,804
  1,640,810
  1,640,834
  1,640,846
  1,640,871
  1,640,916
  1,640,928
  1,640,932
  1,640,964
  1,641,014
  1,641,032
  1,641,054
  1,651,954
  1,651,982
  1,652,014
  1,652,021
  1,652,067
  1,656,796
  1,656,799
  1,656,802
  1,656,809
  1,656,826
  1,656,850
  1,688,906
  1,722,493
  1,722,501
  1,722,504
  1,756,762
  1,757,588
  1,767,645
  1,767,647
  1,778,759
  1,778,864
  1,778,868
  1,786,055
  1,786,085
  1,786,087
  1,786,088
  1,800,728
  1,807,241
  1,807,242
  1,834,420
  1,845,025
  1,845,027
  1,845,032
  1,845,052
  1,845,058
  1,845,060
  1,845,070
  1,845,078
  1,845,081
  1,845,087
  1,845,090
  1,845,093
  1,845,095
  1,845,100
  1,845,112
  1,845,115
  1,845,121
  1,845,138
  1,846,316
  1,846,322
  1,846,333
  1,846,339
  1,846,349
  1,846,365
  1,846,367
  1,846,377
  1,846,397
  1,846,398
  1,846,402
  1,846,409
  1,846,421
  1,846,428
  1,846,433
  1,846,439
  1,846,450
  1,846,470
  1,846,502
  1,846,507
  1,846,517
  1,846,530
  1,846,536
  1,846,540
  1,846,544
  1,846,550
  1,846,555
  1,846,557
  1,846,559
  1,846,569
  1,846,573
  1,846,575
  1,846,579
  1,846,610
  1,846,612
  1,846,617
  1,846,629
  1,846,632
  1,846,644
  1,846,648
  1,846,656
  1,847,403
  1,850,716
  1,851,271
  1,851,274
  1,851,275
  1,851,280
  1,851,289
  1,851,293
  1,875,638
  1,875,642
  1,875,676
  1,875,707
  1,913,183
  1,919,829
  1,926,811
  1,927,492
  1,927,994
  1,929,440
  1,929,467
  1,929,488
  1,929,720
  1,930,433
  1,932,844
  1,932,932
  1,932,948
  1,932,972
  1,932,978
  1,932,979
  1,933,020
  1,933,086
  1,933,093
  1,933,164
  1,933,197
  1,933,204
  1,933,214
  1,933,216
  1,933,291
  1,933,292
  1,933,296
  1,933,343
  1,933,350
  1,933,352
  1,933,355
  1,933,356
  1,933,357
  1,933,362
  1,933,386
  1,933,453
  1,933,475
  1,965,502
  1,977,542
  1,996,271
  1,996,743
  1,996,759
  1,996,772
  1,996,813
  1,996,825
  1,996,842
  1,997,659
  1,998,651
  1,999,366
  1,999,372
  1,999,379
  1,999,390
  1,999,486
  1,999,515
  1,999,618
  1,999,635
  1,999,741
  1,999,757
  1,999,780
  1,999,805
  2,004,822
  2,015,598
A/G
C/T
-/2
3/-
-/C
A/C
T/C
T/G
G/A
3/-
G/T
A/G
C/G
A/T
T
-
A
-
A
A
A
A
T
-
-
-
A
-
-
-
-
C
-
-
A
-
-
T
2
-
C
-
T
-
-
-
A
-
T
C
3
T
T
T
T
A
T
-
-
G
T
-
-
-
G
-
A
C
-
A
-
-
2/-
C/T
A/T
G
A
T
26
T
G
C
-
C
A
2
T
-
-
A
T
G
G
A
G
2
T
-
-
T
-
G
G
G
T
-
G
A
T
T
A
C
T
C
-
G
-
-
T
A
G
-
G
T
-
T
-
-
2
-
C
G
2
T
-
A
-
T
-
G
-
-
-
-
-
A
T
G
G
T
T
-
3
G
G
-
T
-
C
A/G
T/C
A/-
A/G
T/C
A/C
T/A
A/T
T/C
A
C/G
C/G
T/C
G/A
C/G
A/G
T/C
T/C
C/A
A/G
T/-
C/G
C/T
C/G
G/A
A/G
A/C
C/A
G/A
C/T
T/G
G/C
-/3
G/A
A/G
T
C
A/T
A/T
A/T
G/A
C/T
G/A
-/2
-
13
A/G
T/A
C/A
T/A
C/G
C/G
G/T
G/A
A/G
C/A
A/G
T/A
13
-