Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 246,946 (bp)   Positions: 509
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.024
.001
.004
.003
.244
.969
.003
.003
.001
.004
.003
.004
.021
.013
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.07
--
--
--
.008
.008
.001
.0
.0
.0
--
--
--
--
.026
.012
.004
.006
.013
.04
.193
.018
.029
.052
.065
.005
.008
.006
.001
.006
.0
.003
.006
.0
.0
.0
.001
.002
.001
.001
.0
.0
.006
.002
.102
.046
.0
.0
.013
.145
.093
.201
.001
.0
.0
.024
.027
.002
.013
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.486
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.028
.023
.02
.08
.102
.106
.152
.28
.276
.295
.294
.228
.216
.2
.183
.12
.137
.168
.175
.291
.469
.606
.474
.201
.088
.047
.025
.033
.05
.05
.029
.012
.003
.001
.001
.002
.002
.016
.023
.076
.044
.018
.01
.012
.027
.043
.064
.188
.103
.38
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.059
.108
.027
.005
.01
.075
.312
.325
.348
.302
.007
.003
.006
.007
.069
.194
.174
.185
.267
.189
.161
.077
.074
.013
.013
.021
.099
.031
.323
.152
.0
.033
.004
.005
.003
.001
.0
.002
.026
.107
.146
.003
.001
.0
.001
.021
.002
.022
.004
.046
.014
.091
.035
.01
.012
.0
.001
.059
.054
.012
.008
.014
.018
.015
.011
.003
.004
.119
.013
.034
.033
.085
.052
.001
.005
.032
.048
.001
.001
.0
.001
.001
.045
.003
.003
.006
.003
.001
.002
.001
.0
.016
.001
.006
.002
.021
.0
.0
.024
.0
.004
.008
.002
.001
.005
.0
.0
.0
.002
.001
.001
.0
.0
.0
.001
.001
.003
.001
.001
.001
.001
.003
.002
.002
.002
.0
.0
.0
.023
.003
.003
.015
.021
.006
.01
.006
.0
.003
.001
.013
.006
.003
.003
.023
.008
.0
.005
.003
.007
.001
.009
.009
.001
.019
.001
.0
.001
.018
.021
.03
.028
.018
.001
.001
.003
.023
.025
.0
.001
.003
.001
.001
.002
.001
.001
.0
.011
.026
.0
.001
.001
.001
.014
.0
.076
.001
.001
.067
.018
.001
.014
.005
.006
.001
.0
.0
.005
.002
.008
.001
.064
.775
.982
.988
1.0
1.0
1.0
1.0
.997
1.0
1.0
1.0
.998
1.0
.999
1.0
1.0
.999
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
.998
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
.978
.998
.13
.001
.001
.546
.65
.802
.993
1.0
1.0
1.0
1.0
.996
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
.999
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
.911
--
.001
--
.005
.012
.446
.207
.13
.031
.01
.002
.001
.043
.139
.251
.489
--
.015
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
Greb1l
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
A
C
A
T
G
A
G
-
A
G
C
A
C
-
A
C
C
C
C
C
G
T
G
T
G
C
G
C
T
G
A
C
A
C
A
-
12
G
C
-
6
G
G
G
G
G
C
2
T
T
G
G
T
2
-
-
G
T
T
G
-
A
T
2
-
A
C
C
G
T
-
A
C
A
-
-
2
A
G
-
A
-
2
-
C
T
A
-
T
G
3
4
C
-
A
T
T
A
A
G
-
G
-
T
-
-
G
C
-
T
T
-
C
-
T
G
A
A
T
T
-
-
2
-
A
A
G
-
A
A
A
C
-
3
T
C
C
-
T
A
G
A
A
A
A
A
C
G
C
T
G
A
G
-
-
G
-
T
-
-
-
-
G
T
C
G
T
C
A
A
-
T
C
C
A
T
G
C
C
-
-
G
2
G
T
A
-
-
C
G
C
A
G
A
C
C
G
G
T
A
-
G
T
G
G
G
-
G
-
-
C
-
G
A
-
-
A
2
-
-
-
2
-
-
-
C
C
-
-
A
A
3
T
T
-
-
A
T
3
-
3
T
T
C
G
C
T
6
G
A
-
G
A
T
A
2
A
G
G
G
T
T
C
A
-
C
G
A
-
3
10
G
C
C
-
G
A
C
3
A
T
T
C
T
2
C
G
T
T
2
2
T
G
G
G
G
C
C
T
G
C
A
C
A
-
C
G
G
-
A
G
A
G
A
G
T
-
G
T
A
C
G
G
C
G
A
G
C
G
2
G
-
-
T
G
T
-
C
A
G
G
A
C
A
-
-
-
G
G
A
G
T
C
C
C
T
C
A
C
T
T
2
-
T
-
G
G
G
C
T
C
T
A
G
T
G
G
-
-
A
-
T
C
A
T
T
T
2
C
2
-
G
T
C
T
T
C
T
-
G
A
2
T
T
C
G
T
T
C
G
-
G
T
T
G
-
T
-
G
T
-
C
A
-
G
3
T
C
A
G
T
A
G
A
G
T
G
A
G
C
-
G
G
T
G
C
G
T
3
A
C
G
A
-
2
G
G
C
C
T
G
C
C
C
G
G
C
G
G
C
A
T
T
G
A
G
G
T
-
G
C
T
G
G
C
G
G
G
T
A
-
C
G
T
2
C
A
-
-
-
T
3
2
-
T
-
C
  1,550,987
  1,551,529
  1,551,530
  1,551,542
  1,551,543
  1,551,557
  1,551,575
  1,551,587
  1,563,379
  1,563,423
  1,563,530
  1,563,578
  1,563,644
  1,563,701
  1,563,769
  1,563,905
  1,578,723
  1,578,726
  1,578,730
  1,578,751
  1,578,759
  1,578,817
  1,578,833
  1,578,858
  1,579,244
  1,579,261
  1,598,216
  1,598,224
  1,598,249
  1,598,254
  1,598,279
  1,598,361
  1,598,362
  1,609,702
  1,619,580
  1,619,581
  1,619,607
  1,627,701
  1,627,706
  1,627,727
  1,627,732
  1,627,739
  1,627,744
  1,629,403
  1,629,409
  1,629,415
  1,629,423
  1,629,432
  1,629,438
  1,629,442
  1,629,464
  1,629,470
  1,629,479
  1,629,483
  1,629,509
  1,629,516
  1,629,523
  1,629,537
  1,629,543
  1,629,569
  1,629,575
  1,629,580
  1,629,595
  1,629,598
  1,629,623
  1,629,627
  1,629,632
  1,629,633
  1,629,646
  1,629,654
  1,629,655
  1,629,659
  1,629,681
  1,629,685
  1,629,687
  1,629,692
  1,629,704
  1,629,720
  1,629,726
  1,629,733
  1,629,734
  1,629,744
  1,629,750
  1,629,767
  1,629,772
  1,629,782
  1,629,788
  1,629,802
  1,629,834
  1,629,842
  1,629,853
  1,629,859
  1,629,868
  1,629,883
  1,632,770
  1,633,643
  1,633,648
  1,633,669
  1,633,672
  1,633,685
  1,633,688
  1,633,692
  1,633,694
  1,633,695
  1,667,977
  1,686,330
  1,686,332
  1,686,337
  1,686,352
  1,686,354
  1,686,360
  1,686,376
  1,686,380
  1,686,419
  1,686,420
  1,686,442
  1,686,455
  1,686,458
  1,686,474
  1,686,497
  1,686,504
  1,686,508
  1,686,519
  1,686,532
  1,686,535
  1,686,552
  1,686,558
  1,686,564
  1,686,571
  1,686,581
  1,686,665
  1,686,676
  1,687,928
  1,697,408
  1,697,412
  1,697,415
  1,697,436
  1,697,440
  1,697,442
  1,697,445
  1,697,503
  1,697,504
  1,697,506
  1,697,516
  1,697,527
  1,697,535
  1,697,544
  1,697,546
  1,697,553
  1,697,558
  1,697,561
  1,697,570
  1,697,582
  1,697,595
  1,697,616
  1,697,624
  1,697,633
  1,697,635
  1,697,637
  1,697,640
  1,697,650
  1,697,653
  1,697,655
  1,697,658
  1,697,660
  1,697,664
  1,697,668
  1,697,670
  1,697,676
  1,697,678
  1,697,683
  1,697,684
  1,697,705
  1,697,707
  1,697,711
  1,697,716
  1,697,717
  1,697,719
  1,697,724
  1,697,737
  1,697,801
  1,697,953
  1,698,014
  1,698,642
  1,698,654
  1,698,686
  1,698,697
  1,698,741
  1,698,748
  1,698,756
  1,698,761
  1,698,765
  1,698,786
  1,698,810
  1,698,843
  1,698,847
  1,698,882
  1,698,890
  1,698,893
  1,698,908
  1,698,909
  1,698,926
  1,698,939
  1,699,530
  1,699,546
  1,699,564
  1,699,569
  1,699,601
  1,699,629
  1,699,635
  1,699,694
  1,699,698
  1,699,748
  1,699,756
  1,699,760
  1,699,770
  1,699,980
  1,699,994
  1,700,000
  1,700,007
  1,700,034
  1,700,047
  1,700,053
  1,700,060
  1,710,834
  1,711,047
  1,711,321
  1,719,920
  1,719,926
  1,719,945
  1,719,968
  1,719,974
  1,719,979
  1,719,997
  1,720,003
  1,720,006
  1,720,017
  1,720,050
  1,720,054
  1,720,071
  1,720,079
  1,720,084
  1,720,102
  1,720,106
  1,720,108
  1,720,135
  1,720,152
  1,720,157
  1,720,168
  1,720,170
  1,720,190
  1,720,191
  1,720,204
  1,732,396
  1,732,402
  1,732,425
  1,732,451
  1,732,513
  1,732,541
  1,732,717
  1,732,729
  1,732,742
  1,732,751
  1,732,756
  1,732,758
  1,732,763
  1,732,783
  1,732,788
  1,732,794
  1,732,803
  1,732,811
  1,732,814
  1,732,824
  1,732,846
  1,732,852
  1,732,866
  1,732,878
  1,732,896
  1,732,909
  1,732,916
  1,732,931
  1,732,947
  1,732,956
  1,732,960
  1,732,969
  1,732,972
  1,732,975
  1,732,978
  1,732,981
  1,732,982
  1,732,986
  1,732,989
  1,732,994
  1,733,002
  1,733,008
  1,733,016
  1,733,019
  1,733,042
  1,733,049
  1,733,067
  1,733,075
  1,733,078
  1,733,097
  1,733,104
  1,733,157
  1,733,161
  1,733,170
  1,733,176
  1,733,179
  1,733,185
  1,733,196
  1,733,210
  1,733,229
  1,733,241
  1,733,248
  1,733,270
  1,733,290
  1,733,291
  1,733,301
  1,733,303
  1,733,322
  1,733,324
  1,733,335
  1,733,349
  1,733,350
  1,733,361
  1,733,379
  1,733,389
  1,733,397
  1,733,402
  1,733,411
  1,733,415
  1,733,421
  1,733,426
  1,733,434
  1,733,444
  1,733,451
  1,733,461
  1,733,466
  1,733,469
  1,733,475
  1,733,481
  1,733,495
  1,733,518
  1,733,527
  1,733,533
  1,733,537
  1,733,543
  1,733,547
  1,733,555
  1,733,573
  1,733,575
  1,733,586
  1,733,587
  1,733,595
  1,733,603
  1,733,614
  1,733,615
  1,733,672
  1,733,676
  1,733,684
  1,733,691
  1,733,695
  1,733,700
  1,733,712
  1,733,717
  1,733,721
  1,733,729
  1,733,737
  1,733,745
  1,733,786
  1,733,797
  1,733,818
  1,733,822
  1,733,824
  1,733,834
  1,733,841
  1,733,847
  1,733,862
  1,733,875
  1,733,886
  1,733,893
  1,733,901
  1,733,904
  1,733,910
  1,733,912
  1,733,917
  1,733,919
  1,733,922
  1,733,928
  1,733,933
  1,733,940
  1,733,944
  1,733,952
  1,734,000
  1,734,002
  1,734,005
  1,734,018
  1,734,022
  1,734,026
  1,734,029
  1,734,035
  1,734,041
  1,734,051
  1,734,065
  1,734,071
  1,734,094
  1,734,095
  1,734,130
  1,734,163
  1,734,176
  1,734,199
  1,734,273
  1,734,333
  1,734,374
  1,734,381
  1,734,385
  1,734,441
  1,734,492
  1,734,505
  1,734,528
  1,734,559
  1,734,573
  1,734,674
  1,734,686
  1,734,703
  1,734,725
  1,734,766
  1,746,567
  1,746,580
  1,746,581
  1,746,584
  1,746,599
  1,746,626
  1,746,627
  1,746,629
  1,746,639
  1,746,650
  1,746,651
  1,746,668
  1,746,672
  1,746,680
  1,746,687
  1,746,690
  1,746,698
  1,746,728
  1,746,732
  1,746,736
  1,746,738
  1,746,743
  1,746,746
  1,746,807
  1,746,819
  1,746,822
  1,746,826
  1,746,828
  1,746,830
  1,746,838
  1,746,852
  1,746,859
  1,746,887
  1,746,893
  1,746,894
  1,746,902
  1,746,903
  1,746,904
  1,746,909
  1,746,921
  1,746,941
  1,746,951
  1,746,958
  1,746,965
  1,746,984
  1,747,001
  1,747,003
  1,747,021
  1,747,026
  1,747,039
  1,747,040
  1,747,051
  1,747,163
  1,747,283
  1,747,307
  1,747,316
  1,747,318
  1,747,319
  1,747,326
  1,747,357
  1,747,367
  1,747,371
  1,747,389
  1,747,661
  1,749,737
  1,749,769
  1,749,856
  1,749,884
  1,749,978
  1,749,989
  1,749,993
  1,750,011
  1,750,015
  1,750,022
  1,750,024
  1,750,047
  1,750,101
  1,750,107
  1,750,118
  1,759,271
  1,766,280
T/C
C/T
A/G
C/T
A/G
T/G
G/A
A/C
G/T
-/G
A/G
G/T
C/A
A/G
C/T
-/30
A/G
C/A
C/T
C/A
C/A
C/T
G/A
T/A
G/C
T/C
G/C
C/G
G/A
C/A
T/-
G/A
A/T
C/T
C
T
T
A
-
A
G/T
7
-
A
-
-
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
C
T
-
-
-
-
A
-
C
-
T
C
T
G
A
-
T
C
T
-
T
T
-
-
C
T
T
A
-
T
T
-
-
C
-
-
-
-
-
15
-
-
C
C
G
-
2
A
A
G
T
A
C
A
T
-
-
A
T
C
-
-
-
-
-
-
G
G
-
C
-
-
A
C
-
-
G
-
A/G
3/-
T/A
C/T
C/T
T
T/C
A/G
G/A
A/G
A/G
A/T
A/G
A/G
C/T
G/A
C/-
T/C
G/A
A/G
G/T
-/3
-/2
G/A
-/G
G/G
-/3
-/8
-/17
-/18
G/A
T/G
C/A
G/A
T/C
C/T
A/G
A/G
-/C
T/A
C/T
C/T
A/G
T/C
G/A
C/T
-
C
T
-
-
-
-
-
C
G
-
-
-
-
T
-
-
-
-
T
C
-
T
-
-
-
-
-
C
-
G
T
-
C
-
-
A
G
-
-
T
A
T
-
5
A
3
-
-
T
C
-
-
-
-
-
T
G
-
G
-
G
-
C
A
-
-
G
A
-
A
T
T
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
T
-
-
G
G
-
-
-
-
-
C
-
-
-
-
G
-
-
-
G
-
G
T
C
C
-
-
-
-
-
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
C
-
A
-
G
-
-
-
-
-
T
A
G
-
-
-
-
-
T
-
-
-
-
-
-
-
-
C
T
-
-
-
C
-
-
-
-
-
-
-
C
G
A
-
-
-
-
A
-
-
T
C
-
-
-
-
-
-
A
-
T
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
G
T
-
C
C
A
-
-
-
-
-
A
-
C
-
A
-
C
-
A
-
G
-
-
-
-
-
A
C
-
-
-
-
T
-
-
-
-
C
-
T
-
-
T
-
-
T
-
-
G
C/A
A/T
G/A
T/G
A/G
G/A
A/G
G/A
T/C
G/A
A/G
G/C
C/-
-/A
G/A
G/A
T/-
G/A
C/T
G/A
T/A
3/-
A/T
C/A
G/T
A/G
-/2
2/-
G/C
G/T
C/T
C/T
T/C
G/A
C/T
C/T
C/T
G/T
G/T
C/T
G/A
G/A
C/A
A/T
T/G
T/G
G/A
A/G
G/A
G/C
T/C
-/8
G/T
C/G
T/C
G/A
G/T
C/T
G/A
G/C
G/T
T/G
T
T
-
-
G/A
-
-
-
3
8
T
-
-
-
G
-
T
-