Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 367,826 (bp)   Positions: 268
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.005
.001
.0
.115
.219
.228
.224
.001
.001
.0
.001
.001
.002
.005
.997
.004
--
.0
.007
.023
.01
.001
.001
.003
.001
.002
.006
.001
.001
.002
.066
.003
.004
.0
.006
.004
.99
.559
.065
.05
.01
.005
.004
.003
.004
.001
.002
.218
.013
.218
.031
.017
.004
.0
.0
.004
.001
.018
.017
.0
.006
.009
.0
.001
.009
.013
.087
.003
.062
.063
.048
.512
.037
.014
.013
.012
--
.01
.003
.0
.003
.001
.0
.399
.556
.208
.969
.654
.812
.002
.027
.024
.0
.001
.0
.831
.007
.0
.007
.005
.114
.15
.094
.066
.003
.0
.004
.609
.0
.0
.0
.006
.003
.001
.0
.024
.132
.24
.0
.0
.0
.005
.001
.0
.0
.001
.001
.0
.0
.0
.102
.472
.011
.002
.001
.008
.014
.999
.999
.001
.008
.005
.047
.114
.118
.123
.125
.126
.005
.007
.322
.423
.003
--
--
.284
.002
.036
.008
.001
.003
.0
.193
.013
.413
.0
.009
.018
.128
.036
.046
.012
.09
.121
.962
.006
.012
.004
.013
.006
.357
.858
.007
.103
.005
.203
.333
.001
.0
.141
.374
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.182
.288
.338
.011
.108
.003
.011
.028
.037
.012
--
.087
.018
--
--
.001
.002
.004
.58
.001
.027
.058
.514
.001
.017
.025
.007
.0
.0
.009
.036
.0
.004
.0
.002
.0
.003
.004
.0
.009
.874
.912
.014
1.0
.998
.024
.79
.387
.815
.063
.019
.005
.0
.0
.017
.003
.029
.859
.003
.034
.012
.003
.332
.028
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
Gpc3
-
C
G
-
G
A
-
C
-
-
T
C
G
-
22
G
G
G
-
-
-
G
C
-
-
-
A
T
G
G
C
T
T
-
G
-
T
-
C
-
-
T
A
T
G
C
A
-
C
-
G
C
C
C
A
T
C
-
C
3
C
3
C
-
2
-
G
2
G
C
C
T
A
-
T
G
G
-
8
T
C
G
G
T
G
-
C
C
-
3
G
-
C
C
G
G
T
T
C
5
C
A
T
A
G
A
A
C
T
C
T
G
T
A
A
2
G
2
A
-
2
T
G
T
-
C
A
C
A
T
A
T
A
A
-
G
C
A
T
C
C
C
C
C
A
T
C
A
A
A
T
T
C
G
3
-
G
G
C
G
A
G
C
T
T
T
A
A
G
T
G
T
C
A
-
A
A
C
-
A
T
A
-
A
T
-
T
G
T
A
A
G
C
C
A
A
C
G
T
C
A
G
G
-
A
G
C
G
A
T
T
-
-
A
A
C
4
C
10
C
C
C
C
G
2
14
8
C
-
G
-
-
A
-
-
A
2
A
C
-
-
G
2
T
-
C
-
-
T
-
G
T
A
T
-
C
C
C
T
A
4
T
C
-
C
T
6
A
  139,589,512
  139,589,515
  139,589,522
  139,589,529
  139,589,535
  139,589,536
  139,589,546
  139,589,553
  139,589,555
  139,589,557
  139,589,558
  139,589,563
  139,607,488
  139,607,890
  139,607,931
  139,608,107
  139,608,585
  139,612,753
  139,612,756
  139,612,761
  139,612,767
  139,612,774
  139,612,786
  139,612,796
  139,612,798
  139,612,817
  139,612,825
  139,616,149
  139,617,754
  139,624,833
  139,624,843
  139,630,825
  139,631,821
  139,632,170
  139,632,180
  139,632,188
  139,632,232
  139,632,257
  139,632,267
  139,632,270
  139,632,282
  139,632,288
  139,632,294
  139,632,295
  139,632,304
  139,632,333
  139,632,334
  139,632,369
  139,632,386
  139,632,395
  139,632,410
  139,632,413
  139,632,421
  139,632,427
  139,632,428
  139,632,452
  139,632,453
  139,632,469
  139,632,487
  139,632,512
  139,632,522
  139,632,529
  139,632,536
  139,632,543
  139,632,558
  139,632,566
  139,632,597
  139,632,633
  139,632,641
  139,632,657
  139,632,670
  139,632,688
  139,632,712
  139,632,716
  139,632,721
  139,632,729
  139,633,036
  139,644,093
  139,645,129
  139,647,593
  139,650,376
  139,650,675
  139,650,679
  139,653,646
  139,653,811
  139,655,236
  139,655,481
  139,655,576
  139,655,999
  139,656,219
  139,658,201
  139,659,478
  139,661,321
  139,661,615
  139,662,491
  139,663,299
  139,664,568
  139,664,837
  139,665,105
  139,665,109
  139,665,322
  139,665,536
  139,665,601
  139,666,248
  139,666,365
  139,667,802
  139,668,450
  139,671,175
  139,671,637
  139,672,001
  139,672,106
  139,672,772
  139,674,053
  139,674,183
  139,674,736
  139,674,756
  139,674,775
  139,674,788
  139,675,191
  139,676,054
  139,676,363
  139,679,824
  139,680,254
  139,680,349
  139,680,351
  139,680,717
  139,680,841
  139,681,169
  139,681,340
  139,682,259
  139,683,922
  139,684,756
  139,684,911
  139,686,028
  139,687,303
  139,687,875
  139,692,827
  139,694,187
  139,694,342
  139,695,610
  139,695,984
  139,696,467
  139,696,494
  139,696,535
  139,696,537
  139,696,540
  139,696,542
  139,696,545
  139,697,488
  139,697,491
  139,698,624
  139,699,792
  139,700,219
  139,701,252
  139,701,272
  139,701,344
  139,701,846
  139,702,020
  139,703,352
  139,703,456
  139,703,623
  139,703,686
  139,703,985
  139,704,501
  139,704,688
  139,704,893
  139,705,164
  139,705,172
  139,706,079
  139,706,842
  139,708,077
  139,708,128
  139,709,937
  139,723,997
  139,724,773
  139,725,234
  139,729,952
  139,730,343
  139,731,882
  139,732,961
  139,737,700
  139,737,795
  139,738,093
  139,739,864
  139,740,550
  139,740,794
  139,740,894
  139,740,939
  139,740,978
  139,741,033
  139,741,270
  139,741,493
  139,741,950
  139,742,211
  139,742,370
  139,742,563
  139,742,687
  139,742,694
  139,742,758
  139,743,131
  139,743,413
  139,743,510
  139,743,560
  139,743,571
  139,743,649
  139,743,677
  139,743,796
  139,747,284
  139,749,212
  139,750,364
  139,752,753
  139,754,481
  139,754,482
  139,755,509
  139,756,388
  139,889,110
  139,889,158
  139,904,166
  139,904,305
  139,904,953
  139,905,030
  139,905,183
  139,906,383
  139,907,454
  139,909,525
  139,909,565
  139,911,224
  139,911,233
  139,911,797
  139,912,247
  139,912,624
  139,915,931
  139,915,937
  139,915,942
  139,915,979
  139,915,983
  139,915,989
  139,916,011
  139,916,013
  139,916,018
  139,916,021
  139,916,024
  139,916,044
  139,916,055
  139,917,355
  139,917,367
  139,917,382
  139,917,444
  139,917,458
  139,917,479
  139,917,491
  139,917,586
  139,921,401
  139,921,630
  139,923,953
  139,925,070
  139,926,655
  139,927,900
  139,928,112
  139,937,725
  139,938,136
  139,940,607
  139,944,575
  139,944,699
  139,944,962
  139,944,963
  139,945,015
  139,946,337
2
A
-
T
C
G
C
A
C
2
C
T
T
2
-
A
A
T
C
C
2
-
T
C
A
C
-
C
A
A
T
C
C
C
-
A
-
G
-
T
C
-
C
A
A
A
C
A
-
C
-
-
-
A
G
C
T
A
-
-
-
-
-
A
-
A
T
-
-
A
-
-
-
A
-
-
A
15
-
C
A
T
C
A
A
2
T
G
T
-
A
-/8
A
T
A
A
G
A
A
-
T
-
C
G
C
G
-
T
C
A
C
A
C
G
G
-
C
-
G
A
-
C
A
A
20
T
C
G
G
A
G
C
-
G
C
G/-
T
G
C
T
A
T
T
T
G
-
A
T
G
G
C
-
T
-
-
A
T
A
T
A
G
A
T
G
C
G
C
G
A
G
A
C
T
T
A
T
G
T
3
-
A
T
A
G
C
2
-
A
C
-
C
T
T
G
G
G
A
A
C
A
C
A
A
3
G
A
T
A
C
C
C
3
11
C
G
G
-
C/T
10/-
T
T
T
A
T
-
14/-
-
G/8
2
A
21
C
G
T
A
-
-
-
-
4
C
-
-
-
T
-
T
T
-
A
-
-
-
G
G
T
T
T
G
G
-
-
T
A
G
C
-
G