Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 135,177 (bp)   Positions: 236
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.0
.0
.004
.003
.001
.037
.0
.0
.005
.0
.973
.001
.0
.143
.001
.02
.494
.001
1.0
.02
.093
.995
.034
.0
.03
.067
.012
.112
.011
.0
.002
.0
.209
.008
.002
.333
.0
.266
.05
.035
.249
.0
.138
.001
.0
.465
.002
.495
.026
.871
.001
.001
.004
.002
.37
.056
.006
.007
.304
.0
.0
.198
.005
.0
.039
.033
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.985
1.0
.641
.714
.798
.63
.685
.782
.998
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.997
1.0
.414
.995
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
1.0
.978
.985
.996
.043
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
.972
.997
.996
1.0
.999
1.0
1.0
.999
.999
1.0
.999
1.0
1.0
1.0
.995
.999
.996
.999
.998
1.0
.996
--
--
--
--
--
.454
.003
.008
.766
.09
.0
.075
.0
.008
.015
.002
.001
.0
.008
.046
.001
.003
.001
.004
.52
.679
.026
.003
.007
.002
.0
.98
.87
.0
.001
.0
.0
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
Gpatch2l
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC100912568
LOC100912568
LOC100912568
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
A
G
T
A
A
A
C
A
A
A
T
G
T
A
C
A
G
C
C
T
A
A
A
A
G
G
G
T
T
A
A
T
A
G
G
C
G
C
C
A
C
G
C
G
A
G
C
C
G
T
C
C
C
C
T
T
T
A
T
T
C
T
T
C
G
T
G
T
G
G
C
T
C
C
A
T
G
A
C
G
T
C
C
C
C
G
G
G
T
A
A
A
A
C
C
G
G
C
T
C
G
G
C
C
G
T
T
T
A
A
T
A
C
G
A
T
A
T
A
G
C
G
T
T
G
A
A
G
G
C
G
G
G
C
T
T
T
C
C
T
A
T
T
A
A
T
C
G
G
T
A
G
G
C
G
T
T
G
T
T
C
A
C
A
A
C
T
C
A
T
G
G
T
C
C
C
T
G
G
G
T
C
T
G
A
A
T
T
G
C
C
T
G
A
T
T
C
A
T
A
T
G
A
C
A
T
A
A
G
A
T
G
G
T
A
T
A
T
G
T
A
A
G
C
G
C
T
C
C
G
G
A
T
G
  110,093,965
  110,094,013
  110,094,049
  110,094,064
  110,094,304
  110,094,329
  110,094,996
  110,095,311
  110,095,392
  110,095,600
  110,095,850
  110,096,523
  110,096,860
  110,096,988
  110,097,569
  110,097,819
  110,098,742
  110,100,333
  110,100,671
  110,101,318
  110,102,406
  110,103,074
  110,103,535
  110,104,595
  110,109,151
  110,109,415
  110,110,834
  110,113,148
  110,113,706
  110,114,191
  110,114,500
  110,114,502
  110,115,073
  110,115,659
  110,116,220
  110,116,950
  110,117,374
  110,117,798
  110,118,555
  110,119,264
  110,120,993
  110,120,997
  110,121,452
  110,122,557
  110,124,025
  110,124,092
  110,124,602
  110,124,961
  110,125,437
  110,127,242
  110,127,713
  110,128,064
  110,128,078
  110,128,084
  110,128,091
  110,128,304
  110,128,587
  110,128,845
  110,128,846
  110,129,394
  110,129,566
  110,129,596
  110,129,878
  110,130,523
  110,131,386
  110,131,459
  110,136,331
  110,138,036
  110,156,091
  110,159,116
  110,159,126
  110,159,180
  110,159,196
  110,159,298
  110,159,323
  110,159,435
  110,159,475
  110,159,556
  110,159,762
  110,163,287
  110,163,339
  110,163,368
  110,163,371
  110,163,381
  110,163,384
  110,163,709
  110,163,888
  110,165,870
  110,165,977
  110,166,114
  110,166,118
  110,166,141
  110,166,199
  110,166,264
  110,166,265
  110,166,301
  110,182,224
  110,182,280
  110,182,491
  110,182,532
  110,182,949
  110,183,013
  110,183,095
  110,183,286
  110,183,845
  110,185,021
  110,185,281
  110,185,316
  110,185,381
  110,186,498
  110,186,544
  110,187,347
  110,187,358
  110,187,408
  110,187,814
  110,187,831
  110,188,628
  110,188,632
  110,188,827
  110,189,133
  110,189,234
  110,189,375
  110,189,494
  110,189,519
  110,189,652
  110,189,915
  110,190,216
  110,190,236
  110,190,336
  110,190,409
  110,190,460
  110,190,658
  110,195,904
  110,195,910
  110,196,021
  110,196,095
  110,196,118
  110,196,220
  110,196,225
  110,196,243
  110,196,274
  110,196,391
  110,196,397
  110,196,437
  110,196,507
  110,197,488
  110,197,827
  110,197,832
  110,197,902
  110,197,918
  110,197,919
  110,198,064
  110,198,067
  110,198,104
  110,198,174
  110,198,180
  110,198,185
  110,198,191
  110,199,424
  110,199,453
  110,199,549
  110,199,603
  110,199,618
  110,199,624
  110,199,680
  110,199,692
  110,199,727
  110,206,354
  110,206,860
  110,206,869
  110,207,080
  110,209,918
  110,209,958
  110,210,018
  110,210,060
  110,210,068
  110,210,081
  110,210,094
  110,210,220
  110,210,232
  110,210,241
  110,210,396
  110,210,553
  110,210,603
  110,210,617
  110,210,628
  110,210,640
  110,210,643
  110,210,646
  110,210,846
  110,210,865
  110,210,900
  110,210,962
  110,211,036
  110,211,059
  110,211,303
  110,211,307
  110,211,329
  110,211,385
  110,211,925
  110,211,927
  110,212,549
  110,212,582
  110,212,614
  110,218,038
  110,218,219
  110,219,828
  110,219,926
  110,220,748
  110,220,790
  110,220,859
  110,221,177
  110,222,012
  110,222,024
  110,222,032
  110,222,181
  110,222,441
  110,223,076
  110,223,309
  110,223,621
  110,224,230
  110,224,761
  110,224,811
  110,224,974
  110,225,274
  110,225,552
  110,226,226
  110,226,242
  110,226,316
  110,226,328
  110,226,568
  110,226,848
  110,227,125
  110,227,525
  110,228,040
  110,228,481
G
G
T
A
C
C
G
T
T
G
G
G
C
A
C
G
T
G
T
T
T
C
A/G
G
G
G
T
C
A
C
C
G
G
C
T
A
A
T
A
T
T
T
T
A
A
A
G
A
T
T
A
C
C/T
C/T
C/T
T
C
C
C
G
C
C
T
G
C
T
C
C
T
T/C
G/C
G/C
C/A
T/C
C/T
C/T
A/C
T/C
G/C
G
C/A
G/A
T/A
C/A
C/G
T
C/T
G/T
G/A
G/A
T/C
A/G
A/G
A/G
A/G
C/G
T
T
A
A
G
G
A
C
G
A
C
C
G
A
G
G
G
G
C/A
A
C
C
C
C
G
T
C/T
A
C
C
C
C
C
T
A
C/G
A
A
A
A
G
A
G
G
G
C
T
G
T/A
G
G
A
G
C
A
A
T
A
G/C
C/T
G/C
T/G
A
G/A
C
C
G
G
C/T
A/T
A/G
A
G
A
T
G
T
T
T/C
C/T
C/T
C/A
T/C
G/A
G/T
G/A
T/G
C/T
T/C
A
A/G
A/G
C
G
C
G
C/T
C
A
G
C
C
G
G
C
A/C
T/C
G/A
G
T
T
C
A/G
G
A
G
G
G/T
G/A
C
G
C
G
C
A
C
G
G
A
T
C
G
C
G
T
A
A
G
C
A