Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 140,106 (bp)   Positions: 298
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.004
.011
.0
.0
.003
.001
.005
.013
.863
.002
.007
.0
.029
.0
.003
.018
.066
.001
.0
.0
.0
.047
.004
.003
.0
.096
.003
.0
.0
.009
.022
.0
.01
.004
.221
.001
.003
.095
.011
.032
.001
.037
.001
.02
.016
.0
.467
.021
.254
.051
.0
.001
.101
.011
.002
.004
.061
.001
.001
.002
.001
.0
.016
.279
.0
.002
.007
1.0
1.0
.0
.003
.001
.0
.977
.001
.025
.036
.0
.0
.002
.0
.001
.0
.0
.002
.001
.0
.024
.002
.002
.0
.0
.988
.016
.099
.0
.0
.0
.005
.034
.006
--
.005
.0
1.0
.016
.458
1.0
.263
.003
.0
.0
.003
.017
.01
.006
.032
.028
.499
.032
.144
.049
.0
.009
.022
.006
.0
.003
.04
.134
.003
.009
.006
.002
.017
.002
.0
.002
.004
.332
.001
.002
.0
.001
.403
.001
.0
.001
.002
1.0
.01
.433
.006
.0
.002
.0
.002
.241
.0
.001
.107
.002
.001
.0
.023
.002
.023
.005
.016
.001
.007
.005
.035
.093
.016
.003
.019
.15
.05
.01
--
--
--
--
.006
.0
.0
.001
.005
.003
.042
.001
.003
.044
.0
.107
.003
.029
.006
.902
.009
.026
.009
.013
.001
.003
.002
.001
.0
.015
.0
.002
.0
.148
.001
.001
.009
.003
.046
.011
.0
.0
.001
.006
.003
.308
.007
.001
.002
.002
.001
.001
1.0
.002
.0
.0
.048
.008
.001
.07
.011
.024
.001
.001
.026
.027
.0
.0
.006
.005
.002
.827
.132
.999
1.0
.001
.016
.002
.0
.021
.001
.001
.0
.0
.0
.999
.392
.823
.996
.001
.001
.0
.007
.0
.0
.002
.088
.176
.007
.008
.001
.001
1.0
.928
.0
.006
.001
.014
.0
.016
.0
.0
.0
.001
.001
.01
.0
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
Gpatch2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102553391
C
A
C
T
C
G
G
A
A
A
T
T
T
T
T
G
A
T
T
A
A
G
C
A
T
G
T
T
G
G
C
G
A
A
A
A
C
A
A
C
T
T
T
C
T
G
C
C
T
C
A
C
A
C
G
C
G
A
G
T
T
A
G
G
T
T
A
T
G
G
C
T
T
T
A
G
C
G
T
A
G
G
A
C
A
T
T
G
T
A
G
T
A
A
C
A
A
T
C
C
T
T
G
C
G
T
T
T
T
T
A
A
A
C
G
A
T
T
G
G
T
T
C
G
T
C
C
A
G
A
T
A
G
C
A
T
A
A
A
T
G
A
G
A
A
T
T
A
G
A
A
T
C
G
A
T
C
C
T
T
C
G
A
T
C
A
C
C
A
T
C
G
A
C
T
G
C
T
T
C
C
C
A
C
G
G
G
C
C
T
C
A
A
C
G
T
C
C
T
T
C
C
G
G
G
G
G
G
C
A
A
G
C
G
G
G
A
G
C
G
C
A
G
G
T
C
A
T
T
A
C
T
C
A
T
C
A
C
C
G
C
C
C
G
T
C
A
G
G
A
T
G
C
G
C
C
A
C
C
T
T
A
G
G
T
T
T
G
C
C
A
G
A
C
T
C
C
A
G
C
G
A
T
T
C
A
T
G
C
A
A
A
C
A
G
T
T
G
  105,686,124
  105,688,021
  105,690,566
  105,691,896
  105,691,897
  105,692,438
  105,692,694
  105,692,979
  105,694,377
  105,694,460
  105,694,582
  105,695,482
  105,695,530
  105,695,555
  105,696,300
  105,697,528
  105,697,857
  105,698,503
  105,701,277
  105,701,647
  105,703,947
  105,704,563
  105,705,118
  105,706,522
  105,706,546
  105,706,733
  105,706,877
  105,706,978
  105,707,273
  105,707,454
  105,707,933
  105,708,063
  105,708,173
  105,708,298
  105,709,566
  105,710,415
  105,710,607
  105,711,173
  105,711,292
  105,711,806
  105,711,807
  105,712,166
  105,712,255
  105,712,584
  105,713,368
  105,716,981
  105,717,116
  105,717,630
  105,717,848
  105,718,136
  105,718,151
  105,718,981
  105,719,277
  105,719,512
  105,719,662
  105,719,839
  105,720,778
  105,721,675
  105,721,737
  105,722,087
  105,722,111
  105,723,493
  105,724,229
  105,724,767
  105,726,084
  105,727,013
  105,727,921
  105,729,262
  105,729,452
  105,729,813
  105,730,688
  105,733,330
  105,733,607
  105,733,812
  105,735,256
  105,735,586
  105,737,829
  105,738,620
  105,738,962
  105,738,969
  105,739,032
  105,739,516
  105,739,859
  105,740,560
  105,740,565
  105,741,800
  105,742,701
  105,742,745
  105,743,898
  105,746,362
  105,746,388
  105,747,570
  105,748,904
  105,750,693
  105,751,487
  105,752,037
  105,752,205
  105,754,448
  105,754,521
  105,754,784
  105,754,874
  105,756,620
  105,757,028
  105,757,784
  105,758,420
  105,758,930
  105,759,792
  105,759,957
  105,760,712
  105,761,045
  105,761,141
  105,761,790
  105,762,201
  105,762,715
  105,764,126
  105,764,436
  105,764,770
  105,765,225
  105,766,420
  105,766,460
  105,766,807
  105,767,518
  105,768,390
  105,769,305
  105,771,409
  105,771,768
  105,772,056
  105,773,543
  105,775,011
  105,777,469
  105,778,584
  105,778,665
  105,779,395
  105,779,586
  105,779,964
  105,780,065
  105,781,831
  105,781,959
  105,783,166
  105,785,011
  105,785,513
  105,785,865
  105,785,949
  105,787,303
  105,788,689
  105,790,818
  105,791,613
  105,791,782
  105,791,810
  105,791,948
  105,792,186
  105,793,462
  105,793,889
  105,796,422
  105,796,548
  105,796,700
  105,797,371
  105,797,724
  105,798,089
  105,799,465
  105,800,215
  105,800,646
  105,800,702
  105,800,943
  105,801,534
  105,801,932
  105,801,984
  105,802,292
  105,802,349
  105,802,877
  105,803,216
  105,803,388
  105,803,548
  105,803,741
  105,803,749
  105,803,781
  105,803,800
  105,803,848
  105,804,002
  105,804,015
  105,804,050
  105,804,172
  105,804,257
  105,804,753
  105,804,775
  105,804,815
  105,805,220
  105,805,250
  105,805,254
  105,805,271
  105,805,281
  105,805,296
  105,805,400
  105,805,429
  105,805,494
  105,805,507
  105,805,552
  105,805,858
  105,806,002
  105,806,097
  105,806,208
  105,806,425
  105,806,513
  105,806,758
  105,806,832
  105,806,952
  105,806,981
  105,806,994
  105,807,167
  105,807,182
  105,807,285
  105,807,372
  105,807,467
  105,807,561
  105,807,628
  105,807,783
  105,807,784
  105,807,964
  105,808,064
  105,808,126
  105,808,227
  105,808,251
  105,808,417
  105,808,617
  105,808,633
  105,808,644
  105,809,027
  105,809,088
  105,809,374
  105,809,497
  105,810,729
  105,810,955
  105,811,023
  105,811,235
  105,811,310
  105,811,444
  105,811,463
  105,811,807
  105,812,035
  105,812,368
  105,812,423
  105,812,453
  105,812,493
  105,812,544
  105,812,550
  105,812,589
  105,812,590
  105,813,205
  105,813,253
  105,813,751
  105,813,762
  105,813,803
  105,813,871
  105,813,950
  105,814,009
  105,814,330
  105,814,916
  105,814,926
  105,816,265
  105,816,829
  105,817,353
  105,817,360
  105,817,373
  105,817,587
  105,817,740
  105,817,767
  105,818,006
  105,818,193
  105,818,226
  105,818,988
  105,819,239
  105,819,387
  105,819,476
  105,819,529
  105,819,633
  105,819,637
  105,819,668
  105,819,706
  105,820,061
  105,820,445
  105,820,457
  105,820,689
  105,820,690
  105,820,793
  105,820,953
  105,821,033
  105,821,235
  105,821,281
  105,821,433
  105,822,400
  105,822,604
  105,822,869
  105,822,872
  105,822,958
  105,823,667
  105,823,881
  105,824,288
  105,824,331
T
G
T
A
A
A
A
G
T
C
G
C
G
C
G
A
G
C
C
C
C
C
T
G
G
A
C
A
A
T
T
A
G
G
G
G
T
C
T
T
G
C
C
T
G
A
A
T
C
T
G
T
C
T
A
T
A
G
A
C
G
G
A
A
A
C
G
C
A
A
T
A
C
C
G
A
T
A
A
G
A
C
G
G
G
C
G
A
G
G
A
A
G
C
T
G
T
C
T
G
C
C
T
A
A
C
C
C
G
G
G
G
G
T
A
G
C
C
A
A
C
C
A
C
A
G
T
G
A
G
C
G
A
T
G
C
G
G
G
C
A
G
A
G
G
A
C
G
A
T
G
C
A
A
G
C
T
T
C
C
A
T
T
C
T
C
G
T
G
G
G
T
G
T
G
A
T
C
C
G
G
T
C
T
A
A
A
T
T
C
G
C
G
A
A
A
T
T
A
A
A
T
A
C
C
A
A
A
T
T
C
A
T
A
A
C
G
A
T
C
T
T
A
A
C
A
G
C
C
G
T
A
T
G
C
A
C
G
T
A
A
T
T
A
G
T
G
A
A
G
C
A
T
A
A
G
G
A
G
C
G
G
A
T
C
C
C
A
T
T
G
A
C
T
C
T
T
G
A
T
A
G
C
C
T
G
G
C
T
G
T
G
T
G
A
C
C
A