Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 53,279 (bp)   Positions: 287
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.057
.0
.001
.001
.0
.003
.008
.037
.003
.002
.002
.01
.001
.001
.155
.0
.481
.013
.01
.0
.001
.003
.012
.001
.001
.001
.0
.016
.0
.002
.002
.005
.007
.039
.029
.033
.031
.074
.012
.042
.046
.001
.001
.0
.003
.005
.967
.019
.011
.012
.001
.0
.0
.003
.0
.097
.186
.02
.467
.027
.125
.005
.001
.001
.002
.0
.0
.0
.0
.008
.0
.002
.015
.051
.001
.003
.009
.0
.005
.017
.014
.01
1.0
.0
.0
.001
.004
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.009
.002
.001
.022
.002
.003
.0
.003
.006
.0
.0
.163
.003
.001
.017
.139
.002
.004
.0
.002
.006
.001
.084
.249
.253
.532
.019
.007
.006
.091
.216
.176
.0
.01
.005
.008
.0
.0
.004
.013
.001
.086
.052
.0
.001
.36
.003
.109
.117
.063
.46
.024
.984
.004
.026
.005
.045
.032
.05
.557
.42
.001
.547
.027
.013
.004
.005
.001
.201
.172
.006
.002
.217
.012
.027
.026
.046
.028
.0
.016
.014
.002
.003
.004
.002
.039
--
--
.005
.005
.024
--
--
--
--
--
.016
.014
.11
.0
.088
.005
.0
.002
.011
.001
.0
.123
.17
.976
.005
--
--
.114
.2
.204
.203
.135
.068
.051
.048
.004
.001
.0
.0
.0
.004
.001
.001
.0
.0
.004
.001
.014
.821
.0
.0
.004
.0
.0
.03
.004
.021
.752
.032
.014
.004
.0
.001
.007
.013
.006
.001
.132
.002
.014
.029
.0
.001
.0
.015
.005
.0
.0
.002
.013
.191
.033
--
--
--
--
--
--
--
.013
.03
.033
.0
.008
.001
.006
.008
.002
.032
.005
.017
.0
.002
.002
.0
.021
.091
.096
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
A
T
A
C
C
C
A
C
G
T
T
T
C
T
A
A
T
A
A
A
A
T
C
C
A
G
A
T
G
G
G
A
T
A
C
T
G
C
T
A
T
T
T
A
C
T
G
C
T
A
G
G
T
T
A
T
A
C
T
T
T
T
T
C
A
C
C
C
G
T
A
A
G
A
T
G
G
C
T
A
T
T
T
C
C
C
G
A
C
C
A
C
T
G
T
G
A
G
C
T
G
A
C
A
G
A
C
A
A
G
C
G
C
G
C
G
C
G
A
G
C
C
C
T
A
C
G
G
T
G
T
G
T
T
T
T
A
A
C
C
C
T
T
C
T
C
A
G
G
A
G
G
A
G
C
C
C
A
T
G
G
A
G
C
G
T
A
A
T
A
A
G
G
G
C
G
T
A
A
C
C
A
C
C
C
G
A
G
C
T
A
T
G
A
T
T
C
G
A
C
T
C
G
G
G
C
C
T
G
A
A
C
G
T
T
G
A
C
A
G
G
C
C
G
G
A
C
A
C
T
T
A
T
G
G
G
T
T
G
A
A
G
C
A
C
G
G
C
T
A
G
T
C
A
C
G
G
A
G
C
A
A
C
A
C
T
C
T
C
A
A
C
T
C
C
A
G
A
A
T
G
A
C
G
C
G
T
  10,344,263
  10,344,972
  10,344,995
  10,345,009
  10,345,016
  10,345,105
  10,345,522
  10,345,523
  10,345,699
  10,345,726
  10,345,729
  10,345,740
  10,345,792
  10,345,855
  10,345,900
  10,346,198
  10,346,252
  10,346,308
  10,346,382
  10,346,396
  10,346,413
  10,346,598
  10,346,703
  10,346,771
  10,347,046
  10,347,145
  10,347,259
  10,347,339
  10,347,541
  10,347,544
  10,347,545
  10,347,565
  10,347,568
  10,347,576
  10,347,701
  10,347,702
  10,347,819
  10,348,397
  10,348,415
  10,348,881
  10,348,902
  10,348,926
  10,348,927
  10,348,970
  10,349,214
  10,349,270
  10,349,884
  10,350,293
  10,350,727
  10,351,768
  10,351,901
  10,351,985
  10,352,582
  10,352,920
  10,353,068
  10,353,227
  10,353,282
  10,353,864
  10,354,275
  10,354,672
  10,355,934
  10,355,984
  10,356,376
  10,356,671
  10,356,748
  10,358,176
  10,358,352
  10,358,357
  10,358,475
  10,363,178
  10,363,576
  10,363,788
  10,364,184
  10,364,465
  10,365,009
  10,365,188
  10,365,215
  10,365,252
  10,365,260
  10,365,272
  10,365,286
  10,365,288
  10,365,898
  10,366,150
  10,366,154
  10,366,182
  10,366,203
  10,366,216
  10,366,223
  10,366,246
  10,366,374
  10,366,435
  10,366,437
  10,366,452
  10,366,455
  10,366,456
  10,366,582
  10,366,644
  10,366,730
  10,366,800
  10,367,240
  10,367,281
  10,367,370
  10,367,386
  10,367,403
  10,367,427
  10,367,486
  10,367,527
  10,367,584
  10,367,646
  10,367,726
  10,367,791
  10,368,030
  10,368,126
  10,368,424
  10,368,427
  10,368,452
  10,368,495
  10,368,699
  10,368,725
  10,368,728
  10,368,804
  10,368,827
  10,368,840
  10,369,534
  10,369,641
  10,369,742
  10,369,753
  10,369,758
  10,369,778
  10,369,781
  10,369,858
  10,370,410
  10,370,426
  10,370,480
  10,370,484
  10,370,526
  10,370,537
  10,370,594
  10,370,659
  10,370,680
  10,370,718
  10,370,875
  10,371,197
  10,371,250
  10,371,402
  10,371,738
  10,371,806
  10,371,865
  10,372,035
  10,372,065
  10,372,066
  10,372,102
  10,372,112
  10,372,158
  10,372,232
  10,372,303
  10,372,304
  10,372,309
  10,372,318
  10,372,338
  10,372,364
  10,372,374
  10,372,381
  10,372,390
  10,372,522
  10,373,076
  10,373,088
  10,373,089
  10,373,441
  10,373,442
  10,373,475
  10,373,499
  10,373,611
  10,373,619
  10,373,633
  10,374,159
  10,374,270
  10,374,337
  10,374,593
  10,374,926
  10,375,063
  10,375,082
  10,375,258
  10,375,512
  10,376,483
  10,376,587
  10,376,829
  10,377,034
  10,377,225
  10,377,409
  10,377,482
  10,377,680
  10,377,968
  10,378,291
  10,378,302
  10,378,386
  10,378,469
  10,378,491
  10,378,502
  10,378,726
  10,378,752
  10,378,833
  10,378,881
  10,379,172
  10,379,353
  10,379,838
  10,379,878
  10,379,879
  10,379,884
  10,379,895
  10,379,901
  10,379,904
  10,379,908
  10,380,479
  10,380,578
  10,380,579
  10,380,687
  10,380,781
  10,380,808
  10,381,113
  10,381,118
  10,381,129
  10,381,135
  10,381,233
  10,381,534
  10,381,598
  10,381,821
  10,381,910
  10,381,921
  10,382,137
  10,382,141
  10,382,143
  10,382,288
  10,382,333
  10,382,355
  10,382,400
  10,382,417
  10,382,754
  10,382,759
  10,382,848
  10,382,849
  10,382,934
  10,383,004
  10,383,067
  10,383,075
  10,383,161
  10,383,506
  10,383,534
  10,383,592
  10,383,683
  10,383,692
  10,383,740
  10,383,908
  10,384,267
  10,384,304
  10,384,331
  10,384,536
  10,384,582
  10,384,661
  10,384,873
  10,385,154
  10,385,199
  10,385,200
  10,385,364
  10,385,406
  10,385,558
  10,385,683
  10,387,178
  10,387,209
  10,387,210
  10,387,372
  10,387,454
  10,387,572
  10,387,810
  10,388,205
  10,388,267
  10,388,914
  10,388,996
  10,389,334
  10,389,441
  10,390,595
  10,392,833
  10,394,089
  10,395,605
  10,395,717
  10,395,824
T
C
G
T
T
G
G
A
C
C
C
C
A
C
G
G
C
C
G
G
T
C
T
T
G
T
G
C
A
T
T
G
A
G
T
C
C
T
C
G
G
C
G
C
T
C
A
T
C
T
A
A
C
A
G
C
G
T
C
C
C
C
C
A
G
T
T
A
A
G
T
T
A
G
C
A
T
A
C
G
C
G
C
T
A
T
A
C
T
T
G
T
C
A
C
A
C
A
T
G
T
C
T
G
A
C
T
G
G
C
T
C
T
T
T
A
T
A
C
A
T
T
T
C
G
T
A
A
G
A
A
A
C
C
C
C
T
G
G
T
T
G
C
G
C
T
C
A
A
G
C
A
G
A
T
G
T
G
G
A
A
G
C
A
T
G
C
T
C
G
T
A
A
C
G
A
C
T
T
T
T
G
A
T
A
C
A/C
A
T
C
G
C
T
G
C
G
A
A
G
A
C
G
A
A
A
C/T
T
A
C
T
G
T
C
C
C
A
T
T
G
A
T
G
G
A
A
G
G
G
G
C
A
T
G
A
A
C
G
A
A
G
C
A
A
G
T
T
A
A
C
G
A
C
G
G
A
T
A
G
A
T
G
G
T
G
T
G
G
G
A
G
C
G
G
T
T
T
C
G
G
C
A
T
T
A
T
A
A