Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 53,279 (bp)   Positions: 374
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.006
.0
.986
.0
.008
.0
.0
.001
.0
.0
.001
.0
.0
.002
.004
.045
.04
.0
.104
.003
.002
.002
.01
.001
.155
.173
.0
.0
.481
.01
.0
.001
.003
.001
.006
.002
.001
.006
.001
.001
.072
.014
.001
.0
.012
.0
.0
.002
.097
.082
.374
.02
.377
.467
.181
.168
.004
.027
.119
.125
.005
.001
.001
.002
.0
.0
.0
.92
.99
.543
.999
1.0
1.0
1.0
.001
.012
.003
.005
.0
.0
.051
--
--
--
--
--
.0
.005
.004
.965
1.0
.0
.0
.001
.004
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.009
.002
.001
.005
.043
.11
.003
.002
.01
.003
.0
.071
.031
.028
.017
.002
.031
.001
.003
.006
.0
.0
.163
.003
.001
.017
.139
.002
.004
.0
.002
.006
--
.208
.005
.002
.001
.084
.253
.532
.019
.007
.006
.091
.216
.006
.362
.998
.847
.753
.796
.83
.859
.978
.962
.717
.825
.176
.001
.01
.005
.008
.0
.0
.004
.12
.688
.013
.001
.086
.052
.0
.001
.36
.003
.109
.117
.063
.46
.024
.002
.984
.358
.012
.004
.026
.005
.029
.215
.045
.032
.05
.557
.42
.001
.547
.027
.013
.004
.005
.005
.001
.201
.172
.006
.002
.217
.004
.002
.312
.434
.097
.074
.271
.012
.039
.006
.288
--
.046
.028
.0
.016
.014
.002
.003
.004
.002
.039
--
--
--
.005
.005
.024
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.014
.006
.005
.0
.001
.088
.005
.005
.0
.002
.011
.001
.0
.123
.17
.976
.006
--
--
.007
.5
.114
.135
.051
.048
.001
.003
.004
.001
.0
.0
.004
.001
.011
.002
.001
.001
.0
.0
.004
.001
.0
.014
.821
.002
.0
.0
.004
.021
.752
.032
.006
.008
.014
.004
.007
.013
.006
.001
.132
.001
.002
.014
.055
.0
.001
.0
.555
.015
.609
.003
.0
.005
.085
.002
.191
.033
.384
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.013
.03
.033
.008
.001
.006
.001
.002
.017
.002
.424
.002
.014
.516
--
--
--
--
--
--
--
.125
.002
.001
.0
.0
.111
.873
.096
.154
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
T
G
G
G
G
T
T
A
A
C
C
G
C
G
C
C
C
T
T
G
G
T
T
T
T
A
A
G
A
T
A
A
A
T
C
C
T
A
G
G
T
C
G
A
T
A
G
G
G
T
T
T
A
T
T
G
G
T
T
T
T
T
T
G
A
G
C
C
G
T
C
A
C
C
C
C
A
G
A
G
A
A
A
A
G
A
A
G
T
G
C
T
C
C
C
G
A
C
C
A
C
T
G
T
G
C
A
C
A
G
G
C
T
T
T
G
T
T
T
A
G
A
C
A
G
A
C
A
A
G
C
G
C
G
T
C
A
G
C
G
G
A
G
C
C
C
T
C
G
G
G
T
A
T
A
G
A
A
A
A
G
G
G
T
G
T
G
A
C
T
T
T
T
A
A
C
C
C
T
T
C
T
T
C
C
C
A
G
G
C
C
A
G
G
A
G
C
C
C
A
T
T
G
G
A
G
C
G
T
A
G
C
C
C
G
C
A
A
C
T
A
A
A
G
G
G
C
G
T
A
A
C
G
A
A
C
C
C
C
C
A
A
C
G
C
G
A
A
C
A
T
G
G
A
A
A
T
T
C
G
A
C
T
C
G
C
G
C
T
C
C
A
G
T
C
C
T
G
A
C
G
A
G
T
G
C
C
G
G
A
C
C
A
C
T
G
T
G
T
T
T
C
G
A
C
A
C
G
G
T
C
T
A
G
T
C
C
A
C
A
A
C
C
A
C
A
G
G
A
A
T
A
A
T
A
A
C
G
G
C
G
C
A
A
C
A
A
T
C
C
C
G
T
T
C
A
C
G
C
C
C
C
C
A
A
T
C
C
C
C
C
G
T
C
  10,343,408
  10,343,498
  10,344,103
  10,344,742
  10,344,903
  10,344,937
  10,344,972
  10,344,981
  10,344,995
  10,345,016
  10,345,023
  10,345,030
  10,345,089
  10,345,091
  10,345,096
  10,345,098
  10,345,162
  10,345,443
  10,345,656
  10,345,681
  10,345,699
  10,345,726
  10,345,729
  10,345,740
  10,345,855
  10,345,900
  10,345,934
  10,346,064
  10,346,198
  10,346,252
  10,346,382
  10,346,396
  10,346,413
  10,346,598
  10,346,771
  10,346,895
  10,346,925
  10,347,046
  10,347,161
  10,347,276
  10,347,417
  10,347,831
  10,348,462
  10,348,520
  10,349,702
  10,351,768
  10,351,985
  10,352,762
  10,353,114
  10,353,227
  10,353,422
  10,353,568
  10,353,857
  10,354,141
  10,354,275
  10,354,473
  10,354,475
  10,354,514
  10,354,672
  10,355,666
  10,355,934
  10,355,984
  10,356,376
  10,356,737
  10,356,748
  10,357,343
  10,358,352
  10,358,357
  10,358,946
  10,358,951
  10,358,988
  10,359,252
  10,359,324
  10,359,366
  10,359,408
  10,360,251
  10,360,267
  10,362,011
  10,362,031
  10,362,708
  10,363,576
  10,364,465
  10,364,757
  10,364,765
  10,364,775
  10,364,819
  10,364,877
  10,365,000
  10,365,260
  10,365,617
  10,365,791
  10,365,898
  10,366,150
  10,366,154
  10,366,182
  10,366,203
  10,366,216
  10,366,223
  10,366,246
  10,366,374
  10,366,435
  10,366,437
  10,366,452
  10,366,455
  10,366,456
  10,366,484
  10,366,509
  10,366,520
  10,366,544
  10,366,644
  10,366,653
  10,366,730
  10,366,800
  10,366,888
  10,366,896
  10,366,897
  10,366,904
  10,366,915
  10,367,044
  10,367,071
  10,367,240
  10,367,281
  10,367,370
  10,367,386
  10,367,403
  10,367,427
  10,367,486
  10,367,527
  10,367,584
  10,367,646
  10,367,726
  10,367,791
  10,368,030
  10,368,126
  10,368,222
  10,368,292
  10,368,359
  10,368,378
  10,368,424
  10,368,427
  10,368,495
  10,368,699
  10,368,725
  10,368,728
  10,368,804
  10,368,827
  10,368,840
  10,368,865
  10,369,171
  10,369,233
  10,369,239
  10,369,242
  10,369,244
  10,369,265
  10,369,267
  10,369,282
  10,369,377
  10,369,393
  10,369,400
  10,369,534
  10,369,716
  10,369,742
  10,369,753
  10,369,758
  10,369,778
  10,369,781
  10,369,858
  10,370,020
  10,370,101
  10,370,410
  10,370,426
  10,370,480
  10,370,484
  10,370,526
  10,370,537
  10,370,594
  10,370,659
  10,370,680
  10,370,718
  10,370,875
  10,371,197
  10,371,250
  10,371,310
  10,371,402
  10,371,614
  10,371,648
  10,371,738
  10,371,806
  10,371,865
  10,371,878
  10,372,025
  10,372,035
  10,372,065
  10,372,066
  10,372,102
  10,372,112
  10,372,158
  10,372,232
  10,372,303
  10,372,304
  10,372,309
  10,372,311
  10,372,318
  10,372,338
  10,372,364
  10,372,374
  10,372,381
  10,372,390
  10,372,522
  10,372,574
  10,372,580
  10,372,658
  10,372,705
  10,372,740
  10,372,911
  10,372,983
  10,373,076
  10,373,094
  10,373,159
  10,373,295
  10,373,336
  10,373,441
  10,373,442
  10,373,475
  10,373,499
  10,373,611
  10,373,619
  10,373,633
  10,374,159
  10,374,270
  10,374,337
  10,374,593
  10,374,601
  10,374,719
  10,375,063
  10,375,082
  10,375,258
  10,375,512
  10,375,622
  10,375,661
  10,375,698
  10,375,702
  10,375,921
  10,375,958
  10,375,973
  10,376,066
  10,376,113
  10,376,314
  10,376,982
  10,377,409
  10,377,415
  10,377,570
  10,377,680
  10,377,901
  10,377,968
  10,378,130
  10,378,291
  10,378,302
  10,378,386
  10,378,469
  10,378,491
  10,378,502
  10,378,726
  10,378,752
  10,378,833
  10,378,879
  10,379,172
  10,379,353
  10,379,505
  10,379,829
  10,379,838
  10,379,895
  10,379,904
  10,379,908
  10,380,156
  10,380,294
  10,380,479
  10,380,578
  10,380,781
  10,380,799
  10,380,808
  10,380,841
  10,380,845
  10,380,861
  10,381,113
  10,381,118
  10,381,129
  10,381,135
  10,381,233
  10,381,534
  10,381,559
  10,381,598
  10,381,821
  10,381,907
  10,381,921
  10,382,060
  10,382,137
  10,382,355
  10,382,400
  10,382,417
  10,382,591
  10,382,601
  10,382,754
  10,382,759
  10,382,934
  10,383,004
  10,383,067
  10,383,075
  10,383,161
  10,383,229
  10,383,506
  10,383,534
  10,383,590
  10,383,683
  10,383,692
  10,383,740
  10,383,847
  10,383,908
  10,383,936
  10,384,006
  10,384,027
  10,384,267
  10,384,495
  10,384,536
  10,384,661
  10,384,873
  10,384,957
  10,385,094
  10,385,154
  10,385,200
  10,385,406
  10,385,663
  10,385,668
  10,385,683
  10,385,781
  10,385,817
  10,385,969
  10,386,309
  10,386,448
  10,386,521
  10,386,524
  10,386,529
  10,386,537
  10,386,540
  10,387,178
  10,387,209
  10,387,210
  10,387,454
  10,387,572
  10,387,810
  10,388,124
  10,388,267
  10,389,334
  10,389,592
  10,390,511
  10,390,595
  10,390,671
  10,391,517
  10,392,034
  10,392,035
  10,392,045
  10,392,059
  10,392,068
  10,392,136
  10,392,137
  10,392,250
  10,392,833
  10,392,897
  10,393,796
  10,393,918
  10,394,129
  10,394,621
  10,395,824
  10,395,832
C
A
A
A
T
G
C
T
G
T
T
A
T
T
A
T
T
C
C
A
C
C
C
C
C
G
C
A
G
C
G
G
T
C
T
T
A
G
T
A
A
A
C
G
C
T
A
A
A
C
A
C
G
C
C
G/A
A
G
C
G
C
C
C
A
G
T
T
A
G/C
T/A
C/G
A/G
C/G
C/G
C/G
C/A
A/C
A
T
C
T
G
A/G
A/G
G/A
A/T
A/G
A
C
A
A
C
T
A
T
A
C
T
T
G
T
C
A
C
A
G
G
A
C
A
A
T
G
C
C
A
G
A
A
G
T
C
T
G
A
C
T
G
G
C
T
C
T
T
G
T
G
A
T
A
A
C
A
T
T
T
C
T
A
G/A
G/A
T/G
A/T
T/G
A/T
A
G
G
G
G
C
A
A
G
A
A
A
G
T
C
C
C
C
T
G
G
T
T
G
C
G
C
C
T
T
A
C
A
A
A
G
G
C
A
G
A
T
G
T
G
G
C
A
A
G
C
A
T
G
G
A
T
T
C/T
G/T
T
C
G
T
C
G
G
T
A
A
C
G
A
C
T
T
T
T
G
G
A
T
A
G
C/T
A/G
A/T
C/T
G/A
G
A
G
G
A
G
T/G
A
T
C
G
G
C
G
A
A
G
A
C
G
G/A
T
A
T
A
T
T
G
C
C
T
T
C
A
G
T
A
G
C
C
T
G
G
A
A
G
T
G
G
T
C
A
A
C
G
A
C
C/A
A
G
A
G
T
T
A
A
A
C
G
A
C
G
A
G
T
G
G
A
G
G
T
G
A
A
G
G
G
C
G
G
A/G
A/C
C/A
G/A
G/C
C/G
G/A
C/G
A/C
A/G
A
G
C
G
T
T
G
C
C
C
A
T
A
A
T
T
T
A
G
G
T
A
T
T
T
T
T
C
A
G