Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 156,378 (bp)   Positions: 290
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.065
.0
.0
.001
.001
.001
.0
.0
.295
.0
.0
.0
.004
.0
.0
.0
.006
.042
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.022
.031
.073
.008
.001
.027
.001
.001
.001
.002
.004
.004
.0
.001
.0
.006
.885
.091
.001
.014
.029
.028
.0
.0
.008
.001
.0
.002
.003
.002
.009
.0
1.0
.031
.0
.154
.002
.02
.03
.002
.001
.804
.133
.03
.0
.014
.001
.0
.0
.007
.01
.001
.001
.006
.001
1.0
.004
.0
.0
.001
.012
.998
.998
.102
.001
.0
.001
.999
.004
.001
.006
.054
.028
.002
.009
.001
.002
.002
.0
.296
.078
.002
.0
.0
.01
.026
.0
.001
.0
.001
.334
.008
.068
.073
.047
.237
.046
.006
.721
.054
.561
.192
.21
.113
.047
.865
.024
.005
.122
.052
.11
.027
.461
.483
.037
.069
.017
.095
.055
.017
.336
.384
.001
.003
.0
.0
.003
.002
.106
.001
.004
.048
.0
.142
.002
.0
.001
.001
.001
.009
.1
.004
.961
.0
.0
.0
.002
.0
.002
--
.0
.104
.0
.017
.0
.001
.0
.037
--
--
--
--
--
--
--
--
.972
.94
.94
.964
.995
.951
.94
.941
--
--
--
--
--
--
--
.001
.008
.034
.002
.0
.249
.005
.011
--
--
--
--
--
.005
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.017
.033
.028
.939
.989
.0
.0
.019
.117
.03
--
--
.006
.06
.014
.013
.001
.001
.006
.0
.014
.006
.002
.166
.01
.001
.046
.001
.0
.002
.007
.0
.001
.012
.0
.016
.0
.001
.001
.0
.002
.003
.006
.0
.004
.004
.05
.0
.005
.002
.0
.008
.029
.086
.0
.576
.015
.0
.0
.982
.316
.994
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
C
A
C
C
G
A
C
G
A
A
A
A
T
T
C
G
A
A
A
A
T
C
T
A
G
G
A
C
C
C
C
G
C
A
C
G
A
T
T
C
C
T
G
A
T
T
G
T
T
T
A
C
G
C
T
C
G
C
C
A
T
C
G
A
G
T
A
C
A
G
A
A
G
A
C
T
C
A
C
T
G
A
A
C
C
T
G
G
G
C
T
T
T
A
C
T
A
C
A
G
A
T
A
A
A
C
G
A
C
T
G
A
G
A
T
C
T
G
T
G
A
A
C
G
T
G
A
T
T
A
G
G
A
C
A
A
T
A
A
G
A
C
T
A
G
A
G
T
G
A
T
G
C
A
C
T
T
A
T
C
G
C
G
G
T
G
G
T
G
T
G
T
G
G
T
G
C
C
T
T
T
T
C
T
T
A
C
G
C
T
C
C
A
T
G
C
C
G
C
C
A
T
G
C
A
A
C
A
T
C
A
A
A
C
G
T
T
T
T
T
T
G
T
A
T
C
C
G
A
C
T
G
G
C
T
T
C
G
A
T
T
T
A
C
G
G
C
C
T
A
T
T
T
T
C
G
T
C
A
T
G
T
G
G
A
T
G
T
T
G
A
G
C
C
G
G
G
C
C
A
G
C
G
G
T
T
G
A
A
C
  11,513,560
  11,515,249
  11,515,258
  11,515,662
  11,515,749
  11,516,068
  11,516,214
  11,517,054
  11,517,438
  11,517,607
  11,518,084
  11,518,349
  11,519,146
  11,521,185
  11,522,064
  11,522,378
  11,523,859
  11,525,180
  11,528,054
  11,528,946
  11,529,659
  11,529,938
  11,529,975
  11,529,982
  11,530,382
  11,530,584
  11,531,104
  11,531,380
  11,531,487
  11,531,491
  11,531,495
  11,531,577
  11,531,788
  11,531,887
  11,532,526
  11,532,527
  11,533,287
  11,534,439
  11,535,872
  11,536,325
  11,536,448
  11,536,989
  11,537,044
  11,537,304
  11,537,340
  11,537,619
  11,538,135
  11,538,717
  11,538,879
  11,538,927
  11,540,057
  11,540,185
  11,541,473
  11,542,179
  11,542,597
  11,542,702
  11,542,889
  11,543,849
  11,544,150
  11,544,373
  11,544,499
  11,544,823
  11,545,271
  11,545,464
  11,546,090
  11,546,118
  11,546,235
  11,546,594
  11,546,738
  11,546,766
  11,546,883
  11,546,909
  11,547,438
  11,547,739
  11,548,606
  11,548,724
  11,549,392
  11,550,691
  11,551,129
  11,551,295
  11,551,321
  11,551,502
  11,551,669
  11,551,731
  11,555,877
  11,556,010
  11,556,037
  11,556,471
  11,556,803
  11,556,818
  11,558,719
  11,559,691
  11,559,997
  11,561,671
  11,562,170
  11,562,508
  11,563,149
  11,563,218
  11,563,729
  11,563,845
  11,564,594
  11,565,035
  11,565,132
  11,565,452
  11,565,659
  11,565,862
  11,566,033
  11,566,068
  11,566,316
  11,566,829
  11,567,540
  11,567,723
  11,569,528
  11,569,568
  11,569,786
  11,569,919
  11,569,988
  11,570,002
  11,570,008
  11,570,009
  11,570,022
  11,570,049
  11,570,128
  11,570,138
  11,570,148
  11,570,162
  11,570,188
  11,570,192
  11,570,248
  11,570,267
  11,570,318
  11,570,487
  11,570,551
  11,570,555
  11,570,582
  11,570,662
  11,570,668
  11,570,671
  11,570,677
  11,570,678
  11,570,813
  11,570,815
  11,570,848
  11,570,868
  11,570,871
  11,570,878
  11,570,886
  11,570,888
  11,570,911
  11,570,918
  11,571,182
  11,571,348
  11,571,542
  11,572,026
  11,572,433
  11,575,776
  11,575,779
  11,575,830
  11,576,767
  11,577,473
  11,577,650
  11,578,114
  11,578,687
  11,579,455
  11,579,712
  11,580,112
  11,580,373
  11,581,303
  11,581,701
  11,582,090
  11,582,099
  11,583,070
  11,583,180
  11,583,503
  11,583,753
  11,584,153
  11,586,244
  11,587,978
  11,590,127
  11,590,397
  11,594,022
  11,594,969
  11,595,424
  11,596,846
  11,596,994
  11,597,747
  11,599,248
  11,599,308
  11,599,411
  11,599,477
  11,599,532
  11,599,794
  11,599,832
  11,600,236
  11,600,243
  11,600,269
  11,600,302
  11,600,315
  11,600,336
  11,600,376
  11,600,871
  11,600,970
  11,601,005
  11,601,012
  11,601,025
  11,601,253
  11,601,329
  11,602,597
  11,602,651
  11,602,840
  11,604,301
  11,604,940
  11,605,306
  11,605,587
  11,610,128
  11,612,450
  11,612,459
  11,612,468
  11,612,477
  11,612,545
  11,615,182
  11,615,503
  11,615,509
  11,615,564
  11,615,637
  11,615,640
  11,615,675
  11,615,891
  11,615,903
  11,615,907
  11,616,253
  11,619,678
  11,619,689
  11,619,797
  11,619,801
  11,619,825
  11,619,845
  11,619,857
  11,619,928
  11,619,933
  11,622,102
  11,622,278
  11,622,310
  11,622,319
  11,622,850
  11,622,852
  11,622,858
  11,626,239
  11,627,886
  11,628,399
  11,629,066
  11,632,401
  11,632,568
  11,633,861
  11,634,184
  11,634,726
  11,636,928
  11,637,447
  11,637,791
  11,638,557
  11,638,640
  11,638,706
  11,638,786
  11,639,141
  11,641,670
  11,642,658
  11,642,917
  11,643,066
  11,643,993
  11,645,637
  11,647,103
  11,647,275
  11,647,397
  11,648,303
  11,651,657
  11,652,112
  11,653,095
  11,655,360
  11,656,958
  11,657,959
  11,660,577
  11,660,698
  11,660,832
  11,662,172
  11,663,647
  11,664,402
  11,666,478
  11,666,654
  11,668,196
  11,669,543
T
G
T
T
A
C
T
T
C
G
T
G
C
C
T
A
G
G
C
G
G
G
C
G
A
T
T
T
C/A
C/A
A
T
G
G
T
T
G
C
C
T
G
C
A
G
C
C
A
C
C
G
G
G
C
T
C
A
T
T
T
G
C
T
T
G
C
C
G
T
G
T
T
G
A
G
G
C
A
G
T
C
A
T
G
T
T
C
A
A
A
T
C
C
C
G
T
C
G
G
G
T
T
G
T
G
C
T
A
G
T
G
A
G
A
G
C
T
T/C
G/A
T/C
G/A
A/G
A/G
C/T
G/A
T/A
G/A
A/T
T/C
T/A
A/G
G/A
G/A
A/G
C/T
A/G
A/G
T/A
A/G
A/C
G/C
A/C
C/T
T/A
A/T
G/A
A/G
A
T/A
G/A
A/G
C
A
T
G
C/T
T/G
T/C
A/G
C
T
C
T
A
C
G
T
A
C
A
G
A
A
A
C
C
C
G
T
G
C
C
C
T
C
G
G
T
T
T
G
T
G
T
T/G
G/C
C/G
C/T
G/A
G
T
T
A
C
G
T
G
A
C
G
G
C
G
G
T
A
T/C
T/C
T/C
T/C
T/C
C
C
C
C
G
G
A
C
C
G
C
A
A
C/G
T/G
T/G
C/G
G/C
C
T/G
G
A
C
A
C
A
A
T
C
G
T/G
C
C
A
T
A
C
T
G
A
A
C
A
A
G
C
T
C
A
A
G
A
C/T
T
A
C
A
T
G
G
A
T
C
G/T
C
C
C
G
G
G