Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 369,744 (bp)   Positions: 325
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.025
.002
.001
.001
.0
.069
.937
.414
.002
.002
.0
.0
.002
.001
.642
.002
.029
.009
.002
.008
.0
1.0
.004
.0
.002
.0
.015
.009
.018
.001
.003
.003
.009
.001
.008
.0
.001
.0
.074
.004
.024
.01
.594
.998
.021
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
1.0
.0
.0
.0
.169
.002
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.218
.008
.0
.003
.019
.001
.001
.004
.0
.0
.083
.016
.001
.091
--
.022
.001
.0
.004
.007
.01
.017
.0
.0
.002
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.992
.967
.658
1.0
.303
.336
.012
.0
.0
.031
.0
.0
.877
.0
.0
.0
.0
.943
.168
.033
.006
.125
.0
.0
.0
.002
.006
.001
.015
.0
.016
.004
.177
.424
.066
.001
.0
.001
.0
.0
.211
.821
--
--
--
--
.017
.002
.027
.001
.02
.012
.0
.0
.976
.004
.0
.017
.002
.004
.0
.0
.014
.023
.001
.006
.0
.0
.001
.002
.005
.008
.711
.001
.224
.3
.016
.096
.02
.001
--
--
.027
.03
.942
.88
.021
.01
.0
.001
.018
.001
.076
.008
.003
.474
.013
.019
.939
.958
.912
.94
.013
.004
.102
.064
.054
--
.759
.001
.339
.001
.02
.005
.0
.0
.003
.024
.006
.0
1.0
.341
.012
.01
.017
.041
.037
.746
.779
.539
.28
.006
.001
.997
.993
.96
.927
.213
--
.089
.001
.031
.0
.003
.001
.001
.0
.057
.018
.01
.042
.044
.013
.008
.011
.1
.974
.978
.944
.546
.314
.29
.291
.064
.033
.04
.037
.03
.002
.307
.021
.001
1.0
.0
.012
.004
.003
--
.0
.0
.029
.01
.015
.013
.014
.01
.003
.038
.0
.005
.034
--
--
--
.049
.004
.04
.051
.58
1.0
.998
.603
.914
.998
.993
.996
.998
1.0
.989
.997
.997
1.0
.0
.051
.0
.007
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102556644
LOC102556644
LOC102556644
LOC102556644
LOC102556644
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
Gfra1
T
C
G
2
G
T
A
T
T
C
A
C
C
C
G
C
C
A
4
C
C
T
-
T
T
G
T
T
T
T
C
T
T
2
T
T
A
A
G
-
T
T
A
A
G
A
T
C
C
T
A
A
G
C
T
A
T
G
A
A
C
C
A
C
T
T
20
T
G
C
G
T
G
T
2
27
3
A
A
C
A
T
G
-
-
G
G
A
T
G
T
G
A
G
-
A
G
T
3
A
A
A
A
T
A
T
-
G
T
A
10
A
G
G
C
T
G
A
C
A
G
A
C
A
T
G
C
G
C
T
T
C
10
C
C
-
-
A
T
T
T
G
8
C
C
G
G
A
4
A
A
-
C
-
A
G
-
T
A
A
T
C
A
T
G
4
G
G
G
A
T
G
G
A
C
G
A
G
G
G
T
G
A
G
T
G
T
T
T
T
-
G
T
2
C
A
C
G
C
T
A
C
T
T
C
C
G
A
G
A
A
G
A
C
T
G
C
G
C
C
G
A
A
A
-
C
2
T
A
C
A
T
2
A
-
-
-
-
T
G
A
G
11
G
5
A
94
G
T
C
-
A
C
A
A
G
G
C
-
A
-
C
-
-
T
A
C
-
A
-
-
-
-
A
T
T
-
-
G
G
G
T
T
T
29
A
A
A
A
C
G
A
A
A
A
4
A
-
-
A
A
-
A
7
T
T
T
T
T
A
T
-
-
T
A
-
-
C
T
G
G
-
C
T
G
  279,204,008
  279,204,776
  279,205,888
  279,206,518
  279,206,541
  279,207,066
  279,207,368
  279,207,751
  279,207,914
  279,207,916
  279,207,958
  279,208,053
  279,208,118
  279,208,584
  279,208,660
  279,210,042
  279,211,483
  279,212,520
  279,213,913
  279,215,030
  279,215,234
  279,215,487
  279,215,876
  279,215,886
  279,216,005
  279,216,189
  279,217,304
  279,218,584
  279,218,862
  279,222,890
  279,223,442
  279,223,910
  279,224,553
  279,226,452
  279,226,716
  279,227,646
  279,231,127
  279,231,685
  279,231,688
  279,231,861
  279,234,543
  279,235,599
  279,235,838
  279,235,996
  279,236,316
  279,236,625
  279,236,745
  279,236,828
  279,236,993
  279,237,076
  279,237,342
  279,238,325
  279,238,441
  279,238,612
  279,238,930
  279,238,990
  279,239,036
  279,239,055
  279,240,675
  279,242,402
  279,242,497
  279,242,515
  279,243,059
  279,243,660
  279,244,341
  279,244,710
  279,246,928
  279,246,961
  279,247,240
  279,247,284
  279,247,586
  279,247,672
  279,248,214
  279,248,442
  279,248,490
  279,248,493
  279,248,521
  279,248,525
  279,248,696
  279,248,717
  279,248,718
  279,249,439
  279,249,878
  279,250,097
  279,250,294
  279,250,384
  279,250,648
  279,250,700
  279,251,066
  279,251,579
  279,252,173
  279,252,220
  279,252,258
  279,252,539
  279,252,572
  279,252,884
  279,253,265
  279,253,303
  279,253,408
  279,253,413
  279,253,414
  279,253,573
  279,253,656
  279,253,657
  279,253,669
  279,253,670
  279,253,686
  279,254,156
  279,254,342
  279,254,387
  279,254,582
  279,254,592
  279,254,617
  279,254,753
  279,254,885
  279,255,060
  279,255,312
  279,256,048
  279,256,948
  279,257,033
  279,257,825
  279,258,301
  279,258,535
  279,258,572
  279,259,501
  279,260,395
  279,260,988
  279,261,035
  279,261,374
  279,262,600
  279,262,952
  279,264,163
  279,264,166
  279,264,188
  279,264,831
  279,265,564
  279,265,568
  279,266,050
  279,266,098
  279,266,488
  279,266,979
  279,267,740
  279,267,845
  279,268,472
  279,269,022
  279,269,488
  279,269,818
  279,269,827
  279,270,320
  279,270,728
  279,271,778
  279,272,199
  279,272,202
  279,272,350
  279,272,616
  279,272,825
  279,273,002
  279,273,183
  279,273,265
  279,273,291
  279,273,308
  279,273,471
  279,273,603
  279,274,006
  279,274,008
  279,274,215
  279,274,521
  279,274,832
  279,274,946
  279,275,127
  279,275,391
  279,276,297
  279,276,854
  279,277,839
  279,278,092
  279,278,866
  279,278,996
  279,279,711
  279,279,798
  279,279,852
  279,280,300
  279,280,350
  279,280,428
  279,280,550
  279,280,580
  279,280,593
  279,280,616
  279,280,638
  279,281,119
  279,281,203
  279,282,178
  279,282,418
  279,283,263
  279,283,291
  279,283,394
  279,283,626
  279,283,642
  279,283,648
  279,283,664
  279,283,911
  279,284,091
  279,284,712
  279,284,736
  279,284,853
  279,284,953
  279,285,154
  279,285,356
  279,285,361
  279,285,406
  279,285,411
  279,285,476
  279,285,591
  279,285,744
  279,285,748
  279,286,207
  279,286,307
  279,286,644
  279,287,196
  279,287,228
  279,287,407
  279,287,626
  279,287,696
  279,287,770
  279,287,788
  279,288,012
  279,288,206
  279,288,532
  279,288,562
  279,288,776
  279,288,849
  279,289,088
  279,289,200
  279,289,285
  279,289,292
  279,289,461
  279,289,494
  279,289,521
  279,289,533
  279,289,595
  279,289,605
  279,290,958
  279,291,824
  279,291,826
  279,291,847
  279,291,855
  279,291,860
  279,294,151
  279,294,775
  279,295,250
  279,295,510
  279,296,164
  279,296,700
  279,296,936
  279,297,203
  279,297,268
  279,297,944
  279,297,964
  279,297,971
  279,297,981
  279,297,985
  279,298,507
  279,298,511
  279,298,516
  279,298,522
  279,298,552
  279,298,557
  279,298,563
  279,298,569
  279,298,576
  279,298,579
  279,298,585
  279,298,605
  279,298,608
  279,298,610
  279,298,612
  279,298,622
  279,298,630
  279,298,635
  279,299,106
  279,299,111
  279,299,162
  279,299,569
  279,299,625
  279,307,018
  279,313,940
  279,343,345
  279,416,187
  279,416,447
  279,429,658
  279,430,087
  279,430,219
  279,430,257
  279,430,258
  279,430,263
  279,430,267
  279,453,543
  279,453,580
  279,453,597
  279,453,652
  279,477,242
  279,477,743
  279,477,878
  279,514,010
  279,537,287
  279,537,949
  279,537,955
  279,538,152
  279,538,230
  279,538,468
  279,555,416
  279,555,421
  279,555,452
  279,555,480
  279,555,481
  279,555,482
  279,555,488
  279,555,497
  279,555,517
  279,555,518
  279,555,525
  279,567,719
  279,568,306
  279,568,423
  279,568,570
  279,568,874
C
T
T
-
C
C
G
C
-
A
C
T
T
T
A
A
G
G
-
T
G
C
G
G
C
A
C
-
C
C
T
C
C
-
C
C
T
G
A
46
C
C
C
G
A
A/G
T/C
T
C/T
T/A
C
A/G
G/A
C/-
T/A
A/G
T/G
G/A
A/G
G
C/T
C/G
G
G
C
C
-
C
A
T
A
C
A
C
-
-
-
C
G
T
G
C
T
A
3
C
A
G
C
A
C
T
G
A
A
C
A
C
-
C
C
G
G
C
G
A
4
A
C
G
-
T
A
A
T
A
T
G
T
T
A
G
T
G
C
C
T
A
A
G
C
T
-
T
G
A
13
G
C
C
C
T
-
T
T
C
A
G
-
G
G
4
T
4
G
A
2
C
G
G
C
T
G
G
A
-
T
A
A
T
A
A
C
C
T
A
G
A
T
A
A
A
G
A
C
T
A
C
A
C
4
T
-
2/-
G
G
G
A
-
C
G
T
C
C
T
T
A
G
A
G
C
A
C
T
A
A
T
-
T
A
A
G
G
G
T
T
-
A
C
T
T
C
-
G
A/T
4
5
3
C
A
G
T
-
-
-
T
-
C
C
T
10
G
T
C
C
-
C
A
G
-
A
-
C
C
C
-
A
A
C
A
C
A
3
T
A
-
C
A
A
A
A
C
C
C
-
G
G
G
G
G
-
G
G
G
G
-
G
2
2
C
G
2
G
-
G
G
C
-
C
-
G
G
G
A
G
G
G
G
C
-
-
20
A
C
A