Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 231,114 (bp)   Positions: 577
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.0
.0
.27
.018
.002
.0
.0
.0
.002
.018
.002
.047
.042
.029
.016
.002
.009
.013
.012
.002
.001
.013
.295
.02
.001
.006
.004
.013
.014
.012
.132
.484
.002
.007
.037
.026
.027
.978
.056
.015
.015
.02
.002
.032
.019
.216
.354
.77
.288
.149
.063
.069
.009
.001
.008
.001
.002
.005
.012
.0
.001
.001
.01
.012
.001
.0
.001
.0
.049
.002
.017
.033
.0
.0
.001
.008
.003
.003
.009
.814
.222
.141
.001
.0
.008
.023
.05
.068
.006
.002
.001
.301
.007
.006
.033
.0
.0
.001
.01
.0
.005
.0
.0
.0
.037
.003
.001
.423
.331
.006
.013
.0
.001
.0
.007
.018
.035
.001
.0
.016
.04
.423
.005
.0
.103
.234
.004
.002
.0
.005
.001
.009
.001
.001
.011
.0
.001
.01
.0
.043
.019
.001
.001
.409
.108
.135
.033
.008
.0
.0
.002
.0
.018
.589
.001
.081
.0
.007
.007
.006
.006
.015
.012
.049
.184
.01
.004
.202
.093
.065
.003
.142
.001
.001
.0
.148
.182
.053
.033
.021
.022
.0
.001
.005
.0
.0
.023
.016
.016
.0
.0
.0
.014
.0
.0
.016
.093
.001
.085
.0
.014
.013
.375
.005
.005
.001
.009
.003
.0
.0
.0
.0
.003
.0
.001
.0
.06
.001
.008
.001
.04
.0
.0
.001
.001
.001
.0
.004
.181
.161
.031
.002
.003
.006
.034
--
.002
.115
.011
.001
.002
.0
.008
.004
.011
.006
.021
.027
.23
.034
.003
.001
.031
.046
.147
.013
.6
.0
.001
.026
.214
.325
.331
.182
.093
--
.0
.0
.001
.198
.0
.244
.002
.017
.004
.026
.0
.0
.259
.244
.696
.009
.001
.016
.002
.003
.028
.032
.003
.005
.054
.037
.018
.0
.028
--
.002
.288
.005
.012
.22
.034
.0
.039
.0
.085
.975
.005
.0
.001
.154
.053
.011
.057
.122
.002
.0
.004
.001
.979
.046
.0
.0
.0
.09
.001
.001
.0
.042
.001
.0
.004
.024
.033
.0
.095
.012
.0
.0
.002
.001
.001
.0
.0
.0
.006
.258
.998
1.0
.544
.012
.029
.0
.001
.042
.001
.271
.006
.001
.002
.004
.001
.0
.0
.003
.0
.032
.003
.001
.008
.0
.0
.0
.01
.01
.001
.001
.001
.001
.003
.034
.013
.0
.003
.004
.046
--
--
.001
.304
.39
.0
.0
.0
.001
.237
.0
.001
.0
.0
.013
.0
.007
.132
.186
.002
.899
.499
.005
.0
.054
.035
.001
.0
.001
.052
.047
.097
.006
.007
.034
.001
.037
.0
.003
.001
.015
.017
.155
.077
.006
.992
.755
.008
.0
.0
.0
.0
.039
.016
.002
.026
.013
.001
.001
.021
.003
.0
.001
.059
.103
.001
.002
.004
.008
.001
.071
.0
.002
.001
.023
.0
.007
.0
.006
.0
.005
.002
.0
.0
.004
.006
.005
.004
.003
.002
.001
.272
.407
.5
.003
.009
.018
.015
.001
.003
.003
.005
.003
.007
.088
.028
.004
.001
.076
.0
.0
.002
.003
.0
.001
.831
.127
.03
.043
.0
.0
.001
.0
.041
.001
.0
.056
.0
.0
.0
.0
.002
.011
.046
.001
.002
--
--
.063
.001
.006
.0
.002
.0
.001
.001
.128
.0
.0
.014
--
--
--
--
--
--
--
.0
.021
.022
.017
.031
.0
.0
.003
.052
.002
.003
.002
.247
.004
.0
.007
.0
.001
.992
.003
.104
.0
.0
.003
.0
.02
.0
.0
.0
.0
.003
.999
.984
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
Gabrb3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
G
T
2
G
-
A
-
-
C
A
C
T
2
C
C
C
C
T
A
C
C
-
-
G
C
2
T
-
-
C
2
6
C
A
A
T
C
A
-
-
C
-
A
C
T
C
C
-
-
T
C
-
-
C
T
G
G
C
-
-
C
C
-
-
G
C
T
T
T
-
G
-
T
-
G
-
T
-
-
-
T
A
C
T
-
G
T
-
T
C
C
-
T
-
G
C
A
C
T
C
A
G
T
G
T
G
-
A
4
C
A
A
-
T
A
2
T
-
-
G
G
C
T
C
C
-
G
G
C
C
C
G
-
T
G
C
T
A
C
T
A
T
4
T
A
C
G
4
3
A
T
G
T
T
C
A
C
-
-
G
A
-
C
C
T
A
C
T
G
C
C
T
G
A
T
A
C
T
-
G
-
A
G
T
T
G
-
G
G
A
T
C
C
T
C
G
T
C
G
C
C
A
C
A
A
A
C
C
A
T
A
T
G
G
G
A
C
C
A
A
T
-
T
C
A
T
G
C
G
T
G
18
A
C
-
C
T
A
G
G
G
G
T
C
C
C
G
C
-
-
T
G
C
C
A
-
4
G
T
T
-
-
-
-
T
-
G
G
-
T
T
T
T
A
A
G
T
T
A
A
T
T
C
-
-
-
-
-
-
-
T
-
T
C
A
A
C
C
G
T
T
C
T
C
T
G
A
T
A
T
G
G
G
G
G
C
A
G
C
A
G
C
C
C
C
A
2
T
T
A
G
-
T
T
T
G
A
G
A
T
C
C
-
C
G
T
G
A
C
T
C
A
A
C
A
T
A
G
A
A
T
G
G
T
T
A
-
G
A
T
G
A
A
G
C
A
T
3
A
T
A
T
C
G
A
C
C
G
A
A
A
G
G
G
G
A
G
-
C
A
A
T
G
G
C
T
T
T
T
C
C
T
C
G
A
T
C
G
A
G
T
T
-
-
C
G
C
G
G
T
G
A
T
T
10
A
T
A
T
C
T
-
T
G
G
G
A
G
T
A
T
A
T
C
C
G
T
A
C
G
T
C
C
C
G
A
-
C
3
A
-
G
C
A
C
A
T
G
G
G
C
G
A
T
A
C
A
G
101
T
A
A
G
A
A
T
T
A
A
C
T
C
C
A
G
T
G
G
G
-
A
G
C
A
A
T
C
T
C
T
-
T
C
C
A
A
T
T
T
G
T
T
G
T
A
115
C
A
T
C
C
2
C
A
A
A
-
-
C
C
A
A
13
T
C
T
A
G
A
A
T
A
8
T
A
C
A
T
T
G
A
T
C
T
-
T
  113,034,659
  113,034,726
  113,034,851
  113,034,977
  113,035,006
  113,037,084
  113,037,091
  113,037,103
  113,037,104
  113,037,109
  113,038,687
  113,041,030
  113,041,196
  113,041,201
  113,041,204
  113,041,213
  113,041,223
  113,041,231
  113,041,234
  113,041,240
  113,041,264
  113,041,269
  113,041,273
  113,041,315
  113,041,360
  113,041,365
  113,041,381
  113,041,405
  113,041,424
  113,041,444
  113,041,459
  113,041,474
  113,041,514
  113,041,538
  113,041,540
  113,041,551
  113,041,554
  113,041,621
  113,041,669
  113,041,732
  113,041,788
  113,041,806
  113,041,821
  113,041,835
  113,041,856
  113,041,865
  113,041,943
  113,041,953
  113,042,080
  113,042,099
  113,042,149
  113,042,165
  113,042,173
  113,043,657
  113,043,680
  113,043,691
  113,043,714
  113,043,720
  113,043,721
  113,043,735
  113,043,783
  113,043,787
  113,043,819
  113,043,860
  113,043,898
  113,043,968
  113,044,011
  113,044,015
  113,044,025
  113,044,045
  113,044,080
  113,044,115
  113,044,130
  113,044,154
  113,044,162
  113,044,184
  113,044,216
  113,044,321
  113,044,379
  113,044,387
  113,044,450
  113,044,455
  113,044,461
  113,044,479
  113,044,483
  113,044,508
  113,044,516
  113,044,517
  113,044,559
  113,044,605
  113,044,608
  113,046,431
  113,047,501
  113,048,492
  113,050,248
  113,051,089
  113,051,444
  113,052,099
  113,052,342
  113,052,509
  113,052,756
  113,053,014
  113,053,181
  113,053,212
  113,053,425
  113,053,450
  113,053,608
  113,053,621
  113,053,769
  113,053,909
  113,054,487
  113,054,566
  113,054,655
  113,055,253
  113,055,295
  113,055,826
  113,056,654
  113,056,957
  113,057,165
  113,057,212
  113,057,339
  113,057,654
  113,060,768
  113,061,145
  113,061,761
  113,062,431
  113,062,466
  113,062,650
  113,065,501
  113,065,531
  113,065,694
  113,065,758
  113,065,762
  113,065,803
  113,066,204
  113,066,591
  113,068,222
  113,068,304
  113,068,333
  113,068,572
  113,069,473
  113,069,804
  113,070,669
  113,070,862
  113,071,081
  113,071,109
  113,071,207
  113,071,265
  113,071,350
  113,071,626
  113,071,792
  113,071,799
  113,072,038
  113,072,069
  113,072,166
  113,072,456
  113,072,606
  113,072,695
  113,072,742
  113,072,743
  113,072,745
  113,072,747
  113,072,752
  113,072,816
  113,072,914
  113,072,957
  113,073,029
  113,073,209
  113,073,378
  113,073,428
  113,073,652
  113,073,882
  113,073,924
  113,074,401
  113,074,418
  113,074,441
  113,074,659
  113,074,689
  113,074,795
  113,075,267
  113,075,270
  113,075,435
  113,076,340
  113,076,760
  113,076,823
  113,077,034
  113,077,215
  113,077,554
  113,077,710
  113,077,947
  113,078,027
  113,078,260
  113,078,340
  113,078,427
  113,078,560
  113,078,582
  113,078,946
  113,079,211
  113,079,226
  113,079,255
  113,079,581
  113,079,900
  113,080,079
  113,080,148
  113,080,393
  113,080,811
  113,080,931
  113,081,079
  113,081,397
  113,081,407
  113,081,670
  113,082,011
  113,082,110
  113,082,528
  113,082,634
  113,082,843
  113,082,960
  113,083,023
  113,083,258
  113,083,414
  113,083,580
  113,084,947
  113,085,248
  113,085,494
  113,085,793
  113,086,111
  113,087,970
  113,088,474
  113,089,563
  113,089,915
  113,089,921
  113,089,944
  113,089,956
  113,090,538
  113,090,582
  113,094,153
  113,095,318
  113,097,702
  113,097,833
  113,097,850
  113,097,872
  113,097,875
  113,097,971
  113,098,592
  113,099,842
  113,099,857
  113,099,858
  113,099,989
  113,100,121
  113,100,144
  113,100,547
  113,100,575
  113,100,580
  113,100,586
  113,100,587
  113,100,590
  113,100,950
  113,101,564
  113,101,760
  113,102,188
  113,103,365
  113,103,825
  113,104,685
  113,104,688
  113,104,698
  113,105,449
  113,107,634
  113,107,797
  113,108,220
  113,110,678
  113,112,160
  113,113,104
  113,115,152
  113,116,518
  113,118,532
  113,119,599
  113,120,764
  113,121,840
  113,121,879
  113,122,792
  113,122,794
  113,122,872
  113,124,780
  113,126,048
  113,129,204
  113,129,208
  113,129,213
  113,129,218
  113,129,221
  113,129,229
  113,129,237
  113,129,262
  113,129,269
  113,131,461
  113,132,212
  113,135,154
  113,136,607
  113,136,916
  113,137,737
  113,138,098
  113,139,195
  113,139,505
  113,139,639
  113,141,254
  113,143,518
  113,144,406
  113,145,166
  113,145,203
  113,145,449
  113,145,900
  113,145,979
  113,146,004
  113,146,035
  113,146,395
  113,146,551
  113,146,687
  113,146,824
  113,148,355
  113,148,718
  113,149,511
  113,149,832
  113,150,297
  113,151,843
  113,151,999
  113,153,279
  113,153,793
  113,154,030
  113,154,111
  113,154,286
  113,154,329
  113,155,146
  113,155,510
  113,156,134
  113,157,382
  113,158,061
  113,158,065
  113,158,988
  113,160,205
  113,160,325
  113,160,349
  113,160,457
  113,160,575
  113,160,614
  113,160,952
  113,161,147
  113,161,153
  113,161,563
  113,162,033
  113,162,781
  113,162,842
  113,162,962
  113,163,204
  113,163,438
  113,163,837
  113,165,949
  113,167,335
  113,168,178
  113,168,826
  113,169,621
  113,170,178
  113,170,318
  113,170,451
  113,171,597
  113,171,613
  113,171,641
  113,172,055
  113,172,708
  113,175,156
  113,175,226
  113,175,460
  113,175,539
  113,176,227
  113,176,339
  113,176,365
  113,176,729
  113,176,770
  113,176,877
  113,176,925
  113,176,980
  113,177,050
  113,177,137
  113,177,924
  113,178,210
  113,178,400
  113,178,841
  113,179,736
  113,179,852
  113,180,108
  113,180,138
  113,180,324
  113,180,634
  113,180,636
  113,180,668
  113,180,672
  113,180,676
  113,181,154
  113,181,749
  113,181,935
  113,181,959
  113,182,040
  113,182,284
  113,182,672
  113,182,899
  113,182,904
  113,183,167
  113,183,346
  113,183,568
  113,184,043
  113,184,412
  113,184,654
  113,184,658
  113,184,848
  113,185,745
  113,185,855
  113,186,287
  113,186,981
  113,187,526
  113,187,758
  113,188,319
  113,188,722
  113,189,311
  113,189,332
  113,190,083
  113,190,540
  113,190,609
  113,190,624
  113,190,629
  113,190,646
  113,191,094
  113,191,755
  113,192,304
  113,192,680
  113,193,500
  113,193,546
  113,193,636
  113,193,813
  113,193,867
  113,194,007
  113,194,312
  113,195,007
  113,195,408
  113,195,420
  113,195,451
  113,196,206
  113,196,908
  113,198,930
  113,199,092
  113,199,289
  113,199,321
  113,199,808
  113,200,196
  113,200,553
  113,200,677
  113,201,460
  113,203,217
  113,203,222
  113,203,284
  113,203,679
  113,203,962
  113,204,009
  113,204,581
  113,204,637
  113,204,819
  113,204,932
  113,205,086
  113,205,129
  113,205,190
  113,205,602
  113,206,463
  113,207,669
  113,208,297
  113,209,155
  113,209,372
  113,210,765
  113,210,773
  113,211,199
  113,211,750
  113,212,903
  113,213,065
  113,213,067
  113,213,069
  113,213,444
  113,214,741
  113,214,862
  113,215,075
  113,215,291
  113,215,859
  113,216,018
  113,216,756
  113,216,833
  113,217,814
  113,218,410
  113,219,350
  113,219,591
  113,219,811
  113,220,357
  113,220,654
  113,221,142
  113,221,880
  113,221,900
  113,222,723
  113,223,202
  113,223,729
  113,223,826
  113,224,161
  113,225,073
  113,225,877
  113,226,895
  113,228,706
  113,229,511
  113,230,109
  113,230,687
  113,230,865
  113,230,954
  113,231,263
  113,231,356
  113,232,437
  113,232,758
  113,233,203
  113,233,641
  113,233,842
  113,234,353
  113,234,375
  113,235,634
  113,235,709
  113,236,772
  113,237,814
  113,238,034
  113,239,412
  113,240,097
  113,240,552
  113,240,729
  113,241,040
  113,241,722
  113,243,546
  113,243,811
  113,244,093
  113,244,243
  113,244,674
  113,245,575
  113,245,672
  113,246,192
  113,246,268
  113,247,323
  113,249,097
  113,249,263
  113,249,264
  113,250,999
  113,251,001
  113,251,358
  113,251,450
  113,252,676
  113,252,880
  113,253,165
  113,253,201
  113,253,219
  113,253,625
  113,254,412
  113,254,805
  113,255,561
  113,255,640
  113,255,689
  113,256,338
  113,257,086
  113,257,630
  113,257,967
  113,259,622
  113,260,371
  113,260,381
  113,260,423
  113,260,936
  113,262,472
  113,263,846
  113,264,155
  113,264,177
  113,264,876
  113,265,273
G
C
A
-
T
C
-
3
3
G
G
T
A
-
T
-
-
-
-
-
-
-
T
A
-
-
-
-
C
G
-
-
-
G
C
-
-
-
-
G
G
-
C
-
-
-
-
-
2
C
-
-
G
G
T
-
-
A
G
A
A
-
-
G
G
-
-
-
-
-
T
-
T
-
2
-
A
-
T
A
A
-
-
-
G
G
T
G
G
-
A
T
T
C
42
-
T
C
T
A
T
T
A
T/C
C
C
A
4
G
-
A
C
T
A
C
T
-
G
17
C
T
A
T
C
A
A
T
A
A
T
A
T
T
T
C
C
G
C
G
T
A
G
C
-
C
C
G
A
-
-
G
C
A
C
C
T
C
T
2
T
C
-
A
T
T
C
C
T
-
A
A
-
A
T
G
C
G
T
G
3
A
2
G
A
A
C
A
T
A
C
G
C
A
T
C
T
A
C
T
T
T
G
G
T
C
G
C
T
T
G
G
C
C
A
A
A
C
T
G
G
C
C
T
C
G
T
G
A
T
-
-
-
18/-
-
A
2
-
C
-
-
T
T
A
-
T
T
T
C
T
T
G/A
A
A
G
T
G
G
-
A
C
C
T
A
T
G
C
G
T
T
2
-
C
G
G
T
G
A
C
C
G
G
C
-
T
G
T
G
A
T
3
G
G
6
A
T
G
G
A
A
A
C
-
T
A
T
C
T
G
C
C
C
A
A
A
A
-
T
-
A
T
G
A
A
T
A
T
C
-
G
C
C
A
10
C
-
C
A
G
A
G
C
G
T
C
-
A
G
A
C
T
A
C/-
G
C
T
G
C
G
A
G
G
A
C
A
G
C
G
C
A
G
A
C
C
G
A
T
C
C
-
G
C
T
C
A
C
G
T
A
A
C
G
G
A
A
A
A
G
A
-/2
-
G
G
C
A
A
T
G
C
-
C
T
T
A
T
A
-
C
T
T
G
A
A
C
2
2
T
T
T
T
T
C
A
T
C
C
-
C
C
-
C
G
C
9
C
-
A
T
G
A
A
G
G
C
C
-
T
A
G
C
T
A
A
T
T
A
C
C
4
T
-
G
8
A
T
-
T
C
C
C
C
C
G
A
-
C
G
G
-
A
-
A
G
G
A
-
G
C
G
G
-
T
C
G
T
C
A
G
A
A
A
A
G
A
T
T
G
A
T
C
T
C
T
C
T
T
-
-
C
A
A
C
C
A
A
C
C
-
T
C
G
A
T
-
T
G
-
T
T
15
T
A
G
-
-
A
T
A
C
T
C
G
G
G
8/-
A
C
T
G
C
C
T
G
C
T
G
T
A