Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 113,542 (bp)   Positions: 548
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.001
.982
1.0
.998
.0
.003
.0
.001
.0
.003
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.414
.563
.004
.0
.0
.04
.015
.002
.011
.002
.085
.556
.027
.001
.005
.065
.068
.016
.002
.031
.05
.002
.008
.008
.001
.231
.0
.419
.002
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.002
.0
.088
.015
.053
.004
.001
.022
.016
.001
.003
.163
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.009
.015
.004
.001
.001
.001
.052
.006
.019
.841
.001
.181
.004
--
.036
.005
.001
.066
.001
.073
.001
.003
.01
.003
.001
.001
.034
.021
.019
.0
.003
.835
.556
.187
.183
.001
.0
.652
.014
.0
.0
.0
.0
.001
.066
.001
.0
.002
.0
.0
.0
.006
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.003
.0
.002
.001
.0
.004
.0
.001
.008
.0
.006
.01
.001
.002
.11
.038
.218
.038
.013
.365
--
--
.01
.01
.536
.093
.008
.025
.013
.059
.03
.036
.016
.011
.019
.312
.037
.016
.008
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.128
.002
.001
.008
.023
--
--
--
--
--
--
.001
.0
.001
.001
.001
.011
.003
.057
.006
.0
.003
.001
.0
.002
.084
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.041
.002
.013
.006
.008
.0
.001
.003
.001
.56
.0
.0
.005
.003
.08
.01
.001
.029
.014
.001
--
--
.005
.008
.003
1.0
1.0
.998
1.0
1.0
.998
1.0
1.0
1.0
.089
.214
.01
.025
.013
--
--
--
--
--
--
--
.002
.023
.006
.0
.001
.001
.001
.01
.0
.001
.005
.003
.0
.017
.072
.004
.001
.012
.014
.005
.041
.001
.051
.097
.004
.009
.012
.008
.005
.0
.052
.0
.007
.049
.179
.002
.002
.015
.0
.001
.15
.019
.055
.064
.002
.001
.002
.0
.006
.002
.006
.012
--
--
--
--
.004
.075
.022
.003
.012
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.002
.421
.324
.235
.608
.086
.017
.032
.034
.008
.064
.084
.049
.045
.043
.005
.008
.162
.022
.096
.073
.321
.423
.58
.454
.299
.0
.004
.058
.001
.0
.002
.04
.004
.002
.0
.003
.002
.0
.018
.001
.064
.023
.002
.0
.003
.0
.0
1.0
.0
.006
.0
.948
.0
.0
.0
.005
.0
.0
.008
.0
.0
.007
.002
.081
--
--
--
.0
.009
.0
.001
.14
.013
.089
.002
.007
.002
.0
.025
.009
.013
.001
.0
.003
.417
.0
.002
.004
.005
.071
.005
.0
.001
.002
.323
.004
.017
.008
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
G
A
C
A
C
A
C
C
G
C
A
-
T
A
A
G
C
T
G
C
A
A
A
7
T
G
C
G
A
G
A
G
C
T
G
G
A
-
A
A
A
C
C
T
A
-
A
C
C
G
A
G
C
C
A
G
G
-
A
C
C
C
T
A
-
T
G
-
G
C
C
A
A
G
G
C
A
A
C
G
T
C
T
G
C
C
C
A
T
A
C
C
C
C
G
C
T
G
A
C
A
C
-
T
C
-
A
A
T
A
T
T
G
G
A
2
G
A
G
T
4
A
T
T
A
T
C
T
G
C
-
-
7
A
T
T
G
C
G
A
C
C
A
G
C
A
T
C
G
G
C
A
C
T
C
T
G
G
T
C
C
G
G
T
A
G
G
A
A
T
A
G
T
A
T
A
G
T
A
C
A
T
C
T
T
A
A
A
T
A
A
T
T
C
C
C
T
A
G
G
A
C
A
C
A
T
A
T
C
T
G
C
C
A
T
A
G
C
C
G
G
A
G
A
C
A
A
G
T
25
A
A
C
C
C
G
-
T
G
T
A
A
C
A
T
G
T
A
-
G
A
T
T
G
T
G
T
C
G
G
G
T
A
G
G
G
-
-
C
G
G
T
C
-
3
C
-
G
G
C
G
-
T
T
-
C
-
C
G
C
C
G
C
-
A
T
A
G
A
C
G
T
T
T
G
A
C
C
A
A
G
C
-
T
C
G
G
T
A
G
T
T
C
T
G
A
C
A
G
G
C
T
C
T
T
G
-
C
C
C
A
A
G
G
G
A
A
T
T
A
G
G
G
-
G
A
T
C
A
-
T
A
A
T
G
-
C
T
-
A
A
A
G
T
A
9
T
G
A
C
T
C
-
T
T
T
C
C
T
A
C
G
C
5
G
C
C
T
T
T
-
G
G
A
C
-
G
G
2
C
T
T
9
G
-
C
T
A
C
G
T
A
C
G
A
G
C
G
A
-
A
G
G
T
A
G
A
T
A
T
G
C
G
T
G
G
C
3
G
T
A
T
A
A
A
C
T
C
T
G
G
A
C
T
G
A
A
C
G
-
C
G
T
G
G
A
T
T
G
A
G
T
T
C
C
T
C
C
T
C
G
-
A
A
G
T
G
T
C
G
C
G
C
C
T
G
T
A
C
A
C
G
4
11
T
T
A
G
A
A
C
T
C
A
C
C
G
C
T
C
A
G
8
A
A
A
A
G
6
G
T
C
A
A
C
A
C
A
  112,834,173
  112,834,736
  112,834,950
  112,835,013
  112,835,307
  112,835,319
  112,835,338
  112,835,401
  112,835,493
  112,835,549
  112,835,579
  112,836,186
  112,836,653
  112,836,678
  112,837,203
  112,837,653
  112,838,158
  112,838,374
  112,838,409
  112,838,430
  112,838,488
  112,838,609
  112,838,644
  112,838,708
  112,838,886
  112,839,218
  112,839,308
  112,839,461
  112,839,466
  112,839,721
  112,839,834
  112,840,264
  112,840,276
  112,840,520
  112,840,563
  112,840,600
  112,841,011
  112,841,234
  112,841,496
  112,841,616
  112,841,695
  112,841,701
  112,841,726
  112,842,013
  112,842,190
  112,842,271
  112,842,280
  112,842,415
  112,842,521
  112,842,618
  112,843,602
  112,843,690
  112,843,693
  112,843,867
  112,843,988
  112,844,062
  112,844,126
  112,844,174
  112,844,239
  112,844,333
  112,844,344
  112,844,349
  112,844,375
  112,844,621
  112,844,664
  112,844,851
  112,844,886
  112,845,235
  112,845,342
  112,845,364
  112,845,863
  112,845,938
  112,846,273
  112,846,590
  112,846,705
  112,846,726
  112,846,744
  112,846,912
  112,846,965
  112,847,143
  112,847,240
  112,847,394
  112,847,437
  112,848,192
  112,849,570
  112,851,100
  112,851,456
  112,851,546
  112,851,580
  112,853,126
  112,853,188
  112,853,192
  112,853,215
  112,854,353
  112,855,759
  112,856,103
  112,856,218
  112,856,333
  112,856,416
  112,856,507
  112,856,523
  112,856,672
  112,856,900
  112,856,933
  112,857,035
  112,857,182
  112,857,300
  112,857,589
  112,857,707
  112,857,710
  112,857,729
  112,857,808
  112,857,880
  112,857,923
  112,858,241
  112,858,350
  112,858,464
  112,858,547
  112,858,606
  112,858,685
  112,858,808
  112,858,912
  112,858,938
  112,859,223
  112,859,276
  112,859,337
  112,859,553
  112,859,625
  112,859,633
  112,859,978
  112,860,026
  112,860,350
  112,860,351
  112,860,358
  112,860,490
  112,860,544
  112,860,614
  112,860,681
  112,860,909
  112,860,914
  112,860,925
  112,861,059
  112,861,133
  112,861,265
  112,861,381
  112,861,555
  112,861,614
  112,861,695
  112,861,810
  112,861,928
  112,862,083
  112,862,261
  112,862,321
  112,862,339
  112,862,423
  112,862,548
  112,862,801
  112,862,833
  112,862,841
  112,863,165
  112,863,190
  112,863,212
  112,863,441
  112,863,512
  112,863,529
  112,863,572
  112,863,656
  112,863,690
  112,863,752
  112,864,092
  112,864,208
  112,864,282
  112,864,335
  112,864,502
  112,864,665
  112,864,685
  112,864,704
  112,865,252
  112,865,255
  112,865,325
  112,865,461
  112,865,472
  112,865,493
  112,865,641
  112,865,934
  112,866,020
  112,866,139
  112,866,473
  112,866,533
  112,866,734
  112,866,742
  112,866,868
  112,867,028
  112,867,099
  112,867,109
  112,867,135
  112,867,157
  112,867,189
  112,867,327
  112,867,392
  112,867,420
  112,867,485
  112,867,605
  112,867,645
  112,867,668
  112,867,707
  112,867,748
  112,868,055
  112,868,071
  112,868,118
  112,868,227
  112,868,325
  112,868,466
  112,868,893
  112,869,135
  112,869,641
  112,870,057
  112,870,286
  112,870,941
  112,871,220
  112,871,264
  112,871,529
  112,871,577
  112,871,589
  112,872,057
  112,872,102
  112,872,147
  112,872,532
  112,872,667
  112,873,477
  112,873,524
  112,873,691
  112,873,831
  112,873,917
  112,873,934
  112,874,093
  112,874,628
  112,874,784
  112,874,790
  112,875,639
  112,875,674
  112,876,201
  112,876,856
  112,878,119
  112,878,510
  112,878,521
  112,878,926
  112,879,028
  112,880,774
  112,880,827
  112,880,867
  112,880,885
  112,880,966
  112,880,982
  112,881,093
  112,881,147
  112,881,225
  112,881,250
  112,881,255
  112,881,287
  112,882,599
  112,884,231
  112,884,555
  112,884,673
  112,885,098
  112,885,245
  112,885,389
  112,885,542
  112,885,583
  112,885,635
  112,885,663
  112,885,732
  112,885,775
  112,885,929
  112,886,010
  112,886,022
  112,886,096
  112,886,097
  112,886,673
  112,886,710
  112,886,723
  112,886,733
  112,886,767
  112,886,822
  112,886,837
  112,886,888
  112,886,900
  112,886,988
  112,887,072
  112,887,106
  112,887,112
  112,887,116
  112,887,255
  112,887,309
  112,887,324
  112,887,342
  112,887,344
  112,887,357
  112,887,401
  112,887,573
  112,887,652
  112,887,666
  112,888,000
  112,888,209
  112,888,870
  112,889,041
  112,889,489
  112,889,756
  112,889,768
  112,890,651
  112,891,263
  112,891,847
  112,891,939
  112,892,619
  112,892,809
  112,893,111
  112,893,523
  112,894,329
  112,895,367
  112,895,748
  112,895,828
  112,896,703
  112,896,936
  112,897,215
  112,897,607
  112,897,888
  112,897,974
  112,898,139
  112,898,165
  112,898,169
  112,898,220
  112,898,308
  112,898,348
  112,898,686
  112,898,996
  112,899,064
  112,899,727
  112,899,947
  112,900,273
  112,900,697
  112,901,094
  112,901,340
  112,901,404
  112,901,482
  112,901,506
  112,901,805
  112,901,965
  112,902,074
  112,902,275
  112,902,369
  112,902,797
  112,902,824
  112,902,932
  112,903,183
  112,903,194
  112,903,195
  112,903,227
  112,903,878
  112,904,584
  112,904,636
  112,904,784
  112,904,887
  112,904,963
  112,905,150
  112,905,188
  112,905,196
  112,905,262
  112,905,907
  112,906,123
  112,906,300
  112,906,533
  112,906,617
  112,906,839
  112,906,976
  112,907,792
  112,907,951
  112,908,067
  112,908,817
  112,909,053
  112,909,156
  112,909,195
  112,909,210
  112,909,331
  112,909,369
  112,909,388
  112,909,428
  112,909,454
  112,909,470
  112,909,536
  112,909,591
  112,909,714
  112,909,801
  112,910,242
  112,910,467
  112,910,557
  112,910,793
  112,910,799
  112,911,357
  112,911,376
  112,911,499
  112,911,502
  112,911,824
  112,911,902
  112,911,955
  112,912,113
  112,912,205
  112,912,398
  112,912,545
  112,912,618
  112,912,657
  112,912,667
  112,912,769
  112,912,826
  112,912,840
  112,912,921
  112,912,984
  112,913,014
  112,913,229
  112,913,240
  112,913,359
  112,913,540
  112,913,920
  112,914,136
  112,914,272
  112,914,345
  112,914,607
  112,914,683
  112,914,745
  112,914,982
  112,915,033
  112,915,497
  112,915,941
  112,915,942
  112,915,943
  112,915,951
  112,916,090
  112,916,094
  112,916,097
  112,916,104
  112,916,109
  112,916,152
  112,916,290
  112,916,342
  112,916,346
  112,916,351
  112,916,352
  112,916,363
  112,916,426
  112,916,437
  112,916,886
  112,917,015
  112,917,087
  112,917,128
  112,917,298
  112,917,316
  112,917,323
  112,917,577
  112,917,658
  112,917,864
  112,917,865
  112,918,327
  112,918,688
  112,918,690
  112,919,215
  112,919,489
  112,919,562
  112,919,692
  112,919,729
  112,919,787
  112,919,900
  112,919,985
  112,920,031
  112,920,041
  112,920,075
  112,920,205
  112,920,800
  112,921,285
  112,921,505
  112,921,663
  112,921,808
  112,921,873
  112,923,624
  112,924,215
  112,924,746
  112,925,536
  112,925,562
  112,925,566
  112,925,852
  112,925,895
  112,926,000
  112,926,012
  112,926,090
  112,926,191
  112,926,262
  112,926,698
  112,926,711
  112,927,300
  112,927,346
  112,927,384
  112,927,596
  112,927,600
  112,927,631
  112,927,935
  112,928,176
  112,928,742
  112,928,745
  112,929,532
  112,929,694
  112,930,024
  112,930,261
  112,930,585
  112,931,014
  112,931,697
  112,931,826
  112,931,848
  112,931,868
  112,932,747
  112,932,803
  112,933,066
  112,933,333
  112,933,785
  112,933,815
  112,934,362
  112,934,516
  112,934,561
  112,934,789
  112,935,559
  112,936,005
  112,937,280
  112,937,490
  112,939,336
  112,940,129
  112,940,186
  112,940,261
  112,940,336
  112,940,714
  112,941,157
  112,941,699
  112,941,797
  112,942,250
  112,942,458
  112,942,823
  112,942,945
  112,944,706
  112,946,278
  112,946,284
  112,946,474
  112,947,157
A
G
T
G
A
G
T
T
A
A
G
A
A
G
T
A
G
G
A
T
G
G
C
-
C
A
T
C
T
A
C
-
T
G
A
A
C
4
G
C
G
T
T
C
G
T
G
T
T
A
G
A
G
-
G
A
A
A
G
T
A
G
C
G
T
A
T
4
C
T
A
G
G
A
A
T
G
G
A
A
A
T
C
A
T
A
C/T
A/G
T/G
A/G
C/G
C/G
C/T
T
G/A
C/A
C
C
G
G
C
T
2
G
G
8
G
G
C
G
C
C
T
A
T
-
C
G
A
-
4/-
G
C
G
G
C
T
C
A
G
6
3
-
C
C
C
A
T
A
G
G
G
T
T
A
T
C
T
A
A
T
G
A
C
T
C
C
C
C
G
G
C
A
A
C
C
C
G
G
C
G
C
A
G
C
G
A
C
G
T
G
C
G
A
C
T
G
G
-
G
C
C
C
A
T
T
G
G
A
A
G
A
T
T
-
A
G
C
A
C
T
T
T
T
A
T
A
T
T
A
A
C
A
T
-
G
G
A
G
-
G
G
T
G
A
A
A
C
T
C
C
G
T
G
A
A
C
G
C
-
G
G
G
-
-
-
-
-
-
-
A
C
T
A
C
A
T
T
-
-
-
-
-
C
-
-
T
T
-
-
A
C
-
A
C
-
T
G
-
-
G
T
-
T
-
-
-
-
-
A
A
C
G
G
C
C
T
T
G
G
C
T
G
G
G
A
A
C
G
A
C
C
A
G
A
-
T
G
A
A
T
C
T
C
C
A
8
T
G
T
C
C
A
A
A
G
G
G
C
T
T
A
C
3
A
G
G
T
G
A
-
G
G
G
T
8
A
-
G
G
G
C
A
C
T
-
A
A
-
T
C
T
A
C
C
C
T
G
G
T
G
A
T
-
T
T
T
C
C
A
G/G
A
A
G
T
2
A
A
-
T
G
C
-
A
G/G
A
C
G
T
A
A
G
-
T
G
A
T
A
-
T
T
A
C
C
G
C
G
C
T
C
A
C/T
G/A
T/C
G/T
G/T
T
-
A
G
-
C
C
G
G
T
G
T
C
A
A
C
T
C
C
G
T
A
A
5
A
C
A
A
C
G
C
C
A
G
A
C
C
T
T
C
T
C/T
T/A
C/T
G/A
3
G
C
T
C
A
G
A
C
A
C
T
A
A
A
C
T
T
-
T
A
-
-
C
C
T
T
G
C
A
C
T
G
T
G
A
T
G
T
G
A
-
G
G
G
T
A
-
A
C
T
G
T
A
T
T
G