Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 231,252 (bp)   Positions: 402
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.001
.001
.0
.0
.01
.002
.007
.037
.153
.077
.141
.0
.821
.769
.169
.012
.423
.005
.078
.351
.029
.781
--
--
--
--
.753
.033
.028
.042
.101
.116
.354
.132
.003
.146
.115
.11
.042
.371
.011
.435
.019
.005
.016
.017
.004
.121
.173
--
--
.001
.003
.678
.715
.012
.562
.014
1.0
.459
.107
.003
.048
.011
.001
.003
.001
.01
.007
.546
.0
.091
.196
.146
.001
--
--
--
--
--
.006
.194
.247
.142
.046
.107
.796
.779
.046
.008
.981
.322
--
--
--
.088
.205
.197
.003
.0
.0
.0
.0
.001
.002
.004
.257
.002
.001
.099
.029
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.109
.001
.247
--
--
--
.02
.013
.059
.009
.248
.0
.412
.0
.001
.263
.065
.167
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.015
.002
--
.001
.136
.05
.794
.026
.0
.001
.001
.028
.419
.076
.128
.025
.002
.001
.377
.595
.004
.114
.025
.02
.022
.025
.017
.073
.018
.177
.0
.001
.0
.0
1.0
.014
.01
.012
.011
.393
.998
.03
.562
.284
.051
.0
.124
.055
.038
.047
.053
.067
.087
.006
.0
.811
.072
.059
.057
.047
.001
.003
.281
.285
.148
.103
.084
.019
.015
.015
.016
.019
.007
.028
.019
.016
.055
.042
.035
.01
.013
.09
.144
.051
.002
.002
.0
.019
.0
.0
.065
.916
.001
.002
.001
.029
.003
.0
.0
--
--
--
--
--
.003
.218
.134
.384
.008
.112
.036
.745
.778
.508
.006
.014
.003
.072
.01
.003
.027
.001
.0
.009
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.459
.0
1.0
.064
--
--
--
--
--
.0
.012
.006
.001
.03
.164
--
--
--
--
--
--
.032
.112
.986
.028
.166
.013
.322
.002
.0
.012
.746
.019
.0
.382
.234
.023
.003
.001
.014
.815
.012
.008
.187
.24
.155
.005
.001
.01
.012
.012
.009
.006
.001
.002
.004
.006
.003
.112
.002
.38
.001
.0
.002
.999
.258
.023
.086
.011
.001
.022
.024
.216
.071
.0
.003
--
--
--
--
--
--
--
.012
.0
.019
.01
.0
.0
1.0
.396
.0
.015
.001
.007
.004
.003
.156
.757
.0
.131
.011
--
.087
.074
--
.024
.095
.01
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
5
T
4
T
A
-
T
G
-
T
C
G
T
T
T
C
T
A
A
T
A
T
C
C
12
C
G
T
A
A
3
G
G
A
G
G
G
T
G
32
C
-
T
11
T
G
4
A
G
C
C
T
T
-
-
T
T
A
A
C
T
A
T
C
4
-
G
G
A
T
T
A
C
A
A
A
G
C
A
A
G
-
A
C
T
T
T
T
C
A
T
C
-
A
C
T
A
G
G
G
-
-
G
C
A
T
T
T
G
T
G
G
G
G
T
G
G
G
-
C
T
G
C
G
A
C
G
G
C
G
A
C
T
T
C
G
T
A
C
T
C
-
C
A
G
G
C
T
G
G
T
A
A
A
T
5
G
T
T
G
T
G
A
G
T
G
T
T
A
-
G
A
T
T
C
G
T
T
4
A
A
G
A
C
G
-
A
4
T
T
T
G
C
6
-
T
G
T
G
A
G
T
22
G
G
G
G
A
T
G
G
A
T
-
T
4
-
T
G
A
G
-
5
C
A
-
7
G
C
C
A
C
T
C
G
G
-
G
C
C
G
T
G
-
A
T
T
T
T
A
G
A
A
G
G
C
27
T
C
C
C
T
G
-
G
G
C
C
C
-
C
T
G
G
A
T
G
C
T
G
T
C
T
A
T
A
A
G
T
T
G
T
A
T
A
C
G
A
A
A
T
A
G
C
C
G
T
C
A
C
A
G
A
C
G
T
T
A
G
C
A
T
G
G
A
C
T
C
C
A
T
-
G
C
G
T
G
G
2
G
3
G
G
G
A
G
G
G
2
3
2
A
G
A
C
C
G
C
3
C
A
C
T
G
G
T
G
C
C
A
T
-
G
-
C
G
C
T
G
G
G
G
T
G
-
T
8
T
T
C
A
T
A
G
-
C
T
A
G
A
C
C
  100,308,357
  100,309,728
  100,309,731
  100,310,248
  100,310,297
  100,310,434
  100,311,320
  100,311,796
  100,312,777
  100,314,561
  100,314,960
  100,316,477
  100,316,540
  100,316,945
  100,317,853
  100,318,146
  100,319,105
  100,320,198
  100,320,265
  100,321,420
  100,322,071
  100,322,210
  100,322,362
  100,322,371
  100,322,792
  100,322,905
  100,323,144
  100,323,641
  100,323,647
  100,323,864
  100,325,191
  100,326,338
  100,326,921
  100,327,006
  100,327,229
  100,327,826
  100,327,963
  100,328,558
  100,329,892
  100,330,212
  100,330,823
  100,331,961
  100,332,463
  100,332,642
  100,332,656
  100,332,657
  100,333,696
  100,334,035
  100,334,448
  100,334,575
  100,335,907
  100,336,741
  100,337,802
  100,339,776
  100,339,783
  100,340,423
  100,342,559
  100,342,657
  100,344,030
  100,344,694
  100,344,805
  100,345,549
  100,346,110
  100,346,173
  100,347,763
  100,347,768
  100,348,198
  100,348,829
  100,350,246
  100,350,385
  100,350,806
  100,352,845
  100,353,765
  100,353,866
  100,354,315
  100,355,793
  100,355,863
  100,355,946
  100,355,996
  100,356,101
  100,356,576
  100,356,635
  100,356,872
  100,356,989
  100,356,997
  100,357,022
  100,357,437
  100,357,678
  100,358,735
  100,360,388
  100,362,735
  100,363,249
  100,363,409
  100,363,797
  100,364,063
  100,365,216
  100,365,487
  100,365,488
  100,365,895
  100,366,373
  100,366,581
  100,366,722
  100,366,853
  100,366,898
  100,367,002
  100,367,067
  100,369,887
  100,371,737
  100,372,811
  100,374,445
  100,374,877
  100,375,380
  100,376,206
  100,376,288
  100,377,785
  100,378,027
  100,378,429
  100,378,883
  100,380,077
  100,380,645
  100,382,601
  100,382,858
  100,384,922
  100,385,756
  100,386,597
  100,386,709
  100,387,627
  100,388,303
  100,389,627
  100,391,924
  100,391,962
  100,393,250
  100,399,168
  100,404,619
  100,408,247
  100,408,819
  100,409,461
  100,410,998
  100,412,216
  100,413,120
  100,413,442
  100,413,829
  100,414,201
  100,414,744
  100,414,949
  100,415,142
  100,415,150
  100,415,157
  100,415,189
  100,415,191
  100,415,363
  100,415,383
  100,415,402
  100,415,473
  100,416,982
  100,418,023
  100,421,516
  100,422,497
  100,423,178
  100,423,992
  100,424,938
  100,425,297
  100,426,372
  100,426,545
  100,428,732
  100,428,830
  100,429,328
  100,430,445
  100,430,694
  100,430,833
  100,430,852
  100,431,074
  100,431,456
  100,431,976
  100,432,269
  100,432,320
  100,432,369
  100,432,390
  100,432,411
  100,432,862
  100,432,864
  100,432,865
  100,432,879
  100,432,950
  100,433,361
  100,433,386
  100,433,416
  100,433,457
  100,434,205
  100,435,246
  100,435,811
  100,436,067
  100,437,520
  100,437,824
  100,438,504
  100,438,793
  100,440,516
  100,441,691
  100,442,156
  100,442,222
  100,442,924
  100,443,665
  100,444,331
  100,444,359
  100,444,363
  100,444,369
  100,444,377
  100,444,735
  100,445,583
  100,446,136
  100,446,207
  100,446,376
  100,446,706
  100,446,877
  100,446,878
  100,446,880
  100,446,940
  100,447,252
  100,448,088
  100,448,140
  100,448,145
  100,448,147
  100,448,149
  100,448,155
  100,448,157
  100,448,159
  100,448,160
  100,448,741
  100,448,969
  100,449,388
  100,449,716
  100,449,765
  100,449,978
  100,450,179
  100,450,290
  100,450,389
  100,450,436
  100,450,750
  100,450,757
  100,451,174
  100,451,478
  100,452,135
  100,452,690
  100,452,715
  100,453,539
  100,453,648
  100,453,693
  100,454,776
  100,455,074
  100,455,449
  100,455,604
  100,455,673
  100,456,995
  100,457,019
  100,457,263
  100,457,850
  100,457,852
  100,458,617
  100,458,694
  100,458,747
  100,459,586
  100,460,578
  100,460,802
  100,460,837
  100,461,413
  100,461,937
  100,462,116
  100,462,149
  100,462,151
  100,462,855
  100,463,410
  100,463,574
  100,463,778
  100,464,049
  100,464,222
  100,464,328
  100,465,580
  100,465,588
  100,465,602
  100,465,854
  100,466,103
  100,466,261
  100,466,847
  100,466,928
  100,468,068
  100,468,380
  100,468,470
  100,468,497
  100,468,501
  100,468,502
  100,468,634
  100,468,655
  100,470,364
  100,473,122
  100,473,349
  100,473,728
  100,474,541
  100,475,565
  100,476,776
  100,477,863
  100,477,920
  100,479,667
  100,482,832
  100,483,070
  100,483,164
  100,483,767
  100,484,100
  100,485,342
  100,485,907
  100,486,556
  100,486,573
  100,486,616
  100,486,620
  100,486,628
  100,489,184
  100,490,084
  100,491,857
  100,493,974
  100,495,821
  100,497,322
  100,498,126
  100,503,407
  100,503,409
  100,503,854
  100,504,276
  100,504,296
  100,504,327
  100,504,999
  100,505,158
  100,505,502
  100,506,197
  100,506,749
  100,506,855
  100,506,946
  100,507,366
  100,507,531
  100,508,307
  100,508,564
  100,508,568
  100,508,587
  100,508,592
  100,508,598
  100,508,600
  100,508,602
  100,508,606
  100,508,607
  100,508,612
  100,508,613
  100,508,625
  100,508,631
  100,508,636
  100,509,065
  100,510,387
  100,510,718
  100,511,276
  100,511,285
  100,511,292
  100,511,468
  100,512,130
  100,512,252
  100,512,436
  100,512,481
  100,512,676
  100,512,684
  100,513,301
  100,513,631
  100,513,641
  100,513,962
  100,515,233
  100,516,176
  100,516,352
  100,517,234
  100,517,522
  100,518,000
  100,518,866
  100,519,263
  100,520,800
  100,521,672
  100,521,769
  100,521,960
  100,522,967
  100,523,208
  100,525,164
  100,525,676
  100,526,415
  100,527,988
  100,528,774
  100,528,787
  100,528,790
  100,528,797
  100,528,980
  100,529,337
  100,531,589
  100,531,800
  100,532,816
  100,533,363
  100,533,712
  100,535,076
  100,535,391
  100,535,900
  100,536,023
  100,536,560
-
C
4/-
-
G
C
C
A
T
A
T
A
C
C
A
T
C
G
T
C
G
A
T
T
12/-
A
A
C
G
G
-
A
A
G
A
A
A
G
A
-
T
4
C
-
A
C
-
G
-
G
T
C
C
2
2
C
C
G
-
T
C
C
C
A
-
3
A
C
G
C
C
T
A
T
C
G
A
T
G
G
A
2
G
T
C
C
C
A
T
-
C
T
2
T
T
A
T
T
A
A
T
A
A
T
G
C
G
-
A
A
T
T
A
T
A
G/A
G/A
G/T
T
A
G
A
T
A
G
T
T
-
A
T
-
G
C
-
T
A
C
-
T
A
T
9
A
G
G/C
G/T
C/-
T/C
G/C
G/T
T/C
A/G
A/G
A/G
C
-
A
C
G
C
C
A
G
T
C
T
-
G
G
T
T
C
G
C
A
A
C
G
-
-
-
T
G
A
A
T
G
-
C
C
C
A
T
-
6
G
T
G
-
G
T
C
22/-
G/T
G/C
G/T
G/T
G
A
-
C/C
G
-
2
A
-
4
A
T
T
C
5
-
T
T
2
-
C
T
A
G
T
C
G
A
C
T
C
A
T
A
C
C
A
G
C
C
C
C
G
A
G
T
A
A
-
-
C
T
T
T
C
A
A
A
C
A
C/G
C/G
T
T
G
-
A
G
C
A
T
C
A
-
T
G
T
C
G
T
A
G
C
T
G
G
C
G
T
T
A/C
A/T
A/G
T/C
A/-
C
T
T
A
G
T
C
C/T
A/G
G/C
A/T
C/T
C
-
C
-
A
T
G
G
-
A
G
T
C
T
T
T
C
2
A
G
T
C
T
-
-
-
-
-
-
-
-
T
-
T
-
-
-
C
T
G
T
T
A
T
-
T
G
G
C
A
A
C
T
T
T
G
-
C
T
4
T
A
T
C
T
A
A
A
C
A
2
-
-
-
C
T
G
A
G
T
3
T
-
T
A
-
T
T