Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 231,252 (bp)   Positions: 283
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.001
.0
.01
.002
.967
.975
.957
.141
.004
.077
.24
.0
.029
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.028
.903
.11
.001
.019
.004
.121
--
.0
--
.005
.485
.014
.0
.001
.064
--
--
1.0
.048
.034
.944
.01
.258
.06
.152
.001
.0
.003
.427
.196
.146
.001
--
--
--
--
--
.006
.194
.247
.142
.046
.107
.796
.046
.008
.981
.322
--
--
--
.088
.205
.197
.003
.0
.0
.0
.0
.002
.004
.079
.257
.002
.001
.001
.099
.0
.029
.002
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.011
--
--
--
--
--
.026
.001
.247
--
--
.013
.059
.009
.043
.0
.0
.005
.263
.065
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.136
.0
.0
.002
.028
.419
.076
.129
.025
.001
.001
.001
.0
1.0
.012
.993
.002
.107
.562
.0
.087
.019
.002
.002
.006
.019
.801
.95
.016
.027
.003
--
--
--
.003
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.02
.03
--
--
--
--
.112
.986
.028
.166
.322
.001
.002
.0
.003
.012
.746
.0
.382
.234
.023
.003
.329
.001
.014
.815
.012
.008
.021
.217
.187
.24
.155
.005
.001
.01
.012
.012
.009
.006
.001
.002
.004
.006
.003
.112
.002
.766
.38
.001
.002
.018
.999
.001
.0
.002
.001
.071
.0
.001
.031
.016
.0
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.448
.0
.019
.518
1.0
.0
.0
.015
.007
.004
.003
.025
.0
.131
.884
.011
--
.087
--
.001
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
Fut8
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
A
-
-
-
3
T
T
T
A
A
A
3
C
C
17
T
C
T
C
C
C
C
2
A
G
T
C
T
4
A
C
A
C
C
-
C
T
T
C
T
T
A
T
-
C
G
-
T
A
G
T
-
A
C
A
A
A
G
T
A
A
G
-
A
C
T
T
T
C
A
T
C
-
A
C
T
A
G
G
G
-
G
G
A
T
G
T
T
G
C
T
C
G
C
G
G
G
C
A
A
A
C
T
T
-
T
C
C
T
G
C
T
G
G
A
G
C
G
A
G
C
G
A
G
T
G
G
T
A
T
-
T
G
G
G
A
G
T
T
5
T
T
T
G
C
T
A
-
G
A
T
T
4
T
T
6
2
A
G
G
T
T
G
T
2
A
-
A
4
C
C
T
G
T
T
-
A
G
T
G
3
T
A
C
A
G
G
G
A
T
C
A
A
C
T
T
A
G
A
A
T
G
A
G
A
T
C
C
A
T
T
-
G
C
G
T
G
C
G
G
2
G
3
G
G
G
A
G
G
G
2
3
2
A
G
A
A
C
G
G
C
G
T
T
T
G
G
C
A
G
A
C
A
2
G
A
C
-
A
C
G
G
T
G
-
T
T
-
T
T
T
C
A
A
G
A
-
C
T
G
C
  100,308,634
  100,310,248
  100,310,297
  100,310,434
  100,312,730
  100,312,732
  100,312,736
  100,313,895
  100,314,522
  100,314,561
  100,315,206
  100,316,429
  100,322,071
  100,322,339
  100,322,362
  100,322,397
  100,322,400
  100,322,476
  100,322,485
  100,322,497
  100,322,500
  100,322,509
  100,322,512
  100,322,748
  100,322,751
  100,323,647
  100,323,774
  100,328,558
  100,329,811
  100,332,463
  100,333,696
  100,334,035
  100,334,530
  100,335,255
  100,336,234
  100,339,158
  100,339,762
  100,339,893
  100,341,188
  100,341,384
  100,342,608
  100,342,755
  100,342,756
  100,344,030
  100,346,110
  100,346,179
  100,347,324
  100,348,829
  100,349,309
  100,349,340
  100,349,448
  100,350,229
  100,350,806
  100,350,846
  100,351,586
  100,353,765
  100,353,866
  100,354,315
  100,355,793
  100,355,863
  100,355,879
  100,355,996
  100,356,101
  100,356,576
  100,356,635
  100,356,872
  100,356,989
  100,356,997
  100,357,022
  100,357,437
  100,358,735
  100,360,388
  100,362,735
  100,363,249
  100,363,409
  100,363,797
  100,364,063
  100,365,216
  100,365,487
  100,365,488
  100,365,895
  100,366,373
  100,366,722
  100,366,853
  100,366,964
  100,367,002
  100,367,067
  100,369,105
  100,369,887
  100,371,737
  100,372,811
  100,374,325
  100,374,445
  100,374,807
  100,374,877
  100,375,310
  100,375,380
  100,376,147
  100,376,206
  100,378,670
  100,379,097
  100,379,160
  100,379,663
  100,379,674
  100,379,677
  100,379,703
  100,380,077
  100,380,373
  100,380,645
  100,380,788
  100,382,601
  100,382,604
  100,384,342
  100,384,346
  100,384,374
  100,384,377
  100,384,381
  100,384,574
  100,384,922
  100,385,756
  100,386,447
  100,387,627
  100,389,627
  100,391,924
  100,391,962
  100,392,185
  100,399,168
  100,399,217
  100,405,995
  100,409,461
  100,410,998
  100,413,120
  100,413,829
  100,414,250
  100,414,949
  100,414,956
  100,415,147
  100,415,269
  100,415,271
  100,416,708
  100,416,982
  100,418,023
  100,423,178
  100,424,938
  100,428,732
  100,428,868
  100,428,927
  100,430,445
  100,430,694
  100,430,833
  100,430,855
  100,431,074
  100,431,976
  100,432,560
  100,433,457
  100,434,205
  100,435,811
  100,437,824
  100,437,966
  100,439,854
  100,440,362
  100,442,156
  100,443,665
  100,445,583
  100,448,741
  100,452,135
  100,452,242
  100,452,262
  100,452,715
  100,459,939
  100,462,234
  100,463,719
  100,463,735
  100,464,328
  100,468,634
  100,468,655
  100,470,627
  100,471,665
  100,473,349
  100,475,300
  100,476,261
  100,477,436
  100,477,508
  100,477,544
  100,477,909
  100,479,682
  100,480,023
  100,480,122
  100,481,213
  100,482,832
  100,483,850
  100,484,100
  100,485,847
  100,485,907
  100,486,933
  100,486,934
  100,490,084
  100,491,857
  100,493,974
  100,495,821
  100,498,126
  100,502,725
  100,503,407
  100,503,409
  100,503,831
  100,503,854
  100,504,276
  100,504,327
  100,504,999
  100,505,158
  100,505,502
  100,506,197
  100,506,669
  100,506,749
  100,506,855
  100,506,946
  100,507,366
  100,507,531
  100,507,587
  100,508,193
  100,508,307
  100,508,564
  100,508,568
  100,508,587
  100,508,592
  100,508,598
  100,508,600
  100,508,602
  100,508,606
  100,508,607
  100,508,612
  100,508,613
  100,508,625
  100,508,631
  100,508,636
  100,509,065
  100,510,387
  100,510,524
  100,510,718
  100,511,276
  100,511,292
  100,511,311
  100,511,468
  100,511,797
  100,512,670
  100,512,673
  100,512,676
  100,513,641
  100,514,193
  100,514,370
  100,514,933
  100,514,934
  100,515,096
  100,515,233
  100,516,176
  100,516,358
  100,517,522
  100,517,732
  100,517,765
  100,518,000
  100,518,314
  100,518,866
  100,519,263
  100,520,116
  100,521,672
  100,521,769
  100,524,232
  100,525,164
  100,525,354
  100,526,415
  100,527,988
  100,528,787
  100,528,790
  100,528,797
  100,530,422
  100,531,589
  100,531,800
  100,531,854
  100,532,816
  100,533,363
  100,533,712
  100,535,391
  100,536,143
T
-
G
C
C/C
3
-
G
C
A
-
G
G
-
C/T
C/-
17/-
T/C
C/T
T/C
C/T
C/T
C/T
-
-
G
A
G
T
C
-
G
T
C
-
T
4
T
C
-
G
C
T/C
-
C
4
T
C
T
-
-
A
C
2
T
A
T
C
G
A
C
G
G
A
2
G
T
C
C
C
T
-
C
T
2
T
T
A
T
T
A
A
A
A
A
G
C
T
G
-
A
T
A
T
T
T
T
A
A
C/G
A/T
A/G
A/G
C/T
T/C
T/A
T
T/A
A
T
G
A
T
C
G/C
G/T
A/T
A
T
A
C
T
A
T
-
A
C
A
A
C
-
A
9
C
G/C
G/A
G/C
A/T
G/T
G
C
-
G
C
C
C
T
G
G
T
T
C
C
C
-
C
C
-
-
T
A
-
C
A
C
C
2/-
T
A
G
-
T
T
C
T
G
C
T
G
A
C
G/A
3/-
T/-
A/G
C/G
G
G/A
-
C
G
G
G
C
G
G
-
C
A/-
A
G
G
G
-
G
A
G
C
T
T
T
C
G
2
A
G
T
C
A
T
T
-
-
-
-
-
-
-
-
T
-
T
-
-
-
C
T
G
G
T
A
A
T
A
C
C
C
T
A
T
C
T
G
T
G
-
T
C
T
4
G
T
A
C
C
T
A
C
A
2
-
-
C
T
G
G
T
G
3
T
-
A
G