Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 340,550 (bp)   Positions: 433
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.008
.0
.015
.002
.007
.005
.002
.004
.129
.997
.02
.009
.013
.0
.0
.004
.0
.069
.021
.0
.0
.007
.005
.0
1.0
.001
.0
1.0
.011
.0
.006
.002
.008
.001
.002
.961
.942
1.0
.002
.0
.001
.001
.0
.0
.021
.063
.993
.994
.006
.173
.0
.67
.999
.001
.006
.026
.073
.027
.071
.0
.121
.013
.081
.0
.017
.003
.001
.005
.959
.0
.959
.826
.0
.002
.002
.002
.0
.902
.0
.027
.002
.0
.001
.0
.002
.012
.0
.0
.0
.01
.82
.993
.653
.01
.0
.01
.0
.0
.0
.001
.0
.012
.978
.0
.0
.0
.002
.999
1.0
.02
.0
.001
.001
.002
.015
.0
.0
.001
.0
.0
1.0
1.0
.001
.001
.0
.0
.04
.0
.0
.001
.018
.004
.005
.989
.012
.002
.0
.001
.002
.0
.001
--
.087
.812
.1
.0
.687
.851
.0
.004
.0
.927
.998
.0
1.0
1.0
1.0
.084
.001
.001
.002
.002
.002
.004
.998
.337
.996
.0
.114
.0
1.0
.278
.993
.081
.001
.0
.0
.004
.002
.0
.001
.002
.005
.004
.0
.018
.001
.757
1.0
.998
1.0
.564
.011
.005
.0
.001
.006
.007
.996
1.0
.0
.009
.008
.0
.0
.008
.004
.024
.0
.001
.022
.0
.0
.259
1.0
.997
.002
.0
.0
.0
.0
.004
.031
.071
.007
.006
.002
.161
.019
.018
.012
.014
.406
.0
.0
.002
.001
.001
.016
.951
.005
.049
.981
.77
.0
.0
.001
.095
.093
.0
.06
.001
.013
.01
.193
.093
.002
.037
.016
.0
.464
.13
.0
.0
.001
.01
.0
.001
.002
.052
.008
.006
.328
.009
.0
.061
.001
.0
.806
.012
.014
.993
.783
.01
.032
.11
.002
.003
.004
.0
.003
.002
.017
.175
.009
.047
.021
.002
.001
.0
.0
.012
.002
.0
.0
.002
.0
.0
.004
.705
.003
.066
.017
.0
.006
.005
.021
.0
.004
.005
.003
.071
.0
.001
.003
.039
.04
.099
.016
.028
.003
.932
.011
.023
.042
.001
.018
.001
.0
.047
.005
.007
.002
.919
.011
.19
.0
.134
.871
.002
.194
.004
--
.003
.043
.029
.031
.0
.003
.005
.0
.005
.003
.018
.002
.003
.019
.009
.004
.011
.0
.0
.001
.0
.0
.003
.001
.0
.002
.046
.024
.0
.017
.147
.015
.001
.001
.525
.012
.001
.0
1.0
1.0
.0
.001
.0
.0
.009
.03
.021
.0
.072
.02
.001
.005
.006
.018
.361
.0
.0
1.0
.004
.907
.0
.008
.002
.003
.003
.004
.011
.003
.005
.012
.005
--
.054
--
.0
.005
.002
.888
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
Fto
A
G
G
T
G
T
C
C
C
G
A
T
G
G
T
C
C
G
A
G
C
G
T
T
T
T
T
T
C
C
G
G
G
T
T
T
T
C
G
A
A
C
T
A
C
C
C
C
A
C
G
T
G
C
G
A
A
C
C
T
A
T
C
G
T
A
G
C
C
A
A
G
G
T
T
G
T
C
T
C
T
G
T
T
A
T
C
T
G
G
C
A
A
A
C
G
T
C
C
A
G
G
C
T
T
G
A
T
G
G
A
T
G
A
G
T
C
C
G
C
T
T
A
C
A
G
T
G
C
G
T
A
T
C
G
C
G
A
G
C
A
A
T
C
T
C
G
G
G
C
A
G
T
G
G
C
A
C
C
G
G
A
C
T
T
C
A
C
A
T
A
A
A
C
C
C
C
C
G
A
G
T
A
A
T
G
T
A
C
C
T
T
C
C
G
T
G
A
G
C
G
C
T
T
C
T
T
G
A
C
G
T
A
C
G
C
T
T
T
C
C
G
C
T
T
C
C
G
C
C
A
C
A
G
C
G
T
C
G
C
C
A
G
T
C
T
T
T
T
G
A
A
A
T
G
G
T
T
A
A
G
C
G
G
C
C
G
A
A
T
T
A
G
A
A
G
A
A
G
T
A
A
A
G
T
C
C
T
G
C
C
C
C
C
G
C
G
T
C
C
T
T
G
G
C
T
C
C
T
A
C
T
T
C
T
C
A
T
A
T
A
A
G
G
C
A
C
C
C
C
C
A
C
A
T
T
A
G
A
G
T
A
T
T
A
G
A
A
A
T
C
A
A
G
A
T
C
A
G
T
A
A
A
C
T
G
A
C
A
T
G
C
G
G
A
G
G
G
T
G
T
C
G
T
C
C
A
T
G
C
T
A
G
G
A
C
C
C
A
G
T
C
T
C
A
G
G
T
A
A
G
G
G
T
C
A
C
T
G
G
G
A
G
C
T
A
T
G
A
G
C
T
T
  16,774,862
  16,774,876
  16,774,878
  16,778,596
  16,778,677
  16,779,017
  16,780,069
  16,781,257
  16,781,744
  16,782,912
  16,785,362
  16,785,473
  16,785,474
  16,785,582
  16,786,084
  16,786,192
  16,786,622
  16,788,172
  16,788,933
  16,789,180
  16,789,946
  16,791,570
  16,792,260
  16,792,856
  16,792,997
  16,793,355
  16,794,156
  16,794,551
  16,794,905
  16,797,637
  16,798,136
  16,798,142
  16,799,706
  16,801,004
  16,801,567
  16,802,155
  16,802,428
  16,802,703
  16,803,026
  16,803,969
  16,804,184
  16,804,399
  16,804,818
  16,805,125
  16,805,970
  16,806,031
  16,806,201
  16,806,535
  16,806,633
  16,806,693
  16,808,504
  16,808,830
  16,809,385
  16,810,028
  16,810,122
  16,811,477
  16,811,478
  16,811,712
  16,812,676
  16,813,311
  16,813,344
  16,813,532
  16,814,648
  16,815,001
  16,815,267
  16,820,057
  16,821,707
  16,822,332
  16,822,485
  16,822,665
  16,823,648
  16,823,730
  16,824,247
  16,824,278
  16,824,411
  16,825,267
  16,826,202
  16,826,935
  16,827,686
  16,829,940
  16,830,047
  16,830,220
  16,832,452
  16,833,698
  16,834,214
  16,834,673
  16,837,467
  16,837,941
  16,839,186
  16,839,927
  16,840,759
  16,841,724
  16,841,738
  16,841,769
  16,842,296
  16,843,601
  16,843,603
  16,843,694
  16,845,110
  16,847,533
  16,847,634
  16,848,146
  16,850,030
  16,851,380
  16,853,422
  16,854,607
  16,856,016
  16,856,239
  16,856,787
  16,856,822
  16,857,451
  16,857,627
  16,857,922
  16,860,214
  16,860,215
  16,860,256
  16,862,873
  16,863,963
  16,864,816
  16,865,551
  16,865,959
  16,867,162
  16,867,237
  16,867,419
  16,867,622
  16,867,829
  16,868,001
  16,868,387
  16,869,141
  16,869,344
  16,869,755
  16,870,101
  16,870,334
  16,870,705
  16,870,906
  16,871,400
  16,871,560
  16,871,596
  16,872,972
  16,876,870
  16,876,903
  16,877,068
  16,877,633
  16,877,669
  16,880,364
  16,881,023
  16,881,082
  16,881,610
  16,881,774
  16,881,988
  16,882,846
  16,884,486
  16,884,810
  16,884,852
  16,885,105
  16,885,413
  16,885,890
  16,886,376
  16,886,616
  16,886,856
  16,886,863
  16,888,356
  16,888,528
  16,889,115
  16,889,861
  16,891,514
  16,891,542
  16,892,049
  16,893,466
  16,895,112
  16,895,366
  16,900,871
  16,900,882
  16,901,169
  16,902,357
  16,902,766
  16,902,861
  16,902,876
  16,904,369
  16,904,394
  16,904,652
  16,907,218
  16,917,266
  16,918,160
  16,919,175
  16,919,192
  16,920,199
  16,920,948
  16,921,981
  16,922,131
  16,923,205
  16,923,483
  16,924,133
  16,924,197
  16,924,307
  16,924,343
  16,924,361
  16,924,593
  16,924,922
  16,925,215
  16,925,443
  16,925,723
  16,925,910
  16,926,150
  16,926,261
  16,926,319
  16,926,701
  16,927,077
  16,927,173
  16,927,231
  16,927,269
  16,927,455
  16,927,497
  16,927,531
  16,929,508
  16,930,648
  16,932,027
  16,933,426
  16,934,706
  16,935,489
  16,935,738
  16,936,468
  16,937,568
  16,939,608
  16,939,633
  16,939,731
  16,940,234
  16,940,370
  16,940,691
  16,940,803
  16,941,220
  16,941,259
  16,941,274
  16,941,446
  16,943,419
  16,944,218
  16,944,669
  16,944,842
  16,944,874
  16,944,891
  16,944,936
  16,945,621
  16,946,103
  16,950,486
  16,951,349
  16,952,797
  16,953,709
  16,954,209
  16,954,287
  16,954,289
  16,954,815
  16,956,232
  16,957,255
  16,959,295
  16,959,587
  16,959,679
  16,960,585
  16,961,551
  16,962,036
  16,962,224
  16,962,379
  16,962,959
  16,962,966
  16,963,309
  16,963,837
  16,964,200
  16,965,717
  16,966,902
  16,967,327
  16,968,066
  16,968,166
  16,968,249
  16,968,502
  16,968,564
  16,969,020
  16,969,077
  16,969,395
  16,971,212
  16,971,369
  16,972,915
  16,974,234
  16,975,244
  16,976,157
  16,976,353
  16,976,632
  16,977,637
  16,977,906
  16,979,759
  16,982,886
  16,984,631
  16,984,638
  16,984,664
  16,984,794
  16,984,820
  16,985,034
  16,985,083
  16,985,169
  16,986,688
  16,986,706
  16,987,116
  16,988,672
  16,989,105
  16,989,307
  16,989,955
  16,990,814
  16,991,055
  16,991,118
  16,992,165
  16,992,242
  16,992,265
  16,992,599
  16,993,369
  16,993,692
  16,993,963
  16,994,147
  16,994,879
  16,995,012
  16,995,152
  16,995,298
  16,995,715
  16,995,951
  16,996,262
  16,996,413
  16,997,233
  16,997,297
  16,997,499
  16,998,535
  16,998,800
  16,998,830
  16,998,946
  16,999,161
  16,999,261
  16,999,338
  16,999,840
  16,999,899
  17,000,937
  17,001,271
  17,001,396
  17,001,857
  17,001,869
  17,002,147
  17,002,356
  17,002,628
  17,003,008
  17,003,027
  17,003,123
  17,003,836
  17,004,671
  17,005,016
  17,005,026
  17,005,691
  17,005,950
  17,006,459
  17,007,548
  17,007,995
  17,008,707
  17,011,169
  17,012,412
  17,012,957
  17,018,722
  17,021,933
  17,022,337
  17,022,357
  17,022,557
  17,028,682
  17,030,169
  17,031,324
  17,033,354
  17,034,381
  17,035,365
  17,036,353
  17,036,367
  17,036,822
  17,037,497
  17,040,147
  17,040,149
  17,040,222
  17,040,374
  17,042,563
  17,045,551
  17,045,586
  17,045,587
  17,045,588
  17,045,612
  17,045,620
  17,045,635
  17,046,796
  17,048,467
  17,049,781
  17,050,229
  17,057,448
  17,057,476
  17,060,604
  17,060,608
  17,061,438
  17,063,496
  17,064,865
  17,064,944
  17,065,076
  17,065,524
  17,065,539
  17,065,808
  17,066,166
  17,066,199
  17,066,238
  17,067,049
  17,067,642
  17,068,223
  17,069,022
  17,069,560
  17,069,640
  17,071,152
  17,073,592
  17,084,167
  17,088,339
  17,093,761
  17,097,464
  17,098,969
  17,105,429
  17,105,442
  17,105,927
  17,106,061
  17,106,079
  17,106,463
  17,106,557
  17,106,811
  17,107,137
  17,107,299
  17,113,169
  17,113,414
  17,113,636
  17,114,120
  17,114,434
G
T
A
G
A
C
T
T
T
A
G
C
A
A
C
A
T
A
G
T
T
C
C
C
C
C
C
C
A
T
T
A
A
C
C
A
C
T
A
G
G
T
C
C
T
T
T
T
C
G
C
G
A
G
A
C
C
T
T
G
G
C
T
A
C
G
A
T
T
G
C
A
C
C
C
A
C
T
C
T
C
A
C
A
G
G
A
C
A
A
T
G
G
C
T
T
C
A
A
C
A
A
G
C
C
C
G
G
A
A
G
C
A
G
T
C
T
T
A
A
C
C
T
T
G
A
C
A
T
A
C
C
C
A
A
T
A
G
A
T
G
G
C
T
C
T
A
A
A
T
G
A
G
C
A
T
G
T
T
A
A
C
T
G
C
A
T
A
T
C
G
T
T
T
T
T
T
T
A
G
C
C
G
G
C
A
C
G
T
T
C
C
G
T
A
C
A
G
T
T
A
T
C
C
T
C
G
A
C
T
A
C
G
T
T
T
C
C
C
T
T
A
T
A
C
T
G
T
T
T
G
T
C
A
A
A
C
T
T
T
T
G
A
G
T
C
C
C
G
T
G
G
C
C
A
A
G
A
G
G
A
T
A
A
G
G
A
G
G
C
C
G
A
C
C
T
T
G
A
C
G
G
G
A
C
T
T
C
A
T
T
A
T
T
A
T
T
C
G
T
C
C
T
A
T
C
T
T
C
C
T
C
C
T
C
G
T
C
T
G
G
G
A
A
T
C
T
A
T
T
G
G
T
T
C
C
G
A
G
A
C
G
G
C
G
A
C
T
G
A
T
T
G
A
G
A
T
G
T
C
G
G
C
T
C
A
G
T
T
C
C
G
A
A
G
T
A
A
A
A
A
A
C
A
A
A
G
C
A
A
C
G
A
T
G
T
T
T
G
T
A
T
C
T
G
A
A
C
G
G
A
C
A
C
A
G
A
C
A
A
A
T
T
T
C
G
G
A
G
A
T
C
C