Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 138,104 (bp)   Positions: 502
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.971
.0
.04
.486
--
--
--
.011
.142
.003
.003
.002
.0
.143
1.0
.002
.036
.001
.003
.02
.025
.0
.002
.001
.001
.0
.005
.015
.0
.002
.0
.01
.001
.0
.0
.0
.0
.017
.0
.0
.0
.001
.001
.0
.021
.002
.004
.002
.008
.0
.799
.0
.0
.001
.1
.049
.003
.003
.011
.0
.006
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.009
.0
.0
.01
.0
.335
.205
.009
.0
.002
.002
.0
.001
.906
.014
.002
.704
.743
.777
.794
.213
.061
.004
.002
.014
.0
.0
.0
.0
.0
.101
.001
.01
.179
.014
.005
.058
.031
.004
.239
.004
.004
.006
.002
.011
.002
.0
.088
.098
.0
.0
.004
.034
.001
.0
.001
.036
.001
.0
.001
.0
.0
.002
.017
.001
.0
.0
.0
.398
.006
.175
.007
.001
.027
.004
--
.068
.329
.206
.152
.009
.018
.013
.102
.001
.0
.0
.307
.001
.001
.005
.971
.998
1.0
.016
.0
.005
.004
.0
.0
.001
.204
.204
.0
.001
.966
.003
.005
.005
.0
.012
.0
.012
.019
.02
.022
.006
.007
.03
.005
.001
.0
.0
.0
.001
.001
.0
.004
.001
.001
.002
.001
.0
.002
.001
.007
.005
.097
.001
.318
.232
.136
.043
.018
.001
.0
.033
.002
.188
.001
.008
.001
.232
.826
.001
.016
.808
.008
.008
.002
.023
.0
.001
.003
.005
.009
.034
.037
.092
.091
.0
.004
.007
.05
.001
.029
.0
.002
.979
1.0
.002
.002
.056
.016
.043
--
--
--
--
.001
.005
--
--
--
--
.017
.0
.0
.0
.001
.95
.001
.002
.001
.056
.001
.103
.04
.227
.133
.006
.01
.024
.086
.047
.0
.01
.005
.0
.0
.0
.73
.0
.015
.005
.0
.0
.0
.937
.246
.0
.004
.003
.994
.001
.108
.005
.001
.018
.029
.14
.19
--
.0
.0
.42
.009
.594
.063
.031
.044
.009
.514
.151
.0
.038
.015
.001
.013
.001
.001
.006
.0
.0
.011
.07
.002
.0
.0
.003
.003
.0
.006
.0
.0
.004
.244
.669
.001
.001
.0
.0
.0
.036
.992
.741
.002
.068
.001
.015
.203
.136
.411
.356
.01
.008
.001
.056
.007
.065
.187
.002
.0
.002
.002
.0
.009
.0
.437
.997
.933
.001
.001
.222
.001
.002
.001
.016
.0
.0
.823
.002
.002
.027
.968
.003
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.01
.0
.01
.0
.001
.004
.008
.023
.004
.001
.0
.005
--
--
--
--
--
.006
.013
.022
.009
.068
.041
.05
.071
.001
.035
.035
.019
.007
.023
.029
.004
.144
.082
.0
.002
.0
.0
.001
.081
.001
.037
.006
.001
.0
.002
.006
.014
.012
.0
.001
.01
.0
.0
.0
.001
.001
.0
.031
.493
.003
.045
.089
.0
.001
.0
.022
.069
.093
.02
.267
.007
.896
.001
.001
.001
.0
.003
.002
.002
.022
.001
.001
.028
.0
.117
.013
.057
.036
.034
.005
.001
.0
.0
.975
.998
.995
1.0
.944
.193
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
Frem2
C
T
C
C
C
T
-
G
T
C
C
A
T
C
18
-
-
G
C
A
T
T
C
A
G
T
3
3
A
T
G
G
A
C
C
A
T
C
-
T
G
-
T
T
A
G
C
T
T
A
7
A
G
T
-
G
T
C
A
C
C
T
T
G
3
-
T
A
G
-
4
C
-
C
-
T
T
T
T
A
A
A
A
C
G
2
A
-
6
A
C
C
-
T
C
2
T
T
A
47
C
C
A
A
A
-
-
A
T
2
-
A
T
C
G
C
G
G
C
C
G
G
-
G
T
G
C
T
G
G
-
A
A
A
4
C
A
G
T
G
A
T
-
A
114
G
G
2
6
A
G
-
A
T
G
C
G
G
A
C
G
A
A
T
G
T
G
T
A
C
G
G
G
T
T
C
G
A
A
C
T
A
G
G
G
3
C
T
A
G
T
T
C
2
G
T
T
T
G
A
T
C
T
T
C
A
T
G
G
G
G
C
A
T
C
G
G
G
G
G
C
4
11
A
C
G
-
C
-
C
A
A
C
G
A
C
T
G
C
A
C
A
C
G
A
C
G
G
T
T
T
G
-
G
2
C
G
T
T
T
A
5
-
A
C
G
A
T
C
T
C
T
T
-
C
T
-
C
T
A
A
C
A
A
-
A
A
G
G
G
T
G
G
A
T
G
G
-
A
C
A
G
G
T
C
G
G
C
G
A
3
C
T
G
T
6
C
A
T
T
G
A
A
C
A
C
G
C
A
C
G
T
A
-
T
A
T
G
A
T
G
G
T
A
A
C
A
G
-
T
A
G
A
G
A
C
G
A
A
-
C
-
A
C
T
A
G
G
T
G
C
G
C
T
G
A
G
C
T
A
C
-
C
T
-
-
T
C
T
A
A
T
-
G
4
A
G
T
T
A
T
C
A
C
G
A
C
G
T
-
C
C
T
C
A
2
26
T
C
-
C
A
C
C
C
T
A
A
T
G
-
3
3
T
G
G
A
A
T
C
A
G
A
T
C
T
C
G
C
A
T
T
C
C
A
A
A
C
2
G
G
A
A
G
G
T
T
T
A
C
G
A
A
T
A
-
C
G
G
G
T
G
2
C
G
T
-
C
G
-
T
T
T
G
G
A
C
C
C
C
G
C
  142,747,625
  142,747,741
  142,748,216
  142,748,250
  142,748,832
  142,748,974
  142,749,026
  142,749,465
  142,749,826
  142,749,839
  142,750,060
  142,752,420
  142,752,435
  142,752,446
  142,753,171
  142,753,578
  142,753,607
  142,753,957
  142,753,960
  142,754,007
  142,755,121
  142,755,629
  142,755,785
  142,755,900
  142,755,953
  142,756,096
  142,756,535
  142,756,546
  142,756,778
  142,756,919
  142,756,921
  142,757,029
  142,757,058
  142,757,095
  142,757,097
  142,757,128
  142,757,135
  142,757,150
  142,757,190
  142,757,192
  142,757,194
  142,757,219
  142,757,401
  142,757,407
  142,757,459
  142,757,474
  142,757,558
  142,757,713
  142,757,776
  142,757,886
  142,757,921
  142,757,936
  142,757,970
  142,758,208
  142,758,222
  142,758,310
  142,758,409
  142,758,483
  142,758,702
  142,758,722
  142,759,020
  142,759,229
  142,759,262
  142,759,292
  142,759,372
  142,759,439
  142,759,493
  142,759,516
  142,759,562
  142,759,575
  142,759,576
  142,759,732
  142,760,086
  142,760,215
  142,760,227
  142,760,329
  142,760,500
  142,760,558
  142,760,648
  142,760,882
  142,760,933
  142,760,949
  142,760,962
  142,761,130
  142,761,221
  142,761,524
  142,761,526
  142,761,529
  142,761,530
  142,761,541
  142,761,961
  142,762,447
  142,762,453
  142,762,636
  142,762,775
  142,762,862
  142,763,090
  142,763,122
  142,763,158
  142,763,319
  142,763,367
  142,763,374
  142,763,422
  142,763,498
  142,763,545
  142,763,645
  142,763,647
  142,763,681
  142,763,722
  142,763,807
  142,763,810
  142,763,851
  142,763,967
  142,764,002
  142,764,063
  142,764,127
  142,764,220
  142,764,224
  142,764,372
  142,764,394
  142,764,486
  142,764,861
  142,764,894
  142,764,977
  142,765,042
  142,765,080
  142,765,109
  142,765,138
  142,765,223
  142,765,343
  142,765,356
  142,765,400
  142,765,464
  142,765,954
  142,766,189
  142,766,423
  142,766,542
  142,766,769
  142,767,117
  142,767,358
  142,767,676
  142,767,768
  142,767,858
  142,767,892
  142,768,199
  142,768,431
  142,768,443
  142,768,452
  142,768,466
  142,768,493
  142,768,511
  142,768,636
  142,768,657
  142,768,678
  142,768,825
  142,768,827
  142,768,945
  142,768,989
  142,769,098
  142,769,107
  142,769,208
  142,769,283
  142,769,364
  142,770,222
  142,770,317
  142,770,531
  142,771,955
  142,772,388
  142,772,550
  142,773,295
  142,773,390
  142,773,392
  142,773,551
  142,774,894
  142,775,404
  142,776,224
  142,777,053
  142,777,326
  142,777,524
  142,777,813
  142,778,106
  142,778,165
  142,778,514
  142,778,516
  142,778,518
  142,778,910
  142,778,926
  142,778,958
  142,779,253
  142,779,666
  142,779,745
  142,779,755
  142,780,296
  142,780,401
  142,780,628
  142,780,831
  142,781,206
  142,781,623
  142,782,046
  142,784,252
  142,784,253
  142,784,256
  142,784,262
  142,784,263
  142,785,105
  142,785,106
  142,787,283
  142,787,399
  142,787,929
  142,787,948
  142,788,123
  142,788,134
  142,788,142
  142,788,153
  142,788,807
  142,791,007
  142,791,080
  142,792,020
  142,792,390
  142,792,638
  142,792,946
  142,793,034
  142,793,094
  142,793,115
  142,793,214
  142,793,677
  142,793,770
  142,793,889
  142,794,127
  142,794,264
  142,795,016
  142,795,568
  142,796,370
  142,797,062
  142,797,068
  142,797,162
  142,797,163
  142,797,187
  142,797,190
  142,797,211
  142,797,290
  142,797,324
  142,797,468
  142,797,496
  142,797,584
  142,797,933
  142,799,086
  142,802,158
  142,804,527
  142,804,666
  142,806,278
  142,806,847
  142,812,808
  142,813,361
  142,823,631
  142,823,720
  142,823,740
  142,823,814
  142,824,317
  142,824,477
  142,824,697
  142,824,699
  142,824,897
  142,825,916
  142,826,093
  142,826,264
  142,827,643
  142,827,683
  142,827,881
  142,828,200
  142,828,844
  142,828,845
  142,828,953
  142,828,984
  142,829,084
  142,829,167
  142,829,286
  142,829,525
  142,829,696
  142,830,321
  142,830,356
  142,830,410
  142,830,555
  142,830,659
  142,832,079
  142,832,451
  142,832,510
  142,833,477
  142,833,604
  142,833,645
  142,834,555
  142,835,152
  142,835,229
  142,835,541
  142,835,549
  142,835,593
  142,835,874
  142,836,546
  142,836,576
  142,836,692
  142,836,760
  142,836,956
  142,837,521
  142,839,544
  142,839,939
  142,840,161
  142,840,854
  142,840,896
  142,841,248
  142,842,174
  142,842,177
  142,842,597
  142,842,915
  142,843,172
  142,843,302
  142,843,422
  142,843,690
  142,843,725
  142,844,236
  142,844,237
  142,844,548
  142,844,579
  142,844,644
  142,844,711
  142,844,720
  142,845,009
  142,845,231
  142,845,644
  142,845,655
  142,845,878
  142,846,116
  142,846,203
  142,846,502
  142,846,590
  142,846,624
  142,846,633
  142,846,647
  142,846,652
  142,846,801
  142,847,000
  142,847,055
  142,847,111
  142,847,237
  142,847,263
  142,847,563
  142,847,760
  142,847,845
  142,847,914
  142,847,937
  142,848,009
  142,848,154
  142,848,166
  142,848,347
  142,848,389
  142,848,401
  142,848,712
  142,848,756
  142,848,783
  142,848,996
  142,849,071
  142,849,247
  142,849,356
  142,849,423
  142,849,588
  142,849,608
  142,849,613
  142,849,720
  142,850,168
  142,850,273
  142,850,293
  142,850,891
  142,851,103
  142,852,053
  142,852,379
  142,852,457
  142,852,521
  142,852,587
  142,852,639
  142,852,657
  142,852,663
  142,852,710
  142,852,918
  142,853,785
  142,853,828
  142,854,150
  142,854,151
  142,854,160
  142,854,304
  142,854,323
  142,854,598
  142,855,178
  142,855,209
  142,855,230
  142,855,563
  142,855,583
  142,855,605
  142,856,344
  142,856,348
  142,856,614
  142,856,634
  142,856,870
  142,856,950
  142,857,916
  142,858,250
  142,858,303
  142,858,409
  142,858,523
  142,858,578
  142,858,715
  142,858,911
  142,859,097
  142,859,098
  142,859,542
  142,859,599
  142,859,603
  142,859,606
  142,859,627
  142,859,664
  142,859,785
  142,859,796
  142,859,800
  142,859,872
  142,859,922
  142,859,941
  142,860,353
  142,860,383
  142,860,501
  142,860,563
  142,860,585
  142,860,767
  142,860,848
  142,860,895
  142,860,899
  142,860,920
  142,861,185
  142,861,304
  142,861,455
  142,861,459
  142,861,463
  142,861,527
  142,861,529
  142,861,583
  142,862,107
  142,862,225
  142,862,369
  142,862,601
  142,862,820
  142,862,836
  142,863,008
  142,863,033
  142,863,043
  142,863,088
  142,863,114
  142,863,171
  142,863,293
  142,863,497
  142,863,602
  142,863,670
  142,863,851
  142,864,290
  142,864,399
  142,864,473
  142,864,621
  142,864,638
  142,864,717
  142,864,849
  142,864,990
  142,865,077
  142,865,281
  142,865,357
  142,865,389
  142,865,521
  142,865,579
  142,866,409
  142,867,049
  142,868,838
  142,868,853
  142,868,856
  142,868,857
  142,868,861
  142,869,203
  142,869,204
  142,869,622
  142,869,939
  142,870,692
  142,870,729
  142,874,214
  142,876,353
  142,876,411
  142,877,163
  142,878,592
  142,878,593
  142,878,594
  142,879,122
  142,879,530
  142,879,952
  142,883,303
  142,883,368
  142,883,371
  142,883,373
  142,883,423
  142,883,539
T
C
T
T
T
C
T
A
C
G
C/-
T
C
T
-
4
16
A
T
G
C
A
G
G
C
G
-
-
G
C
A
C
G
T
T
G
C
T
3
C
A
3
C
C
G
T
A
C
C
C
-
G
A
C
139
A
C
T
G
T
T
C
C
A
-
11
C
G
A
2
-
T
T
T
10
G
C
C
A
G
G
C
C
T
A
-
C
2
-
G
T
T
2
C
T
-
C
A
C
47/-
C/T
C/A
A/C
G
C
7
4
G
-
-
7/C
G
C
A
A
A
A
A
T
T
T
A
8
A
G
A
-
C
C
A
C
G
G
G
-
T
T
A
C
T
G
C
A
G
-
C
C
-
-
G
A
11
G
C
C
T
T
A
G
T
T
G
G
C
C
C
A
C
T
G
C
C
A
C
C
T
A
G
G
T
A
G
C
C
C
-
T
C
T
T
C
G
T
-
T
C
C
C
A
-
G
G
G
G
T
G
C
A
G/A
G/A
A
T
G
G
T
A
A
C
A
A
G
-
11/-
G
A
A
T
T
18
T
C
C
T
C
G
T
G
A
T
G
T
G
T
C
-
T
C
C
C
-
G
C
A
T
-
T
A
C
C
C
A/T
5/-
4
G
G
T
C
C
A
A
G
G
A
A
T
G
C
A
C
C
G
T
C
G
6
G
G
A
A
A
C
T
A
G
C
A
C
8
G
T
G
-
A
C
T
A
A
T
C
G
-
-
A
A
A
-
G
C
A
G
A
G
G
T
G
T
C
T
G
T
A
C
G
2
C
G
C
A
T
G
A
A
C
C
T
A
G
C
4
G
G
A
G
A
-
A
A
G
G
2
T
G
G
T
C
C
A
A
C
T
T
A
A
C
A
C
C
A
G
G
T
C
T
-
A
A
C
T
C
C
T
C
12
C
-
C
-
A
C
G
C
T
G
T
C
-
T
C
A
3
T
T
C
T
-
-
-
A
T
C
T
G
G
G
T
C
G
G
A
A
C
-
-
C
A
-
G
T
G
T
G
A
T
C
T
C
A
A
A
G
C
G
T
T
G
G
G
A
-
A
A
G
T
A
A
C
C
G
G
T
A
G
C
C
G
7
C/T
G/C
G/T
G/T
A
A
-
T
A
C
T
T
C
6
A
A
C
C
A
-
-
-
T
-
A
T