Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 88,981 (bp)   Positions: 244
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.849
.0
.536
.0
.0
.012
1.0
.022
.217
.003
.013
.004
.623
.103
.012
.017
.014
.003
.012
.073
.029
.092
.135
.205
.015
.003
.006
.054
.104
.026
.007
.102
.006
.009
.028
.029
.035
.091
.117
.137
.125
.103
.069
.102
.001
.0
.074
.021
.009
.001
.012
.107
.18
.026
.013
.375
.025
.366
.083
.006
.002
.005
.582
.543
.007
.422
.049
.002
.003
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.391
.381
.077
.015
.973
--
.007
.027
.046
.063
.427
.003
.007
.328
--
--
.04
.005
.905
.0
.001
.009
.001
.0
.01
.002
.013
.622
.002
.0
--
.005
.001
.001
.001
.058
.004
.007
.017
.001
.337
.04
.724
.328
.856
--
--
.869
.255
.001
.021
.102
.002
.005
.026
.002
.146
.004
.179
.004
.04
.015
.004
.0
.417
.091
.03
.016
.025
.0
.003
.003
.006
.01
.001
.001
1.0
.106
.945
.004
.004
.001
.039
.011
.1
.136
.021
.011
.023
.0
.002
.195
--
.185
.017
.0
.002
.137
.004
.008
.127
.23
.355
.018
.085
.011
.0
.96
.185
.178
.171
.0
.014
.263
.001
.139
.001
.006
.002
--
--
--
.093
.011
.004
.999
.991
.003
.0
.006
.004
.072
.202
.445
.052
.041
.995
.901
.011
1.0
.997
.007
.038
.998
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
Foxj3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
A
A
A
C
-
-
G
-
T
G
T
-
C
T
T
C
C
G
T
-
-
-
T
-
T
T
-
C
A
-
-
2
3
-
C
-
C
-
G
-
-
2
A
-
G
-
C
T
-
-
G
G
-
-
-
G
T
3
A
G
T
C
T
C
A
G
C
A
C
C
-
C
-
T
-
C
A
-
-
-
G
-
T
-
2
C
-
C
-
T
C
21
A
80
G
C
C
C
-
-
-
T
-
-
G
8
-
4
3
C
G
G
-
C
G
-
C
A
G
G
T
C
C
G
T
-
-
G
A
16
-
A
C
A
T
-
-
C
T
G
C
C
T
A
A
T
G
C
T
T
T
T
A
T
C
C
T
A
T
G
T
C
C
-
C
A
C
C
T
G
G
A
G
A
4
A
A
C
G
A
T
C
T
11
T
G
A
C
G
A
C
9
G
G
T
-
C
-
23
A
T
T
T
C
A
T
A
A
A
A
-
T
T
C
-
C
T
G
T
G
C
T
T
G
G
C
C
T
T
A
T
A
-
-
2
-
-
-
A
20
A
A
C
  138,589,178
  138,589,817
  138,590,031
  138,590,819
  138,591,055
  138,591,626
  138,592,984
  138,593,362
  138,594,687
  138,594,874
  138,594,917
  138,595,782
  138,596,329
  138,596,410
  138,596,826
  138,597,573
  138,597,636
  138,597,780
  138,598,922
  138,599,267
  138,599,302
  138,599,306
  138,599,308
  138,599,313
  138,599,336
  138,599,338
  138,599,357
  138,599,362
  138,599,372
  138,599,378
  138,599,382
  138,600,978
  138,601,141
  138,601,152
  138,601,160
  138,601,161
  138,601,181
  138,601,206
  138,601,213
  138,601,223
  138,601,242
  138,601,249
  138,601,256
  138,602,190
  138,602,227
  138,602,238
  138,602,265
  138,602,598
  138,602,605
  138,602,610
  138,602,614
  138,602,623
  138,602,640
  138,602,696
  138,602,729
  138,602,899
  138,603,499
  138,603,685
  138,604,847
  138,605,384
  138,605,454
  138,606,154
  138,608,221
  138,608,415
  138,609,786
  138,610,050
  138,610,141
  138,610,439
  138,610,441
  138,610,443
  138,610,452
  138,610,511
  138,610,523
  138,610,542
  138,610,550
  138,610,552
  138,610,580
  138,610,584
  138,610,594
  138,610,600
  138,610,606
  138,610,620
  138,610,664
  138,610,672
  138,610,749
  138,610,752
  138,610,763
  138,610,781
  138,610,783
  138,611,201
  138,611,227
  138,611,231
  138,611,250
  138,611,285
  138,611,295
  138,611,401
  138,611,638
  138,611,640
  138,611,651
  138,611,664
  138,612,167
  138,612,168
  138,613,326
  138,613,387
  138,613,707
  138,613,858
  138,614,483
  138,615,151
  138,615,163
  138,615,168
  138,615,257
  138,616,153
  138,616,527
  138,616,955
  138,617,036
  138,617,401
  138,617,744
  138,618,459
  138,619,466
  138,620,179
  138,620,334
  138,621,803
  138,622,012
  138,622,878
  138,624,576
  138,624,845
  138,624,873
  138,625,538
  138,625,562
  138,625,587
  138,625,732
  138,626,240
  138,626,577
  138,626,898
  138,628,252
  138,628,470
  138,629,697
  138,630,125
  138,630,204
  138,630,212
  138,631,746
  138,632,221
  138,633,503
  138,633,535
  138,633,584
  138,634,002
  138,634,008
  138,634,176
  138,634,235
  138,634,581
  138,634,804
  138,635,691
  138,635,775
  138,636,041
  138,637,539
  138,637,666
  138,637,745
  138,638,150
  138,638,643
  138,638,980
  138,640,629
  138,641,087
  138,641,263
  138,643,189
  138,643,853
  138,643,956
  138,644,118
  138,644,376
  138,645,665
  138,647,179
  138,648,189
  138,648,347
  138,648,617
  138,648,970
  138,648,984
  138,649,381
  138,649,622
  138,649,770
  138,650,861
  138,651,423
  138,651,433
  138,651,447
  138,651,734
  138,652,476
  138,652,936
  138,653,887
  138,653,993
  138,654,194
  138,655,703
  138,655,863
  138,656,199
  138,656,461
  138,657,305
  138,657,450
  138,657,699
  138,658,036
  138,659,015
  138,659,115
  138,660,434
  138,660,980
  138,661,012
  138,661,082
  138,661,163
  138,661,379
  138,661,668
  138,662,047
  138,662,134
  138,662,201
  138,662,672
  138,662,673
  138,662,674
  138,663,172
  138,663,291
  138,663,331
  138,663,513
  138,663,879
  138,664,179
  138,664,351
  138,664,395
  138,664,533
  138,664,538
  138,664,604
  138,664,718
  138,665,449
  138,665,678
  138,666,925
  138,667,879
  138,668,191
  138,668,273
  138,669,959
  138,670,665
  138,671,241
  138,672,423
  138,673,389
  138,673,466
  138,675,335
  138,675,511
  138,675,521
  138,675,583
  138,675,622
  138,675,634
  138,675,672
  138,675,707
  138,676,867
C
G
G
G
T
13
4
A
C
C
A
C
13
T
C
A
T
A
T
-
G
A
T
-
A
A
-
T
-
-
T
4
-
-
G
A
T
T
T
T
T
2
-
-
A
-
A
-
-
T
G
-
-
T
A
-/118
T
A
-
G
T
A
T
A
T
T
A
A
C
-
-
G
-
A
A
2
A
-
A
T
A
C
A
-
A
-
-
T
A
A
A
-
-
C
-
A
-
A
-
A
6
4
G
9
A
A
-
T
4/-
3/-
T
A
A
3
T
T
C
G
G
A
A
C
T
T
A
C
T
T
A
C
-
5
-
T
G
-
C
15
-
C
A
T
T
C
G
T
A
A
T
G
G
C
C
T
G
A
T
-
C
C
A
C
T
T
A
T
G
T
T
C
A
A
G
C
G
-
G
G
A
A
G
C
T
A
-
C
T
G
T
A
G
A
-
A
A
C
17
T
T
-
-
C
C
C
T
G
C
T
T
T
T
A
-
C
T
16
T
A
C
C
T
T
C
C
A
A
A
T
C
C
T
-
G
6
3
-
A
A
A
-
-
-
-
A