Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 56,321 (bp)   Positions: 288
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.005
.001
.001
.003
.133
.002
.002
.0
.002
.0
.002
--
.114
.031
.435
.495
.488
.011
.003
.254
.035
.074
.009
.015
.627
.218
.066
.202
.197
.111
.033
.013
.063
.112
.218
.137
.511
.215
.241
.274
.38
.036
.008
.022
.003
.067
.01
.022
.173
.04
.003
.001
.117
.0
.153
.001
.0
.015
.027
.04
.156
.041
.0
.123
.03
.258
.381
.007
.003
.003
.001
.0
.094
.007
.0
.001
.0
.002
.008
.003
.003
.408
.168
.0
.001
.004
.065
.001
.001
.003
.002
.55
.106
.169
.002
.066
.0
.069
.29
.0
.058
.172
.141
.009
.013
.106
--
--
--
.0
.005
.0
.003
.675
.506
.589
.439
.272
.007
.019
.001
--
.004
.005
.008
.001
.002
.0
.003
.001
.0
.0
.163
.056
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.002
.002
.001
.007
.202
.004
.004
.006
.003
.004
.118
.175
.014
.074
.075
.078
.046
.006
.002
.03
.035
.002
.007
.004
.001
.0
.01
.0
.0
--
--
.002
.001
.027
.004
.039
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.008
.006
.006
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.001
.026
.002
.082
.011
.004
.005
.001
.0
.002
.003
.001
.0
.001
.017
.001
.001
.001
.036
.002
.015
.002
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
Fam185a
G
T
A
-
T
C
G
G
C
T
C
G
G
C
C
C
C
-
C
A
G
C
T
C
-
C
A
A
A
A
A
-
G
T
-
-
C
G
T
G
-
G
-
C
G
G
T
C
G
T
T
T
C
T
T
A
A
T
A
G
-
-
C
C
C
G
G
T
C
C
C
A
T
G
C
C
C
T
C
A
G
A
T
T
A
A
T
8
-
C
T
C
C
C
A
A
A
C
T
-
-
A
T
T
T
-
A
T
A
C
C
A
A
C
-
G
T
C
G
G
G
C
G
C
G
C
-
G
G
G
A
A
A
C
C
C
T
C
T
C
C
C
G
A
C
G
A
A
A
-
A
-
-
G
T
C
C
C
2
-
G
C
A
C
A
C
T
A
T
C
C
3
G
T
G
G
A
T
T
C
T
T
A
A
G
C
A
T
G
5
T
A
T
G
A
C
T
-
-
-
T
-
-
-
-
T
G
T
-
16
11
G
A
A
A
T
T
A
-
-
-
-
T
-
-
-
-
C
T
-
C
-
-
-
C
-
-
-
C
-
-
C
-
-
-
G
-
-
T
-
-
-
G
2
C
-
-
2
C
G
-
T
2
C
-
T
-
G
G
C
T
T
A
A
A
T
T
G
A
A
C
C
C
G
4
G
A
T
  10,213,721
  10,213,843
  10,214,376
  10,214,386
  10,214,676
  10,214,859
  10,215,055
  10,215,224
  10,215,431
  10,215,483
  10,215,540
  10,215,602
  10,216,253
  10,216,422
  10,216,559
  10,216,583
  10,216,634
  10,216,896
  10,216,913
  10,217,076
  10,217,146
  10,217,311
  10,217,359
  10,217,545
  10,217,852
  10,217,899
  10,217,933
  10,218,106
  10,218,107
  10,218,238
  10,218,306
  10,218,921
  10,219,021
  10,219,047
  10,219,355
  10,219,364
  10,219,651
  10,219,774
  10,219,841
  10,219,860
  10,219,872
  10,220,062
  10,220,072
  10,220,241
  10,220,469
  10,220,481
  10,220,692
  10,220,696
  10,220,796
  10,220,877
  10,221,164
  10,221,252
  10,221,485
  10,221,615
  10,222,020
  10,222,095
  10,222,230
  10,222,316
  10,222,482
  10,222,598
  10,222,667
  10,222,780
  10,222,975
  10,223,053
  10,223,111
  10,223,241
  10,223,244
  10,223,380
  10,223,433
  10,223,495
  10,223,660
  10,223,894
  10,224,526
  10,224,771
  10,224,994
  10,225,248
  10,225,330
  10,225,487
  10,225,940
  10,230,916
  10,231,027
  10,231,072
  10,231,143
  10,231,344
  10,231,442
  10,231,482
  10,231,609
  10,231,955
  10,231,964
  10,232,040
  10,232,440
  10,232,561
  10,232,575
  10,232,725
  10,232,879
  10,233,050
  10,233,814
  10,234,133
  10,234,656
  10,235,573
  10,235,628
  10,235,634
  10,237,050
  10,239,115
  10,239,442
  10,239,619
  10,240,493
  10,240,494
  10,240,518
  10,241,884
  10,242,245
  10,242,315
  10,242,422
  10,242,483
  10,242,521
  10,242,640
  10,243,021
  10,243,789
  10,243,840
  10,243,890
  10,243,985
  10,244,682
  10,244,757
  10,244,947
  10,244,949
  10,244,957
  10,244,968
  10,244,998
  10,245,002
  10,245,316
  10,245,378
  10,246,426
  10,247,152
  10,247,264
  10,247,358
  10,247,363
  10,247,364
  10,247,367
  10,247,373
  10,247,374
  10,247,965
  10,248,396
  10,249,162
  10,249,358
  10,249,422
  10,249,514
  10,249,666
  10,249,713
  10,250,527
  10,250,561
  10,250,564
  10,250,585
  10,250,592
  10,250,627
  10,250,737
  10,250,814
  10,250,821
  10,250,835
  10,250,872
  10,250,945
  10,250,978
  10,250,985
  10,251,102
  10,251,144
  10,251,272
  10,251,333
  10,251,439
  10,251,589
  10,251,634
  10,252,339
  10,256,054
  10,256,080
  10,256,163
  10,256,168
  10,256,196
  10,256,405
  10,256,823
  10,257,161
  10,257,654
  10,258,451
  10,258,598
  10,258,998
  10,259,420
  10,259,832
  10,259,919
  10,259,945
  10,259,946
  10,259,953
  10,260,076
  10,260,144
  10,260,164
  10,261,551
  10,261,593
  10,261,598
  10,261,600
  10,261,623
  10,261,643
  10,261,655
  10,261,674
  10,261,729
  10,261,735
  10,261,743
  10,261,751
  10,261,783
  10,261,802
  10,261,809
  10,261,827
  10,261,842
  10,261,860
  10,261,883
  10,261,907
  10,261,963
  10,261,989
  10,261,995
  10,262,017
  10,262,122
  10,263,042
  10,263,044
  10,263,050
  10,263,051
  10,263,054
  10,263,058
  10,263,063
  10,263,111
  10,263,155
  10,263,215
  10,263,231
  10,263,257
  10,263,265
  10,263,283
  10,263,289
  10,263,296
  10,263,300
  10,263,301
  10,263,304
  10,263,311
  10,263,337
  10,263,351
  10,263,380
  10,263,445
  10,263,486
  10,263,499
  10,263,502
  10,263,572
  10,263,646
  10,263,659
  10,263,722
  10,263,752
  10,263,820
  10,263,825
  10,263,850
  10,263,901
  10,264,025
  10,264,029
  10,264,035
  10,264,043
  10,264,046
  10,264,074
  10,264,078
  10,264,152
  10,264,786
  10,264,795
  10,264,804
  10,264,821
  10,264,839
  10,264,843
  10,264,850
  10,264,868
  10,265,000
  10,265,248
  10,265,285
  10,265,615
  10,265,780
  10,265,929
  10,266,006
  10,266,417
  10,266,688
  10,267,210
  10,267,452
  10,267,600
  10,267,713
  10,267,853
  10,267,904
  10,268,210
  10,268,711
  10,268,818
  10,269,104
  10,269,682
A
C
T
C/A
C
T
A
C
T
C
T
A
-
T
T
A
T
6
T
G
C
G
C
G
4
T
C
T
T
C
C
2
A
C
G
T
T
C
C
A
A
A
A
T
A
A
G
T
A
A
G
C
G
C
C
G
G
C
G
A
91
93
A
T
A
A
C
-
T
T
G
G
C
A
A
T
T
C
G
T
C
G
C
C
G
G
C
-
3
T
C
T
T
G
G
C
G
T
C
6
G
T
C
C
C
4
G
C
T
T
G
G
G
T
2
-
C
T
A
T
A
T
A
T
A
T
2
T
A
A
T
G
G
A
A
A
C
A
A
T
T
T
A
G
T
A
G
-
C
C
-
A
C
-
C
A
C/-
C/-
-
T
A
G
-
-
T
T
C
G
C
T
-
-
C
-
A
A
-
C
C
T
C
C
-
G
A
G
G
C
A
-
-
C
G
-
C
-
G
A
T
G
-
T
A
T
A
C
T
-
G
-
-
A
T
G
-
C
A
-
T
T
T
2
-
T
G
G
T
T
C
G
-
T
G
G
T
T
T
T
-
C
C
T
T
A
T
-
G
A
C
T
T
G
A
-
T
C
6
-
A
A
7
-
-
-
G
-
8
T
A
T
C
-
T
C
G
A
C
A
G
G
T
T
T
T
-
A
G
C