Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 471,772 (bp)   Positions: 551
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
--
--
--
--
.033
--
.004
.005
.005
.027
.003
.003
.017
.019
.017
.005
.007
.014
.001
.002
.004
.017
.035
.076
.264
.417
.346
.206
.18
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.795
.756
.447
.304
.245
.056
.002
.924
.006
.003
.003
.006
.016
.015
.304
.125
.115
.024
.015
.006
.002
.001
.085
.019
.012
.007
.011
.01
.033
.041
.009
.014
.131
.11
.049
.155
.294
.057
.049
.001
.011
.005
.019
.013
.04
.287
.201
.059
.498
.472
.443
.414
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
.984
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
.997
.918
.744
.0
.025
.041
.038
--
--
--
--
.128
.107
.11
.291
.183
.072
.038
.019
.057
.017
.058
.015
.021
.006
.002
.019
.001
.015
.103
.208
.061
.132
.272
.413
.295
.011
.035
.007
.012
.048
.005
.001
.01
.001
.015
.042
.003
.005
.007
.003
.003
.006
.014
.002
.004
.033
.173
.21
.202
.283
.013
.02
.006
.002
.001
.001
.016
.008
.008
.011
.007
.002
.002
.003
.011
.004
.024
.027
.003
.011
.004
.002
.001
.009
.002
.041
.002
.034
.017
.039
.034
.033
.016
.116
.001
.018
.002
.0
.003
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.002
.0
.0
.0
.005
.014
.015
.015
.012
.001
.014
.001
.0
.006
.001
.0
.001
.0
.001
.001
.001
.001
.001
.001
.001
.004
.0
.0
.0
.0
.003
.001
.0
.014
.006
.0
.009
.01
.247
.001
.015
.014
.02
.007
.012
.028
.029
.038
.005
.046
.04
.153
.133
.007
.045
--
.004
.315
.504
.056
.023
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.777
.351
.006
.002
.012
.001
.002
.002
.002
.0
.0
.001
.033
.042
.047
.002
.006
.001
.062
.023
.016
.005
.002
.002
.001
.041
.049
.001
.0
.034
.059
.002
.003
.004
.029
.178
.099
.008
.003
.001
.012
.004
.001
.001
.005
.002
.001
.001
.001
.038
.038
.015
.028
.007
.021
.006
.0
.0
.014
.047
.009
.03
.088
.095
.055
.025
.039
.097
.106
.093
.085
.006
.009
.001
.003
.016
.007
.025
.02
.002
.002
.0
.001
.011
.001
.001
.001
.023
.025
.002
.001
.013
.002
.001
.012
.008
.006
.002
.088
.076
.0
.0
.0
.001
.003
.0
.003
.0
.0
.002
.003
.0
.0
.006
.001
.002
.003
.029
.003
.011
.213
.219
.048
.001
.152
.003
.005
.103
.004
.008
.058
.784
.095
.141
.003
.413
.004
.002
.003
.006
.005
.008
.016
.007
.013
.015
.005
.048
.185
.002
.005
.001
.004
.001
.053
--
.022
.703
.005
.001
.13
.278
.603
1.0
.001
.004
.007
.0
.001
.021
--
--
--
.083
.077
.043
.091
.061
.026
.003
.761
.204
.031
.024
.019
.007
.098
--
.001
.019
.088
.088
.103
.368
.431
.021
.024
.01
.0
.273
.41
--
--
--
--
--
--
.006
.164
--
--
.013
.002
.014
.008
.001
.488
.047
.045
.023
.028
.024
.056
.035
--
.237
--
--
--
--
--
--
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
Exoc6b
G
C
C
G
-
-
G
-
G
A
T
-
C
-
G
A
A
-
-
G
G
G
3
-
A
-
C
C
T
-
-
A
T
-
T
T
G
G
G
-
-
A
-
G
A
G
A
T
-
G
G
T
A
C
A
-
C
-
C
T
T
T
C
C
C
G
C
G
-
A
C
-
A
G
2
2
-
-
A
-
T
-
A
-
-
-
A
-
-
C
-
2
-
A
C
2
C
-
-
C
-
-
C
C
C
C
-
-
C
-
-
-
A
-
G
-
-
-
C
-
C
T
-
-
G
6
A
-
G
-
-
-
-
T
-
A
T
G
C
A
A
-
-
A
A
G
-
-
-
C
-
-
-
4
A
G
G
2
G
G
A
-
C
C
-
G
C
C
C
A
A
C
G
A
C
-
G
T
2
C
G
-
C
-
4
T
-
-
A
C
-
C
G
T
T
2
G
G
C
A
-
G
2
G
T
2
G
T
2
-
-
-
T
C
-
G
G
C
A
C
-
C
C
-
T
T
G
A
A
G
-
A
C
-
A
C
A
2
C
T
T
T
G
-
-
-
A
-
-
3
-
T
G
T
-
-
C
-
-
A
4
T
4
A
T
C
T
A
T
C
C
A
C
A
T
C
G
A
T
A
A
-
A
-
-
C
A
C
G
A
A
G
T
G
G
2
C
-
-
C
G
C
T
-
-
C
-
C
A
T
A
-
-
2
-
-
-
-
G
A
C
7
T
A
A
-
T
-
-
T
A
G
-
T
2
A
2
C
C
-
A
G
T
2
-
A
2
A
A
C
C
G
T
C
A
A
-
C
T
C
A
T
C
-
T
-
-
A
A
-
A
C
A
G
A
C
T
A
C
G
G
-
-
T
G
-
-
-
-
2
G
C
G
-
-
-
2
-
-
2
G
T
T
G
T
C
-
-
T
-
-
-
T
C
3
C
A
G
-
-
-
T
-
-
G
G
C
A
T
G
-
T
-
-
G
-
T
C
A
-
G
G
G
G
C
A
T
C
G
C
C
C
C
C
C
C
C
C
G
G
C
C
C
-
T
C
-
-
T
A
A
C
T
A
-
C
2
C
-
-
-
T
-
-
C
G
C
G
-
-
-
A
-
-
-
A
G
-
2
-
-
-
-
-
-
C
C
A
-
10
-
-
-
-
-
T
T
A
A
-
A
G
C
G
-
A
-
T
9
A
G
T
A
G
7
G
-
-
-
C
-
T
C
2
A
C
A
C
G
G
G
  116,378,762
  116,378,764
  116,378,811
  116,381,733
  116,413,744
  116,413,771
  116,413,809
  116,413,821
  116,413,835
  116,413,850
  116,413,871
  116,413,875
  116,413,889
  116,413,893
  116,413,899
  116,413,912
  116,413,913
  116,413,923
  116,413,927
  116,413,931
  116,413,933
  116,413,940
  116,413,942
  116,416,932
  116,416,940
  116,416,952
  116,416,970
  116,417,024
  116,417,117
  116,434,672
  116,434,686
  116,434,805
  116,434,815
  116,434,833
  116,434,868
  116,434,885
  116,441,293
  116,441,310
  116,441,317
  116,445,290
  116,445,297
  116,445,303
  116,445,307
  116,445,318
  116,445,327
  116,445,336
  116,445,382
  116,445,440
  116,445,454
  116,445,457
  116,445,460
  116,445,474
  116,445,477
  116,445,490
  116,445,513
  116,445,522
  116,445,529
  116,445,532
  116,445,536
  116,445,538
  116,445,539
  116,445,551
  116,445,623
  116,445,631
  116,445,635
  116,445,642
  116,445,654
  116,445,661
  116,445,671
  116,445,682
  116,445,683
  116,445,710
  116,445,715
  116,445,728
  116,445,742
  116,445,770
  116,445,780
  116,445,794
  116,445,821
  116,445,826
  116,445,840
  116,445,859
  116,445,865
  116,445,868
  116,445,890
  116,445,898
  116,445,911
  116,445,969
  116,445,976
  116,445,983
  116,445,993
  116,459,624
  116,459,695
  116,459,701
  116,459,704
  116,459,712
  116,459,752
  116,459,755
  116,459,761
  116,459,767
  116,459,774
  116,459,793
  116,459,833
  116,459,854
  116,459,859
  116,459,861
  116,459,872
  116,459,890
  116,459,901
  116,459,907
  116,459,924
  116,459,940
  116,459,949
  116,459,975
  116,459,983
  116,460,002
  116,460,013
  116,460,019
  116,460,034
  116,460,073
  116,460,077
  116,469,600
  116,510,541
  116,510,546
  116,512,401
  116,512,850
  116,512,916
  116,512,948
  116,513,013
  116,513,027
  116,513,042
  116,513,047
  116,513,052
  116,513,084
  116,513,112
  116,513,123
  116,513,129
  116,513,146
  116,513,151
  116,513,184
  116,513,187
  116,513,222
  116,513,227
  116,513,254
  116,513,263
  116,513,357
  116,513,367
  116,513,451
  116,513,467
  116,513,481
  116,513,488
  116,513,493
  116,513,528
  116,513,533
  116,513,579
  116,513,599
  116,513,606
  116,513,625
  116,513,643
  116,513,660
  116,513,666
  116,513,699
  116,513,714
  116,513,729
  116,513,746
  116,513,769
  116,513,785
  116,513,801
  116,513,813
  116,513,816
  116,513,825
  116,513,833
  116,513,878
  116,513,879
  116,513,922
  116,513,928
  116,513,934
  116,513,938
  116,513,962
  116,513,972
  116,513,986
  116,513,992
  116,513,996
  116,513,998
  116,513,999
  116,514,009
  116,514,019
  116,514,024
  116,514,027
  116,514,031
  116,514,035
  116,514,092
  116,514,093
  116,514,104
  116,514,110
  116,514,118
  116,514,121
  116,514,132
  116,514,138
  116,514,141
  116,514,145
  116,514,156
  116,514,169
  116,514,192
  116,514,234
  116,514,267
  116,514,286
  116,514,294
  116,514,308
  116,514,326
  116,514,329
  116,514,335
  116,514,391
  116,514,415
  116,514,449
  116,515,480
  116,515,483
  116,515,489
  116,515,491
  116,515,498
  116,515,504
  116,515,520
  116,515,526
  116,515,528
  116,515,533
  116,515,537
  116,515,548
  116,515,549
  116,515,576
  116,515,597
  116,515,606
  116,515,608
  116,515,609
  116,515,613
  116,515,621
  116,515,628
  116,515,642
  116,515,659
  116,515,674
  116,515,678
  116,515,681
  116,515,690
  116,515,709
  116,515,732
  116,515,733
  116,515,767
  116,515,770
  116,515,795
  116,515,800
  116,515,804
  116,515,812
  116,515,826
  116,515,831
  116,515,855
  116,515,859
  116,515,867
  116,515,894
  116,515,903
  116,515,910
  116,515,916
  116,515,927
  116,515,932
  116,515,939
  116,519,456
  116,519,500
  116,519,564
  116,519,781
  116,519,834
  116,519,900
  116,519,904
  116,519,920
  116,519,921
  116,519,932
  116,520,758
  116,520,793
  116,520,843
  116,520,872
  116,520,877
  116,520,994
  116,521,195
  116,521,617
  116,524,503
  116,537,186
  116,537,209
  116,537,249
  116,537,252
  116,537,306
  116,537,342
  116,538,977
  116,539,020
  116,539,085
  116,539,102
  116,539,110
  116,539,113
  116,539,138
  116,539,171
  116,539,192
  116,539,243
  116,539,347
  116,539,385
  116,539,401
  116,539,428
  116,539,430
  116,539,440
  116,539,450
  116,539,494
  116,539,506
  116,539,517
  116,539,523
  116,539,524
  116,539,530
  116,562,456
  116,562,472
  116,562,487
  116,562,498
  116,562,510
  116,562,527
  116,562,532
  116,562,541
  116,562,544
  116,562,548
  116,562,551
  116,562,561
  116,562,571
  116,562,573
  116,562,583
  116,562,591
  116,562,601
  116,562,632
  116,562,687
  116,562,700
  116,562,704
  116,562,715
  116,562,723
  116,562,730
  116,562,740
  116,562,752
  116,562,754
  116,562,783
  116,562,786
  116,562,796
  116,562,803
  116,562,835
  116,562,842
  116,562,851
  116,562,853
  116,562,869
  116,562,873
  116,562,888
  116,562,890
  116,562,918
  116,562,964
  116,562,967
  116,562,971
  116,562,973
  116,562,996
  116,563,004
  116,563,013
  116,563,014
  116,563,025
  116,563,033
  116,563,037
  116,563,047
  116,563,108
  116,563,134
  116,563,160
  116,563,178
  116,563,187
  116,563,190
  116,563,240
  116,563,309
  116,563,335
  116,563,406
  116,563,437
  116,563,442
  116,563,466
  116,563,490
  116,563,492
  116,563,502
  116,563,505
  116,563,518
  116,563,535
  116,563,599
  116,563,606
  116,563,614
  116,563,618
  116,563,641
  116,563,655
  116,563,660
  116,563,666
  116,563,719
  116,563,756
  116,563,759
  116,563,762
  116,563,780
  116,563,810
  116,563,815
  116,563,834
  116,563,850
  116,563,854
  116,563,959
  116,563,995
  116,564,040
  116,564,057
  116,564,058
  116,564,069
  116,564,087
  116,564,156
  116,564,217
  116,564,244
  116,564,279
  116,564,328
  116,564,334
  116,564,418
  116,564,434
  116,564,454
  116,564,456
  116,564,471
  116,564,496
  116,564,503
  116,564,528
  116,564,566
  116,564,582
  116,564,599
  116,564,631
  116,564,637
  116,565,823
  116,565,827
  116,565,842
  116,565,941
  116,565,977
  116,566,089
  116,566,178
  116,566,207
  116,566,315
  116,567,802
  116,567,903
  116,567,909
  116,567,923
  116,567,953
  116,568,059
  116,568,084
  116,568,101
  116,568,133
  116,568,206
  116,568,283
  116,568,311
  116,568,439
  116,568,446
  116,568,449
  116,568,454
  116,568,456
  116,568,459
  116,568,461
  116,568,466
  116,568,472
  116,568,474
  116,568,482
  116,568,485
  116,568,504
  116,568,515
  116,568,538
  116,568,546
  116,568,563
  116,568,566
  116,568,594
  116,570,462
  116,570,511
  116,586,956
  116,597,116
  116,597,119
  116,607,046
  116,607,053
  116,607,074
  116,608,661
  116,608,844
  116,627,620
  116,630,172
  116,631,621
  116,631,624
  116,631,639
  116,654,612
  116,654,646
  116,654,656
  116,654,749
  116,654,751
  116,654,762
  116,654,771
  116,654,789
  116,654,796
  116,654,806
  116,654,842
  116,654,871
  116,654,913
  116,654,925
  116,655,035
  116,655,073
  116,655,111
  116,656,997
  116,657,002
  116,657,039
  116,657,129
  116,657,132
  116,657,136
  116,657,143
  116,657,146
  116,657,196
  116,657,198
  116,657,210
  116,657,216
  116,660,561
  116,677,096
  116,700,908
  116,700,945
  116,700,950
  116,700,970
  116,700,980
  116,700,991
  116,713,493
  116,714,620
  116,723,833
  116,723,839
  116,745,028
  116,745,114
  116,745,199
  116,745,310
  116,745,314
  116,745,351
  116,745,362
  116,745,374
  116,745,378
  116,745,435
  116,745,558
  116,745,672
  116,745,873
  116,750,379
  116,750,603
  116,757,007
  116,757,010
  116,757,014
  116,757,038
  116,757,048
  116,757,049
  116,758,972
  116,770,569
  116,770,595
  116,770,597
  116,770,818
  116,770,836
  116,771,159
  116,771,212
G/A
C/A
C/T
G/A
A
3
T
T
A
-
-
2
-
T
T
-
C
G
G
-
T
T
-
C
-
A
-
T
-
G
G
-
G
T
G
-
A
A
-
2
A
-
A
-
T
-
-
-
A
-
-
-
C
A
-
A
-
G
A
C
A
-
-
-
-
-
-
-
2
C
G
G
-
-
-
-
T
A
-
A
A
2
-
T
T
2
C
A
A
-
A
-
G
-
A
-
-
2
A
T
C
C
A
-
A
T
4
G
-
T
A
G
-
C
A
T
A
T
-
C
-
G
A
A
-
-
-
A
-
A
A
T
T
-
A
-
C
-
-
-
-
A
G
-
-
A
G
2
T
-
A
A
A
-
T
-
-
-
A
-
-
A
-
-
A
-
-
A
-
G
-
-
A
G
T
C
-
-
-
G
-
C/T
T
T
-
-
A
2
-
-
T
-
T
-
-
-
-
A
-
C
A
-
-
T
G
-
-
-
-
T
G
T
-
G
G
-
T
G
-
-
C
-
T
T
-
-
T
G
-
-
G
C
T
T
-
-
C
-
-
-
-
-
T
C
2
2
-
A
G
-
2
-
-
G
A
G/G
-
G
2
-
-
A
-
G
C
T
C
G
C
T
T
G
T
A/T
T/C
C/T
G/A
A/G
T/C
A/G
A/C
95
-
G
T
-
-
-
A
-
C
A
-
C
-
-
A
C
A
-
-
-
A
A
A
T
A
T
C
A
-
G
A
-
C
A
A
C
-
-
-
-
-
-
-
A
-
G
A
-
-
-
2
-
-
-
-
A
-
T
-
-
-
-
T
-
-
-
-
-
-
-
C
A
C
-
A
T
C
-
-
-
-
2
-
A
A
C
-
C
-
-
-
-
-
A
A
-
-
-
-
A
G
-
C
A
A
C
C
-
-
G
-
G
C
T
-
T
A
-
-
-
C
T
A
-
C
A
-
C
2
G
-
-
-
-
-
-
A
A
G
-
A
A
-
-
-
-
-
-
C
-
A
C
-
18
-
-
-
A
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
-
G
G
G
2
G
G
-
-
-
-
-
C
-
2/-
A
2
T
A
G
A
G
-
A
-
-
A
A
G
-
C
G
G
-
-
A
-
G
G
T
G
G
G
A
-
C
A
-
2
2
G
T
C
C
C
T
A/-
T
A/T
G/A
-
-
A
-
A
-
-
-
C
-
-
-
-
-
163
G
2
T
3
C
T
2/-
A/G
C/A
A/G
C/G
G/A
G/A
G/T