Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 122,555 (bp)   Positions: 575
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.149
.997
.0
.0
.0
.049
.025
.019
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.253
.001
.002
.143
.29
.01
.452
.127
.001
.026
.007
.044
.008
.02
.072
.111
.005
.006
.0
.042
.04
.001
.001
.002
.003
.003
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.049
.019
.023
.643
.002
.002
.002
.0
.003
.0
.008
.343
.06
.062
.003
.011
.172
.17
.169
.103
.034
.13
.315
.12
.004
.01
.015
.005
.026
.037
.036
.019
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.578
.404
.018
.217
.062
.003
.006
.359
.396
.002
.047
.001
.14
.0
.03
.006
.0
.0
.001
.01
.0
.01
.11
.004
.002
.002
.001
.618
.249
.002
.016
.007
.011
.001
.002
.005
.005
.004
.009
.004
.0
.0
.0
.0
.003
.004
.048
.007
.018
.273
.001
.004
.0
.005
.079
.096
.119
.163
.051
.013
.013
.069
.002
.014
.024
.226
.013
.006
.492
.001
.008
.0
.0
.924
.898
.648
.048
.001
.163
.736
.997
.989
.978
.933
.003
.002
.003
.002
.004
.166
.01
.012
.006
.057
.61
1.0
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.0
.136
.215
.57
.493
.494
.061
.049
.022
.003
.26
.024
.005
.002
.142
--
--
--
--
.148
.001
.142
.0
.017
.015
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.018
.012
.008
.004
.003
.013
.002
.071
.017
.011
.332
.307
.287
.335
.594
.012
.086
.018
.065
.029
.033
.995
1.0
.999
.11
.544
.004
.001
.003
.002
.016
.147
.151
.176
.19
.214
.215
.218
.221
.218
.21
.198
.191
.18
.064
.001
.002
.002
.001
.0
.243
.0
.001
.002
.0
.0
.265
.215
.003
.001
.005
.001
.012
.028
--
--
--
.001
.019
.011
.002
.037
.093
.141
.163
.016
.005
.004
.004
.0
.001
.001
.002
.004
.001
.0
.007
.02
.002
.524
--
--
--
--
--
.002
.002
.012
.018
.04
.071
.071
.182
.001
.005
.003
.006
.002
.002
.011
.064
.11
.126
.135
.211
.307
.356
.031
.007
.008
.023
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.097
.022
.068
.052
.045
.038
.042
.063
.097
.059
.032
.002
.002
.047
.157
.201
.264
.037
.015
.02
.004
.002
.005
.046
--
--
.0
.002
.001
.021
.025
.002
.001
.0
.027
.023
.0
.0
.001
.003
.02
.01
.009
.002
.034
.0
.29
.996
.0
.001
.008
.454
--
--
.184
.297
.341
.002
.015
.005
.0
.0
.055
.062
--
--
--
--
--
--
--
.003
.003
.1
.001
.663
.001
.007
.004
.0
.0
.001
.009
.0
.0
.0
.009
.001
.01
.0
.0
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
Epm2a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
T
G
A
C
C
C
A
G
C
G
G
G
T
T
G
C
C
C
T
T
T
G
C
-
C
A
C
C
T
C
A
C
C
-
T
T
G
G
C
C
A
C
A
T
C
G
C
C
G
G
T
A
G
-
A
-
G
C
C
C
A
T
T
A
-
-
A
T
-
T
-
C
-
A
-
-
-
G
-
G
C
-
-
-
A
C
G
C
C
-
A
T
T
C
A
A
-
-
-
T
A
-
G
G
G
T
-
A
T
-
T
G
G
G
C
G
A
A
-
G
9
-
G
-
T
G
C
G
C
-
G
C
A
-
A
-
-
A
C
G
G
C
C
-
G
-
A
A
T
C
C
G
C
C
C
4
G
C
G
G
G
G
G
A
G
C
T
A
8
C
3
C
C
T
A
A
C
C
C
-
G
T
T
T
G
C
C
G
-
G
A
A
A
G
G
C
A
G
G
G
A
-
G
C
G
G
T
G
-
G
T
A
-
T
-
T
C
-
-
C
-
G
C
C
T
C
A
C
C
T
G
T
-
A
G
T
2
T
T
G
A
A
T
C
A
A
A
2
C
A
2
C
-
C
A
A
-
T
T
T
G
A
-
-
C
C
C
14
C
T
T
G
-
C
T
G
T
G
C
C
T
T
C
A
-
T
C
G
A
A
G
T
T
T
-
T
G
-
C
T
2
T
C
A
T
C
T
G
C
G
G
2
6
A
A
G
T
C
G
A
T
A
G
T
A
T
G
A
A
T
G
A
T
A
A
T
T
T
G
A
C
C
C
T
C
T
G
2
G
G
T
G
A
C
A
A
T
T
T
2
2
2
2
C
2
2
2
A
T
2
T
G
A
-
A
T
A
A
T
T
C
C
C
C
11
-
A
-
-
C
T
T
T
2
-
2
T
A
2
C
G
T
G
T
-
C
A
-
-
C
-
T
T
T
G
-
G
C
G
G
A
G
C
G
G
-
A
T
-
C
3
G
C
C
-
T
G
G
-
C
C
2
G
A
-
G
-
-
3
C
A
T
-
G
T
-
G
G
-
2
-
-
-
2
-
G
A
-
-
A
C
A
4
3
G
3
4
G
G
G
G
A
C
G
T
A
G
T
A
G
2
C
3
C
2
-
A
A
2
G
A
6
G
G
2
2
G
A
T
T
G
-
T
G
T
T
A
G
-
A
C
G
G
-
T
T
-
-
C
C
T
T
C
G
C
C
C
A
16
A
G
A
A
-
A
A
A
C
C
G
G
-
T
T
G
A
A
-
-
G
-
-
-
T
G
G
C
C
A
C
C
C
C
  5,449,101
  5,449,128
  5,449,275
  5,449,357
  5,450,063
  5,450,354
  5,450,359
  5,450,360
  5,450,790
  5,451,388
  5,451,682
  5,452,028
  5,452,040
  5,452,053
  5,452,418
  5,452,777
  5,452,869
  5,453,064
  5,453,525
  5,454,163
  5,454,421
  5,454,933
  5,454,978
  5,455,612
  5,455,791
  5,456,161
  5,456,453
  5,457,018
  5,457,115
  5,457,240
  5,457,340
  5,457,430
  5,457,770
  5,457,843
  5,457,903
  5,458,147
  5,458,613
  5,458,967
  5,459,009
  5,459,012
  5,459,216
  5,460,157
  5,460,405
  5,460,573
  5,460,610
  5,462,105
  5,462,546
  5,462,846
  5,463,021
  5,463,607
  5,463,698
  5,464,381
  5,464,433
  5,464,629
  5,465,098
  5,465,846
  5,466,087
  5,466,256
  5,466,404
  5,466,512
  5,466,550
  5,467,362
  5,467,692
  5,467,777
  5,467,894
  5,468,247
  5,468,454
  5,468,771
  5,468,877
  5,468,917
  5,469,228
  5,469,242
  5,469,327
  5,469,331
  5,469,434
  5,469,456
  5,469,535
  5,469,569
  5,469,605
  5,469,677
  5,469,702
  5,469,759
  5,469,781
  5,469,829
  5,469,951
  5,469,964
  5,470,121
  5,470,137
  5,470,181
  5,470,187
  5,470,397
  5,471,666
  5,471,772
  5,471,812
  5,472,138
  5,472,228
  5,472,354
  5,472,562
  5,472,569
  5,472,574
  5,472,593
  5,472,658
  5,472,671
  5,472,705
  5,472,709
  5,472,766
  5,472,869
  5,475,479
  5,475,553
  5,475,594
  5,475,694
  5,475,745
  5,475,746
  5,476,011
  5,476,026
  5,476,048
  5,476,061
  5,476,227
  5,476,284
  5,476,348
  5,476,376
  5,476,410
  5,476,444
  5,476,568
  5,476,569
  5,476,588
  5,476,594
  5,477,727
  5,477,779
  5,477,800
  5,477,842
  5,477,883
  5,477,921
  5,477,931
  5,477,964
  5,477,996
  5,478,004
  5,478,022
  5,478,073
  5,478,172
  5,478,186
  5,478,199
  5,478,207
  5,478,213
  5,478,228
  5,478,233
  5,478,244
  5,478,260
  5,478,274
  5,478,730
  5,478,814
  5,479,127
  5,479,244
  5,479,350
  5,479,822
  5,480,251
  5,480,335
  5,480,361
  5,480,387
  5,480,502
  5,480,568
  5,480,669
  5,480,693
  5,480,723
  5,481,087
  5,481,258
  5,481,420
  5,481,831
  5,482,154
  5,482,381
  5,482,867
  5,482,885
  5,482,902
  5,482,911
  5,482,934
  5,482,942
  5,482,963
  5,482,975
  5,483,018
  5,483,043
  5,483,088
  5,483,092
  5,483,163
  5,483,185
  5,483,195
  5,483,219
  5,483,224
  5,483,304
  5,483,369
  5,483,399
  5,483,455
  5,483,512
  5,483,527
  5,483,599
  5,483,600
  5,483,630
  5,483,645
  5,483,708
  5,483,727
  5,483,751
  5,483,769
  5,483,777
  5,483,819
  5,483,837
  5,483,840
  5,483,845
  5,483,861
  5,483,952
  5,483,979
  5,483,980
  5,483,993
  5,484,035
  5,484,081
  5,484,117
  5,484,159
  5,484,175
  5,484,209
  5,484,221
  5,484,279
  5,484,282
  5,484,303
  5,484,305
  5,484,432
  5,484,439
  5,484,445
  5,484,451
  5,484,482
  5,484,498
  5,484,512
  5,484,534
  5,484,541
  5,484,549
  5,484,554
  5,484,597
  5,484,632
  5,484,654
  5,484,655
  5,484,671
  5,484,688
  5,484,703
  5,484,789
  5,484,852
  5,484,959
  5,485,340
  5,485,389
  5,485,859
  5,488,004
  5,488,006
  5,488,008
  5,488,014
  5,488,048
  5,488,054
  5,488,098
  5,488,118
  5,488,227
  5,488,238
  5,488,261
  5,488,263
  5,488,318
  5,488,334
  5,488,343
  5,488,390
  5,488,396
  5,488,404
  5,488,410
  5,488,416
  5,488,935
  5,488,983
  5,489,018
  5,489,801
  5,490,456
  5,490,839
  5,491,556
  5,491,898
  5,493,212
  5,493,668
  5,494,652
  5,494,865
  5,495,449
  5,495,450
  5,495,626
  5,495,688
  5,495,731
  5,495,928
  5,496,554
  5,496,576
  5,496,670
  5,496,760
  5,496,826
  5,496,878
  5,496,980
  5,497,300
  5,497,405
  5,497,530
  5,497,539
  5,497,806
  5,498,086
  5,498,316
  5,498,401
  5,498,442
  5,498,724
  5,498,889
  5,499,200
  5,499,203
  5,499,205
  5,499,289
  5,499,567
  5,499,745
  5,499,794
  5,499,876
  5,499,978
  5,499,987
  5,499,989
  5,500,422
  5,500,428
  5,500,454
  5,500,738
  5,500,788
  5,501,808
  5,502,526
  5,502,556
  5,502,558
  5,502,706
  5,502,780
  5,502,781
  5,502,788
  5,502,793
  5,502,806
  5,502,807
  5,502,810
  5,502,820
  5,502,828
  5,502,835
  5,502,842
  5,502,845
  5,502,849
  5,502,864
  5,502,889
  5,503,145
  5,503,147
  5,506,765
  5,507,647
  5,507,718
  5,508,341
  5,510,355
  5,510,519
  5,510,713
  5,510,830
  5,512,806
  5,512,809
  5,513,726
  5,515,292
  5,515,457
  5,516,524
  5,516,887
  5,517,157
  5,518,980
  5,519,814
  5,519,822
  5,520,114
  5,520,175
  5,520,177
  5,520,183
  5,520,187
  5,520,193
  5,520,199
  5,520,202
  5,520,216
  5,520,252
  5,520,257
  5,520,261
  5,520,270
  5,520,282
  5,520,316
  5,520,461
  5,520,505
  5,520,520
  5,520,607
  5,520,667
  5,520,686
  5,520,703
  5,521,775
  5,521,955
  5,522,083
  5,524,429
  5,524,756
  5,525,591
  5,528,624
  5,528,628
  5,528,636
  5,528,641
  5,528,650
  5,528,660
  5,528,662
  5,528,675
  5,528,724
  5,528,729
  5,528,739
  5,528,751
  5,528,770
  5,528,776
  5,528,783
  5,528,801
  5,528,807
  5,528,814
  5,528,819
  5,528,825
  5,528,834
  5,528,839
  5,528,848
  5,528,852
  5,528,853
  5,528,858
  5,529,623
  5,529,631
  5,529,660
  5,529,666
  5,529,701
  5,529,737
  5,529,743
  5,529,744
  5,529,766
  5,529,813
  5,529,818
  5,529,830
  5,529,869
  5,529,895
  5,530,028
  5,530,046
  5,530,054
  5,530,074
  5,530,081
  5,530,090
  5,530,095
  5,530,109
  5,530,113
  5,530,152
  5,530,171
  5,530,181
  5,530,190
  5,530,195
  5,530,198
  5,530,201
  5,530,244
  5,530,260
  5,530,291
  5,530,314
  5,530,363
  5,530,372
  5,530,396
  5,530,404
  5,530,424
  5,530,446
  5,530,460
  5,530,470
  5,530,484
  5,530,514
  5,530,519
  5,530,529
  5,530,579
  5,530,603
  5,530,625
  5,530,637
  5,530,643
  5,530,657
  5,531,617
  5,531,621
  5,531,669
  5,531,696
  5,531,701
  5,531,714
  5,531,740
  5,531,758
  5,531,762
  5,534,501
  5,534,511
  5,534,523
  5,534,529
  5,534,536
  5,534,862
  5,535,066
  5,537,565
  5,537,939
  5,537,980
  5,539,017
  5,541,071
  5,541,103
  5,541,106
  5,541,108
  5,541,112
  5,541,114
  5,541,116
  5,541,124
  5,541,132
  5,541,135
  5,541,141
  5,541,145
  5,541,151
  5,541,156
  5,541,159
  5,541,168
  5,541,172
  5,541,174
  5,541,177
  5,541,189
  5,541,191
  5,541,198
  5,541,211
  5,541,229
  5,541,230
  5,543,248
  5,543,333
  5,543,347
  5,543,354
  5,543,355
  5,543,405
  5,543,467
  5,543,539
  5,543,572
  5,543,573
  5,543,592
  5,543,599
  5,543,604
  5,543,782
  5,543,789
  5,543,840
  5,543,860
  5,543,863
  5,543,897
  5,543,938
  5,544,432
  5,544,902
  5,547,520
  5,548,942
  5,552,302
  5,555,226
  5,558,171
  5,558,982
  5,559,361
  5,559,455
  5,559,479
  5,561,365
  5,561,732
  5,561,733
  5,561,974
  5,562,681
  5,562,903
  5,563,159
  5,563,844
  5,563,859
  5,563,880
  5,563,908
  5,563,917
  5,564,866
  5,564,956
  5,564,967
  5,565,000
  5,565,037
  5,565,063
  5,565,097
  5,565,168
  5,565,179
  5,565,187
  5,565,192
  5,565,199
  5,565,227
  5,567,324
  5,567,361
  5,568,227
  5,568,396
  5,568,467
  5,570,498
  5,570,819
  5,571,008
  5,571,018
A
G
C
T
G
C/A
C/A
C/A
T
A
T
T
T
A
C
C
A
G
T
T
C
C
C
G/A
T
G
T
G
G
C/A
T/G
C/T
C
G
T
T
G
T/A
G/T
G/A
T
G
G
T
-
C
T
A
G
A
A
T
C
G
C
T
G
C
A
T
A
G
-
C
A
G
4
3
G
A
C
C
G
T
T
C
G
T
T
T
2
-
T
T
T
A
C
G
A
T
G
3
G
A
C
T
C
-
C
A
C
-
T
C
-
A
-
G
C
G
A
A
A
T
A
-
T
-
-
-
T
-
-
A
A
T
C
C
-
-
T
T
-
-
-
A
-
T
A
-
-
-
-
-
-
2
-
T
C
G
A
T
T
A
T
T
T
-
T
T
A
A
T
A
-
T
A
T
-
G
-
-
-
A
-
A
-
-
-
-
-
T
-
-
A
-
-
-
-
A
G
-
-
G
G
-
-
-
G
A
-
-
-
A
-
-
-
-
G
T
C
-
-
-
A
-
A
-
-
2
C
-
A
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
C
G
A
-
-
-
-
A
G
T
C
T
-
-
-
-
-
-
-
-
C
-
T
T
A
-
-
-
-
-
28
98
A
-
G
-
A
A
G
A
5
T
C
A
C
A
T
A
C
A
T
C
6/T
C
T
A
G
C
A
G
G
A
15
C
A
A
T
C
-
A
A
T
C
T
C
A
T
A
A
-
-
C
T
A
C
T
A
T
G
C
T
C
C
C
T
C
G
A
T
C
A
C
C
C
C
T/C
T
C
T
T
T
G
G
C
A
-
A
A
C
A
G
A
G
G
C
C
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
G
6
G
C
G
G
C
C
T
-
T
G
-
2
-
A
A
T
-
-
-
-
C
-
-
-
-
-
-
-
-
-
C
-
-
A
A
A
2
-
-
-
-
A
-
T
C
T
T
-
-
T
-
G
-
-
T
-
-
-
-
-
T
-
-
-
T
T
-
-
-
-
T
-
G
T
-
-
-
-
G
-
-
T
-
-
A
-
T
G
T
-
T
-
-
T
C
C
-
-
-
-
-
-
-
A
T
A
A
G
T
C
C
-
C
C
C
-
-
-
-
-
-
2
-
-
-
A
T
-
A
-
-
-
A
C
C
G
-
-/G
T/-
-
-
C
G
A
A
T
-
-
-
T
-
C
C
2
T
G
G
C
T
T
T
A
T
G
-
G
C
G
T
2
G
-
-
-
-
A
-
G
G
-
-
T
-
A
G
-
A
T
T
-
A
T
G
T
G
G
G
T
T