Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 142,265 (bp)   Positions: 351
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.381
.004
1.0
.147
.004
.104
.002
.0
.108
.285
.229
.004
.003
.0
.004
.001
.005
.006
.011
.003
.005
.0
.012
1.0
.0
.001
.087
.733
.19
.0
.012
.0
.001
1.0
.996
.92
.004
.993
.013
.014
.003
.013
.004
.011
.009
.0
.0
.337
.024
.002
.002
.009
.012
.051
.003
.044
.0
.001
.981
1.0
.0
.004
.891
.063
.0
.0
.003
.002
.0
.0
.01
.0
.149
.018
.017
.006
.0
.173
.861
.027
.102
.003
.0
.008
.001
.001
.01
.0
1.0
.996
.0
.151
.0
.002
.001
.097
.001
.0
.016
.98
.0
.001
1.0
.0
.001
.003
.099
.025
.0
.074
.0
.997
.001
.0
.0
.0
.0
.108
.091
.164
.417
.01
.009
.003
.002
.007
.007
.017
.197
.0
.999
.002
.0
.003
.0
.0
.0
.827
.0
.0
.001
.0
.0
.054
.013
.013
.001
1.0
.05
.143
.0
.0
.0
.001
.0
.003
.002
.0
.008
.002
.001
.0
.001
.003
.0
.0
.0
.002
.0
.0
.048
.003
.024
.0
.0
.001
.0
.091
.017
.002
.115
.988
.001
.0
.001
.0
.002
.25
.0
.221
.799
.0
.017
.0
.002
.001
.001
.0
.001
.171
.021
.02
.001
.008
.046
.003
.021
.969
.006
.0
.992
.002
.012
.0
.0
.002
.001
.001
.0
.001
.0
.004
.0
--
.0
.001
.149
.001
.0
.017
.012
.0
.924
.202
.0
.001
.028
.011
.011
.001
.002
.0
.001
.0
.0
.002
.015
.0
.194
.464
.39
.961
.0
.014
.006
.0
.0
.046
.014
.657
.025
.826
.001
.001
.001
.016
.007
.371
.0
.006
.0
.143
.134
.0
.014
.002
.0
.0
.0
.005
.001
.0
.0
.0
.0
.011
.0
.001
--
--
--
--
--
.001
.003
.006
.277
.257
.218
.111
.057
.001
.001
.0
.874
.488
.449
.281
.199
.102
.112
.0
.002
.0
.0
.0
.085
.006
.049
.001
.0
.0
.066
.002
.003
.0
.084
.004
.484
.0
.007
.008
.0
.0
.439
.159
.084
.227
.204
.999
.002
.017
.02
.0
.002
.263
.855
.003
.868
1.0
.502
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
Epha4
T
-
T
T
G
C
C
-
3
A
A
A
-
T
G
G
-
A
G
T
T
-
C
C
T
A
G
A
T
A
6
A
G
G
G
C
A
G
C
A
G
G
T
A
3
C
T
-
G
C
A
-
-
2
-
-
G
T
A
T
G
-
A
A
C
C
A
-
C
3
-
C
T
C
6
-
T
-
C
G
T
T
2
G
C
G
T
G
G
G
G
A
G
T
12
C
C
C
T
G
A
C
T
G
G
G
A
A
T
C
C
A
G
T
T
T
C
C
C
G
-
G
T
A
G
T
G
-
T
T
T
A
G
T
A
A
T
A
G
T
C
T
T
G
C
A
C
G
A
A
-
2
G
G
G
-
C
A
-
G
C
T
A
T
-
C
-
T
A
G
T
-
A
C
T
T
T
G
G
G
T
C
C
G
3
C
C
A
-
T
T
A
T
C
T
C
C
G
T
T
C
2
T
T
C
A
G
G
C
C
T
T
T
-
T
A
3
G
C
A
C
C
T
C
A
G
G
A
C
T
A
G
G
G
G
C
A
A
A
G
G
G
T
G
G
A
T
G
T
T
C
A
A
T
T
T
A
G
G
A
3
C
T
G
-
2
-
G
C
A
T
A
-
G
C
-
G
A
C
G
T
C
6
G
A
A
A
G
T
G
-
T
T
-
A
C
G
-
-
-
-
-
T
C
-
-
-
-
-
-
-
C
T
T
A
T
G
A
-
C
C
A
-
4
G
G
-
T
C
T
A
T
C
A
C
T
C
C
A
A
T
-
C
A
C
A
-
T
2
C
A
  83,112,440
  83,113,118
  83,113,259
  83,114,125
  83,114,346
  83,115,267
  83,116,758
  83,116,834
  83,118,230
  83,118,305
  83,119,046
  83,120,862
  83,121,038
  83,121,573
  83,122,548
  83,122,902
  83,122,991
  83,123,016
  83,123,066
  83,123,242
  83,123,265
  83,123,363
  83,123,533
  83,124,098
  83,124,380
  83,124,386
  83,124,496
  83,124,557
  83,124,931
  83,125,707
  83,125,887
  83,126,089
  83,126,121
  83,126,663
  83,126,720
  83,127,073
  83,127,145
  83,127,370
  83,127,878
  83,128,182
  83,128,185
  83,128,190
  83,128,201
  83,128,203
  83,128,213
  83,128,221
  83,128,232
  83,128,242
  83,128,250
  83,128,377
  83,128,378
  83,128,383
  83,128,402
  83,128,406
  83,128,416
  83,128,418
  83,129,809
  83,130,079
  83,130,730
  83,131,141
  83,132,175
  83,132,185
  83,132,388
  83,132,434
  83,132,490
  83,132,587
  83,132,658
  83,132,762
  83,132,763
  83,132,765
  83,132,770
  83,132,823
  83,134,605
  83,134,720
  83,134,722
  83,134,812
  83,135,214
  83,136,355
  83,136,872
  83,136,966
  83,137,549
  83,139,820
  83,140,533
  83,140,971
  83,141,256
  83,141,326
  83,141,867
  83,141,906
  83,142,064
  83,142,067
  83,142,197
  83,142,362
  83,142,382
  83,142,638
  83,142,962
  83,143,034
  83,143,385
  83,143,395
  83,143,575
  83,144,214
  83,144,295
  83,144,315
  83,144,610
  83,144,736
  83,144,899
  83,144,953
  83,145,038
  83,145,276
  83,145,759
  83,145,849
  83,146,499
  83,146,880
  83,147,497
  83,147,588
  83,147,682
  83,148,082
  83,148,295
  83,148,401
  83,148,459
  83,148,775
  83,148,885
  83,148,909
  83,148,924
  83,148,950
  83,148,951
  83,149,417
  83,149,418
  83,149,706
  83,150,312
  83,150,715
  83,151,803
  83,151,961
  83,152,362
  83,152,496
  83,152,519
  83,154,469
  83,154,850
  83,157,371
  83,158,825
  83,158,946
  83,159,076
  83,159,160
  83,159,575
  83,159,779
  83,159,844
  83,159,857
  83,160,128
  83,160,417
  83,160,484
  83,160,769
  83,161,106
  83,161,199
  83,161,418
  83,161,471
  83,161,576
  83,161,588
  83,161,672
  83,161,733
  83,161,797
  83,161,811
  83,161,899
  83,162,149
  83,162,700
  83,162,705
  83,162,756
  83,162,909
  83,163,054
  83,163,084
  83,163,675
  83,164,679
  83,164,698
  83,164,729
  83,164,754
  83,164,903
  83,165,001
  83,165,012
  83,165,446
  83,166,993
  83,167,000
  83,167,310
  83,167,340
  83,167,434
  83,167,556
  83,167,727
  83,167,760
  83,167,853
  83,168,359
  83,168,877
  83,169,019
  83,169,207
  83,169,375
  83,169,835
  83,170,107
  83,171,423
  83,172,113
  83,172,636
  83,172,656
  83,172,865
  83,173,561
  83,174,198
  83,174,448
  83,175,513
  83,175,660
  83,175,942
  83,176,004
  83,176,187
  83,176,297
  83,176,817
  83,178,721
  83,179,396
  83,180,112
  83,180,610
  83,180,934
  83,181,136
  83,181,381
  83,181,732
  83,182,098
  83,182,120
  83,183,584
  83,183,587
  83,183,794
  83,183,861
  83,184,388
  83,185,373
  83,186,778
  83,186,810
  83,186,986
  83,187,025
  83,187,104
  83,187,215
  83,187,281
  83,187,331
  83,187,543
  83,187,589
  83,187,687
  83,187,947
  83,188,339
  83,188,340
  83,188,343
  83,188,352
  83,188,396
  83,188,448
  83,188,465
  83,188,475
  83,188,488
  83,188,497
  83,188,520
  83,188,541
  83,188,684
  83,188,690
  83,189,211
  83,189,328
  83,190,153
  83,190,258
  83,190,911
  83,191,619
  83,194,546
  83,194,772
  83,197,062
  83,198,143
  83,199,056
  83,200,266
  83,200,424
  83,200,425
  83,200,436
  83,200,447
  83,200,454
  83,201,432
  83,201,624
  83,202,008
  83,202,011
  83,203,572
  83,203,990
  83,204,262
  83,206,290
  83,208,782
  83,209,076
  83,209,763
  83,210,351
  83,210,859
  83,212,491
  83,212,900
  83,216,004
  83,216,777
  83,216,883
  83,217,185
  83,217,337
  83,217,427
  83,218,230
  83,218,260
  83,218,313
  83,218,324
  83,218,334
  83,218,340
  83,218,344
  83,218,349
  83,218,461
  83,218,471
  83,218,485
  83,218,491
  83,218,493
  83,218,975
  83,218,978
  83,218,980
  83,218,987
  83,218,992
  83,218,994
  83,219,000
  83,219,002
  83,219,005
  83,219,007
  83,219,430
  83,219,948
  83,220,403
  83,220,718
  83,222,345
  83,222,800
  83,223,740
  83,223,756
  83,224,384
  83,224,697
  83,224,840
  83,224,954
  83,225,292
  83,225,756
  83,226,539
  83,227,499
  83,227,921
  83,228,494
  83,228,619
  83,229,251
  83,229,845
  83,230,787
  83,231,597
  83,232,742
  83,232,796
  83,232,910
  83,232,986
  83,232,988
  83,233,143
  83,237,644
  83,238,501
  83,238,503
  83,239,463
  83,239,828
  83,243,284
  83,246,008
  83,246,267
  83,246,871
  83,250,255
  83,252,523
C
C
G
C
A
T
T
-/4
-
G
G
G
T
G
A
A
T
G
C
C
A
C
T
T
C
C
C
T
C
C
-
G
A
A
A
G
C
T
T
-
-
-
-
G
-
-
G
A
-
-
G
3
T
-
23
62
A
A
G
C
A
4
G
G
T
T
T
G
T
-
G/G
T
C
-
-
10
G
T
T
A
A
C
-
A
T
A
C
A
A
A
C
C
A
C
-
G
G
G
-
A
G
T
C
A
A
A
G
T
C
T
A
T
T
G
G
C
T
-
A
A
G
C
C
T
A
C
A
4
A
C
C
G
A
C
T
G
C
T
A
A
T
C
C
A
T
G
T
A
G
G
3
-
-
-
-
A
G
-
T
-
A
C
G
G
C
T
C
G
G
A
C
C
C
A
C
A
C
A
A
A
C
T
T
T
-
T
T
T
14
C
A
C
G
G
C
C/A
C/T
A
A
A
T
-
C
C
T
G
A
A
T
T
G
C
C
3
G
T
-
A
A
G
T
T
C
A
C
A
A
G
T
-
C
A
A
A
A
T
C
T
T
C
A
C
C
A
C
G
C
A
G
C
T
C
C
C
-
C
G
A
A
C
3/-
G
G
T
G
-
C
A
T
G
G
-
T
A
A
T
-
G
T
C
C
T
-
A
G
T
G
A
C
-
C
A
-
C
-
-
T/C
C
A
A
C
2
-
T
63
2
47
23
41
C
7
T
G
C
G
C
A
G
4
A
T
T
4
-
A
A
3
C
A
C
-
C
T
T
T
C
T
T
G
C
A
A
A
G
T
T
3
C
-
A
C