Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 361,785 (bp)   Positions: 642
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.015
.549
.0
.267
.0
.983
.0
.0
.001
.0
.001
.002
.023
.004
.004
.216
.005
.003
.0
.002
.001
.004
.0
.005
.001
.014
1.0
.863
.008
.991
1.0
.0
.012
.467
--
--
.048
--
.004
.003
.06
.003
.003
.001
.001
.0
.008
.0
.0
.0
.409
.0
.001
.001
.0
.0
.001
.047
.0
.0
.089
.0
.188
.003
.0
.0
.0
.988
.999
.116
.007
.006
.002
.44
.002
.002
.08
.001
.001
.045
.001
.0
.001
.0
.005
.004
.987
.993
.049
.005
.006
.002
.012
.001
.072
.001
.043
.552
.002
.001
.0
.0
.0
.002
.004
.001
.005
.969
.009
.529
.046
.003
.092
.003
.002
.002
.011
.0
.131
.0
.051
.011
.004
.0
.056
.0
.142
.168
.013
.011
.001
.0
.742
.0
.013
1.0
.999
.956
.985
.462
.0
.0
.0
.0
.026
.538
1.0
.049
.025
.03
.014
.003
.016
.031
.008
.06
.267
.006
.015
.0
.012
.0
--
.018
.0
.002
.0
.0
.066
.0
.0
.009
.107
.001
.0
.0
.021
.0
.0
.573
.994
.513
.001
.0
.181
.1
.034
.036
.004
.0
.005
.001
.002
.055
.717
.008
.012
.0
.269
--
.01
.023
.021
.001
.004
.0
.0
.0
.0
.0
.005
.0
.001
.005
.0
.0
.009
.035
.134
.483
.014
--
--
--
--
--
--
--
.001
.001
.002
.061
.087
.066
.0
.001
.964
.029
.1
.08
.0
.001
.649
.0
.001
.009
--
.001
.001
.037
.005
.013
.0
.016
.03
.016
.014
.014
.015
.039
.001
.014
.029
.008
.035
.155
.001
--
--
--
.003
.001
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.021
.003
.001
.0
.0
.011
.107
.08
.057
.024
.004
.344
.001
.0
.014
.023
--
.004
.005
.004
.0
.0
.0
.001
.001
.001
.001
.0
.01
.097
.077
.01
.03
.236
.011
.005
.788
.002
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.015
--
--
--
--
.056
.0
.847
.0
.001
.419
.002
.0
.001
--
--
.029
.0
.0
.013
.002
.11
--
--
--
.0
.001
.001
.004
.025
.049
.056
--
.001
.127
.0
.0
.0
.001
.005
.002
.0
.089
.0
.009
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.0
.0
.142
.001
.91
.0
.0
.001
.001
--
--
.005
.068
.012
.002
.003
--
--
--
--
--
--
.007
.011
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.003
.017
.062
.942
.012
.0
.014
.004
.228
.04
.043
.003
.001
.0
.084
.001
.0
.011
.0
.691
.0
.376
.376
.002
.026
.762
.0
.066
.003
.0
.0
.001
.049
.003
.019
.003
.002
.0
.035
.0
.072
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.188
.439
.897
.0
.199
.02
.07
.141
.047
.003
.064
.999
.004
.003
.0
.224
.296
.017
.003
.012
.027
.0
.0
.191
.001
.006
.0
.652
.006
.008
.122
.103
--
--
--
--
--
.001
1.0
.005
.001
.002
.0
.028
.0
.039
.001
.31
.018
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.002
.533
.001
.003
.002
.999
.04
.0
.001
.001
.008
.024
--
--
--
.001
.005
.001
.001
.015
.0
1.0
.924
.005
.005
.047
.04
.003
.09
.012
.004
.005
.248
.014
.0
.0
.017
--
--
--
.111
.111
.007
.001
.0
.013
.996
.0
.003
.207
.056
.001
.003
.002
.0
.0
.024
.025
.001
.0
.009
.001
.004
.001
.006
.0
.001
.018
.041
.407
.235
.0
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
Epha3
C
T
A
T
A
T
A
G
C
C
T
C
G
A
A
G
6
-
C
A
C
G
T
C
C
A
T
T
-
-
C
G
T
4
-
C
T
C
T
T
T
-
-
T
T
C
T
G
A
A
A
T
T
C
-
C
T
-
A
A
T
T
A
G
G
G
G
C
C
C
A
A
A
3
C
T
C
G
A
T
C
A
T
C
G
C
G
C
C
-
-
-
C
-
A
A
G
2
A
C
C
T
G
C
C
A
-
A
-
A
C
T
A
A
4
A
T
C
A
T
T
G
-
T
G
-
2
C
C
4
A
A
T
-
A
G
A
T
C
G
3
G
C
C
G
G
A
A
A
T
A
A
C
A
C
G
C
T
G
C
G
C
-
A
T
A
G
T
C
T
C
G
T
A
G
C
-
C
T
G
T
A
-
C
T
G
A
G
A
A
G
-
T
G
C
T
C
A
T
A
A
-
-
-
G
T
A
T
G
2
T
A
-
T
T
T
T
G
C
T
T
T
-
T
C
-
A
A
G
T
G
-
G
T
G
T
-
-
C
T
A
C
A
C
A
G
A
-
C
-
C
A
G
T
G
G
T
-
-
C
A
T
A
C
T
A
T
C
G
C
A
C
C
T
T
-
G
G
T
G
G
G
-
G
A
3
A
-
10
A
A
T
C
A
4
-
-
-
10
A
C
A
A
A
G
A
G
C
C
-
C
A
T
T
C
C
G
C
-
A
T
-
G
C
T
A
A
C
A
T
A
C
C
C
A
C
G
C
-
G
A
A
A
T
T
G
A
-
T
A
A
C
-
G
G
A
G
T
T
-
-
A
T
C
A
2
C
A
-
A
G
A
G
G
T
T
T
T
G
G
C
5
A
A
T
A
C
C
T
C
A
C
A
A
A
-
C
G
A
A
G
G
T
A
A
T
T
C
T
G
G
A
A
T
G
T
C
A
3
7
C
-
-
G
A
C
C
C
C
C
G
T
C
G
C
G
G
C
A
C
C
C
A
C
A
G
C
T
C
A
C
C
A
T
C
G
A
A
G
T
G
A
G
A
T
T
-
T
T
2
T
G
12
G
C
T
A
G
A
A
-
C
A
C
T
G
T
A
A
G
-
T
A
A
C
T
A
A
C
-
T
G
T
C
T
T
C
C
A
T
-
10
G
G
T
T
2
2
-
2
C
C
A
A
A
T
T
C
34
A
A
G
C
A
T
T
-
A
A
3
G
T
2
10
A
G
G
A
-
C
G
C
C
T
C
T
T
T
C
C
G
T
A
T
T
T
C
G
T
4
A
A
T
-
C
A
G
A
C
C
A
T
T
C
G
A
A
T
A
T
T
C
2
C
C
T
-
T
A
C
G
A
T
-
-
T
A
T
G
18
-
A
T
C
A
C
6
A
C
T
T
G
T
T
-
G
T
G
T
C
A
A
G
T
G
C
-
C
G
A
A
G
  421,538
  421,874
  421,966
  422,084
  422,524
  423,577
  424,063
  424,327
  424,427
  424,699
  425,174
  425,278
  427,118
  428,000
  428,664
  428,769
  428,804
  429,045
  429,692
  430,865
  431,435
  431,884
  432,410
  432,693
  432,785
  432,794
  433,545
  433,854
  433,895
  433,942
  434,196
  434,521
  434,952
  435,231
  435,340
  435,794
  436,924
  437,432
  438,749
  438,766
  438,816
  438,834
  438,835
  439,168
  439,386
  439,895
  440,358
  440,972
  441,156
  441,391
  441,617
  442,477
  442,630
  442,995
  443,227
  443,235
  443,395
  443,785
  443,801
  444,269
  444,701
  444,744
  444,812
  444,963
  445,033
  445,404
  445,590
  446,027
  446,265
  447,014
  447,107
  447,376
  447,393
  447,786
  448,019
  448,418
  448,715
  449,309
  449,378
  449,866
  450,212
  450,293
  450,303
  450,469
  450,621
  450,751
  451,190
  451,237
  453,548
  453,671
  453,872
  454,403
  454,729
  454,953
  455,017
  455,972
  456,314
  456,717
  457,486
  457,828
  457,834
  458,326
  458,450
  459,767
  460,307
  460,373
  460,382
  460,967
  461,002
  463,514
  464,167
  464,312
  464,674
  464,711
  464,896
  465,692
  465,929
  466,747
  467,385
  467,869
  467,904
  467,907
  468,020
  468,048
  468,905
  470,591
  470,690
  470,715
  470,908
  471,396
  471,978
  472,058
  472,328
  473,041
  473,351
  474,777
  474,895
  475,050
  475,052
  475,367
  475,414
  475,681
  475,691
  475,763
  476,121
  476,420
  476,836
  477,299
  477,397
  477,403
  477,640
  477,742
  477,950
  479,326
  479,365
  479,605
  479,775
  480,345
  480,510
  481,349
  481,608
  481,710
  481,914
  482,672
  482,962
  483,351
  483,482
  484,605
  485,800
  485,858
  485,987
  485,996
  486,426
  486,994
  487,253
  487,567
  488,084
  488,327
  488,360
  488,911
  488,970
  489,181
  489,662
  489,770
  490,069
  490,299
  490,424
  490,645
  490,927
  491,365
  491,366
  491,421
  491,460
  491,622
  491,942
  492,247
  492,261
  493,644
  494,011
  494,172
  494,894
  495,653
  495,654
  495,656
  495,658
  495,695
  495,754
  495,861
  495,967
  496,781
  497,014
  497,134
  497,401
  497,952
  498,275
  498,548
  499,348
  499,631
  499,888
  500,016
  500,020
  500,354
  500,362
  500,472
  500,473
  500,656
  500,845
  501,176
  502,196
  502,319
  502,419
  502,761
  502,831
  503,006
  503,388
  503,599
  503,910
  503,964
  503,972
  504,729
  505,085
  505,151
  505,492
  505,733
  505,743
  505,837
  506,184
  506,593
  506,850
  508,652
  508,716
  508,905
  508,954
  509,665
  509,735
  509,780
  509,781
  509,894
  509,895
  509,947
  510,156
  510,628
  510,664
  511,505
  511,747
  513,102
  513,474
  513,898
  515,051
  515,193
  515,380
  515,386
  515,776
  516,937
  517,143
  517,204
  517,235
  517,239
  517,240
  517,243
  517,246
  517,247
  517,288
  517,414
  517,415
  517,523
  517,832
  517,844
  517,874
  518,935
  519,077
  519,592
  519,616
  521,558
  522,310
  522,482
  522,484
  522,601
  522,673
  522,799
  523,486
  523,510
  523,986
  523,988
  524,750
  524,964
  525,104
  525,711
  525,751
  525,932
  526,086
  526,524
  526,529
  527,645
  527,924
  528,177
  528,590
  528,766
  528,794
  528,913
  528,967
  529,241
  529,411
  529,455
  530,776
  533,878
  535,158
  537,806
  539,566
  539,569
  540,653
  541,339
  548,458
  549,489
  551,242
  551,407
  551,682
  552,912
  555,452
  555,456
  555,460
  555,468
  556,314
  557,377
  559,281
  561,957
  564,191
  568,848
  571,242
  571,504
  571,507
  572,345
  576,341
  579,001
  580,777
  582,606
  582,674
  583,266
  584,118
  585,741
  585,992
  586,007
  586,966
  587,196
  587,876
  589,977
  592,182
  592,547
  592,549
  593,201
  598,141
  599,202
  599,555
  600,411
  600,437
  600,868
  602,018
  602,187
  602,415
  602,697
  603,165
  603,253
  603,391
  603,834
  605,107
  605,123
  605,189
  605,707
  605,959
  606,284
  606,362
  606,387
  606,394
  606,399
  606,400
  606,607
  606,680
  606,681
  606,976
  607,317
  607,567
  608,171
  608,173
  608,966
  609,453
  609,681
  609,714
  610,948
  611,292
  611,340
  612,457
  613,106
  613,942
  615,877
  616,383
  616,972
  617,469
  617,570
  618,237
  618,241
  619,253
  619,750
  620,123
  620,209
  620,392
  621,137
  621,646
  622,360
  622,773
  622,857
  623,336
  623,818
  624,703
  624,745
  625,154
  625,698
  625,944
  626,084
  626,124
  626,345
  626,604
  626,800
  626,847
  627,966
  627,978
  627,984
  628,330
  628,797
  628,842
  628,850
  628,990
  629,573
  630,234
  630,343
  630,475
  630,544
  630,642
  631,027
  631,530
  631,548
  631,602
  631,663
  631,925
  632,792
  633,581
  633,934
  634,618
  634,787
  635,518
  636,086
  636,420
  636,893
  637,516
  638,506
  639,083
  639,261
  641,035
  641,981
  642,586
  642,683
  643,068
  643,457
  643,494
  659,999
  660,257
  660,502
  660,860
  661,705
  662,651
  662,691
  662,699
  663,946
  663,954
  665,491
  667,140
  667,447
  668,424
  668,438
  668,542
  668,550
  668,623
  668,795
  668,847
  668,870
  669,076
  669,078
  669,293
  669,356
  669,367
  669,389
  669,401
  669,890
  669,959
  670,094
  670,394
  670,430
  670,744
  670,898
  671,228
  671,234
  671,788
  671,805
  672,288
  673,190
  673,367
  673,869
  674,010
  674,725
  674,736
  674,795
  675,439
  675,978
  676,199
  676,447
  676,448
  677,115
  677,122
  677,690
  678,556
  679,337
  679,462
  679,554
  679,639
  679,654
  679,905
  680,316
  680,941
  681,105
  682,032
  683,508
  683,757
  683,916
  684,214
  684,441
  684,763
  684,990
  686,310
  686,454
  686,875
  686,952
  687,206
  687,489
  687,578
  687,647
  687,656
  687,665
  687,707
  687,821
  688,082
  688,257
  688,584
  688,589
  689,025
  689,717
  689,878
  689,909
  690,065
  690,148
  690,170
  690,299
  709,537
  709,538
  709,834
  710,653
  712,485
  712,491
  715,746
  716,458
  719,685
  720,889
  721,126
  721,891
  723,731
  726,340
  726,342
  730,142
  730,145
  732,295
  737,694
  737,728
  743,592
  746,399
  748,895
  750,505
  753,312
  757,148
  757,219
  757,636
  758,949
  758,952
  759,143
  760,089
  762,028
  762,295
  763,356
  764,134
  766,193
  767,049
  767,174
  767,263
  767,591
  767,615
  767,708
  769,780
  770,446
  771,486
  773,174
  773,411
  773,967
  774,773
  774,802
  775,934
  776,058
  776,244
  776,248
  778,558
  780,994
  781,559
  781,572
  782,318
  782,425
  782,798
T
A
C
C
G
C
G
A
G
A
A
A
A
T
C
G/-
-
T
A
C
G
A
A
A
T
T
G
G
2
A
-
T
A
-
A
T
G
T
C
A
-
T
T
A
C
A
G
C
G
G
G
C
G
T
2
T
A
A
T
G
C
C
C
A
A
A
A
T
T
T
G
G
G
-
G
G
T
A
T
A
T
C
G
T
T
-
A
-
T
2
T
C
T
T
C
G
T
-
G
G
-
C
A
T
T
C
T
-
A
C
T
C
G
C
-
G
G
T
T
C
A
T
4
C
A
G
2/-
C/A
T
-
G
G
C
A
T
A
-
G
T
T
-
C
A
T
C
A
T
G
T
C
-
G
T
T
T
A
-
A
-
G
A
A
T
G
C
T
A
A
T
C
T
C
C
G
A
T
A
T
C
A
C
T
51
T
C
A
G
C
C
G
A
A
G
T
T
A
G
C
C
G
G
G
2
C
C/5
A
G
C
C
-
C
C
A
G
-
C
C
C
T
-
C
C
T
A
A
3
G
T
T
C
A
A
T
C
A
G
T
2
T
C
T
T
G
T
G
T
T
3
T
4
A
G
T
C
A
C
G
4
4
T
G
C
G
T
C
-
C
T
A
T
G
T
T
C
C
3
T
A
A
A
C
T
5
T
G
-
T
2
-
G
-
A
A
-
-
-/20
-/18
2
-
G
A
G
G
-
A
T
A
T
T
A
A
G
C
A
A
T
A
G
2
G
G
A
A
G
C
G
G
T
T
C
-
A
G
T
T
T
C
T
-/8
G/C
A/C
A/C
G
C
T/G
-
G
3
C
G
C
A
G
C
A
G
C
C
-
12
3
C
C
A
G
-
A
T
A
T
A
-
T
A
C
C
C
C
T
T
T
-
G
G
A
G
A
A
C
A
G
A
C
T
G
A
C/T
A
C
G
A
C
A
G
T
A
C
T
C
A
A
T
T
A
A
C
T
G
-
-
G
2
T
A
C
G
T
T
-
-
A
C
T
C
A
C
A
A
C
C/A
A
C/A
A/G
T
T
A
T
T/C
A
G
C/T
C/T
A/T
T/C
C/T
G/A
A/T
-
A
G
T
G
-
G
A
C
4
G
C
-
C
A
-
T
A
A
G
A
T
G
G
T
G
T
G
T
C
G
G
C
A
G
T
G
T
C
-
-
T
T
C
C
C
T
A
A
C/A
C/A
A/C
A
52
-
C
T
C
C
-
-
2
-
T
T
C
G
G
-
C
T
-
G
G
C
T
T
C
A
A
G
G
-
A
C
-
-
G
A
T
G
A
T
A
T
A
C
A
C
A
G
T
T
A
C
G
C
A
C
T
C
C
-
-
C
C
A
-
-
-
-
G
-
C
A
C
G
A
G
G
A
G
G
G
T
-
G
G
C
4
A
G
G
C
-
-
T
9
C
G
C
A
-
4
T
C
G
G
A
-
T
T
C
-
A
A
A
A
C
G
A
-
G
G
T
A
C
T
T
T
G
A
G
G
T