Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 275,877 (bp)   Positions: 481
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.943
1.0
.975
.993
.296
.002
.008
.98
.006
.0
.123
.0
.005
.015
.0
.628
.0
.002
--
.0
.04
.001
.247
.005
.066
.058
.007
.008
.039
.004
.0
.998
.999
.047
.12
.201
.18
.0
.025
.003
.0
.0
.386
.834
.054
.0
.001
.0
.001
.02
.009
.007
.291
.644
.0
.12
.002
1.0
.002
.002
.782
.352
.008
.807
.001
.0
.136
.0
.002
.005
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.001
1.0
.999
.008
.001
.001
.022
.002
.278
.105
.0
.0
.037
.001
.003
.0
.0
.054
.965
1.0
.023
.313
.003
.0
.0
.188
.0
.0
.02
.002
.002
.016
.0
.0
.185
.002
.051
.0
.424
.005
.0
.121
.073
.006
.006
.005
.001
.005
.002
.003
.0
.001
.0
.028
.001
.001
.0
.017
.017
.001
.002
.0
.0
.149
.0
.0
.008
.067
.002
.257
.991
.061
.008
.001
.001
.0
.001
.036
.001
.003
.145
.001
.013
.0
.004
.021
.002
.005
.028
.003
.013
.019
.0
.0
.0
.835
.001
.062
.015
.006
1.0
1.0
.036
.925
.008
.0
.514
.006
.995
.0
.003
.003
.0
.006
.0
.005
.118
.002
.003
.006
.006
.001
.0
.005
.0
1.0
.963
.002
.0
.001
.077
.015
.002
.017
.008
.013
.019
.032
.143
.001
.05
.027
.0
.005
.002
.002
.003
.0
.001
.006
.0
.075
.016
.001
.018
.0
.004
.0
.029
.0
.0
.003
.0
.0
.002
.0
.091
.004
.999
.002
1.0
.599
.001
.099
.0
.055
.0
.012
.0
.0
.0
.0
.0
.002
.001
.001
.0
.003
.001
.0
.066
.048
.803
.0
.061
1.0
.008
.0
.0
1.0
.02
.13
.002
.993
.995
.002
.001
.0
.247
.619
.403
.204
.002
.038
.001
.006
.02
.002
.172
.933
.998
.001
.001
.001
.001
.004
.035
.007
.001
.34
.442
.716
.331
.726
.105
.004
.041
.004
.0
.0
.008
.021
.006
.0
.0
.0
.0
.0
.02
.007
.997
.523
1.0
.0
.001
.0
.001
.0
.0
1.0
.027
--
.001
.995
.991
.997
.002
.05
.216
.006
.996
.598
.004
.0
.004
.032
.034
.241
.0
.003
.004
.039
.887
.0
.0
.032
.0
.049
.475
.005
.007
.984
.301
.083
.005
.012
.007
.0
.0
.008
.93
.0
.0
.026
.007
.003
.0
.117
.001
1.0
.001
.932
.002
.008
.868
.191
.316
.0
.008
.002
.018
.0
.001
.0
.001
.002
.001
.001
.001
.004
.0
.0
.081
.827
.0
1.0
.001
.001
.002
.99
.0
.003
.001
.815
.0
.0
.0
.004
.0
.0
.0
.003
.001
.002
.005
.398
.721
.717
.349
.071
.002
.002
.001
.0
.0
.0
.006
.013
.001
.004
.001
.0
.001
.001
.949
.022
.06
.045
.001
.017
.967
.088
.859
.005
.001
.01
.003
.0
.002
.006
.006
.915
.452
.109
.015
.0
.992
.009
.001
.005
.001
.005
1.0
.998
.847
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
Efna5
A
C
T
T
G
A
A
T
G
C
G
A
G
G
T
C
A
T
C
T
C
C
G
C
T
T
T
G
G
T
G
G
G
G
C
A
T
T
A
G
T
C
A
T
G
A
C
T
G
T
C
G
C
T
C
C
A
G
A
T
A
T
A
C
C
C
T
A
C
A
G
T
C
T
C
A
T
G
C
G
A
C
G
G
T
T
G
T
A
A
G
C
C
A
T
T
T
T
G
T
A
A
G
C
T
G
G
C
T
T
A
G
A
A
T
T
C
T
C
C
T
A
A
C
C
G
G
T
A
T
C
G
A
G
T
A
T
G
C
T
A
A
G
A
A
G
G
G
C
T
C
G
A
T
C
T
C
C
C
C
C
T
G
G
A
C
T
T
C
C
A
G
G
G
G
T
A
A
A
A
C
A
G
A
T
T
G
A
G
T
G
A
T
C
T
A
C
G
C
A
C
T
G
G
C
T
C
T
T
A
A
A
G
T
A
C
G
T
A
C
T
A
G
T
C
T
C
A
G
A
G
T
T
A
C
T
T
A
A
C
T
C
T
G
C
A
G
G
G
T
T
A
T
A
C
C
G
G
C
A
G
G
C
A
T
T
A
C
A
T
A
A
G
G
T
G
C
A
G
A
T
G
T
G
A
A
A
G
T
T
G
T
C
G
C
T
A
T
T
C
C
A
A
A
T
A
G
T
C
G
A
T
G
G
T
A
G
T
G
A
G
G
C
C
C
G
A
G
A
A
T
G
G
C
T
C
T
T
G
G
T
C
C
A
G
C
G
A
C
C
G
T
C
G
G
G
G
C
G
T
A
A
A
A
C
A
G
A
T
T
T
G
C
T
C
C
A
G
A
T
T
T
C
G
A
T
C
C
T
A
T
A
G
A
C
G
A
G
C
A
A
A
T
C
G
A
G
G
T
A
A
A
A
C
C
C
T
G
C
G
G
T
A
G
A
C
T
A
G
C
T
T
C
C
A
A
T
G
T
A
C
A
G
C
T
G
G
G
T
T
G
A
C
T
G
C
A
G
A
C
G
C
G
C
C
C
T
C
C
C
A
G
T
A
C
T
T
A
A
G
C
  110,054,996
  110,055,845
  110,056,320
  110,057,774
  110,057,912
  110,061,124
  110,062,324
  110,063,174
  110,063,955
  110,063,961
  110,064,086
  110,064,981
  110,067,612
  110,072,248
  110,076,906
  110,077,416
  110,078,648
  110,078,828
  110,079,390
  110,080,603
  110,080,952
  110,081,058
  110,081,308
  110,081,671
  110,082,419
  110,082,604
  110,082,616
  110,082,818
  110,082,824
  110,082,946
  110,083,075
  110,083,489
  110,083,493
  110,083,913
  110,083,921
  110,084,010
  110,084,011
  110,085,008
  110,085,460
  110,085,998
  110,086,446
  110,087,302
  110,087,352
  110,088,034
  110,088,278
  110,088,426
  110,088,527
  110,088,547
  110,088,648
  110,089,670
  110,090,413
  110,090,642
  110,090,828
  110,090,911
  110,091,399
  110,091,478
  110,091,780
  110,092,460
  110,092,866
  110,092,924
  110,094,007
  110,098,062
  110,098,075
  110,099,288
  110,102,816
  110,103,008
  110,103,501
  110,104,190
  110,104,219
  110,105,330
  110,106,397
  110,106,411
  110,108,983
  110,109,402
  110,109,540
  110,109,700
  110,110,131
  110,110,301
  110,110,388
  110,111,824
  110,113,701
  110,120,172
  110,120,375
  110,120,973
  110,122,123
  110,127,699
  110,127,934
  110,128,236
  110,128,928
  110,128,988
  110,129,109
  110,129,737
  110,129,857
  110,129,933
  110,130,790
  110,130,979
  110,131,350
  110,131,442
  110,131,560
  110,131,661
  110,131,665
  110,131,820
  110,132,887
  110,133,342
  110,133,963
  110,134,008
  110,134,068
  110,134,364
  110,135,436
  110,135,739
  110,136,430
  110,136,441
  110,136,455
  110,136,529
  110,136,556
  110,136,575
  110,136,715
  110,136,830
  110,137,192
  110,137,213
  110,137,214
  110,137,507
  110,137,869
  110,137,987
  110,138,147
  110,138,545
  110,138,821
  110,139,110
  110,139,155
  110,141,250
  110,141,833
  110,143,003
  110,143,208
  110,147,056
  110,147,715
  110,148,069
  110,148,175
  110,148,319
  110,148,332
  110,148,788
  110,149,783
  110,149,938
  110,149,962
  110,150,458
  110,150,588
  110,151,318
  110,151,789
  110,152,032
  110,152,101
  110,152,797
  110,153,460
  110,153,954
  110,153,973
  110,154,245
  110,154,468
  110,155,172
  110,155,456
  110,157,968
  110,159,924
  110,160,561
  110,161,351
  110,161,367
  110,161,396
  110,161,399
  110,161,903
  110,163,596
  110,166,103
  110,166,240
  110,166,617
  110,167,003
  110,167,156
  110,167,296
  110,169,368
  110,170,827
  110,170,945
  110,171,245
  110,171,609
  110,171,900
  110,172,024
  110,172,327
  110,172,397
  110,173,713
  110,174,504
  110,174,534
  110,174,986
  110,175,403
  110,176,294
  110,176,593
  110,176,966
  110,178,176
  110,180,860
  110,181,028
  110,181,184
  110,185,949
  110,189,503
  110,189,860
  110,191,276
  110,191,769
  110,193,884
  110,194,992
  110,196,548
  110,197,630
  110,199,334
  110,200,609
  110,202,588
  110,202,762
  110,202,865
  110,203,050
  110,203,092
  110,203,173
  110,203,200
  110,203,202
  110,203,203
  110,203,227
  110,203,264
  110,203,335
  110,203,458
  110,203,517
  110,204,910
  110,204,949
  110,205,324
  110,205,428
  110,205,547
  110,205,609
  110,205,648
  110,206,260
  110,206,373
  110,206,760
  110,207,078
  110,207,461
  110,207,536
  110,207,932
  110,208,072
  110,208,123
  110,208,212
  110,208,970
  110,209,471
  110,209,798
  110,210,128
  110,210,137
  110,210,606
  110,210,874
  110,210,974
  110,212,154
  110,212,415
  110,212,470
  110,212,910
  110,214,794
  110,215,341
  110,220,530
  110,222,372
  110,223,755
  110,224,377
  110,225,765
  110,225,878
  110,226,149
  110,226,157
  110,226,191
  110,226,200
  110,226,376
  110,226,467
  110,226,536
  110,226,551
  110,226,761
  110,226,842
  110,226,879
  110,226,991
  110,227,005
  110,227,957
  110,228,365
  110,229,577
  110,232,344
  110,233,166
  110,233,992
  110,235,009
  110,235,234
  110,235,598
  110,236,111
  110,237,590
  110,238,506
  110,239,717
  110,240,414
  110,241,443
  110,242,141
  110,243,012
  110,243,284
  110,243,412
  110,243,494
  110,244,106
  110,244,307
  110,245,784
  110,246,121
  110,250,088
  110,254,233
  110,254,965
  110,255,792
  110,255,944
  110,257,243
  110,257,973
  110,259,695
  110,259,777
  110,260,183
  110,260,254
  110,260,309
  110,260,367
  110,260,405
  110,260,407
  110,260,420
  110,260,444
  110,260,925
  110,261,268
  110,261,787
  110,264,170
  110,264,943
  110,265,787
  110,266,617
  110,268,017
  110,268,680
  110,268,956
  110,269,912
  110,270,448
  110,270,453
  110,270,456
  110,270,653
  110,271,135
  110,271,337
  110,271,740
  110,271,797
  110,271,956
  110,272,190
  110,272,193
  110,272,255
  110,272,312
  110,272,408
  110,272,454
  110,272,843
  110,274,120
  110,274,401
  110,274,912
  110,275,214
  110,275,215
  110,276,227
  110,276,521
  110,276,826
  110,277,315
  110,277,328
  110,277,630
  110,277,982
  110,278,146
  110,278,249
  110,278,406
  110,278,414
  110,278,415
  110,278,475
  110,278,515
  110,278,521
  110,278,558
  110,278,604
  110,278,817
  110,279,783
  110,279,892
  110,279,988
  110,280,001
  110,280,018
  110,280,585
  110,280,707
  110,281,079
  110,281,604
  110,281,611
  110,281,612
  110,281,613
  110,281,632
  110,281,633
  110,281,673
  110,281,674
  110,281,723
  110,281,899
  110,282,520
  110,283,074
  110,283,599
  110,283,783
  110,284,091
  110,284,798
  110,284,816
  110,284,910
  110,285,243
  110,286,233
  110,286,264
  110,286,346
  110,287,116
  110,287,565
  110,288,194
  110,289,546
  110,291,351
  110,291,445
  110,291,906
  110,292,072
  110,292,670
  110,292,726
  110,293,415
  110,293,580
  110,293,744
  110,294,744
  110,297,252
  110,297,633
  110,297,922
  110,298,679
  110,298,867
  110,299,238
  110,299,350
  110,299,779
  110,300,064
  110,300,571
  110,300,884
  110,301,552
  110,302,180
  110,302,328
  110,302,829
  110,302,903
  110,303,862
  110,303,927
  110,304,172
  110,304,239
  110,304,317
  110,304,352
  110,304,550
  110,304,551
  110,304,582
  110,304,706
  110,304,891
  110,304,919
  110,305,044
  110,305,116
  110,305,462
  110,305,699
  110,305,897
  110,305,944
  110,305,945
  110,306,405
  110,306,518
  110,307,196
  110,307,820
  110,308,155
  110,308,174
  110,308,352
  110,309,439
  110,309,457
  110,309,573
  110,309,851
  110,310,132
  110,310,256
  110,312,404
  110,312,579
  110,313,313
  110,313,401
  110,313,858
  110,314,282
  110,314,429
  110,315,027
  110,316,940
  110,316,982
  110,317,269
  110,317,480
  110,318,009
  110,318,474
  110,318,639
  110,318,888
  110,319,151
  110,319,327
  110,320,642
  110,320,932
  110,321,888
  110,322,994
  110,323,441
  110,324,556
  110,325,314
  110,326,119
  110,326,973
  110,327,511
  110,327,740
  110,327,916
G
T
C
A
A
G
T
C
A
A
A
C
A
A
C
T
G
C
T
C
G
T
T
T
G
A
C
T
A
C
A
T
A
A
T
T
A
C
C
A
C
T
G
A
A
C
T
C
A
C
G
A
G
A
T
T
G
T
T
C
G
C
G
A
T
T
G
G
T
G
A
C
T
G
T
G
C
A
T
A
G
G
C
A
C
C
A
C
C
C
T
T
T
C
A
A
A
C
A
C
C
G
C
G
G
A
A
T
C
A
G
A
G
G
C
C
T
C
T
T
A
G
G
T
T
T
A
C
G
C
T
C
G
A
C
G
A
T
G
C
G
G
A
G
G
T
A
A
T
C
T
A
C
C
T
C
T
G
G
T
T
G
A
T
G
T
C
C
T
T
G
A
A
A
A
A
G
G
G
C
T
G
C
T
C
C
A
G
A
G
A
G
G
T
C
G
A
A
T
G
T
A
A
A
A
C
T
A
C
G
G
G
C
A
G
A
A
C
G
A
C
C
C
C
T
G
A
G
A
T
T
C
C
G
A
C
C
G
G
A
C
A
C
C
T
C
A
A
T
C
C
G
C
G
T
T
A
A
T
C
A
T
T
G
C
G
G
T
C
C
G
G
A
A
G
A
T
G
A
G
C
A
C
A
G
G
T
A
C
C
C
C
A
A
T
C
G
G
C
T
T
C
C
G
C
C
A
C
G
C
T
C
A
T
G
G
A
C
C
G
T
A
T
A
T
A
G
A
G
G
C
A
A
T
C
T
A
G
A
A
C
A
T
T
A
T
T
G
G
A
A
C
A
C
A
T
A
T
A
C
G
T
G
G
A
G
A
G
C
C
C
T
G
C
T
A
C
A
C
C
C
C
T
T
G
C
T
T
C
G
A
G
A
G
T
A
G
C
T
G
T
G
A
T
A
G
A
C
C
G
T
T
G
T
T
T
C
A
T
C
C
C
T
A
G
T
G
G
C
T
G
A
T
T
G
G
C
A
A
G
T
G
A
T
G
A
T
A
C
C
C
C
T
C
A
T
G
C
G
T
A
T
A
A
T
T
C
T
A
T
T
T
A
G
T
A
C
G
G
A
A