Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 367,559 (bp)   Positions: 518
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.011
.031
.001
.197
.002
.0
.001
.002
.008
.165
.004
.007
.05
.002
.002
.011
.004
.119
.024
.012
.009
.447
.006
.038
.101
.007
.002
.244
.047
.004
.0
.709
.005
.003
--
--
--
--
.004
.001
.006
.125
.387
.178
.303
.284
.108
.102
--
.434
.192
.205
.008
.042
.002
.14
.002
.006
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.029
.001
.047
.234
.029
.04
.055
.076
.069
.0
.001
.002
.0
.105
.337
.061
.007
.999
.035
.001
.234
.002
.457
.001
.016
.001
.0
.0
.041
.024
.011
.003
.044
.047
.137
.0
.009
.0
.113
.022
.075
.022
.001
.015
--
--
--
.337
--
--
--
--
--
.039
.004
.004
.06
.01
--
--
--
.003
.017
.0
.003
--
--
--
--
--
--
--
.148
.007
.031
.077
.005
.014
.214
.27
.086
.086
.003
.063
.001
.007
.104
.025
.002
.04
.61
.0
.0
.07
.001
.184
.018
.001
.168
.006
.001
.018
.607
.005
.0
.012
.007
.387
.519
.023
.042
.001
.064
.0
.004
.001
.009
.009
.006
.002
.073
.001
.025
.05
.09
.009
.061
.079
.002
.037
.011
.019
.038
--
--
--
--
.0
.002
.002
.001
.006
.03
.0
.051
--
.009
.0
.025
.005
.008
.038
.0
.056
.0
.027
.011
.0
.0
.008
.001
.009
.002
.0
.003
.019
--
.002
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.241
.157
.015
.176
.014
.094
.016
.003
.212
.013
.002
.005
.0
.0
.104
.031
.037
.004
.001
.008
.0
.001
.632
.067
.003
.021
.001
.002
.639
.038
.052
.002
.003
.005
.569
.464
.004
.011
.024
.329
.361
.51
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.164
.319
.186
.03
.044
.216
.327
.094
.785
.001
--
--
--
.034
.006
.0
.015
.014
.029
.002
.057
--
.0
.002
.001
.005
.003
.019
.044
.234
.45
.179
.073
.094
.103
.117
.002
.006
.014
.0
.0
.0
.001
--
.0
.002
.018
.01
.0
.0
.014
.0
.0
.053
.147
.001
.006
.04
.0
.005
.0
.01
.026
.566
.526
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.005
.028
--
--
.404
.01
.254
.027
.0
.052
.006
.004
.012
.032
.021
.0
.098
.0
.0
.005
.0
.012
--
.056
.479
.081
.018
.0
.001
.0
.004
.0
.032
.004
.003
.008
.007
.0
.001
.003
.581
.994
.252
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.094
.001
.001
.139
.001
.012
.001
.149
--
--
--
--
--
.291
.177
.136
.147
.005
.001
.128
.015
.002
.007
.355
.019
--
--
.031
.003
.001
.006
.025
.973
.002
.161
.183
.041
.029
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108352141
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
C
A
A
C
A
T
A
T
G
C
C
T
T
G
T
C
A
T
A
T
A
C
C
C
T
C
C
G
C
C
C
C
C
G
T
A
A
T
T
T
T
G
G
C
T
C
C
G
T
T
C
T
A
T
C
G
T
G
A
C
T
G
C
G
A
T
G
G
C
C
A
C
C
T
C
A
G
C
G
T
T
C
C
A
C
T
G
C
C
C
T
T
T
G
C
A
C
A
G
G
C
A
G
G
T
A
G
G
A
C
C
G
T
G
C
G
C
T
C
G
A
T
G
G
C
C
C
A
C
T
C
A
G
C
T
T
T
T
G
A
C
A
G
C
A
A
C
G
G
C
T
C
C
G
C
C
C
A
A
A
G
G
G
G
T
A
A
T
G
G
A
T
T
C
A
T
A
C
C
C
C
C
T
G
C
G
C
G
C
G
G
T
C
G
C
G
G
C
C
G
G
G
A
G
A
G
C
T
C
G
T
C
T
G
T
T
G
G
G
C
G
C
C
G
T
C
G
A
G
C
G
C
G
T
A
G
C
A
G
G
T
A
G
G
C
A
C
C
A
T
A
T
A
T
A
T
T
T
A
A
G
T
A
A
A
C
T
A
G
A
A
T
A
G
T
T
T
C
T
T
A
C
C
C
G
T
T
T
G
G
C
C
C
G
A
T
A
C
A
G
G
C
C
T
C
A
A
G
T
T
G
A
T
C
C
A
G
C
C
A
G
C
A
A
C
C
C
T
G
G
T
T
A
C
T
C
T
T
C
C
C
A
A
C
C
T
C
T
G
C
G
G
A
T
C
T
A
T
G
A
T
C
C
G
G
C
C
T
C
A
A
A
T
G
C
G
T
G
G
A
T
A
T
T
C
C
A
C
T
T
A
C
T
A
C
C
C
A
C
A
A
A
C
C
A
A
G
T
A
A
T
C
T
G
A
G
A
G
G
A
A
A
A
T
T
C
G
G
G
G
T
A
T
G
G
C
A
A
A
G
G
G
A
G
T
G
A
A
C
T
C
G
G
T
C
G
C
G
G
A
A
A
C
G
T
G
A
T
T
C
A
T
C
C
G
C
C
C
G
G
C
A
G
A
G
G
G
A
G
A
T
C
C
A
A
A
G
T
A
A
G
T
A
T
A
C
C
T
T
T
A
T
G
T
A
T
  92,820,849
  92,820,901
  92,821,950
  92,822,425
  92,822,586
  92,823,191
  92,823,198
  92,823,347
  92,823,741
  92,823,835
  92,823,905
  92,824,079
  92,824,272
  92,824,451
  92,824,700
  92,824,706
  92,825,286
  92,825,425
  92,825,481
  92,825,837
  92,825,922
  92,825,954
  92,826,065
  92,826,088
  92,826,098
  92,826,130
  92,826,323
  92,826,338
  92,826,402
  92,826,489
  92,826,634
  92,826,774
  92,826,897
  92,827,191
  92,827,571
  92,827,692
  92,827,946
  92,828,022
  92,828,145
  92,828,151
  92,828,208
  92,828,265
  92,828,280
  92,828,367
  92,828,382
  92,828,524
  92,828,594
  92,828,608
  92,828,768
  92,828,846
  92,828,945
  92,829,041
  92,829,136
  92,829,209
  92,829,321
  92,829,426
  92,829,686
  92,829,865
  92,829,866
  92,833,227
  92,833,430
  92,833,559
  92,833,657
  92,834,445
  92,834,528
  92,834,567
  92,834,757
  92,834,842
  92,834,843
  92,835,101
  92,835,255
  92,841,655
  92,841,751
  92,841,786
  92,841,863
  92,841,865
  92,842,051
  92,842,241
  92,842,252
  92,842,374
  92,842,377
  92,842,521
  92,842,546
  92,842,808
  92,842,919
  92,843,134
  92,843,371
  92,843,424
  92,843,462
  92,843,550
  92,843,577
  92,843,644
  92,843,687
  92,844,000
  92,844,084
  92,844,157
  92,844,389
  92,844,433
  92,844,529
  92,844,731
  92,844,733
  92,844,887
  92,845,100
  92,845,526
  92,845,564
  92,845,672
  92,845,722
  92,845,849
  92,846,243
  92,846,499
  92,846,565
  92,846,772
  92,847,487
  92,849,770
  92,854,244
  92,857,423
  92,862,884
  92,863,745
  92,864,845
  92,865,474
  92,866,281
  92,869,385
  92,872,589
  92,873,712
  92,877,068
  92,877,435
  92,877,746
  92,878,846
  92,881,088
  92,882,636
  92,889,159
  92,893,407
  92,904,467
  92,905,624
  92,912,075
  92,912,446
  92,912,865
  92,912,866
  92,914,055
  92,915,609
  92,915,610
  92,916,477
  92,917,305
  92,918,007
  92,924,203
  92,924,991
  92,926,577
  92,926,598
  92,926,866
  92,927,751
  92,928,501
  92,928,580
  92,928,748
  92,928,953
  92,930,507
  92,930,654
  92,930,869
  92,930,878
  92,931,595
  92,932,398
  92,932,566
  92,932,618
  92,932,848
  92,934,443
  92,934,735
  92,935,335
  92,935,525
  92,936,681
  92,937,041
  92,939,222
  92,939,932
  92,942,879
  92,947,309
  92,948,230
  92,948,976
  92,949,295
  92,949,372
  92,949,390
  92,949,579
  92,949,774
  92,949,921
  92,949,964
  92,950,238
  92,950,466
  92,950,478
  92,950,482
  92,950,493
  92,950,804
  92,950,873
  92,951,078
  92,951,170
  92,951,196
  92,951,245
  92,951,265
  92,951,278
  92,951,419
  92,951,609
  92,951,790
  92,951,826
  92,952,524
  92,952,599
  92,952,602
  92,953,359
  92,953,662
  92,954,691
  92,956,200
  92,958,057
  92,962,138
  92,962,379
  92,963,064
  92,964,123
  92,964,453
  92,964,585
  92,965,008
  92,965,485
  92,966,266
  92,966,362
  92,967,710
  92,969,704
  92,970,130
  92,970,655
  92,970,831
  92,971,639
  92,971,683
  92,971,878
  92,971,883
  92,971,979
  92,971,984
  92,972,027
  92,972,038
  92,972,075
  92,972,083
  92,972,105
  92,972,142
  92,972,379
  92,972,590
  92,972,886
  92,974,474
  92,974,860
  92,975,142
  92,975,787
  92,976,552
  92,977,934
  92,978,245
  92,978,302
  92,978,641
  92,979,038
  92,979,214
  92,979,327
  92,979,338
  92,979,936
  92,980,075
  92,980,092
  92,980,274
  92,980,894
  92,981,172
  92,981,405
  92,981,446
  92,981,774
  92,982,025
  92,982,614
  92,982,688
  92,983,622
  92,983,631
  92,984,064
  92,984,548
  92,985,071
  92,992,841
  92,992,874
  92,992,944
  92,993,049
  92,993,147
  92,993,169
  92,993,192
  92,993,812
  92,994,085
  92,994,238
  92,994,606
  92,995,516
  92,996,024
  92,996,255
  92,996,637
  92,996,944
  92,997,166
  92,997,377
  92,997,391
  92,997,701
  92,997,935
  92,998,005
  92,998,042
  92,998,160
  92,998,368
  92,998,387
  92,998,804
  92,999,078
  92,999,390
  92,999,514
  92,999,516
  93,000,081
  93,000,082
  93,000,113
  93,000,320
  93,000,465
  93,000,608
  93,000,968
  93,001,051
  93,001,290
  93,001,295
  93,001,310
  93,001,653
  93,001,726
  93,001,784
  93,001,854
  93,001,891
  93,002,030
  93,002,198
  93,002,454
  93,002,622
  93,002,640
  93,002,676
  93,002,755
  93,003,195
  93,003,270
  93,003,509
  93,003,562
  93,003,598
  93,003,655
  93,003,683
  93,003,967
  93,003,989
  93,004,409
  93,004,586
  93,005,219
  93,006,041
  93,006,198
  93,006,237
  93,006,239
  93,006,407
  93,006,574
  93,006,668
  93,006,902
  93,009,335
  93,016,200
  93,016,568
  93,016,751
  93,018,445
  93,018,774
  93,020,173
  93,020,195
  93,021,301
  93,021,354
  93,021,416
  93,023,123
  93,023,652
  93,024,576
  93,024,906
  93,027,520
  93,027,604
  93,027,605
  93,029,939
  93,030,295
  93,030,425
  93,030,819
  93,031,031
  93,031,189
  93,032,014
  93,032,165
  93,033,189
  93,034,240
  93,034,720
  93,035,020
  93,035,227
  93,035,342
  93,035,442
  93,035,449
  93,036,000
  93,037,950
  93,039,506
  93,041,556
  93,041,585
  93,041,604
  93,041,614
  93,042,401
  93,046,335
  93,046,510
  93,046,544
  93,046,743
  93,046,975
  93,047,126
  93,047,375
  93,049,213
  93,049,424
  93,049,432
  93,049,446
  93,049,631
  93,049,879
  93,049,887
  93,050,490
  93,051,064
  93,052,344
  93,052,361
  93,052,431
  93,052,658
  93,052,752
  93,052,926
  93,052,993
  93,053,073
  93,053,104
  93,053,156
  93,053,295
  93,054,763
  93,055,450
  93,055,750
  93,055,835
  93,055,844
  93,056,180
  93,056,379
  93,056,393
  93,056,405
  93,056,584
  93,056,733
  93,057,434
  93,057,563
  93,059,504
  93,060,299
  93,063,393
  93,063,506
  93,064,024
  93,064,884
  93,065,069
  93,065,853
  93,066,467
  93,067,422
  93,070,094
  93,070,221
  93,071,039
  93,072,556
  93,072,847
  93,073,707
  93,074,135
  93,074,163
  93,074,186
  93,074,652
  93,075,627
  93,077,677
  93,078,156
  93,081,695
  93,081,920
  93,082,734
  93,083,254
  93,084,173
  93,085,906
  93,087,990
  93,088,569
  93,090,078
  93,090,861
  93,091,477
  93,094,035
  93,094,594
  93,094,595
  93,095,067
  93,095,514
  93,098,081
  93,104,527
  93,104,765
  93,104,783
  93,104,821
  93,104,834
  93,104,835
  93,104,860
  93,132,030
  93,132,100
  93,132,207
  93,132,339
  93,132,371
  93,132,419
  93,132,457
  93,132,461
  93,132,464
  93,141,767
  93,142,099
  93,147,938
  93,147,943
  93,148,953
  93,149,270
  93,151,145
  93,152,514
  93,153,092
  93,154,196
  93,154,429
  93,154,455
  93,154,895
  93,154,937
  93,155,775
  93,155,937
  93,161,996
  93,162,699
  93,162,732
  93,163,378
  93,164,235
  93,164,557
  93,164,836
  93,164,995
  93,165,187
  93,165,707
  93,169,249
  93,169,357
  93,170,014
  93,170,127
  93,170,638
  93,173,377
  93,174,761
  93,176,853
  93,181,112
  93,181,175
  93,181,653
  93,181,723
  93,182,347
T
G
T
T
G
T
G
C
T
C
C
A
A
C
C
C
C
T
T
C
G
G
G
G
A
T
C
A
T
A
T
G
T
T
C/G
A
C
G
G
C
C
C
C
T
T
T
G
G
T
A
C
C
T
C
G
C
T
G/T
T/G
A
G
A
C
A
T
T
C
T/C
G/C
A
T
A
T
G
A
C
T
T
C
T
T
C
C
A
G
G
T
C
T
G
T
T
C
C
C
C
G
G
T
G
T
A
T
G
A
A
C
C
A
A
T
T
T
C
G
G/C
T
A
A
T/C
T
A
C
A
A
A
T
T
T
G
G
C
G
G
A
A
C
C
C
T/G
G/T
G
A
A/C
A
G
G
T
A
A
A
T
C
T
T
A
T
T
T
C
C
G
A
A
A
A
A
T
G
C
A
T
G
C
C
T
T
C
G
T
T
A
T
T
C
T
T
A
T
A
A
T
G/T
A
T
A
T
T
T
T
T
A
A
A
G
G/A
G
A
T
A
T
A
G
T
C
T
C
C
A
A
G/C
T
C
T
T
T
C
T
A
G
C
G
A
T
C
T/C
G
A
T
G
A
A
C
T
A
C
T
T
T
A
G
G
G
C
G
G
G
G
C
C
G
C
C
G
G
G
G
A
G
G
A
G
G
C
G
A
C
G
G
T
T/A
T/C
G
T
T
G
A
C
G
C
T
T
T
T
T
A
G
G
T
T
G
T
A
T
T
A
T
G
C
C
A
C
A
G
A
T
A
G
A
T
C/T
G
C
T
G
G
A
G
T
C
A
T
C
C
T
C/G
G
G
A
G
G
T
T
G
G
T
T
C
T
C
A
T
A
C
G
C
T
G
C
C
T
T
C
T
T
T
A
A
A
C
T
G
G
G
C
A
T
T
G
A
G/T
A/G
A
G
G
C
T
T
C
G
C
C
G
T
A
T
T
C/T
T
A/G
C/T
C
G
A/T
T
T
A/G
A/G
C
A
G
G
C
A
G
C
G
C
C
A
C
G
G
G
A/T
G
C
T
A
A
A
A
A
G
C
A
T
T
G
G
T
C
T
A
G
A
C
A
G
T
T
G
T
A
A
C
T
A
T
G/A
A
C
G
G
T
C
G
C
G
A
T/C
C/T
G
C
T
G
C
G
T
T
A
G/A
C/A
G
A
G
A
A
A
G
A
T
C
C/A
A
G
G
C
C
G
T
T
T
C
G
T/C
A/G
G
A
C
C
C
A/G
C
A
C
G
C