Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 85,120 (bp)   Positions: 277
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.004
.001
.006
.003
.001
.014
.01
.037
.988
.328
.416
.0
.045
.313
.103
.006
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.032
.034
.056
.065
.999
.0
.0
.01
.011
.0
.0
.0
.813
.806
.993
.697
.001
.0
.0
.001
.018
.002
.019
.011
.0
.005
.177
.0
.026
.021
.003
.0
.071
.007
.192
.001
--
.005
.02
.002
.014
.002
.122
.0
.004
.262
.0
.0
.0
.0
.997
.193
.113
.0
.007
.999
1.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.2
.001
--
.008
.005
.004
.0
.01
.001
.417
.327
.0
.001
.032
.0
.0
.101
.99
.011
.074
.313
.003
.0
.831
.001
.0
.095
.048
.0
.025
.0
.013
.007
.0
.001
.042
.0
.002
.061
.113
--
.0
.002
.002
.002
.001
.02
.003
.004
.0
.087
.009
.016
.127
.0
.001
.0
.0
.002
.011
.695
.015
.021
.0
.001
.375
.019
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.0
.045
.075
--
.03
.019
.0
.004
.997
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
G
3
T
-
A
T
-
G
G
G
A
G
C
A
T
A
-
A
G
A
C
G
G
G
G
G
T
C
A
G
C
C
C
T
G
C
3
-
A
T
T
A
T
C
C
G
G
T
G
G
C
G
T
G
-
T
G
T
A
T
C
C
G
G
T
T
A
G
G
T
A
G
T
T
A
A
G
C
A
T
G
A
C
C
C
C
T
5
T
A
C
A
A
A
T
C
G
A
C
T
-
G
G
A
G
T
G
G
-
G
A
A
C
T
C
A
G
T
G
T
A
T
C
2
C
G
C
C
G
G
C
T
C
28
A
-
T
A
G
T
G
T
A
86
A
T
T
T
A
T
C
A
C
C
G
C
C
G
C
T
A
A
G
T
C
G
C
T
T
A
A
T
C
T
G
C
C
T
G
G
T
G
G
G
T
T
T
G
T
G
A
T
G
G
G
C
C
T
T
A
C
C
C
C
G
G
T
G
G
A
A
G
A
C
G
C
G
T
T
T
A
G
A
A
G
G
C
T
T
C
A
C
G
T
C
G
G
C
G
G
G
G
G
-
G
A
T
T
C
G
G
G
G
T
G
C
G
C
C
A
G
G
T
A
A
T
A
C
G
A
G
T
G
-
G
  37,102,046
  37,102,769
  37,103,071
  37,103,619
  37,103,879
  37,106,221
  37,107,198
  37,108,591
  37,108,620
  37,108,788
  37,108,795
  37,109,078
  37,109,805
  37,109,940
  37,111,304
  37,112,980
  37,112,981
  37,113,384
  37,113,469
  37,113,797
  37,113,972
  37,114,056
  37,114,062
  37,114,357
  37,115,830
  37,115,836
  37,115,838
  37,115,844
  37,116,046
  37,116,389
  37,116,528
  37,116,632
  37,116,914
  37,116,915
  37,116,939
  37,116,971
  37,117,151
  37,117,627
  37,117,760
  37,118,075
  37,118,176
  37,118,927
  37,119,223
  37,119,572
  37,119,605
  37,121,548
  37,121,550
  37,122,540
  37,123,115
  37,123,921
  37,123,984
  37,124,387
  37,124,412
  37,124,911
  37,125,140
  37,125,274
  37,125,281
  37,125,383
  37,126,274
  37,127,425
  37,127,570
  37,127,586
  37,127,615
  37,127,772
  37,128,837
  37,129,000
  37,129,476
  37,129,830
  37,131,160
  37,131,280
  37,132,272
  37,132,812
  37,133,037
  37,133,119
  37,135,090
  37,136,796
  37,136,878
  37,137,513
  37,137,866
  37,139,189
  37,139,658
  37,139,694
  37,140,554
  37,140,783
  37,141,564
  37,141,662
  37,141,781
  37,141,942
  37,142,633
  37,143,699
  37,144,491
  37,144,752
  37,144,899
  37,145,376
  37,145,562
  37,147,056
  37,147,501
  37,147,541
  37,147,857
  37,147,861
  37,147,971
  37,148,181
  37,148,373
  37,148,678
  37,151,347
  37,152,179
  37,152,411
  37,153,128
  37,153,751
  37,153,960
  37,155,095
  37,155,766
  37,156,294
  37,156,325
  37,157,023
  37,157,026
  37,158,126
  37,159,263
  37,159,869
  37,159,967
  37,160,120
  37,160,467
  37,160,491
  37,160,682
  37,161,168
  37,161,814
  37,162,036
  37,162,111
  37,162,609
  37,162,878
  37,163,008
  37,163,517
  37,163,563
  37,163,726
  37,164,773
  37,165,182
  37,165,945
  37,165,962
  37,166,018
  37,166,058
  37,166,745
  37,166,980
  37,167,130
  37,167,157
  37,167,728
  37,167,903
  37,168,416
  37,168,493
  37,168,494
  37,168,959
  37,169,219
  37,169,547
  37,169,601
  37,169,755
  37,169,895
  37,170,014
  37,170,192
  37,170,833
  37,171,048
  37,171,758
  37,172,040
  37,172,121
  37,172,814
  37,172,819
  37,172,940
  37,173,403
  37,174,199
  37,174,204
  37,174,325
  37,174,532
  37,176,375
  37,176,394
  37,176,406
  37,176,455
  37,176,472
  37,176,477
  37,176,710
  37,176,861
  37,176,945
  37,177,021
  37,177,075
  37,177,105
  37,177,264
  37,177,318
  37,177,330
  37,177,333
  37,177,340
  37,177,342
  37,177,343
  37,177,375
  37,177,393
  37,177,515
  37,177,553
  37,177,564
  37,177,565
  37,177,569
  37,177,570
  37,177,721
  37,177,724
  37,177,734
  37,177,744
  37,177,791
  37,177,817
  37,177,845
  37,178,054
  37,180,140
  37,180,209
  37,180,214
  37,180,224
  37,180,238
  37,180,256
  37,180,263
  37,180,328
  37,180,389
  37,180,395
  37,180,398
  37,180,401
  37,180,493
  37,180,599
  37,180,610
  37,180,636
  37,180,642
  37,180,661
  37,180,673
  37,180,704
  37,180,729
  37,180,763
  37,180,887
  37,181,515
  37,181,703
  37,181,816
  37,181,985
  37,181,995
  37,182,025
  37,182,102
  37,182,228
  37,182,273
  37,182,889
  37,182,993
  37,183,015
  37,183,101
  37,183,119
  37,183,162
  37,183,184
  37,183,190
  37,183,255
  37,183,311
  37,183,525
  37,183,560
  37,183,636
  37,183,654
  37,183,733
  37,183,825
  37,183,843
  37,183,908
  37,184,004
  37,184,015
  37,184,016
  37,184,020
  37,184,021
  37,184,027
  37,184,028
  37,184,038
  37,184,223
  37,184,280
  37,184,354
  37,184,372
  37,184,445
  37,184,674
  37,184,683
  37,184,724
  37,184,968
  37,185,203
  37,185,294
  37,185,677
  37,186,054
  37,186,426
A
C
A
-
C
G
G
G
T
A
A
T
G
A
T
T
G
C
C
C
T
T
T
A
A
A
A
A
C
T
C
A
T
T
G
A
A
G
-
A
G
C
C
C
C
T
T
C
A
C
A
C
T
A
C
-
A
C
A
C
-
C
T
T
A
A
C
C
T
A
A
C
G
A
A
A
T
-
A
T
-
G
C
T
T
T
T
T
C
-
G
G
T
G
G
T
C
T
A
T
T
C
13
A
A
G
A
G
A
A
T
T
T
-
T
C
T
G
A
C
T
C
G
C
T
-
T
C
T
T
A
A
G
C
T
-
G
G
C
G
C
C
A
C
G
-
T
C
C
C
G
C
G
C
A
T
A
T
G
A
T
G
G
G
A
C
T
A
T
A
A
C
T
C
A
C
G/A
T
T
A
G/A
G/C
T/C
G/T
G/T
G/A
T/-
T/C
T/A
G/A
T/G
G/A
A/G
T/G
G/A
G/A
G/A
C/A
C/A
T/G
T/C
A/G
C/T
C/T
C/G
C/T
G/T
G/A
T/A
G/A
G/A
G
A/C
G/A
A/C
C/T
G/T
G
G/A
T/C
T/C
T/A
A/G
G/T
A/G
A/G
G/T
G/T
G
C
T/C
C/G
A/G
A
C
G
A
C
G/T
G
C
C
C
T
C
G
A
G
C
C
T
A
A
T
T
C
G/T
C/T
G/A
C/G
C/T
A/T
C
T
A
G
G
C
T
T
T
-
C
C
A
11
A