Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 160,972 (bp)   Positions: 314
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.02
.04
1.0
.0
.002
.193
.108
--
--
--
.555
.024
--
--
--
.105
.352
.067
.004
.986
.007
.464
.013
--
--
--
.005
.005
.001
.002
.019
.014
.027
.011
.022
.001
.001
.028
.003
--
--
.869
.042
.067
.638
.019
.0
.766
.006
.0
.003
.003
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.596
.01
.002
.019
.007
.0
.006
.001
.0
.01
.002
.0
.001
.301
.014
.003
.489
.805
.0
.001
.0
.0
.001
.0
.123
.001
.768
.589
.178
.013
.11
.014
.01
.006
.009
.004
.038
.0
.001
.002
.0
.0
.0
.017
.999
.002
.001
.005
.016
.136
.004
.014
.0
.001
.002
.023
.06
.147
--
--
--
--
.084
.037
.268
.001
.462
.004
.001
.045
.012
.059
.02
.003
.0
.164
.92
.0
.002
.001
.003
.004
.006
.001
.0
.031
.0
.0
.25
.0
.001
.002
.001
.0
.005
.254
.002
.001
.002
.001
.001
.013
.002
.011
.937
.979
.0
.003
.001
.057
.0
.0
.001
.013
.269
.548
.047
.196
.756
.003
.172
.056
.265
.024
.012
.014
.013
.005
.012
.291
.039
.011
.174
.018
.065
.201
.048
.278
.012
.001
--
--
.351
.021
.0
.003
.004
.007
.079
.041
.166
.0
.004
.012
.005
.002
.691
.031
.007
.0
.0
.04
.013
.025
.18
.102
.0
.0
.002
.0
.0
.006
.008
.0
.0
--
--
--
--
.765
.0
.0
.002
.745
.208
.477
.005
.0
.0
.004
.198
.03
.098
.063
.077
.112
.135
.003
.029
.086
.014
.0
.0
.003
.067
.016
.047
.305
.004
.0
.01
.0
.0
.001
.031
.005
.001
.25
.0
.001
.014
.121
.002
.67
.229
.003
.002
.071
.005
.0
.0
.0
.007
.0
.054
.046
.0
.131
.005
--
--
--
.105
.103
.003
.004
.048
.008
.004
.229
.0
.002
.001
.004
.0
.0
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
Dtd1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
C
G
T
G
T
G
A
T
C
C
C
G
T
G
G
G
C
G
C
C
A
T
C
T
C
T
G
C
T
G
G
G
T
G
G
A
C
C
C
G
A
G
G
C
G
C
A
A
A
G
C
T
T
T
C
T
T
G
G
A
G
T
T
C
C
G
A
G
T
A
A
C
T
T
A
C
G
T
C
A
T
G
T
C
C
T
G
T
C
C
T
G
G
G
G
C
T
C
A
C
T
G
C
G
T
G
C
A
A
T
C
C
T
A
G
A
T
A
A
T
T
T
C
G
C
A
G
C
C
A
A
T
G
C
C
C
C
G
T
G
G
G
C
G
G
T
C
A
C
G
C
A
T
G
C
G
T
T
T
C
C
T
G
T
A
A
T
A
A
C
C
A
C
C
G
C
A
A
T
C
G
A
T
T
C
T
G
C
A
A
T
T
C
T
G
G
A
A
C
T
T
G
A
C
C
A
A
G
T
G
T
G
G
C
A
T
G
C
G
A
G
C
G
C
C
A
G
T
G
A
A
C
C
C
T
C
C
C
T
C
A
G
T
T
T
C
A
A
G
T
T
C
C
T
C
T
A
T
A
G
G
G
T
T
G
G
A
T
T
C
G
A
G
C
T
C
T
G
A
G
G
C
A
C
C
T
G
A
C
C
G
A
C
A
A
A
A
A
A
A
C
A
T
C
C
A
T
A
T
G
A
T
  138,771,134
  138,772,544
  138,774,641
  138,775,024
  138,775,200
  138,775,576
  138,778,210
  138,779,595
  138,779,870
  138,780,886
  138,782,396
  138,782,787
  138,783,772
  138,784,023
  138,784,037
  138,786,149
  138,786,249
  138,786,822
  138,787,795
  138,788,166
  138,789,184
  138,789,498
  138,790,274
  138,790,954
  138,791,381
  138,792,227
  138,795,199
  138,795,210
  138,795,385
  138,795,389
  138,795,479
  138,795,626
  138,796,180
  138,796,217
  138,796,881
  138,797,575
  138,798,052
  138,798,337
  138,798,712
  138,799,913
  138,799,915
  138,800,345
  138,800,502
  138,801,431
  138,802,536
  138,803,312
  138,805,214
  138,805,787
  138,806,110
  138,806,800
  138,807,612
  138,808,827
  138,808,904
  138,809,647
  138,809,712
  138,809,807
  138,810,298
  138,810,517
  138,810,877
  138,811,456
  138,811,510
  138,811,634
  138,811,688
  138,811,724
  138,812,057
  138,812,569
  138,813,396
  138,814,240
  138,814,637
  138,814,810
  138,814,956
  138,815,644
  138,817,036
  138,817,446
  138,817,978
  138,818,061
  138,818,289
  138,818,501
  138,818,864
  138,819,031
  138,819,538
  138,820,447
  138,821,496
  138,821,669
  138,822,118
  138,822,901
  138,823,413
  138,823,704
  138,823,906
  138,824,284
  138,825,885
  138,826,345
  138,827,173
  138,828,492
  138,830,177
  138,830,641
  138,830,836
  138,831,360
  138,832,404
  138,832,415
  138,832,442
  138,832,897
  138,833,715
  138,834,243
  138,834,426
  138,835,861
  138,836,378
  138,836,425
  138,837,344
  138,837,475
  138,837,485
  138,839,137
  138,839,668
  138,840,463
  138,840,518
  138,840,658
  138,841,188
  138,841,367
  138,841,765
  138,841,929
  138,843,685
  138,844,050
  138,844,066
  138,844,335
  138,844,474
  138,846,875
  138,846,922
  138,847,800
  138,848,577
  138,849,138
  138,849,155
  138,849,788
  138,850,176
  138,850,547
  138,850,566
  138,850,838
  138,851,005
  138,851,008
  138,851,273
  138,851,342
  138,851,412
  138,851,458
  138,851,549
  138,851,596
  138,851,617
  138,852,167
  138,852,519
  138,853,060
  138,853,160
  138,853,389
  138,853,390
  138,853,730
  138,853,752
  138,853,860
  138,853,881
  138,853,947
  138,854,124
  138,854,245
  138,854,250
  138,854,298
  138,854,529
  138,854,691
  138,854,767
  138,854,771
  138,855,619
  138,855,801
  138,855,984
  138,856,114
  138,856,404
  138,856,461
  138,857,172
  138,857,317
  138,857,381
  138,857,486
  138,858,621
  138,859,884
  138,860,190
  138,860,312
  138,860,429
  138,861,392
  138,861,614
  138,862,389
  138,862,531
  138,862,798
  138,862,932
  138,863,119
  138,863,442
  138,864,401
  138,864,458
  138,864,643
  138,864,751
  138,864,776
  138,865,241
  138,865,276
  138,865,723
  138,865,754
  138,866,172
  138,866,340
  138,866,501
  138,866,854
  138,867,229
  138,867,623
  138,868,304
  138,868,391
  138,868,538
  138,869,075
  138,869,245
  138,869,545
  138,870,774
  138,871,123
  138,871,224
  138,871,420
  138,871,549
  138,871,652
  138,872,030
  138,872,109
  138,872,201
  138,872,319
  138,872,401
  138,872,811
  138,874,307
  138,874,991
  138,875,369
  138,875,376
  138,876,667
  138,876,841
  138,877,358
  138,877,394
  138,877,501
  138,877,724
  138,878,065
  138,878,245
  138,878,247
  138,879,251
  138,879,452
  138,879,852
  138,879,881
  138,880,840
  138,881,639
  138,881,657
  138,881,977
  138,882,027
  138,882,923
  138,882,968
  138,883,724
  138,884,071
  138,884,211
  138,885,009
  138,885,267
  138,885,353
  138,885,373
  138,885,746
  138,885,754
  138,886,053
  138,886,135
  138,886,545
  138,886,708
  138,886,752
  138,887,158
  138,887,393
  138,887,583
  138,887,626
  138,887,811
  138,887,935
  138,887,992
  138,888,226
  138,888,337
  138,888,618
  138,888,674
  138,888,935
  138,889,519
  138,889,646
  138,890,802
  138,891,364
  138,893,549
  138,894,811
  138,895,104
  138,895,557
  138,896,255
  138,896,291
  138,896,354
  138,896,548
  138,896,581
  138,896,617
  138,896,664
  138,896,671
  138,896,720
  138,897,202
  138,897,247
  138,897,298
  138,901,500
  138,901,825
  138,905,170
  138,907,736
  138,909,370
  138,909,929
  138,912,241
  138,913,790
  138,915,950
  138,915,966
  138,917,834
  138,917,837
  138,918,189
  138,918,490
  138,918,541
  138,918,576
  138,919,854
  138,919,942
  138,925,131
  138,925,672
  138,927,082
  138,929,079
  138,929,412
  138,929,641
C/T
T
T
A
C
A
C
A
T
C
T
T
C/G
G/T
T/C
T
A
T
T
C
T
T
C
C
C/G
G
T
C
T
A
C
A
T
A
C
A
A
G
C/A
A
C/T
A
G
A
T
A
A
T
G
T
C
A
T
C
C
C
A
C
A
A
C
G
C
A
C
T
T
G/A
G
A
C
T
G
T
G
A
G
T
G/A
C
T
G
A
A
C
C/T
T
C
A
A
T
T
C
A
T
T
T
C/T
C
T
G
T
C
A
T
A
C
A
T
G
T
C
T
G
C
A/G
T
G
C
C
C
G
C
G
G
A
T
G
A
T
T
C
T
C
C
G
T
T
G
A
C
A
C
T
T
T
A
C
T
G
A
A
T
T
A
A
T
C
C
C
A
T
C/T
C
A
C
G
G
C
G
G
T
A
C
T
T
A
T
G
G
G
A
A
G
C
A
G
C
C
T
G
G
C
G
A
C
A
T
G
G
T
A
C
A
G
T
T
G
G
A
C
G/A
A
A
A
A
G
C
A
T
C
G
A
A
A
T
A
G
A
C
A
C
G
T
T
T
C
G
T
T
A
T
G
T
C
C
A
T
G
G
A
G
C
G
G
C
T
C
G
A
G
A
A
A
C
C
A
A
G
C
C
T
T
T
A
T
A
A
T/A
G/T
G
G/A
G/A
C/A
A/G
T
C/T
G
A
G
T
T
A
G
T
G
G
T
A/T
A/T
G
C
T
C
C
A
A
G
C
G
C
T
T
C