Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 314,320 (bp)   Positions: 529
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.0
.005
.001
.0
.001
.001
.024
.692
.176
.052
.06
.003
.002
.298
.014
.028
.004
.001
.001
.004
.011
.0
.0
.0
.0
.006
.013
.0
.014
.001
.001
--
--
--
.058
.006
.005
.005
.005
.001
.0
.009
.001
.007
.003
.003
.0
.0
.0
.0
.002
.002
.0
.0
.906
1.0
.033
.936
.963
.002
.193
.458
.001
.002
.029
.182
.001
.0
.0
.001
.0
.009
.08
.044
.062
.0
.007
.309
.257
.009
.002
.001
.231
.113
.042
.002
.0
.26
.017
.044
.053
.025
.025
.0
.0
.028
.043
.043
.081
.223
.005
.0
.012
.013
.003
.0
.085
--
.132
.008
.076
.081
.19
.08
.237
.291
.904
.141
.0
.021
.001
.003
.219
.003
.017
.115
.027
.001
.003
.002
.434
.0
.061
.037
.041
.217
.102
.83
.0
.004
.001
.137
.087
--
--
.178
.212
.224
.077
.023
.006
.011
.765
.0
.041
.0
.003
.002
.003
.001
.1
.009
.083
.162
.163
.158
.968
1.0
.0
.159
.002
.002
.002
.001
.364
.003
.052
.007
.0
.007
.009
.001
.002
.0
.51
.031
.015
.012
.001
.013
.014
.0
.002
.001
.238
.009
.0
.021
.052
.171
.026
--
--
--
--
--
--
.005
.004
.0
.003
.002
.032
.0
.0
.0
.001
.042
.052
.031
.002
.0
.0
.001
.003
.0
.0
.029
.0
.0
.006
.322
.043
.011
.007
.005
.005
.001
.001
.006
.001
.003
.0
.002
.0
.0
.0
.016
.016
.018
.238
.262
.35
.334
.322
.311
.308
.3
.292
.036
.035
.772
.002
.0
.001
.0
.0
.009
.011
.014
.017
.094
.088
.0
--
--
--
--
.001
.001
.003
.0
.251
.008
.011
.009
.0
.001
.001
.003
.001
--
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.013
.072
.0
.003
.001
.003
.176
.0
.0
.0
.001
.004
--
.001
.002
.001
.01
.126
.314
.06
.369
.158
.177
.026
.002
.022
.0
.986
.004
.0
.0
.003
.001
.013
.008
.002
.0
.009
.391
.403
.022
.745
.0
.0
.087
.007
.0
.001
.01
.002
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.007
.0
.034
.878
.001
.004
.0
.026
.004
.016
.001
.0
.002
.0
.002
.008
.001
.0
.001
.251
.028
.004
.002
.001
.0
.002
.012
.001
.036
.0
.001
.001
.005
.001
.003
.001
.014
.004
.095
.012
1.0
.181
.175
.997
.993
.0
.001
.044
.46
.378
.345
.022
.037
--
--
.002
.034
.003
.002
.001
.104
.049
.049
--
--
--
.0
.96
.0
.396
.162
.001
.032
.058
.645
.874
.105
.052
.026
.13
.001
.002
.003
.0
.021
.005
.01
--
.006
.0
--
--
--
--
.013
.001
.001
.003
.002
.001
.001
.006
.003
.001
.001
.009
.025
.002
.014
.036
.024
.001
.019
.021
.015
.021
.011
.006
.003
.048
.139
.008
.01
.011
.007
.009
.005
.002
.009
.049
.034
.004
.012
.006
.05
.031
.005
.001
.001
.001
.009
.049
.085
.106
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.129
.0
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
T
G
G
T
3
A
G
G
A
A
A
G
A
G
C
T
-
T
A
T
T
-
T
G
A
T
G
G
A
C
-
12
2
2
C
T
G
4
T
G
C
A
-
T
G
A
C
A
T
T
G
T
C
T
A
G
T
-
G
T
C
A
A
T
T
T
G
G
C
C
T
T
A
T
C
G
G
G
-
T
G
G
G
T
T
A
G
C
T
G
A
-
G
2
C
A
T
G
C
-
C
C
C
T
A
4
T
G
C
G
-
C
G
T
A
A
T
11
G
G
T
-
-
C
A
C
A
C
T
T
T
C
G
G
C
A
C
-
T
-
G
T
C
T
-
-
C
G
G
T
G
T
T
T
T
T
C
G
C
G
C
T
A
-
3
4
25
T
T
A
A
C
G
G
C
T
T
T
-
A
T
C
T
C
G
G
T
T
T
G
T
-
G
G
C
A
C
G
-
A
A
A
C
T
A
T
A
T
G
-
6
C
T
A
T
T
6
A
A
-
G
A
C
T
-
A
C
A
T
C
T
-
C
-
C
3
G
-
C
C
-
A
T
T
A
G
G
C
T
C
C
-
T
-
T
-
-
-
-
-
A
G
C
T
A
T
A
-
-
-
-
-
-
-
-
C
G
-
A
G
T
A
-
-
C
2
2
3
-
C
-
A
G
-
-
-
-
A
-
3
A
-
G
4
-
-
A
-
-
-
A
-
G
C
C
G
-
A
T
C
G
-
C
-
T
T
C
2
T
C
T
C
A
G
C
A
A
A
A
T
A
C
-
T
T
T
T
2
-
A
T
T
4
T
T
G
T
-
G
A
G
G
T
C
C
T
T
A
C
T
T
C
C
A
T
G
G
C
G
T
C
A
T
G
T
C
G
A
10
G
4
A
C
C
T
G
T
T
A
T
C
C
A
C
C
G
C
A
-
T
T
A
T
T
A
T
26
2
A
2
T
10
2
-
C
3
-
G
G
C
G
G
C
3
C
T
2
T
-
G
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
G
43
-
T
C
C
T
G
G
G
C
G
T
T
C
T
T
C
G
2
A
-
-
A
A
C
-
-
A
C
T
G
C
C
C
-
-
-
-
-
-
6
A
-
C
-
-
G
-
-
A
A
-
4
A
-
-
3
3
A
-
-
A
-
A
C
G
A
A
T
G
-
A
T
  145,785,791
  145,786,134
  145,786,707
  145,787,011
  145,787,328
  145,787,481
  145,787,553
  145,787,618
  145,787,865
  145,788,178
  145,788,250
  145,788,251
  145,788,909
  145,788,945
  145,789,044
  145,789,161
  145,789,373
  145,789,439
  145,789,740
  145,789,782
  145,789,789
  145,789,796
  145,789,876
  145,789,954
  145,789,964
  145,789,972
  145,790,049
  145,791,308
  145,791,555
  145,792,020
  145,792,561
  145,794,740
  145,794,779
  145,794,811
  145,794,831
  145,794,856
  145,794,935
  145,795,552
  145,796,580
  145,796,757
  145,799,865
  145,799,950
  145,800,091
  145,800,115
  145,800,410
  145,805,224
  145,805,500
  145,805,503
  145,805,506
  145,805,558
  145,805,559
  145,805,613
  145,805,790
  145,805,812
  145,805,822
  145,805,871
  145,806,010
  145,806,239
  145,806,353
  145,806,554
  145,807,235
  145,807,250
  145,807,286
  145,807,403
  145,807,549
  145,807,785
  145,807,939
  145,808,042
  145,808,179
  145,808,290
  145,808,516
  145,808,761
  145,808,941
  145,808,952
  145,809,002
  145,809,024
  145,809,375
  145,809,481
  145,809,673
  145,809,683
  145,809,820
  145,809,822
  145,809,824
  145,809,962
  145,810,275
  145,810,507
  145,810,528
  145,811,267
  145,811,337
  145,811,464
  145,811,510
  145,811,512
  145,811,981
  145,812,368
  145,812,425
  145,812,435
  145,813,194
  145,813,301
  145,813,319
  145,813,444
  145,813,481
  145,814,155
  145,814,545
  145,814,898
  145,815,682
  145,816,250
  145,816,283
  145,817,651
  145,820,070
  145,820,746
  145,821,930
  145,822,897
  145,824,688
  145,825,240
  145,825,827
  145,827,345
  145,828,664
  145,829,256
  145,829,646
  145,830,064
  145,830,513
  145,830,571
  145,830,573
  145,831,904
  145,832,619
  145,835,046
  145,837,100
  145,837,500
  145,838,994
  145,839,012
  145,839,901
  145,840,441
  145,840,636
  145,841,096
  145,841,105
  145,841,128
  145,841,207
  145,841,306
  145,842,297
  145,842,681
  145,843,340
  145,844,844
  145,845,255
  145,845,390
  145,846,617
  145,846,649
  145,847,307
  145,847,313
  145,847,753
  145,847,844
  145,848,642
  145,851,845
  145,852,618
  145,852,988
  145,853,490
  145,855,557
  145,857,213
  145,857,383
  145,857,874
  145,858,415
  145,859,705
  145,860,094
  145,860,198
  145,860,213
  145,860,384
  145,860,389
  145,860,396
  145,860,825
  145,860,956
  145,861,236
  145,861,650
  145,862,190
  145,862,266
  145,862,752
  145,862,826
  145,863,265
  145,863,635
  145,863,801
  145,863,840
  145,863,841
  145,863,881
  145,864,183
  145,864,347
  145,864,381
  145,864,384
  145,864,697
  145,864,986
  145,865,024
  145,865,520
  145,865,844
  145,865,913
  145,865,981
  145,866,142
  145,866,359
  145,866,400
  145,866,887
  145,866,966
  145,867,126
  145,867,325
  145,868,029
  145,868,211
  145,868,423
  145,868,683
  145,868,763
  145,868,778
  145,868,788
  145,868,798
  145,868,820
  145,868,947
  145,868,966
  145,868,976
  145,869,727
  145,869,799
  145,869,943
  145,869,969
  145,870,145
  145,870,203
  145,870,210
  145,870,289
  145,870,374
  145,870,404
  145,870,427
  145,870,636
  145,870,995
  145,871,400
  145,871,411
  145,872,103
  145,872,161
  145,872,676
  145,873,041
  145,875,761
  145,876,801
  145,876,943
  145,878,810
  145,878,817
  145,878,821
  145,878,827
  145,878,845
  145,878,848
  145,878,850
  145,878,857
  145,878,862
  145,878,926
  145,879,058
  145,879,166
  145,879,178
  145,879,865
  145,881,173
  145,884,037
  145,884,381
  145,884,541
  145,886,326
  145,886,329
  145,886,378
  145,886,387
  145,886,395
  145,886,403
  145,886,405
  145,886,412
  145,886,418
  145,886,887
  145,887,562
  145,887,988
  145,888,054
  145,889,123
  145,889,130
  145,889,138
  145,889,154
  145,889,171
  145,889,173
  145,889,220
  145,889,236
  145,889,252
  145,889,253
  145,890,060
  145,891,147
  145,891,205
  145,891,219
  145,891,230
  145,891,636
  145,891,637
  145,891,658
  145,891,663
  145,891,675
  145,891,687
  145,891,696
  145,891,741
  145,891,776
  145,892,292
  145,893,116
  145,893,279
  145,893,658
  145,894,268
  145,894,652
  145,894,874
  145,894,992
  145,895,000
  145,895,034
  145,895,084
  145,895,103
  145,895,147
  145,895,217
  145,895,238
  145,895,272
  145,895,316
  145,895,320
  145,895,465
  145,895,546
  145,895,634
  145,895,650
  145,895,717
  145,895,743
  145,895,822
  145,895,903
  145,896,102
  145,896,715
  145,897,090
  145,897,438
  145,898,185
  145,898,553
  145,900,147
  145,900,301
  145,901,168
  145,902,605
  145,904,820
  145,905,024
  145,905,289
  145,905,320
  145,906,061
  145,906,086
  145,906,200
  145,906,240
  145,906,253
  145,906,308
  145,906,506
  145,907,121
  145,907,658
  145,908,150
  145,908,364
  145,908,751
  145,908,825
  145,908,867
  145,909,737
  145,910,208
  145,910,740
  145,911,079
  145,911,386
  145,911,496
  145,911,511
  145,911,611
  145,912,167
  145,912,392
  145,912,427
  145,912,503
  145,912,587
  145,913,058
  145,913,121
  145,913,129
  145,913,173
  145,913,216
  145,913,217
  145,913,500
  145,914,547
  145,915,204
  145,915,371
  145,915,610
  145,915,654
  145,915,763
  145,915,796
  145,916,009
  145,916,945
  145,916,969
  145,917,509
  145,917,794
  145,917,992
  145,918,154
  145,918,254
  145,918,264
  145,918,455
  145,918,529
  145,918,912
  145,919,017
  145,919,186
  145,919,253
  145,919,285
  145,919,326
  145,919,330
  145,919,497
  145,919,531
  145,919,649
  145,919,747
  145,919,820
  145,920,098
  145,920,202
  145,920,378
  145,920,509
  145,920,533
  145,920,616
  145,920,845
  145,920,959
  145,920,967
  145,921,033
  145,921,044
  145,921,057
  145,921,067
  145,921,740
  145,921,808
  145,921,853
  145,921,877
  145,922,809
  145,923,528
  145,923,762
  145,924,961
  145,925,342
  145,925,576
  145,925,706
  145,929,107
  145,935,057
  145,935,066
  145,935,070
  145,949,531
  145,950,537
  145,955,297
  145,955,313
  145,981,293
  145,982,607
  145,982,614
  145,982,615
  145,982,619
  145,982,629
  145,982,634
  145,982,637
  145,989,331
  145,989,494
  145,989,583
  145,989,593
  145,989,668
  145,989,885
  145,989,931
  145,989,956
  145,990,031
  145,990,036
  145,990,050
  145,990,096
  145,990,104
  145,990,112
  145,990,117
  145,990,140
  145,990,143
  145,990,177
  145,990,197
  145,990,199
  145,990,203
  145,990,213
  145,990,228
  145,990,230
  146,004,834
  146,005,896
  146,016,086
  146,053,666
  146,053,705
  146,053,722
  146,053,735
  146,066,914
  146,066,918
  146,066,922
  146,066,927
  146,066,937
  146,066,943
  146,066,955
  146,066,961
  146,066,978
  146,066,981
  146,066,986
  146,066,993
  146,067,005
  146,067,020
  146,067,024
  146,067,039
  146,067,045
  146,067,060
  146,067,070
  146,067,076
  146,067,082
  146,067,087
  146,067,093
  146,067,094
  146,067,100
  146,067,110
  146,067,138
  146,067,171
  146,067,179
  146,067,188
  146,067,196
  146,067,199
  146,067,213
  146,067,219
  146,067,226
  146,067,247
  146,067,253
  146,067,292
  146,067,304
  146,067,320
  146,067,330
  146,067,336
  146,067,340
  146,067,343
  146,067,353
  146,067,354
  146,067,366
  146,067,445
  146,067,453
  146,067,461
  146,068,532
  146,068,552
  146,068,554
  146,068,562
  146,068,568
  146,068,577
  146,068,593
  146,070,996
  146,071,002
  146,071,005
  146,071,061
  146,071,062
  146,071,067
  146,074,226
  146,076,300
  146,076,301
A
A
A
C
-
C
A
T
G
G
G
T
T
A
T
C
C
C
G
C
C
G
C
C
-
C
A
A
G
T
2
-
-
-
T
-
A
-
G
T
T
G
C
C
A
C
T
G
C
C
A
C
T
C
G
A
C
T
A
G
A
T
G
C
C
C
T
A
G
T
C
C
C
C
T
A
T
A
5
C
A
A
A
C
G
-
T
A
C
A
T
2
A
-
A
G
C
A
A
6
A
T
A
A
G
-
C
A
T
A
2
T
A
C
G
G
C
-
A
A
C
6
-/4
T
-
T
C
T
-
A
G
T
A
A
G
C
T
4
G
2
A
C
T
C
3
2
T
A
C
A
A
C
C
C
C
C
T
A
T
A
T
C
G
10
-
-
-
A
C
G
G
A
A
A
A
G
C
C
C
T
C
T
A
T
A
A
C
C
C
A
C
A
A
A
T
G
T
A
G
G
-
G
T
C
T
A
G
G
C
4
-
T
C
G
C
G
-
G
G
6
A
T
T
C
2
G
T
T
C
T
C
T
G
A
A/A
-
T
T
-
A
A
-
C
C
C
C
A
G
A
T
T
A
-
7
A
3
4
G
G
G
C
C
T
C
-
-
-
2
C
3
T
C
T
C
A
-
-
G
-
T
G
-
A
A
-
-
-
-
15
T
27
G
-
T
A
G
G
-
C
-
-
G
-
-
T
T
-
C
A
A
-
A
A
T
T
A
G
G
C
T
T
C
G
T
C
G
G
-
G
A
C
T
G
A
T
G
C
G
G
C
G
T
C/A
C
C
G
C
-
2
G
C
-
-
C
C
A
G
C
A
G
T
A
C
T
T
C
C
-
A
C
C
A
T
G
A
A
T
T
T
A
T
C
C
A
-
T
A
G
-
A
-
G
T
A
C
C
C
C
G
C
T
T
G
T
T
A
T
T
T
G
C
C
G
C
G
C
-
-
-
-
C
-
-
A
C/T
-
T
T
-
A
-
A
-
-
-
-
-
G
C
-
2
G
A
G
A
G
G
3
2
G
G
2
2
G
G
A
-
T
C
C/T
C/A
T/A
G/T
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
C
A
A
-
-
A
T
2
-
-
C
T
-
-
-
C
C
C
A
C
C
-
C
C
T
C
A
A
T
A
-
-
T
-
-
G
A
-
-
-
2
C
-
G
-
T
-
-
T
G
-
T
C
A