Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 145,214 (bp)   Positions: 303
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.027
.001
.052
.227
.229
.225
.221
.131
.001
.001
.001
.001
.001
.004
.024
.011
.011
.008
.002
.002
.19
--
--
--
.0
.004
.014
.276
.279
.883
.037
.082
.001
.001
.0
.001
.104
.001
.001
.008
.005
.019
.028
.103
.0
.0
.0
.001
.007
.012
.002
.963
.147
.163
.016
.002
.001
.254
.1
.132
.0
.006
.007
--
.066
.007
.0
.003
.038
.002
.003
.001
.002
.093
.0
.001
.004
.002
.027
.001
.001
.001
.0
.022
.06
.026
.0
.023
.058
.007
.058
.094
.099
.124
.008
.005
.0
.065
.024
.006
.039
.034
.043
.011
.04
.003
.001
.017
.511
.017
.0
.033
.929
.992
1.0
.993
.488
1.0
.0
.0
.001
.012
.006
.049
.038
.754
.73
.127
.443
.003
.001
.0
.0
.001
.0
.0
.001
.004
.0
.005
.08
.126
.008
.017
.004
.0
.0
.029
.374
.999
.002
.0
.002
.036
.001
.0
.997
.045
.12
.045
.0
.0
.166
.0
.0
.0
.002
.0
.001
.001
.062
.009
.0
.0
.01
.0
.02
.002
.009
.055
.008
.0
.0
.987
.0
1.0
1.0
--
.975
.006
.97
.034
.109
.106
.042
--
--
--
--
--
--
--
.007
.522
.137
.007
.0
.001
.05
--
.002
.0
.0
.003
.134
.218
--
.049
.01
.005
.03
.035
.798
.194
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.24
.119
.177
.001
.027
.75
.003
.022
.64
.019
.014
.024
.001
.014
.0
.0
.829
.067
.0
.019
.013
.023
.089
1.0
1.0
.115
--
.401
.016
.034
.155
.005
.033
.0
.0
.0
.006
.071
.033
.003
.023
.025
.596
.259
.05
--
--
--
--
--
.045
.032
.0
.029
.0
.007
.084
.053
.098
.003
.305
.006
.077
.185
.007
.003
.047
.0
.014
.984
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
2
G
C
A
C
T
T
A
A
G
2
A
G
G
A
G
C
A
-
T
A
T
G
A
T
C
C
C
-
-
G
G
-
G
T
G
G
A
A
G
C
-
G
T
A
T
A
-
-
A
C
-
T
A
C
C
G
G
C
T
A
G
T
-
A
T
C
G
G
C
C
G
C
G
A
C
G
C
C
G
G
A
-
T
C
C
C
A
A
C
G
A
A
G
A
G
G
T
-
C
-
C
A
T
T
A
C
A
G
5
G
C
G
T
G
T
C
G
T
T
A
C
C
G
G
G
G
G
G
G
A
T
G
G
G
G
3
G
-
T
C
C
A
T
T
C
T
A
C
G
T
G
A
A
4
C
A
A
T
-
T
G
A
A
T
-
G
T
G
A
4
G
C
A
T
A
C
A
T
T
G
T
C
A
A
G
A
G
G
A
G
T
T
T
T
T
A
C
C
C
G
G
A
A
C
T
G
C
G
-
G
G
A
T
G
C
A
G
G
G
T
51
T
-
A
T
G
G
G
A
A
C
A
-
3
C
C
T
A
T
A
G
A
8
A
C
A
C
T
T
T
G
G
T
A
C
C
G
A
C
A
C
C
-
T
T
T
G
G
-
2
2
A
-
A
A
T
G
A
A
G
T
T
135
A
G
A
A
T
A
G
C
A
G
G
-
G
G
C
A
10
C
T
  58,934,269
  58,934,522
  58,934,648
  58,934,754
  58,934,759
  58,934,774
  58,934,778
  58,934,804
  58,935,031
  58,935,036
  58,935,059
  58,935,079
  58,935,083
  58,935,695
  58,936,108
  58,936,184
  58,936,329
  58,936,413
  58,936,901
  58,937,068
  58,937,234
  58,937,701
  58,937,754
  58,937,801
  58,938,024
  58,938,067
  58,938,191
  58,938,259
  58,938,890
  58,938,972
  58,939,423
  58,939,695
  58,939,863
  58,939,864
  58,939,868
  58,939,949
  58,940,126
  58,940,299
  58,940,445
  58,940,537
  58,940,555
  58,940,669
  58,940,784
  58,941,415
  58,941,517
  58,941,948
  58,942,403
  58,942,492
  58,942,871
  58,943,235
  58,943,548
  58,943,749
  58,943,829
  58,943,833
  58,944,183
  58,944,212
  58,944,659
  58,945,000
  58,945,288
  58,945,792
  58,946,825
  58,946,993
  58,947,289
  58,947,387
  58,947,577
  58,948,523
  58,948,545
  58,948,799
  58,949,408
  58,949,443
  58,949,445
  58,950,154
  58,950,182
  58,950,881
  58,950,911
  58,951,084
  58,951,179
  58,951,181
  58,951,183
  58,951,196
  58,951,199
  58,951,235
  58,951,895
  58,951,949
  58,952,555
  58,952,708
  58,953,368
  58,953,769
  58,953,780
  58,953,976
  58,954,131
  58,954,466
  58,954,524
  58,954,528
  58,954,567
  58,954,569
  58,954,606
  58,954,685
  58,954,852
  58,955,025
  58,955,333
  58,955,506
  58,955,798
  58,955,821
  58,955,827
  58,955,853
  58,955,860
  58,955,865
  58,956,847
  58,957,413
  58,958,032
  58,958,976
  58,959,961
  58,960,512
  58,960,612
  58,960,981
  58,961,181
  58,961,393
  58,962,319
  58,962,941
  58,963,307
  58,963,525
  58,963,703
  58,963,871
  58,963,875
  58,964,003
  58,964,006
  58,964,021
  58,964,392
  58,965,187
  58,965,367
  58,965,434
  58,965,435
  58,965,439
  58,965,444
  58,965,452
  58,965,454
  58,965,457
  58,965,706
  58,965,709
  58,965,847
  58,966,079
  58,966,269
  58,966,280
  58,966,944
  58,967,626
  58,967,690
  58,967,914
  58,968,008
  58,968,453
  58,968,800
  58,968,979
  58,969,042
  58,969,057
  58,969,090
  58,969,202
  58,969,913
  58,970,022
  58,970,773
  58,970,788
  58,971,536
  58,971,537
  58,971,677
  58,974,100
  58,974,184
  58,974,276
  58,974,694
  58,974,743
  58,974,840
  58,975,288
  58,975,881
  58,976,772
  58,976,858
  58,976,998
  58,977,098
  58,977,115
  58,977,168
  58,978,021
  58,978,411
  58,979,355
  58,979,722
  58,980,224
  58,980,227
  58,981,771
  58,982,038
  58,982,615
  58,984,238
  58,984,630
  58,985,992
  58,987,534
  58,988,791
  58,989,760
  58,989,793
  58,989,796
  58,990,248
  58,990,993
  58,990,998
  58,990,999
  58,991,020
  58,991,052
  58,991,144
  58,991,930
  58,992,169
  58,992,239
  58,992,935
  58,995,768
  58,996,246
  58,996,276
  58,996,574
  58,997,309
  58,997,454
  58,997,459
  58,997,490
  58,997,493
  58,998,175
  58,999,627
  59,001,303
  59,002,614
  59,003,441
  59,003,442
  59,004,224
  59,005,082
  59,006,566
  59,007,870
  59,009,062
  59,009,250
  59,009,922
  59,010,003
  59,010,207
  59,010,278
  59,011,083
  59,013,525
  59,014,248
  59,015,680
  59,016,497
  59,017,317
  59,017,403
  59,018,142
  59,018,841
  59,019,903
  59,021,444
  59,022,414
  59,023,478
  59,024,055
  59,026,729
  59,027,946
  59,027,970
  59,031,468
  59,033,300
  59,033,708
  59,034,622
  59,035,165
  59,037,562
  59,037,920
  59,038,941
  59,039,306
  59,039,908
  59,040,450
  59,040,640
  59,041,226
  59,041,551
  59,044,349
  59,045,764
  59,048,343
  59,050,254
  59,050,535
  59,050,868
  59,051,367
  59,051,417
  59,052,444
  59,052,758
  59,052,772
  59,053,122
  59,054,117
  59,054,988
  59,056,552
  59,056,617
  59,057,374
  59,058,096
  59,058,197
  59,058,262
  59,058,607
  59,060,969
  59,062,283
  59,063,793
  59,064,969
  59,065,017
  59,065,491
  59,065,821
  59,066,385
  59,066,747
  59,067,263
  59,069,254
  59,071,240
  59,072,056
  59,072,897
  59,072,982
  59,074,239
  59,075,412
  59,075,695
  59,076,998
  59,077,069
  59,077,513
-
A
A
G
T
C
C
G
G
-
-
G
C
C
G
A
A
G
5
C
C
C
C
G
C
T
A
T
38
-/2
A
C
3
-
-
A
T
T
G
A
T
T
A
C
G
C
T
G
T
-
T
A
C
T
G
T
A
A
A
A
G
C
C
5
C
C
A
A
T
T
A
C
-
A
T
T
A
T
A
A
C
-
3
C
T
A
A
T
G
T
C
G
C
A
G
A
T
C
16
T
16
T
G
C
C
-
A
-
A
-
A
T
C
C
A
C
T
A
C
-
G
A
-
-
-
T
T
A
T
T
G
G
A
A
C
C
-
C
G
A
T
T
G
A
C
A
-
C
T
A
A
A
G
G
-
A
G
G
C
2
C
A
G
T
C
5/A
T
C
A
C
-
T
A
T
C
G
T
G
C
C
T
C
T
G
T
A
G
T
A
G
A
C
C
C
G
T/A
A/C
C/T
C/A
C/G
G/A
A
T
G
A
C
A
T
A
T
A
A
G
C
A
T
G
C
-
A
C
-
C
A
G
C
A
T
G/T
G
T
T
-
12
-
A
-
A
G
C
T
A
G
-
G
T
T
T
A
C
C
A
A
-
G
T
T
T
-
G
G
T
T
A
C
C
-
A
A
15
-
-
G
T
G
G
C
A
A/T
A/G
G/A
A
C
135/-
G
A
C
T
A
T
A
T
C
C
A
11
A
A
T
G
-
T
G