Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 882,762 (bp)   Positions: 585
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.091
.002
.001
.101
.029
.004
.076
.003
.001
.002
.001
.005
.314
.081
.021
.005
.022
.002
.0
.0
.187
.001
.0
.001
.009
.113
--
.04
.132
.001
.028
.0
.006
.003
.001
.0
.0
.0
.001
.005
.002
.001
.156
.003
.003
.013
.005
.013
.005
.02
.017
.385
.247
.151
.07
.083
.004
.003
.01
.014
.052
.162
.029
.014
.016
.085
.206
.104
.006
--
.013
.074
.021
.001
.001
.0
.008
.008
.002
.005
.001
.001
.009
.041
.002
.0
.0
.006
.761
.401
.075
.0
.004
.002
.025
.001
.004
.001
.006
.002
.012
.0
.006
.002
.0
.008
.0
.001
.0
.005
.0
.0
.007
.002
.001
.006
.001
.017
.181
.0
.001
--
.473
.003
.002
.001
.001
.002
.01
.0
.081
.0
.0
.003
.005
.001
.004
.001
.0
.009
.001
.002
.006
.001
.914
.0
.965
.002
.002
.0
.402
.0
--
.006
.001
.0
.003
.009
.0
.019
.031
.025
.059
.0
.008
.759
.4
.0
.001
.006
.001
.037
.999
1.0
.002
.001
.004
.0
.233
.003
.056
.199
.014
.048
.028
.003
.013
.073
.15
.616
.513
.018
.024
.057
.028
--
--
.083
.033
.175
.012
--
--
.06
.043
.033
.554
.173
.002
.002
.004
.012
.014
.003
.131
.119
.004
.011
--
--
--
--
--
.092
.044
--
.025
.003
.005
.003
.024
.123
.052
.003
.0
.001
.0
.003
.014
.0
.012
.01
.003
.044
.0
.001
.004
.0
.001
.006
.0
.021
.011
.001
.0
.0
.002
.0
.423
.049
.0
.0
.005
.002
.03
.003
.069
.0
.471
.051
.001
.001
.561
.0
.005
.828
.003
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.002
.001
.001
.002
.0
.0
--
.011
.001
.001
.0
.518
.0
.025
.0
.0
.0
.0
.042
.019
.0
.001
.0
.028
.009
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.006
.006
.0
.026
.012
.0
.116
.012
.022
.0
.002
.015
.796
.0
.006
.085
.0
.748
.001
.0
.0
.005
.0
.0
.025
.005
.02
.004
.054
1.0
.258
.0
.063
.031
.127
.01
.034
.013
.004
.004
.003
.001
.002
.016
.004
.003
.634
.099
.291
.003
.005
.008
.076
.001
.018
.028
.001
.051
.027
.001
.01
.001
.019
.515
.029
.187
.6
.294
.013
.259
.25
.166
.661
.002
.011
.003
.002
.017
.011
.052
.0
.0
.011
.001
.024
.02
.001
.001
.008
.021
.515
.014
.009
.011
.003
.0
.0
.529
.005
.01
.01
.253
.003
.003
.003
.001
.003
.0
.0
.0
.147
.001
.001
.049
.001
.0
.0
.033
.047
.035
.013
.167
.014
.039
.127
.001
.0
.134
--
.001
.344
.001
.0
.085
.129
.0
.0
.459
.005
.001
.015
.007
.007
--
.123
.003
.002
.234
.001
.165
.0
.001
.002
.001
.013
--
--
.0
.002
.009
.001
.0
.001
.08
.004
.0
.001
.26
.003
.0
.009
.54
.093
.006
.001
.037
.0
.005
.463
.009
--
.001
.0
.0
.0
.001
.978
.995
.098
.001
.001
.002
.0
.004
.0
.009
.005
.01
.582
.0
.002
.011
.001
.0
.031
.019
.001
.201
.002
.003
.0
.007
.002
.0
.0
.004
.02
.067
.01
.022
.012
.001
.256
.012
.113
.119
.008
.002
.001
.001
.001
.149
.0
.019
.002
.01
.001
.001
.002
.0
.027
.0
.001
.002
.03
.277
.288
.002
.019
.04
.0
.035
.0
.001
.001
.01
.0
.0
.047
.124
.003
.004
.014
.093
.006
.142
.055
.0
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
G
G
A
C
G
T
G
A
T
A
A
C
G
G
T
G
T
T
T
C
A
A
G
G
C
C
A
G
G
C
C
C
A
T
A
A
G
A
C
A
C
C
T
G
T
T
T
A
A
A
C
A
A
G
C
A
A
C
G
T
G
C
T
T
C
G
G
C
T
C
T
A
A
G
A
A
G
T
G
C
C
T
G
G
A
C
C
A
G
T
C
C
A
A
T
G
T
G
G
A
G
C
C
T
C
C
G
G
G
C
T
C
C
T
A
G
C
T
T
A
G
C
T
T
A
A
A
A
T
G
G
G
T
G
C
C
G
G
G
C
C
A
C
C
T
G
T
A
A
G
T
G
T
C
G
T
G
G
T
T
C
A
C
C
A
C
A
C
C
A
A
A
C
A
G
G
G
G
T
G
A
C
T
T
A
G
C
C
A
T
T
A
G
G
C
G
C
G
T
T
G
C
G
C
G
A
A
G
T
G
T
T
C
C
G
A
T
A
C
C
A
T
C
T
C
T
G
G
C
T
C
A
T
T
T
C
C
A
T
T
T
A
G
A
G
C
C
C
A
T
T
G
G
G
T
G
T
C
A
C
G
G
G
A
G
G
A
C
T
G
G
T
T
T
C
T
G
C
G
T
G
C
C
G
G
G
T
A
G
G
A
A
C
A
C
G
G
A
G
A
C
A
T
C
T
T
C
T
T
G
T
G
T
C
T
A
G
A
G
A
T
C
G
A
G
G
C
A
A
C
G
A
G
T
C
C
G
T
G
G
C
T
G
A
T
G
C
C
A
A
T
A
G
T
T
G
G
T
G
A
C
G
A
A
T
G
G
A
A
T
C
A
A
C
C
A
C
A
T
C
T
T
A
G
G
A
A
T
G
A
A
C
A
A
C
C
G
G
A
C
T
G
A
C
A
T
C
G
T
C
G
G
T
G
A
G
A
C
C
C
G
A
A
A
G
T
A
G
G
T
T
T
G
A
G
G
T
C
C
C
T
T
T
C
A
A
G
G
C
C
G
A
C
G
T
A
C
T
A
G
A
A
C
T
A
A
C
T
C
T
T
G
T
G
G
A
G
G
G
C
C
A
G
A
G
A
G
G
C
A
T
C
A
T
A
A
T
T
A
G
G
G
G
C
A
T
T
C
T
A
C
G
A
G
A
C
C
A
T
G
A
A
A
T
G
C
C
G
C
A
T
G
T
A
A
G
A
C
A
G
G
T
G
G
C
G
A
C
A
G
G
T
G
C
T
C
A
C
G
T
C
C
A
G
A
T
T
A
T
A
A
A
A
G
A
T
A
T
C
G
C
C
C
  118,279,418
  118,280,566
  118,280,770
  118,281,378
  118,281,444
  118,283,471
  118,283,724
  118,284,013
  118,284,994
  118,285,095
  118,285,177
  118,285,379
  118,285,885
  118,286,070
  118,286,907
  118,287,009
  118,287,318
  118,287,477
  118,287,724
  118,287,935
  118,288,344
  118,288,892
  118,289,435
  118,289,638
  118,290,062
  118,290,430
  118,291,732
  118,292,030
  118,292,627
  118,293,560
  118,293,640
  118,293,699
  118,294,026
  118,294,109
  118,294,589
  118,294,713
  118,295,113
  118,295,384
  118,295,550
  118,295,876
  118,296,408
  118,297,039
  118,297,392
  118,298,830
  118,299,765
  118,300,399
  118,300,556
  118,300,745
  118,300,760
  118,300,852
  118,300,869
  118,300,956
  118,301,002
  118,301,140
  118,301,238
  118,301,239
  118,301,314
  118,301,357
  118,301,434
  118,301,629
  118,301,659
  118,301,671
  118,301,743
  118,301,775
  118,301,776
  118,301,805
  118,301,884
  118,302,356
  118,303,064
  118,303,931
  118,304,578
  118,304,765
  118,304,821
  118,364,786
  118,487,541
  118,504,569
  118,504,971
  118,504,974
  118,567,777
  118,624,584
  118,630,374
  118,632,126
  118,634,202
  118,634,212
  118,658,018
  118,658,054
  118,658,055
  118,658,096
  118,688,890
  118,688,926
  118,688,957
  118,710,168
  118,737,071
  118,737,076
  118,798,165
  118,798,765
  118,798,768
  118,809,872
  118,810,261
  118,812,269
  118,813,662
  118,814,758
  118,815,291
  118,815,610
  118,815,865
  118,817,094
  118,817,228
  118,817,519
  118,817,571
  118,817,970
  118,818,882
  118,818,949
  118,819,543
  118,820,314
  118,820,491
  118,820,655
  118,821,522
  118,822,771
  118,823,297
  118,823,521
  118,823,641
  118,823,820
  118,824,358
  118,825,009
  118,825,190
  118,825,502
  118,825,767
  118,827,088
  118,827,120
  118,828,061
  118,828,199
  118,829,414
  118,829,428
  118,829,546
  118,829,785
  118,829,793
  118,830,017
  118,830,036
  118,830,284
  118,830,767
  118,830,998
  118,831,025
  118,831,232
  118,833,578
  118,835,795
  118,836,561
  118,838,596
  118,841,252
  118,841,435
  118,842,473
  118,843,562
  118,843,977
  118,844,499
  118,845,348
  118,845,741
  118,846,106
  118,846,168
  118,846,857
  118,847,103
  118,847,812
  118,848,469
  118,848,471
  118,848,502
  118,848,563
  118,848,652
  118,848,803
  118,848,977
  118,849,547
  118,849,576
  118,849,803
  118,850,610
  118,851,239
  118,851,805
  118,851,807
  118,852,615
  118,853,547
  118,853,746
  118,855,166
  118,856,007
  118,856,331
  118,857,288
  118,857,859
  118,858,101
  118,858,231
  118,858,965
  118,858,993
  118,859,279
  118,859,304
  118,860,196
  118,861,947
  118,861,960
  118,862,106
  118,862,185
  118,862,257
  118,862,267
  118,862,472
  118,862,510
  118,862,628
  118,862,711
  118,863,100
  118,863,287
  118,863,301
  118,863,302
  118,866,279
  118,866,751
  118,867,631
  118,867,739
  118,869,642
  118,869,686
  118,870,667
  118,872,049
  118,872,414
  118,873,052
  118,876,075
  118,876,126
  118,876,138
  118,876,374
  118,876,391
  118,876,530
  118,876,630
  118,876,856
  118,877,016
  118,877,126
  118,877,603
  118,877,721
  118,878,275
  118,878,479
  118,878,536
  118,878,695
  118,878,699
  118,879,029
  118,879,941
  118,880,094
  118,880,790
  118,880,995
  118,881,530
  118,881,555
  118,881,677
  118,881,740
  118,883,538
  118,884,056
  118,884,609
  118,884,716
  118,884,898
  118,885,954
  118,886,064
  118,886,123
  118,888,620
  118,890,075
  118,890,809
  118,891,657
  118,891,953
  118,891,954
  118,892,080
  118,893,234
  118,893,484
  118,894,130
  118,896,403
  118,896,779
  118,897,270
  118,901,583
  118,902,347
  118,904,555
  118,906,301
  118,914,548
  118,915,619
  118,915,873
  118,916,872
  118,917,920
  118,918,009
  118,918,024
  118,918,523
  118,918,874
  118,920,424
  118,921,210
  118,922,031
  118,922,258
  118,922,737
  118,922,778
  118,923,639
  118,923,858
  118,923,946
  118,923,950
  118,924,007
  118,924,682
  118,925,168
  118,925,204
  118,927,129
  118,928,077
  118,928,698
  118,934,680
  118,934,741
  118,934,770
  118,935,143
  118,935,209
  118,935,419
  118,935,681
  118,935,944
  118,935,978
  118,936,151
  118,936,482
  118,937,898
  118,939,522
  118,939,658
  118,939,945
  118,939,947
  118,939,965
  118,939,995
  118,940,510
  118,940,553
  118,940,618
  118,940,830
  118,941,058
  118,941,065
  118,941,135
  118,941,549
  118,941,961
  118,942,035
  118,942,513
  118,942,972
  118,943,628
  118,943,672
  118,943,869
  118,944,105
  118,944,311
  118,944,348
  118,947,179
  118,948,504
  118,950,405
  118,951,732
  118,954,888
  118,955,306
  118,955,665
  118,955,779
  118,956,084
  118,957,518
  118,957,836
  118,958,159
  118,958,355
  118,958,530
  118,958,624
  118,958,986
  118,959,017
  118,959,202
  118,959,549
  118,960,168
  118,962,499
  118,962,853
  118,963,377
  118,964,039
  118,964,080
  118,964,652
  118,965,013
  118,965,719
  118,968,032
  118,968,859
  118,969,609
  118,969,819
  118,969,828
  118,969,956
  118,970,078
  118,970,465
  118,970,549
  118,970,580
  118,970,804
  118,971,315
  118,971,367
  118,971,524
  118,971,708
  118,971,897
  118,971,916
  118,972,051
  118,972,412
  118,972,513
  118,972,623
  118,972,640
  118,972,669
  118,972,726
  118,972,770
  118,972,791
  118,972,808
  118,972,901
  118,972,978
  118,973,259
  118,973,292
  118,973,728
  118,973,797
  118,973,798
  118,973,888
  118,973,972
  118,974,018
  118,974,171
  118,974,242
  118,974,731
  118,975,485
  118,976,104
  118,976,475
  118,976,555
  118,976,761
  118,976,880
  118,976,895
  118,977,344
  118,977,596
  118,977,967
  118,977,968
  118,979,056
  118,979,612
  118,980,772
  118,981,753
  118,981,754
  118,982,697
  118,983,445
  118,983,470
  118,983,537
  118,985,495
  118,985,852
  118,986,013
  118,986,429
  118,987,459
  118,987,843
  118,988,595
  118,988,810
  118,988,940
  118,989,127
  118,992,118
  118,992,432
  118,992,722
  118,993,931
  118,994,847
  118,994,947
  118,995,125
  118,995,558
  118,995,574
  118,996,056
  118,996,196
  118,996,198
  118,996,204
  118,996,239
  118,996,316
  118,997,472
  118,997,519
  118,997,522
  118,997,853
  118,998,035
  118,998,746
  118,999,164
  118,999,452
  118,999,606
  118,999,625
  118,999,735
  119,000,845
  119,001,036
  119,001,062
  119,001,088
  119,001,596
  119,002,375
  119,002,380
  119,002,666
  119,003,830
  119,004,309
  119,004,996
  119,005,295
  119,006,112
  119,006,837
  119,007,204
  119,007,886
  119,008,090
  119,008,180
  119,008,503
  119,008,766
  119,008,769
  119,008,937
  119,009,167
  119,009,200
  119,009,642
  119,009,711
  119,009,854
  119,009,863
  119,009,898
  119,010,060
  119,010,358
  119,010,879
  119,010,928
  119,011,036
  119,011,123
  119,011,184
  119,011,477
  119,012,085
  119,012,184
  119,012,204
  119,012,230
  119,012,401
  119,012,672
  119,012,926
  119,013,254
  119,013,384
  119,013,546
  119,013,777
  119,014,269
  119,014,278
  119,014,410
  119,014,437
  119,014,616
  119,014,908
  119,014,941
  119,015,318
  119,015,346
  119,015,372
  119,015,583
  119,016,257
  119,016,803
  119,017,089
  119,017,099
  119,017,484
  119,017,823
  119,018,274
  119,018,749
  119,019,011
  119,019,310
  119,020,411
  119,021,090
  119,021,575
  119,021,867
  119,022,232
  119,022,309
  119,022,545
  119,023,428
  119,024,012
  119,024,137
  119,024,331
  119,024,343
  119,024,598
  119,026,842
  119,027,080
  119,030,846
  119,031,130
  119,031,225
  119,032,082
  119,032,801
  119,036,254
  119,036,862
  119,039,996
  119,040,165
  119,040,274
  119,041,358
  119,041,482
  119,041,658
  119,041,674
  119,042,944
  119,044,395
  119,045,760
  119,049,604
  119,050,082
  119,050,265
  119,050,393
  119,050,718
  119,051,052
  119,051,804
  119,051,955
  119,052,340
  119,052,582
  119,052,591
  119,053,329
  119,053,343
  119,053,792
  119,054,524
  119,054,642
  119,055,303
  119,055,429
  119,056,034
  119,056,056
  119,056,678
  119,063,319
  119,064,044
  119,066,187
  119,066,445
  119,066,513
  119,066,714
  119,067,886
  119,068,167
  119,069,383
  119,073,883
  119,075,017
  119,080,787
  119,089,097
G
C
A
T
C
T
C
C
A
G
C
G
T
T
A
T
C
A
C
C
C
T
G
G
A
A
A
T
G
T
T
T
T
T
G
C
T
G
T
T
T
G
T
T
G
C
C
C
C
G
C
T
T
G
C
A
T
C
G
T
A
C
A
T
C
A
T
A
A
T
G
T
C
A/C
G
A
C
C
A
G
T
A
T
C
A
A
G
A
G
G
C
G
A
G
G
T
A
A
C
A
A
G
A
T
T
C
A
T
C
A
A
T
G
T
T
A
C
A
G
C
G
C
A
A
C
A
G
G
G
C
A
A
A
C
C
A
T
T
A
A
A
T
T
G
T
T
C
C
C
G
G
T
G
A
C
T
A
C
A
C
A
C
T
G
T
A
G
G
C
T
T
T
T
T
T
G
A
A
T
A
C
A
G
A
C
G
G
A
T
G
G
C
C
G
C
A
T
C
G
T
C
G
T
T
A
T
T
G
G
A
C
A
C
C
T
G
A
G
C
G
A
T
G
A
T
C
T
A
A
A
T
C
T
G
C
C
C
T
T
G
C
C
G
G
C
G
A
T
T
T
G
C
C
A
A
A
C
A
C
T
G
G
A
A
A
G
A
C
G
T
C
A
A
C
G
A
T
C
A
T
T
G
A
T
T
T
A
A
G
T
C
A
G
G
T
G
T
A
A
G
A
G
T
G
G
T
A
C
T
C
C
C
A
T
A
T
C
G
A
G
C
C
C
T
A
C
A
C
A
T
G
T
A
G
A
C
A
T
A
C
A
A
G
A
C
G
G
C
T
T
G
G
C
G
C
C
C
A
A
G
A
G
T
T
G
G
C
A
A
G
G
C
T
C
G
G
T
G
A
G
C
T
C
C
G
A
A
C
T
G
T
G
G
T
T
G
T
T
A
A
C
T
C
A
C
T
G
C
T
A
C
T
A
T
G
C
G
A
C
T
T
T
A
G
G
G
A
A
G
A
A
C
G
A
A
G
A
A
C
A
G
T
C
G
C
T
G
G
A
A
G
G
A
G
T
T
C
G
T
A
T
A
G
G
T
C
G
C
T
C
T
A
C
A
C
A
A
G
T
A
A
A
T
T
A
G
A
T
A
A
A
G
A
A
G
A
T
C
G
C
G
A
T
A
C
T
T
C
C
A
A
T
T
T
G
A
G
T
T
G
A
A
G
T
T
G
A
T
T
A
T
G
C
A
C
G
G
A
G
T
G
A
A
C
A
C
T
A
T
G
G
A
A
C
A
T
C
T
G
A
A
C
T
T
G
A
C
A
C
C
C
C
G
G
G
A
G
A
G
G
T
A
T
G
G