Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 882,762 (bp)   Positions: 499
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.036
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.149
.003
.002
.116
--
--
.002
.001
.046
.0
.003
.001
.0
.084
.008
.029
.007
.002
.002
.003
.008
.01
.004
.003
.084
.006
.104
.016
.008
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.021
.001
.027
.009
.003
.001
.004
.006
.008
.007
.005
.004
.036
.029
--
.002
.008
.008
.001
.005
.085
.016
.039
.003
.002
.005
.008
--
--
--
--
--
.041
.013
.009
.039
.014
.02
.014
.002
.001
.005
.015
.004
.002
.025
.001
.0
.001
.0
.01
.012
.011
.016
.008
.024
.002
.001
.007
--
--
--
--
.002
.148
.133
.001
--
.024
.003
.0
.001
.001
.015
.003
.014
.278
.222
.033
.007
.001
.005
.002
.001
.002
.004
.006
.072
.059
.026
.004
.008
.0
.0
.02
.004
.023
.003
.002
.002
.002
.022
.008
.005
.003
.001
.008
.031
.037
.014
.133
.124
.059
.067
.016
.022
.0
.044
.025
.018
.002
.158
.008
.009
.041
.325
.046
.021
.203
.006
.089
.07
.003
.027
.001
.003
.005
.002
.011
.007
.058
.005
.008
.067
.002
.004
.0
.005
--
--
--
.244
.467
.605
.967
.863
.22
.009
.0
.004
.001
.041
.045
.007
.001
.032
.001
.002
.001
.0
.0
.0
.001
.001
.002
.007
.488
.08
.021
.006
.014
--
--
--
--
.114
.256
.19
.029
.053
.09
.97
.985
.571
.456
.358
.003
.001
.019
.078
.15
.592
.753
.881
.497
.4
.001
.001
.003
.002
.016
.007
.001
.001
.0
.0
.0
.001
.006
.002
.001
.003
.0
.007
.149
.001
.001
.001
.761
.401
.456
.581
.075
--
--
--
--
--
.001
.006
.0
.001
.003
.001
.003
.005
.0
.092
.182
.304
.216
.14
.145
.126
.073
.051
.02
.008
.012
.007
.005
.023
.048
.031
.029
.038
.043
.069
.017
.011
.025
.011
.022
.016
.005
.009
.005
.011
.033
.06
.059
.087
.183
.18
.054
.05
.056
.004
.036
.043
.042
.023
.004
.001
.001
.003
.002
.001
.003
.001
.013
.013
.011
.004
.001
.03
.02
.001
.003
.003
.009
.009
.008
.003
.01
.009
.005
.006
.003
.019
.012
.007
.113
.065
.01
.001
.01
.011
.004
--
.005
.004
.003
.002
.013
.0
--
--
--
.21
.211
--
--
--
--
--
--
.004
.001
.002
.006
.007
.011
.01
.002
.007
.064
.094
.031
.029
.007
.002
.002
.016
.011
.006
.005
.022
.013
.006
.005
.007
.009
.001
.0
.003
.001
.004
.0
.009
.01
.001
.003
.002
.0
.006
.002
.008
.007
.044
.036
.486
.813
.037
.007
.261
.665
.778
.987
.878
.845
.053
.052
.175
.397
--
--
--
--
.016
.006
.014
.02
.056
.001
.0
.581
.092
.021
.753
.997
.998
.999
1.0
1.0
.997
1.0
.803
.0
.003
.002
.002
.001
--
--
.017
.001
.005
.005
.023
.003
--
--
.014
.002
.0
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
Dlgap1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102555426
--
-
T
C
C
G
C
T
T
C
G
A
-
-
C
C
A
-
A
-
G
G
-
-
-
T
T
A
T
2
G
G
G
G
G
3
G
-
C
A
A
C
10
T
T
T
-
-
-
G
-
2
-
A
C
10
-
C
C
C
C
-
7
2
C
C
C
2
2
T
-
-
A
-
-
-
G
-
G
-
C
-
4
G
G
10
-
-
G
A
C
C
C
-
2
C
T
-
3
-
C
A
C
T
C
C
C
2
C
T
3
-
-
A
G
C
10
2
C
C
-
G
T
-
-
2
-
A
G
-
2
2
A
-
3
T
4
T
3
T
2
T
2
G
3
-
G
T
-
-
G
-
G
G
A
-
T
-
-
-
A
-
3
G
-
G
-
-
-
2
-
-
T
-
C
-
A
C
T
A
A
C
-
G
T
T
-
-
G
2
C
T
-
C
C
-
A
A
-
-
G
C
G
T
-
C
C
G
2
-
A
C
-
-
-
T
-
G
T
4
T
G
-
-
C
A
G
C
G
-
G
3
T
2
7
-
G
C
2
-
2
-
2
-
A
A
2
T
3
2
A
C
2
2
C
-
C
A
C
2
G
G
C
G
G
T
-
T
G
A
T
4
C
C
T
-
G
G
2
T
T
2
C
A
A
T
G
-
T
G
C
C
A
-
T
G
A
T
-
C
G
G
C
-
-
A
-
2
C
A
3
A
G
-
C
A
A
4
A
T
2
A
T
T
G
G
C
A
G
C
T
G
-
-
-
-
T
G
C
A
T
-
3
-
-
C
-
C
C
C
C
-
-
C
-
A
A
G
-
G
T
A
T
T
-
A
C
C
A
C
-
A
2
C
3
C
-
T
G
A
-
-
-
G
-
C
C
C
-
A
C
T
A
G
G
A
T
A
G
G
G
G
-
G
C
C
T
-
G
G
C
3
-
G
C
C
C
-
C
A
G
G
G
2
C
C
G
T
-
-
A
T
G
-
5
G
-
T
3
2
A
C
C
C
A
C
-
G
T
A
-
C
G
G
G
T
A
G
A
T
G
-
A
-
T
-
-
T
4
-
-
C
C
-
-
C
G
-
A
2
G
-
T
-
-
-
-
A
A
C
A
G
C
T
T
T
2
G
A
-
  118,281,660
  118,329,416
  118,330,972
  118,331,031
  118,338,285
  118,380,344
  118,380,379
  118,380,387
  118,380,393
  118,380,395
  118,385,669
  118,414,463
  118,460,231
  118,460,614
  118,469,180
  118,477,173
  118,477,199
  118,487,541
  118,494,660
  118,504,569
  118,504,624
  118,504,671
  118,504,681
  118,504,698
  118,504,840
  118,504,859
  118,504,863
  118,504,865
  118,504,868
  118,504,873
  118,504,876
  118,504,878
  118,504,896
  118,504,899
  118,504,915
  118,504,944
  118,504,962
  118,504,970
  118,504,971
  118,504,974
  118,527,875
  118,528,170
  118,528,296
  118,528,298
  118,528,386
  118,536,166
  118,536,169
  118,536,176
  118,536,177
  118,536,185
  118,536,206
  118,536,213
  118,536,218
  118,543,925
  118,543,930
  118,543,943
  118,543,947
  118,543,950
  118,543,955
  118,543,958
  118,543,960
  118,543,962
  118,543,970
  118,543,972
  118,543,974
  118,544,049
  118,544,056
  118,549,006
  118,567,479
  118,567,500
  118,567,505
  118,567,512
  118,567,540
  118,567,604
  118,567,674
  118,567,710
  118,567,775
  118,567,777
  118,567,796
  118,567,838
  118,568,682
  118,568,686
  118,576,956
  118,576,961
  118,576,970
  118,577,499
  118,577,505
  118,577,526
  118,577,533
  118,583,287
  118,583,295
  118,583,298
  118,583,308
  118,583,314
  118,583,323
  118,583,327
  118,583,341
  118,583,342
  118,583,370
  118,583,385
  118,583,389
  118,583,392
  118,583,417
  118,583,427
  118,583,429
  118,583,432
  118,583,445
  118,583,454
  118,583,469
  118,583,475
  118,583,483
  118,583,509
  118,583,514
  118,583,518
  118,583,520
  118,583,530
  118,585,149
  118,590,169
  118,590,178
  118,606,704
  118,623,834
  118,624,435
  118,624,439
  118,624,442
  118,624,448
  118,624,455
  118,624,480
  118,624,504
  118,624,527
  118,624,550
  118,624,558
  118,624,565
  118,624,569
  118,624,576
  118,624,584
  118,624,586
  118,624,591
  118,624,598
  118,624,602
  118,624,605
  118,624,618
  118,624,621
  118,624,623
  118,624,630
  118,630,289
  118,630,298
  118,630,299
  118,630,312
  118,630,334
  118,630,839
  118,630,849
  118,630,851
  118,630,857
  118,630,858
  118,630,878
  118,630,887
  118,630,889
  118,630,892
  118,630,900
  118,630,910
  118,630,916
  118,630,920
  118,630,935
  118,630,964
  118,631,053
  118,631,064
  118,631,078
  118,631,146
  118,631,156
  118,633,411
  118,634,065
  118,634,081
  118,634,084
  118,634,092
  118,634,138
  118,634,154
  118,634,202
  118,634,212
  118,634,222
  118,634,288
  118,634,289
  118,641,177
  118,644,519
  118,644,616
  118,644,620
  118,644,627
  118,644,635
  118,644,866
  118,644,943
  118,644,947
  118,644,960
  118,644,980
  118,644,985
  118,645,008
  118,645,065
  118,645,075
  118,645,084
  118,645,123
  118,645,129
  118,645,135
  118,645,154
  118,645,258
  118,645,259
  118,645,264
  118,647,409
  118,647,418
  118,647,421
  118,647,431
  118,647,463
  118,647,471
  118,647,483
  118,647,489
  118,647,505
  118,647,567
  118,647,583
  118,647,595
  118,647,649
  118,647,652
  118,652,252
  118,654,602
  118,654,607
  118,654,621
  118,654,624
  118,654,638
  118,654,640
  118,654,655
  118,654,661
  118,654,671
  118,654,677
  118,654,697
  118,654,720
  118,654,725
  118,654,728
  118,654,735
  118,656,641
  118,656,648
  118,656,668
  118,656,673
  118,656,704
  118,656,714
  118,656,738
  118,656,743
  118,656,759
  118,656,761
  118,656,774
  118,656,783
  118,656,800
  118,656,803
  118,656,810
  118,656,846
  118,656,849
  118,656,873
  118,656,877
  118,656,880
  118,656,894
  118,656,899
  118,656,912
  118,656,928
  118,656,932
  118,656,967
  118,656,969
  118,657,996
  118,658,018
  118,658,027
  118,658,033
  118,658,038
  118,658,047
  118,658,054
  118,658,055
  118,658,064
  118,658,073
  118,658,096
  118,658,104
  118,658,128
  118,658,153
  118,658,191
  118,658,195
  118,658,230
  118,658,238
  118,658,241
  118,658,245
  118,688,890
  118,688,926
  118,688,931
  118,688,940
  118,688,957
  118,698,674
  118,706,924
  118,706,987
  118,707,002
  118,707,010
  118,709,958
  118,709,971
  118,710,168
  118,710,174
  118,710,245
  118,710,297
  118,710,324
  118,710,333
  118,710,336
  118,718,277
  118,718,286
  118,718,308
  118,718,318
  118,718,322
  118,718,328
  118,718,333
  118,718,338
  118,718,346
  118,718,356
  118,718,363
  118,718,366
  118,718,373
  118,718,385
  118,718,389
  118,718,396
  118,718,403
  118,718,412
  118,718,415
  118,718,418
  118,718,431
  118,718,439
  118,718,447
  118,718,472
  118,718,478
  118,718,491
  118,718,492
  118,718,495
  118,718,514
  118,718,519
  118,718,534
  118,718,537
  118,718,545
  118,718,546
  118,718,549
  118,718,565
  118,718,570
  118,718,612
  118,718,613
  118,718,616
  118,718,633
  118,718,642
  118,718,654
  118,718,655
  118,718,657
  118,718,665
  118,718,670
  118,718,672
  118,718,675
  118,718,677
  118,718,685
  118,718,691
  118,718,704
  118,718,711
  118,718,712
  118,718,715
  118,718,718
  118,718,721
  118,718,729
  118,718,750
  118,718,758
  118,718,762
  118,718,771
  118,718,776
  118,718,778
  118,718,786
  118,718,807
  118,718,817
  118,718,820
  118,718,828
  118,718,835
  118,718,842
  118,718,852
  118,718,854
  118,718,865
  118,718,894
  118,718,935
  118,718,983
  118,718,987
  118,718,991
  118,719,006
  118,719,009
  118,720,865
  118,734,005
  118,737,071
  118,737,075
  118,737,076
  118,742,355
  118,759,530
  118,760,488
  118,760,555
  118,760,670
  118,769,178
  118,769,185
  118,783,848
  118,784,051
  118,786,850
  118,789,263
  118,789,742
  118,789,748
  118,798,488
  118,798,496
  118,798,506
  118,798,513
  118,798,515
  118,798,517
  118,798,520
  118,798,524
  118,798,527
  118,798,535
  118,798,547
  118,798,557
  118,798,565
  118,798,572
  118,798,586
  118,798,594
  118,798,604
  118,798,620
  118,798,626
  118,798,627
  118,798,634
  118,798,639
  118,798,652
  118,798,668
  118,798,681
  118,798,693
  118,798,735
  118,798,739
  118,798,759
  118,798,765
  118,798,768
  118,798,780
  118,798,784
  118,798,788
  118,798,800
  118,798,805
  118,798,808
  118,798,815
  118,799,069
  118,799,074
  118,799,080
  118,799,082
  118,799,090
  118,799,095
  118,799,106
  118,799,114
  118,799,135
  118,799,141
  118,799,170
  118,799,180
  118,799,188
  118,799,207
  118,799,213
  118,799,216
  118,799,248
  118,862,919
  118,863,100
  118,863,127
  118,863,301
  118,863,302
  118,863,694
  118,878,359
  118,879,267
  118,879,273
  118,879,278
  118,879,289
  118,879,296
  118,908,437
  118,909,315
  118,909,335
  118,909,517
  118,910,332
  118,910,354
  118,910,374
  118,910,398
  118,910,406
  118,910,414
  118,910,476
  118,910,548
  118,910,560
  118,910,569
  118,910,586
  118,910,613
  118,910,625
  118,910,640
  118,910,666
  118,929,947
  118,930,107
  118,932,756
  118,932,768
  118,976,202
  118,976,218
  118,980,156
  118,980,175
  118,980,183
  119,025,361
  119,073,879
  119,093,007
  119,114,683
6
G
T
G
-
-
-
-
T
C
A/-
14
6
T
A
-
A
G
5
A
-
A
T
C
-
-
-
G
-
C
-
C
-
C
-
-
A
T
C
C
C/T
10/-
T/A
T/G
T/A
T
C
A
T
G
-
2
-
-
-
3
A
A
-
-
6
-
-
A
-
-
-
2/-
-
A
A
-
C
C
A
-
2
A
C
-
2
-
-
-
-
G
2
A
-
-
A
-
T
-
-
-
2
-
C
-
-
T
-
A
-
-
-
-
-
-
G
T
-
T
G
-
-
T
G
24
-
-
A
G
-
A
-
-
T
-
-
-
G
-
G
-
-
-
-
-
G
-
T
-
G
A
G
T
G
-
T
-
A
G
G
G
G
G
T
T
T
-
T
T
-
A
22
T
-
A
C
A
T
-
C
-
T
C
-
T
A
A
-
-
-
C
C
-
-
-
-
C
-
-
T
-
-
T
T
-
-
T
C
T
T
-
-
-
T
C
-
A
A
A
-
C
-
-
-
-
-
T
C
-
C
A
-
-
A
T/A
-
-
-
-
T
-
G
-
C
-
T
-
G
-
-
-
G
-
-
T
-
-
-
T
G
-
-
-
-
T
C
-
A
-
-
T
-
A
G
-
-
A
-
-
G
-
T
-
-
-
-
G
G
-
-
C
3
T/C
G/A
C/T
C/T
C
G
G
-
-
-
G
-
-
-
G/T
G
A
-
C
-
-
-
-
-
T
7
-
-
-
-
T
C
-
-
-
G
-
-
G
C
-
T
-
-
T
T
T
T
-
T
A
G
-
GA/T
-
A
A
T
T
G
-
-
G
A
A
-
2
G
-
T
G
-
-
G
G
G
T
G
-
-
-
-
A
-
-
-
-
-
T
-
-
-
2
C
A
G/T
G
A
-
G
A
-
G
C
T
-
-
A/-
T/A
A/G
G/A
A
-
-
C
-
T
T
A
G
A
-
A
-
A
-
G
-
-
C
-
G
A
-
-
-
-
-
-
-
T
C
T
A
-
C
-
-
T
A
-
-
-
-
-
-
-
-
T
T
-
-
A
-
-
-
-
-
-
T
-
G
T
G
-
C
C
C
C
C
-
G
T
-
-
A
C
T
-
A
-
-
T
G
-
G
T
T
2
-
-
-
-
C
T
G
-
A
2/-
-
A/-
-/A