Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 293,135 (bp)   Positions: 437
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.003
.0
.0
.03
.001
.001
.0
.12
.0
.001
.0
.0
.019
.007
.01
.055
.141
.021
.014
.001
.0
.0
.001
.966
.0
.035
.02
.001
.003
.001
.095
.002
.001
.386
.008
.03
.03
.001
--
--
--
.016
.0
.023
.021
.0
.023
.993
.998
.003
.0
.001
.0
.0
.002
.001
.0
.001
.002
.002
.0
.194
.002
.814
.001
.999
.995
.588
.007
.0
.001
.001
.112
.041
.001
.0
.003
.001
.01
.001
.001
.013
.0
.003
.006
.001
.002
.0
.005
.02
.005
.02
.005
.006
.002
.383
.001
.012
.0
.01
.007
.002
.003
.084
.02
.016
.009
.01
.003
.003
.002
.0
.003
.005
.0
.003
.0
.001
.145
.004
.005
.043
.0
.01
.0
.002
.001
.0
.006
.001
.041
.016
.051
.164
.171
.036
.014
.01
.025
.006
.094
.673
.983
.015
.009
.015
.001
.0
.0
.0
.026
.339
.0
.003
.002
.04
.005
.0
.001
.001
.034
.034
.001
--
--
--
--
.12
.065
.001
.0
.004
.0
.001
.009
.006
.138
.001
.0
.019
.103
.092
.02
.003
.009
.065
.033
.063
.017
.074
.002
.022
.004
.0
.001
.004
.006
.007
.016
.0
.025
.003
.0
.143
.01
.747
.006
.0
.002
.016
.105
.002
.011
.053
.001
.0
.0
.011
.033
.013
.0
.0
.005
.001
.008
.002
.001
.0
.024
.0
.023
.007
.002
.002
.065
.0
.001
.006
.001
1.0
1.0
.92
.94
.38
.004
.0
.002
.962
--
.317
.044
.014
.015
.004
.003
.0
.009
.001
.0
.001
--
.013
.001
.018
--
.021
.078
.099
.36
.006
.002
.002
.428
.027
.081
.002
.001
.143
.0
.0
.0
.001
.024
.158
.39
.0
.143
.122
.018
.008
.001
.001
.162
--
.04
.007
.009
.0
.001
.0
.001
.007
.006
.022
.037
.003
.754
.004
.0
.001
1.0
.0
.001
.392
.001
.14
.007
.001
.011
.001
.007
.007
.16
.001
.561
.997
.002
.0
--
.0
.0
.0
.0
.001
.977
.0
.017
.011
.024
.0
.999
.999
.468
.001
.001
.991
.0
.0
.001
.0
.001
.001
.006
.0
.124
.336
1.0
.0
.189
.001
.0
.0
.001
.003
.0
.0
.017
.07
.0
.003
.523
.0
.0
.583
.645
.954
.0
.0
.0
.0
.004
.287
.257
.006
.996
.002
.978
.002
.087
.825
.037
.0
.0
.0
.002
.0
.002
.0
.95
.0
.003
.03
.666
.032
.001
.001
.0
.002
.211
.0
.0
1.0
.001
.151
.003
.0
.004
.0
.0
.967
.001
.0
.001
.004
.001
.003
.003
1.0
.872
.734
.993
.001
.074
.005
.882
1.0
.97
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102552324
LOC102552324
LOC102552324
LOC102552324
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
A
C
A
T
A
G
G
A
G
A
A
A
A
A
C
G
G
C
T
C
G
T
A
A
C
A
G
C
T
G
C
A
C
A
T
A
T
T
T
G
T
G
T
G
T
A
A
G
C
T
G
C
A
A
A
G
A
T
G
G
T
G
T
T
T
T
A
C
A
A
A
A
C
G
T
C
C
T
C
T
T
A
A
C
T
G
T
T
T
G
G
C
A
A
G
C
T
C
T
A
G
G
G
G
A
C
C
C
T
G
G
G
C
G
T
A
T
G
A
A
G
G
C
A
G
T
A
C
G
A
G
C
A
C
T
G
G
C
C
T
G
T
G
G
T
C
A
C
T
G
C
C
G
G
A
T
A
A
T
G
G
A
G
A
G
T
A
G
A
T
A
G
T
C
A
T
G
G
C
A
T
G
G
G
G
A
C
A
T
A
A
G
A
G
A
T
C
A
T
G
A
T
C
A
G
G
C
C
G
T
A
C
C
T
C
A
A
G
T
A
G
T
A
T
C
A
C
T
G
A
C
T
T
A
A
C
G
G
T
C
T
C
T
G
T
G
G
G
A
C
T
G
T
G
C
C
A
A
T
T
C
G
A
T
G
T
G
G
T
A
T
C
T
G
C
T
C
G
G
G
T
T
T
A
A
C
T
T
G
T
C
T
G
C
A
T
T
C
A
C
G
G
A
C
C
A
G
A
C
G
T
T
G
A
C
C
G
A
G
C
G
A
T
G
T
A
T
A
G
C
T
G
C
G
G
G
T
A
A
A
C
G
T
A
A
A
T
C
A
T
C
C
T
C
G
G
G
A
G
C
G
A
C
C
G
A
G
C
T
A
T
A
C
G
A
A
A
T
A
C
T
A
G
G
G
A
A
G
T
G
G
G
C
G
C
G
T
T
T
A
T
T
A
C
A
C
A
C
A
G
T
A
T
G
T
G
C
G
A
T
C
G
C
C
C
G
C
C
C
A
T
C
T
G
T
C
  144,648,354
  144,651,381
  144,652,896
  144,654,598
  144,655,471
  144,655,525
  144,656,270
  144,661,270
  144,664,723
  144,665,812
  144,672,677
  144,673,223
  144,674,480
  144,675,441
  144,676,704
  144,676,874
  144,677,721
  144,677,771
  144,677,897
  144,681,449
  144,681,730
  144,681,963
  144,682,230
  144,682,289
  144,682,649
  144,682,825
  144,683,020
  144,683,215
  144,683,442
  144,683,923
  144,684,029
  144,684,093
  144,684,111
  144,684,473
  144,685,303
  144,685,529
  144,685,717
  144,685,997
  144,686,506
  144,686,608
  144,687,132
  144,687,846
  144,688,401
  144,689,139
  144,689,198
  144,689,289
  144,689,446
  144,689,685
  144,689,714
  144,690,441
  144,690,505
  144,690,670
  144,690,679
  144,690,765
  144,691,168
  144,691,835
  144,692,274
  144,692,752
  144,692,777
  144,694,037
  144,694,639
  144,695,107
  144,695,524
  144,696,746
  144,697,033
  144,697,435
  144,697,436
  144,697,552
  144,698,507
  144,698,704
  144,698,790
  144,698,860
  144,698,982
  144,698,987
  144,699,192
  144,699,317
  144,699,701
  144,699,748
  144,699,749
  144,699,822
  144,700,047
  144,700,635
  144,700,805
  144,702,472
  144,703,613
  144,704,026
  144,704,285
  144,704,559
  144,704,774
  144,704,991
  144,705,027
  144,705,370
  144,705,593
  144,706,365
  144,708,331
  144,708,781
  144,708,887
  144,708,990
  144,709,243
  144,709,370
  144,709,441
  144,709,444
  144,709,618
  144,709,646
  144,709,660
  144,709,911
  144,710,214
  144,710,255
  144,710,461
  144,710,535
  144,710,642
  144,711,432
  144,711,525
  144,711,547
  144,711,549
  144,711,601
  144,711,940
  144,712,279
  144,712,310
  144,712,367
  144,712,595
  144,712,875
  144,713,221
  144,713,613
  144,713,635
  144,713,969
  144,714,419
  144,714,524
  144,714,691
  144,714,710
  144,714,885
  144,715,083
  144,715,091
  144,715,132
  144,715,139
  144,716,000
  144,716,170
  144,716,219
  144,716,294
  144,716,584
  144,716,829
  144,717,509
  144,717,633
  144,718,240
  144,718,452
  144,718,488
  144,718,596
  144,718,673
  144,719,033
  144,719,200
  144,719,840
  144,720,463
  144,720,712
  144,721,115
  144,721,186
  144,721,472
  144,721,648
  144,721,654
  144,721,820
  144,721,826
  144,722,048
  144,722,200
  144,722,584
  144,722,633
  144,722,839
  144,722,954
  144,723,023
  144,723,569
  144,723,611
  144,723,739
  144,723,878
  144,724,202
  144,724,285
  144,724,657
  144,725,344
  144,725,411
  144,725,489
  144,725,523
  144,725,547
  144,725,584
  144,725,952
  144,726,100
  144,726,162
  144,726,279
  144,726,297
  144,726,368
  144,726,435
  144,726,474
  144,726,567
  144,726,591
  144,727,491
  144,727,618
  144,727,727
  144,728,050
  144,728,315
  144,728,546
  144,729,045
  144,729,928
  144,731,026
  144,731,053
  144,732,684
  144,733,284
  144,733,964
  144,734,314
  144,734,600
  144,734,641
  144,734,987
  144,735,155
  144,735,413
  144,737,673
  144,738,877
  144,739,193
  144,739,213
  144,740,594
  144,742,131
  144,744,969
  144,748,397
  144,748,562
  144,750,528
  144,751,820
  144,752,053
  144,753,842
  144,755,798
  144,759,588
  144,760,469
  144,762,528
  144,763,341
  144,765,225
  144,766,451
  144,768,544
  144,770,554
  144,776,919
  144,777,106
  144,779,106
  144,779,965
  144,780,030
  144,780,031
  144,780,308
  144,781,222
  144,782,113
  144,782,115
  144,782,183
  144,782,184
  144,782,354
  144,782,878
  144,784,175
  144,784,469
  144,784,696
  144,785,510
  144,788,075
  144,788,796
  144,788,806
  144,788,851
  144,791,020
  144,797,507
  144,798,174
  144,798,272
  144,798,611
  144,799,805
  144,800,427
  144,801,377
  144,801,446
  144,802,269
  144,802,432
  144,803,198
  144,803,607
  144,803,647
  144,803,749
  144,803,802
  144,804,083
  144,804,084
  144,804,090
  144,804,141
  144,804,260
  144,804,567
  144,804,665
  144,804,668
  144,804,829
  144,805,316
  144,805,673
  144,806,619
  144,807,107
  144,807,284
  144,808,253
  144,808,793
  144,810,804
  144,811,272
  144,811,275
  144,811,381
  144,811,732
  144,812,931
  144,814,519
  144,815,219
  144,815,768
  144,816,572
  144,816,762
  144,820,797
  144,821,470
  144,822,688
  144,823,604
  144,824,948
  144,825,123
  144,826,259
  144,826,660
  144,828,981
  144,829,311
  144,829,721
  144,830,884
  144,831,838
  144,832,035
  144,832,782
  144,833,753
  144,836,144
  144,836,230
  144,836,634
  144,837,341
  144,842,435
  144,842,475
  144,842,720
  144,842,943
  144,844,027
  144,844,587
  144,845,288
  144,845,795
  144,851,616
  144,851,734
  144,854,384
  144,854,578
  144,855,757
  144,862,246
  144,862,907
  144,862,925
  144,862,926
  144,863,108
  144,865,687
  144,865,844
  144,866,462
  144,866,927
  144,866,928
  144,866,940
  144,867,021
  144,867,392
  144,869,067
  144,871,287
  144,871,558
  144,872,097
  144,873,363
  144,873,519
  144,873,735
  144,874,702
  144,874,870
  144,875,000
  144,875,453
  144,877,454
  144,877,631
  144,878,572
  144,878,956
  144,880,565
  144,881,256
  144,882,910
  144,882,926
  144,884,213
  144,884,286
  144,884,379
  144,884,858
  144,885,067
  144,888,661
  144,888,806
  144,889,393
  144,889,430
  144,889,830
  144,891,537
  144,891,785
  144,892,435
  144,893,579
  144,894,576
  144,894,792
  144,894,794
  144,894,954
  144,895,272
  144,895,767
  144,895,836
  144,895,837
  144,896,865
  144,896,884
  144,896,954
  144,897,279
  144,900,144
  144,900,245
  144,900,764
  144,901,568
  144,904,932
  144,905,738
  144,905,758
  144,909,421
  144,909,651
  144,910,022
  144,910,219
  144,910,251
  144,910,392
  144,911,610
  144,911,982
  144,912,766
  144,913,060
  144,916,673
  144,919,077
  144,919,364
  144,919,720
  144,919,773
  144,920,276
  144,920,587
  144,922,517
  144,924,849
  144,925,250
  144,925,827
  144,926,184
  144,927,097
  144,927,098
  144,927,241
  144,927,537
  144,928,831
  144,928,838
  144,928,839
  144,929,922
  144,930,226
  144,930,788
  144,932,380
  144,933,940
  144,934,693
  144,936,243
  144,936,624
  144,937,773
  144,938,084
  144,938,380
  144,938,560
  144,938,627
  144,939,236
G
G
T
G
C
C
A
A
T
A
G
C
G
G
G
T
A
C
T
A
A
A
C
G
G
T
G
A
T
C
A
T
G
T
G
C
T
C
C
C
A
C
A
G
T
C
G
G
C
T
C
A
G
G
G
G
A
G
C
A
A
C
C
C
C
A
A
C
T
C
T
C
G
T
A
C
T
G
C
G
C
C
C
G
A
C
A
C
C
A
A
T
T
G
G
T
T
A
T
C
G
A
A
A
A
T
A
T
T
C
C
A
C
T
C
G
G
C
A
G
T
A
A
A
G
T
C
T
T
A
G
A
T
C
A
A
A
A
A
T
C
A
C
A
T
C
T
G
A
A
A
T
T
A
C
G
C
G
G
C
A
A
G
A
G
A
G
G
A
G
A
G
A
A
T
G
A
A
T
A
G
C
A
A
C
C
T
T
T
C
G
G
A
C
C
G
A
T
C
A
C
G
C
T
T
A
A
T
T
C
A
C
T
T
C
G
G
G
A
C
T
A
C
G
C
G
G
G
A
C
C
T
G
C
G
C
A
A
A
A
T
C
A
C
A
C
A
T
A
G
A
A
C
G
A
T
T
C
C
A
G
T
A
G
C
A
C
A
A
G
C
C
T
A
A
T
C
T
A
A
A
C
C
C
C
G
A
A
C
A
C
T
G
C
T
G
G
C
A
G
T
C
A
C
T
A
G
T
C
T
A
C
C
A
G
T
T
A
G
A
T
A
G
C
A
G
G
C
G
C
A
C
A
T
A
C
A
C
G
G
G
T
A
C
G
G
G
A
T
T
C
T
T
G
T
A
T
A
C
A
T
A
C
T
T
A
G
A
T
A
G
C
G
G
A
G
G
G
C
G
T
A
T
A
A
A
G
G
T
C
A
A
A
A
A
T
C
C
C
C
T
C
C
G
T
T
G
G
T
G
A
C
G
G
A
G
A
A
A
G
C
G
A
G
A
T
A
T
T
T
G
G
T
C
T
C
T