Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 293,135 (bp)   Positions: 540
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.961
.208
.003
.0
.0
.0
.0
.007
.0
.001
.03
.0
.001
.055
.006
.007
.007
.008
.002
.001
.922
.011
.004
.001
.0
.001
.0
.006
.004
.097
.0
.004
.0
.0
.002
.003
.009
.001
.163
.002
.002
.002
.012
.012
.0
.02
.177
.023
.0
.0
.022
.02
.0
.036
.012
.019
.021
.007
.036
.027
.01
.141
.021
.014
.107
.002
.03
.023
.0
.966
.0
.02
.0
.003
.001
.0
.008
.03
.03
.001
.0
.001
.023
.021
.0
.023
.993
.998
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.002
.004
.002
.004
.0
.016
.009
.194
.003
.002
.03
.0
.002
.573
.285
.019
.012
.003
.001
.001
.077
.112
.041
.003
.003
.003
.002
.001
.01
.001
.0
.001
.063
.003
.003
.547
.018
.003
.0
.013
.022
.006
.048
.053
.0
.001
.014
.084
.001
.963
.829
.001
.0
.002
.05
.001
.001
.012
.026
.01
.007
.002
--
--
.009
.01
.001
.002
.0
.0
.0
.001
.004
.005
.007
.0
.005
.0
.01
.0
.001
.0
.006
.001
.041
.164
--
--
.557
.014
.01
.025
.0
1.0
.94
.983
.001
.014
.015
.001
.0
.0
.026
.001
.043
.001
.001
.016
.364
.001
--
--
.0
.12
.007
.0
.0
.001
.069
.045
.001
.027
.006
.012
.248
.0
.016
.0
.051
.025
.342
.003
.0
.002
.0
.01
.001
.0
.0
.004
.016
.002
.019
.001
.105
.008
.008
.018
.002
.0
.002
.013
.0
.007
.0
.004
.0
.001
.0
.0
.011
.0
.009
.0
.003
.755
.163
.005
.004
.004
.001
.001
.008
.005
.002
.001
.002
.011
.0
.057
.255
.002
.024
.02
.0
.001
.043
.863
.957
.047
.009
.452
.016
.034
.023
.386
.001
.0
.016
.005
.264
.028
.001
.016
.087
.003
.0
.371
.749
.002
.004
.002
.0
.016
.878
.009
.0
.0
.017
.0
.0
.001
.0
.003
.023
.355
.002
.0
.065
.0
.001
.006
.003
.23
1.0
1.0
.92
.94
.38
.0
.0
.0
.962
.607
.0
.317
.0
.0
.001
.006
.006
.5
.001
.0
.017
.003
.06
.011
--
--
--
--
--
.0
.0
.001
.018
--
.021
.078
.099
.006
.002
.002
.428
.027
.081
.002
.001
.005
.002
.007
.0
.0
.0
.001
.018
.024
.084
.158
.0
.0
.395
.031
.0
.0
.0
.029
.052
.001
.01
.004
.231
.007
.001
.003
.008
.002
.001
.001
.0
.0
.752
.007
.002
.002
.006
.28
.003
.01
.0
.0
.02
.001
.001
.586
.0
.001
--
.489
.0
.011
.015
.007
.003
.001
.001
.024
.002
.011
.001
.057
.039
.266
.0
.997
.008
.002
.0
.0
.0
.0
.002
.977
.0
.001
.001
.991
.028
.0
.0
.0
.693
.023
.0
.001
.001
.0
.0
.002
.189
.488
.0
.004
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.003
.017
.523
.0
.0
.0
.583
.954
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.02
.002
.457
.001
.02
.0
.0
.0
.002
.0
.002
.0
.95
.003
.03
.666
.032
.001
.001
.0
.002
.0
.0
1.0
.001
.151
.003
.0
.004
.0
.0
.967
.001
.0
.001
.006
.004
.001
.003
.003
1.0
.872
.734
.993
.001
.074
.005
.882
1.0
.97
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
Dclk1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102552324
LOC102552324
LOC102552324
LOC102552324
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
G
A
T
C
G
A
C
A
G
A
T
T
G
G
C
A
C
C
C
T
G
A
C
T
C
C
C
G
C
C
G
T
A
A
C
G
G
C
G
C
C
G
T
G
C
T
C
C
A
A
A
A
A
A
A
G
A
T
C
A
G
G
C
A
C
C
C
G
A
A
A
C
C
T
C
A
T
A
T
G
C
T
G
T
A
A
G
T
C
A
A
G
A
T
G
C
G
C
G
G
T
G
T
C
G
C
A
G
A
A
G
A
A
C
A
C
T
C
C
G
C
T
C
T
G
G
C
G
G
G
G
G
T
C
A
T
G
C
G
G
C
T
C
G
G
C
A
C
G
C
T
G
T
A
G
A
T
C
C
T
T
C
G
A
T
A
A
C
G
T
A
C
A
T
T
C
G
A
A
T
C
G
G
G
C
C
G
G
T
C
A
T
C
A
T
G
C
G
G
A
C
G
A
A
T
C
A
G
T
G
T
G
C
G
A
T
A
C
C
A
T
A
G
C
A
A
T
T
A
G
C
T
C
G
G
G
G
T
T
C
C
T
A
C
T
G
T
G
A
G
G
G
A
A
A
A
A
T
A
A
T
G
A
G
G
T
T
C
A
G
C
G
G
A
G
T
G
G
G
G
G
C
C
G
G
A
A
A
A
T
A
T
G
C
A
G
A
C
G
A
G
G
C
A
T
A
A
T
T
T
C
C
G
G
G
C
T
T
G
T
C
A
A
C
G
G
G
T
C
T
C
T
T
T
T
G
G
C
A
T
A
C
T
C
C
G
T
T
G
T
A
A
A
T
T
C
A
G
T
A
T
G
T
G
T
A
T
C
T
G
C
T
C
T
C
G
T
G
T
C
T
G
T
T
G
C
T
C
T
A
C
C
C
C
C
G
A
C
G
C
G
C
G
T
A
A
G
T
C
G
G
G
T
A
T
C
T
A
C
G
G
C
T
G
A
C
T
C
A
T
G
A
G
C
G
C
G
G
T
T
A
T
C
T
G
G
G
A
T
A
A
A
C
A
T
A
T
G
C
T
G
G
C
A
G
C
G
A
C
G
G
A
G
G
C
A
A
T
A
T
C
A
C
A
T
A
T
G
A
A
A
C
C
C
G
G
C
G
C
G
T
T
A
T
T
A
C
A
C
A
A
G
T
A
T
G
T
G
C
G
A
T
C
G
C
C
C
C
G
C
C
C
A
T
C
T
G
T
C
  144,647,113
  144,647,511
  144,648,354
  144,648,719
  144,649,918
  144,650,691
  144,650,943
  144,651,358
  144,651,381
  144,652,429
  144,654,598
  144,655,111
  144,655,471
  144,656,457
  144,657,163
  144,657,617
  144,657,673
  144,657,694
  144,657,819
  144,658,001
  144,659,756
  144,659,841
  144,660,360
  144,660,550
  144,661,975
  144,662,252
  144,662,310
  144,662,440
  144,662,442
  144,663,773
  144,664,156
  144,664,601
  144,664,613
  144,664,723
  144,665,194
  144,665,295
  144,665,729
  144,665,812
  144,667,263
  144,667,307
  144,667,378
  144,667,425
  144,668,888
  144,669,763
  144,670,054
  144,670,692
  144,670,771
  144,671,501
  144,672,097
  144,672,677
  144,672,695
  144,673,021
  144,673,223
  144,673,257
  144,673,460
  144,674,480
  144,675,329
  144,675,441
  144,675,993
  144,675,994
  144,676,704
  144,677,721
  144,677,771
  144,677,897
  144,678,030
  144,678,283
  144,678,461
  144,679,130
  144,681,963
  144,682,289
  144,682,649
  144,683,020
  144,683,071
  144,683,442
  144,683,923
  144,684,288
  144,685,303
  144,685,529
  144,685,717
  144,685,997
  144,687,942
  144,689,032
  144,689,139
  144,689,198
  144,689,289
  144,689,446
  144,689,685
  144,689,714
  144,690,505
  144,690,679
  144,690,765
  144,691,835
  144,692,057
  144,692,752
  144,692,777
  144,692,799
  144,693,215
  144,694,326
  144,694,434
  144,694,870
  144,694,888
  144,695,107
  144,695,192
  144,695,196
  144,695,225
  144,695,803
  144,696,161
  144,697,480
  144,697,533
  144,697,902
  144,698,061
  144,698,341
  144,698,790
  144,698,860
  144,698,974
  144,698,982
  144,698,987
  144,699,103
  144,699,232
  144,699,701
  144,699,733
  144,699,748
  144,699,749
  144,699,822
  144,700,449
  144,701,157
  144,701,267
  144,702,183
  144,702,462
  144,703,387
  144,703,501
  144,703,573
  144,704,266
  144,705,031
  144,706,200
  144,706,365
  144,706,396
  144,706,397
  144,706,413
  144,706,560
  144,706,587
  144,706,991
  144,707,016
  144,707,082
  144,707,088
  144,707,348
  144,708,117
  144,708,331
  144,708,523
  144,708,880
  144,708,887
  144,708,990
  144,709,345
  144,709,370
  144,709,441
  144,709,444
  144,710,078
  144,710,079
  144,710,214
  144,710,255
  144,710,905
  144,711,142
  144,711,431
  144,711,549
  144,711,940
  144,712,279
  144,712,367
  144,712,595
  144,712,983
  144,713,221
  144,713,554
  144,713,583
  144,713,613
  144,713,635
  144,714,419
  144,714,437
  144,714,691
  144,714,710
  144,714,885
  144,715,132
  144,715,248
  144,715,386
  144,715,904
  144,716,170
  144,716,219
  144,716,294
  144,716,824
  144,717,542
  144,717,564
  144,717,633
  144,718,384
  144,718,454
  144,718,488
  144,718,596
  144,718,673
  144,719,200
  144,719,840
  144,719,953
  144,720,420
  144,721,199
  144,721,820
  144,721,964
  144,722,469
  144,722,584
  144,722,839
  144,723,023
  144,723,364
  144,723,569
  144,723,796
  144,723,878
  144,724,285
  144,724,657
  144,724,872
  144,725,118
  144,725,523
  144,725,732
  144,729,045
  144,729,735
  144,730,061
  144,730,916
  144,731,026
  144,731,053
  144,732,567
  144,732,684
  144,732,813
  144,733,284
  144,733,344
  144,733,351
  144,733,964
  144,734,600
  144,735,246
  144,736,910
  144,737,075
  144,737,250
  144,737,673
  144,738,039
  144,738,044
  144,738,147
  144,738,877
  144,739,249
  144,742,184
  144,742,199
  144,742,287
  144,742,912
  144,742,955
  144,743,251
  144,743,354
  144,744,124
  144,745,589
  144,745,665
  144,745,824
  144,746,013
  144,746,252
  144,748,397
  144,748,562
  144,748,804
  144,750,985
  144,752,053
  144,753,034
  144,753,696
  144,755,084
  144,755,798
  144,756,184
  144,757,992
  144,760,294
  144,760,417
  144,760,469
  144,760,908
  144,762,528
  144,763,341
  144,764,313
  144,764,330
  144,764,471
  144,764,493
  144,764,538
  144,766,373
  144,766,451
  144,766,573
  144,768,115
  144,768,531
  144,768,805
  144,768,835
  144,768,843
  144,769,333
  144,769,351
  144,770,137
  144,770,491
  144,770,529
  144,770,554
  144,770,658
  144,770,850
  144,770,854
  144,771,105
  144,771,215
  144,771,892
  144,771,995
  144,772,178
  144,773,505
  144,773,531
  144,773,552
  144,773,657
  144,773,777
  144,773,948
  144,774,062
  144,774,094
  144,774,990
  144,775,176
  144,775,988
  144,776,010
  144,776,265
  144,776,657
  144,776,720
  144,777,228
  144,777,478
  144,777,523
  144,777,555
  144,777,964
  144,778,079
  144,778,419
  144,778,567
  144,779,106
  144,779,917
  144,779,965
  144,780,030
  144,780,031
  144,780,308
  144,780,623
  144,781,679
  144,782,113
  144,782,115
  144,782,183
  144,782,184
  144,782,354
  144,783,381
  144,784,175
  144,784,210
  144,784,696
  144,785,294
  144,787,785
  144,788,075
  144,788,863
  144,788,866
  144,790,155
  144,793,062
  144,794,287
  144,794,896
  144,795,358
  144,795,365
  144,795,597
  144,797,507
  144,800,602
  144,800,861
  144,800,972
  144,801,193
  144,801,262
  144,801,377
  144,801,384
  144,801,477
  144,801,545
  144,801,692
  144,802,432
  144,803,198
  144,803,607
  144,803,647
  144,803,749
  144,804,083
  144,804,084
  144,804,090
  144,804,141
  144,804,260
  144,804,567
  144,804,665
  144,804,668
  144,804,733
  144,804,739
  144,805,008
  144,805,416
  144,805,616
  144,806,619
  144,807,107
  144,807,266
  144,807,284
  144,807,890
  144,808,253
  144,809,917
  144,810,035
  144,810,124
  144,810,134
  144,810,196
  144,810,747
  144,810,804
  144,811,322
  144,812,456
  144,814,179
  144,815,574
  144,815,617
  144,815,899
  144,816,762
  144,820,213
  144,820,695
  144,820,861
  144,820,983
  144,822,688
  144,823,214
  144,823,390
  144,823,604
  144,824,692
  144,825,123
  144,826,202
  144,826,212
  144,826,259
  144,826,828
  144,828,527
  144,828,818
  144,831,838
  144,833,753
  144,834,855
  144,836,144
  144,836,634
  144,837,280
  144,839,460
  144,839,705
  144,840,836
  144,841,510
  144,841,969
  144,842,720
  144,844,583
  144,844,585
  144,845,534
  144,845,747
  144,845,795
  144,846,144
  144,846,444
  144,847,642
  144,847,653
  144,848,696
  144,848,790
  144,849,027
  144,849,518
  144,851,734
  144,853,704
  144,854,384
  144,854,578
  144,862,907
  144,862,925
  144,862,926
  144,865,192
  144,865,687
  144,866,940
  144,871,287
  144,871,558
  144,872,097
  144,872,658
  144,874,468
  144,874,702
  144,877,454
  144,878,569
  144,878,701
  144,878,751
  144,879,125
  144,879,938
  144,880,021
  144,880,187
  144,880,675
  144,881,256
  144,881,667
  144,882,926
  144,882,952
  144,883,107
  144,883,178
  144,883,219
  144,884,213
  144,884,286
  144,884,887
  144,886,904
  144,887,148
  144,888,661
  144,889,830
  144,891,537
  144,891,785
  144,892,073
  144,892,435
  144,894,576
  144,894,716
  144,894,792
  144,894,793
  144,894,794
  144,894,954
  144,895,261
  144,895,272
  144,900,092
  144,900,144
  144,900,510
  144,902,002
  144,902,388
  144,904,932
  144,905,738
  144,905,758
  144,909,421
  144,909,651
  144,910,022
  144,910,219
  144,910,251
  144,911,610
  144,911,982
  144,912,766
  144,913,060
  144,916,673
  144,919,077
  144,919,364
  144,919,720
  144,920,276
  144,920,587
  144,922,517
  144,924,849
  144,925,250
  144,925,827
  144,926,184
  144,927,097
  144,927,098
  144,927,241
  144,927,537
  144,928,831
  144,928,838
  144,928,839
  144,929,889
  144,929,922
  144,930,226
  144,930,788
  144,932,380
  144,933,940
  144,934,693
  144,936,243
  144,936,624
  144,937,773
  144,938,084
  144,938,380
  144,938,560
  144,938,627
  144,939,236
G
A
G
C
G
A
G
T
G
A
G
G
C
A
A
T
G
G
T
T
C
A
G
T
C
T
T
T
A
T
T
A
C
T
G
T
T
A
T
A
T
T
A
C
T
G
C
T
G
G
G
G
C
G
G
G
A
G
A
A
G
A
C
T
G
T
G
T
A
G
G
G
T
T
C
T
G
C
T
C
A
T
A
T
C
G
G
C
C
G
G
G
A
G
C
A
T
A
G
A
A
C
T
G
T
A
T
T
A
G
G
C
T
C
T
G
T
G
G
T
C
G
C
G
G
T
T
G
A
A
A
A
A
C
T
G
C
A
T
A
A
T
A
A
C
A
T
C
A
A
T
A
A
C
G
A
T
A
A
T
A
C
T
C
G
C
G
T
T
A
C
G
A
G
C
A
T
A
G
C
C
T
A
A
A
A
T
A
A
C
A
T
C
T
G
A
A
T
A
T
G
T
A
G
G
G
T
G
C
A
A
A
A
T
A
T
A
T
T
G
C
A
G
C
A
G
G
C
C
T
A
T
C
T
C
A
A
A
A
C
T
T
G
G
T
C
A
C
A
G
T
A
A
G
G
C
G
T
C
C
G
C
A
G
T
A
C
C
G
G
A
T
A
C
G
A
A
C
T
A
T
T
G
T
T
T
G
T
C
G
A
G
C
C
T
G
A
G
T
A
G
A
A
T
C
C
G
G
C
C
C
G
T
A
A
A
T
C
C
T
C
T
G
C
A
A
A
A
A
T
C
A
C
A
C
A
T
A
T
G
A
G
A
G
T
T
A
G
C
A
C
G
G
T
C
G
A
G
A
C
G
C
A
C
A
G
C
C
T
A
A
T
C
T
C
T
A
G
A
C
A
C
A
C
C
T
T
C
A
C
G
T
T
T
T
A
A
G
T
A
T
A
A
A
C
G
G
C
A
A
A
T
A
C
C
C
T
C
G
T
A
A
T
C
C
G
T
C
A
T
C
A
C
A
G
C
A
A
A
G
C
G
C
A
C
A
A
A
G
C
G
G
A/C
T
T
G
T
G
A
T
C
A
A
T
C
A
T
A
G
A
C
A
C
A
T
T
G
G
C
G
C
G
G
T
G
A
G
C
C
G
C
G
T
T
T
A
A
A
A
T
C
C
C
T
C
C
G
T
T
G
G
G
A
C
G
G
A
G
A
A
A
G
C
G
A
C/T
G
A
T
A
T
T
T
G
G
T
C
T
C
T