Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 71,509 (bp)   Positions: 232
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
ACI/EurMcwi (MCW) 
.031
.026
.038
.013
.067
.005
.101
.012
.026
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.006
.017
.025
.033
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.023
.002
.373
.995
.533
.254
.188
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.021
.038
.405
.013
.002
.164
.201
.006
.025
.002
.016
.005
.0
.014
.09
.146
.368
.455
.976
.992
.003
.184
.778
.067
.049
.248
.379
.336
.996
.794
.35
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.022
.723
.026
.998
.97
.083
.137
.283
.112
.11
.053
.007
.005
.0
.0
.008
.012
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
Cyp2c79
G
G
G
A
T
T
T
G
G
G
T
T
C
A
C
G
A
C
C
C
T
T
G
T
C
C
G
A
A
G
A
T
G
T
A
G
T
G
G
A
A
T
A
A
G
A
G
C
C
T
C
T
C
A
G
A
T
A
C
C
G
T
A
G
G
G
C
C
A
C
A
G
G
C
T
A
T
A
G
A
C
C
T
C
G
T
T
A
G
C
G
G
G
A
T
T
G
T
C
A
A
G
T
C
A
T
T
C
C
G
T
A
T
C
A
C
T
C
G
T
G
A
G
T
A
C
A
T
T
C
C
G
A
G
C
T
C
T
C
C
G
A
C
C
C
C
G
A
C
G
C
C
A
G
C
T
G
C
A
C
C
C
A
C
A
A
T
C
C
G
C
A
G
T
G
G
A
C
G
C
C
C
G
C
C
G
A
A
T
T
G
G
G
C
G
C
A
C
C
T
T
T
T
T
A
T
T
C
C
A
G
C
G
T
T
T
T
G
T
G
A
A
T
G
G
A
C
A
T
T
C
T
  147,236,717
  147,238,267
  147,238,270
  147,238,282
  147,238,383
  147,238,552
  147,238,648
  147,238,706
  147,238,797
  147,238,972
  147,239,277
  147,239,282
  147,239,357
  147,239,437
  147,239,440
  147,239,502
  147,239,931
  147,239,957
  147,239,974
  147,240,056
  147,241,202
  147,241,206
  147,242,680
  147,242,731
  147,242,968
  147,243,202
  147,244,025
  147,244,290
  147,244,659
  147,246,159
  147,247,820
  147,248,060
  147,248,661
  147,248,679
  147,248,705
  147,248,730
  147,248,889
  147,248,904
  147,248,959
  147,249,024
  147,249,055
  147,249,058
  147,249,074
  147,249,080
  147,249,090
  147,249,124
  147,249,248
  147,249,251
  147,249,299
  147,249,302
  147,249,326
  147,250,707
  147,250,743
  147,251,115
  147,251,141
  147,251,205
  147,251,310
  147,251,367
  147,251,397
  147,253,563
  147,258,554
  147,258,560
  147,258,587
  147,258,598
  147,258,661
  147,258,757
  147,258,764
  147,258,768
  147,263,309
  147,263,596
  147,263,618
  147,264,090
  147,264,393
  147,264,432
  147,264,435
  147,265,705
  147,266,044
  147,266,314
  147,266,361
  147,266,694
  147,266,746
  147,266,827
  147,266,837
  147,266,895
  147,266,904
  147,267,043
  147,267,068
  147,267,147
  147,267,178
  147,268,615
  147,268,638
  147,268,709
  147,268,743
  147,268,888
  147,269,552
  147,270,031
  147,270,136
  147,270,382
  147,270,389
  147,270,413
  147,270,429
  147,270,432
  147,270,440
  147,270,503
  147,270,573
  147,270,604
  147,270,661
  147,270,674
  147,270,702
  147,270,721
  147,270,763
  147,270,822
  147,270,827
  147,270,847
  147,272,502
  147,272,532
  147,272,550
  147,272,594
  147,272,626
  147,272,644
  147,272,754
  147,272,772
  147,272,848
  147,272,849
  147,272,921
  147,272,950
  147,272,962
  147,274,317
  147,276,055
  147,276,202
  147,280,875
  147,280,932
  147,280,938
  147,280,963
  147,281,012
  147,281,057
  147,281,576
  147,281,581
  147,281,644
  147,281,700
  147,282,690
  147,282,695
  147,284,004
  147,284,040
  147,284,052
  147,284,098
  147,284,104
  147,284,195
  147,284,210
  147,284,218
  147,284,273
  147,284,313
  147,284,391
  147,287,104
  147,287,135
  147,287,168
  147,287,205
  147,287,309
  147,287,384
  147,287,397
  147,287,406
  147,287,438
  147,287,556
  147,287,872
  147,288,388
  147,288,429
  147,288,444
  147,288,462
  147,288,733
  147,288,735
  147,288,744
  147,288,799
  147,288,817
  147,288,833
  147,288,868
  147,288,904
  147,288,905
  147,288,911
  147,288,934
  147,289,044
  147,292,157
  147,292,283
  147,292,287
  147,292,291
  147,293,655
  147,293,681
  147,293,736
  147,293,737
  147,293,747
  147,293,766
  147,294,420
  147,294,864
  147,294,865
  147,294,990
  147,294,992
  147,295,042
  147,297,165
  147,298,156
  147,298,247
  147,298,747
  147,298,759
  147,298,820
  147,298,825
  147,300,363
  147,300,369
  147,300,420
  147,300,434
  147,300,460
  147,300,467
  147,301,209
  147,301,229
  147,301,293
  147,301,298
  147,301,307
  147,301,315
  147,301,336
  147,301,656
  147,301,680
  147,301,691
  147,301,728
  147,301,772
  147,303,463
  147,303,475
  147,303,534
  147,303,546
  147,303,586
  147,303,618
  147,303,695
  147,303,741
  147,303,819
  147,303,872
  147,303,998
A
C
A
G
C
C
A
A
G/A
G/A
A
C
T
G
T
G/A
A/G
C/T
C/A
C/G
T/G
T/G
G/C
T/A
C/A
T
G/A
A/C
A/T
G/C
A/T
T/A
G/A
T/A
G
G/C
T/A
G/A
G/T
A/G
A/G
T/C
A/G
A/G
G/A
A/G
G/T
C/T
C/T
T/C
C/T
T/A
C/T
A/G
G/A
A/C
T/C
A/G
C/T
C/T
G/A
T/A
A/C
G/A
G/A
G/A
C/G
C/A
A/G
C/T
A/T
G/A
G/A
C/T
T/C
A/G
T/C
A/G
G/A
A/C
C/T
C/G
T/A
C/T
G/A
T/G
T/C
A/T
G/T
C/G
G/A
G/C
G/T
A/C
T/A
A
G/A
T/C
C/T
A/G
A/G
G/A
T/C
C/T
A/G
T/G
T/C
C/T
C/T
G/A
T/C
A/G
T/C
C/T
A/C
C/G
T/C
C/T
G/T
T/C
G/A
A/C
G/A
T/A
A/T
C/A
A/C
T/A
T/G
C/T
C/T
G/A
A/G
G/A
C/T
T/G
C/T
T/C
C/T
C/T
G/C
A/C
C/A
C/A
C/A
C/G
G/A
A/G
C/T
G/T
C/G
C/A
A/G
G/A
C/A
T/G
G/T
C/T
A/C
C/T
C/G
C/A
A/T
T
A/G
A/G
T/C
C/T
C/A
G/A
C/T
A/T
G/A
T/C
G/A
G/C
A/T
C/T
G/C
C/A
C/A
C/A
A
C/A
C/T
G/A
A/T
A/G
T/G
T/G
C
A
A
C/T
G/A
C/T
T
G
T
T/C
T/C
T/C
T/C
T/G
A/G
T/C
T/A
C/T
C/T
G
A
T
G/T
T/C
T/A
T/G
T/C
G/A
T/C
G/A
A/G
A/G
T/C
G/T
G/A
G
A
T
C
C
C/T
T/G