Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 204,294 (bp)   Positions: 266
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
1.0
.0
.0
.008
.0
.001
.002
.0
.0
.659
.007
.0
.025
.017
.01
.008
.014
.003
.0
.001
.096
.003
.245
.0
.002
.0
.217
.002
.064
.0
.025
.12
.019
.006
.001
.006
.006
.001
.997
.008
.004
.274
.007
.011
.009
.002
.001
.043
.001
.0
.0
.0
.001
.011
.006
.204
.144
.003
1.0
.271
.0
.0
.024
.002
.0
.002
.002
.005
.08
.001
.037
.142
.172
.132
.001
.03
.001
.049
.004
.003
.003
.009
.007
.005
.0
.071
.001
.005
.014
.001
.004
.137
.024
.006
.231
.013
.002
.996
.997
.909
.93
.005
.002
.007
.007
.02
.058
.118
.0
1.0
.0
.028
.004
.0
.002
.0
.013
.006
.0
.0
.006
.0
.002
.0
.0
1.0
.981
1.0
.013
.011
.328
.151
.446
.435
.131
.004
.19
.09
.986
.003
.0
.0
.038
.001
.0
.0
.029
.001
.0
.004
.068
.088
.0
.001
.0
1.0
.99
.98
.713
.0
.0
.007
.027
.001
.959
.08
.0
.857
.894
.011
1.0
.283
.284
.054
.009
.004
.025
.001
.004
.018
.006
.0
.056
.01
.012
.751
.0
.001
.002
.046
.026
.058
.003
.001
.005
.0
.001
.005
.001
.162
.158
.774
.271
.015
.004
.014
.074
.378
.022
.931
.001
.001
.0
.0
.001
.023
.016
.29
.012
.0
.001
.0
.0
.132
.0
.0
.001
.985
.017
.998
1.0
.91
.034
.016
.0
.001
.27
--
--
.002
.01
.013
.019
.135
.001
.041
.008
.01
.002
.04
--
--
.004
.027
.07
.018
.001
.001
.0
.002
.009
.003
.345
.008
.001
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
T
C
T
G
A
G
A
A
C
A
C
C
C
A
T
C
G
G
A
G
T
A
C
G
A
T
A
A
C
G
C
T
C
C
T
G
T
G
A
A
C
T
T
G
C
C
G
T
T
T
C
C
G
T
C
A
A
T
T
C
T
T
A
C
A
A
G
T
T
A
G
G
T
G
G
G
A
G
A
T
T
T
T
T
A
C
T
G
G
C
C
A
G
G
G
C
C
T
T
T
C
T
G
A
C
A
G
A
C
G
T
A
T
G
G
G
G
C
C
A
C
T
C
C
G
C
G
T
A
G
A
A
G
G
G
A
A
A
C
C
T
A
C
T
T
A
C
A
G
A
A
A
T
A
C
T
G
T
T
C
G
G
G
C
G
A
A
A
C
C
A
A
G
G
G
C
C
T
G
G
C
T
T
C
G
T
G
G
A
A
A
A
C
A
T
G
T
C
A
G
T
G
G
C
C
G
T
A
A
A
G
G
C
T
A
C
T
C
A
A
T
T
T
T
T
C
G
G
T
A
T
A
T
G
G
A
C
T
T
C
G
G
C
T
A
T
G
T
C
T
A
A
A
T
T
C
G
A
G
A
C
T
C
A
  40,019,136
  40,020,375
  40,020,436
  40,020,586
  40,020,734
  40,023,637
  40,024,689
  40,025,134
  40,025,244
  40,025,417
  40,025,804
  40,025,877
  40,025,933
  40,026,528
  40,026,592
  40,026,660
  40,026,661
  40,026,863
  40,026,903
  40,027,001
  40,028,312
  40,028,438
  40,029,971
  40,030,459
  40,031,244
  40,031,256
  40,031,266
  40,031,526
  40,031,608
  40,032,582
  40,033,200
  40,036,764
  40,037,949
  40,038,516
  40,039,093
  40,039,373
  40,039,469
  40,039,584
  40,040,453
  40,041,911
  40,043,261
  40,043,441
  40,043,634
  40,043,698
  40,044,193
  40,044,697
  40,045,190
  40,045,506
  40,046,060
  40,047,211
  40,047,740
  40,047,741
  40,048,090
  40,051,793
  40,053,509
  40,054,369
  40,055,774
  40,056,536
  40,056,889
  40,057,739
  40,061,895
  40,067,147
  40,068,327
  40,069,179
  40,070,877
  40,072,016
  40,072,074
  40,072,387
  40,072,639
  40,072,666
  40,073,400
  40,075,879
  40,076,304
  40,076,760
  40,076,843
  40,078,031
  40,078,334
  40,078,416
  40,078,719
  40,078,768
  40,078,928
  40,079,064
  40,079,082
  40,079,287
  40,079,378
  40,079,452
  40,079,533
  40,079,655
  40,079,767
  40,079,981
  40,080,025
  40,080,465
  40,080,478
  40,081,302
  40,081,597
  40,081,685
  40,081,918
  40,082,054
  40,082,901
  40,083,043
  40,083,052
  40,083,056
  40,083,434
  40,084,541
  40,087,470
  40,087,834
  40,088,505
  40,089,195
  40,089,486
  40,090,259
  40,090,791
  40,091,888
  40,092,108
  40,092,435
  40,093,028
  40,093,233
  40,093,246
  40,093,268
  40,093,269
  40,093,330
  40,093,644
  40,093,652
  40,093,750
  40,093,963
  40,094,264
  40,094,436
  40,094,695
  40,094,720
  40,094,802
  40,097,166
  40,097,170
  40,097,347
  40,097,350
  40,097,413
  40,097,663
  40,097,669
  40,097,683
  40,097,961
  40,098,084
  40,098,158
  40,098,247
  40,099,012
  40,099,148
  40,099,637
  40,100,248
  40,100,515
  40,101,210
  40,101,217
  40,101,477
  40,101,887
  40,102,249
  40,102,282
  40,103,783
  40,104,158
  40,104,290
  40,104,696
  40,105,019
  40,105,046
  40,105,068
  40,105,094
  40,105,695
  40,107,028
  40,107,520
  40,109,988
  40,110,056
  40,110,362
  40,110,389
  40,110,624
  40,110,783
  40,110,801
  40,111,948
  40,114,595
  40,115,002
  40,115,003
  40,115,923
  40,116,636
  40,116,858
  40,117,922
  40,118,339
  40,119,626
  40,121,003
  40,121,144
  40,122,030
  40,126,965
  40,127,518
  40,127,519
  40,127,872
  40,128,126
  40,128,170
  40,128,219
  40,128,332
  40,128,469
  40,129,015
  40,129,223
  40,129,228
  40,129,935
  40,130,056
  40,131,803
  40,132,165
  40,132,514
  40,133,119
  40,133,241
  40,133,361
  40,133,535
  40,134,031
  40,134,733
  40,135,453
  40,135,659
  40,135,905
  40,140,673
  40,140,936
  40,142,302
  40,142,588
  40,143,923
  40,144,345
  40,145,620
  40,145,754
  40,145,815
  40,146,105
  40,148,151
  40,152,179
  40,154,023
  40,154,103
  40,155,522
  40,155,806
  40,155,868
  40,156,323
  40,156,509
  40,157,638
  40,157,873
  40,161,034
  40,161,072
  40,161,098
  40,161,419
  40,161,673
  40,161,692
  40,161,768
  40,162,499
  40,162,543
  40,162,771
  40,163,458
  40,163,515
  40,163,594
  40,164,242
  40,164,251
  40,164,800
  40,164,885
  40,165,111
  40,165,112
  40,165,400
  40,167,295
  40,177,636
  40,177,637
  40,187,225
  40,187,726
  40,187,979
  40,192,823
  40,193,621
  40,194,648
  40,195,905
  40,197,053
  40,198,668
  40,202,702
  40,202,907
  40,207,808
  40,213,216
T
A
C
T
C
A
G
T
G
T
T
C
A
G
T
G
C
G
A
A
G
A
C
C
G
A
G
C
G
C
T
A
T
C
A
T
C
C
C
A
T
G
T
C
A
A
G
T
A
A
G
A
T
G
A
C
G
G
C
C
C
T
C
C
G
T
T
G
A
C
C
G
A
A
C
A
A
A
G
A
G
C
G
C
C
C
G
T
C
A
C
T
G
T
C
C
A
T
T
G
A
C
G
C
A
G
T
G
A
C
T
A
C
G
C
A
C
C
T
G
T
G
G
C
T
T
A
T
A
C
G
A
G
G
A
A
A
G
G
G
T
T
G
G
T
C
C
G
T
G
A
G
G
G
C
G
T
C
A
C
C
T
A
A
A
A
A
G
T
T
T
T
G
C
A
A
A
A
T
C
A
A
A
C
C
T
T
A
C
A
G
C
T
G
A
G
G
A
A
T
G
T
C
A
A
T
A
A
C
C
G
T
A
A
A
A
G
A
C
A
C
G
C
C
C
C
C
T
A
C
C
G
C
G
G
A
C
G
T
G
C
T
A
T
T
G
G
G
C
C
A
A
T
G
G
C
C
T
T
G
A
G
T
C
A
G