Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 204,294 (bp)   Positions: 366
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.003
.0
.0
.001
1.0
.0
.391
.0
.008
.001
.001
.032
.0
.022
.0
.021
.008
.25
.001
.001
.0
.003
.003
.005
.014
.004
.036
.001
.026
.002
.001
.0
.0
.0
.0
.217
.002
.0
.002
.0
.001
.891
.0
.041
.001
.389
.0
.0
.025
.12
.019
.006
.004
.001
.006
.006
.017
.108
.001
.05
.038
.001
.002
.279
.542
.003
.008
.004
.274
.007
.011
.009
.002
.001
.0
.002
.773
.001
.001
.006
.204
.006
.004
.08
.144
.003
--
--
--
.002
.13
.271
.055
.004
.693
.005
.0
.0
.006
.011
.003
.002
.0
.013
.001
.001
.007
.001
.0
.002
.0
.0
.0
.001
.0
.024
.001
.002
.078
.0
.72
.003
.003
.0
.002
.0
.001
.0
.244
.001
.002
.006
.017
.952
.014
.002
.049
.007
.003
.003
.009
.007
.277
.005
.0
.071
.001
.005
.014
.001
.013
.0
.169
.002
.085
.045
.081
.034
.002
.042
.014
.127
.235
.019
.548
.019
.116
.101
.011
.008
.054
.001
.006
.007
.064
.004
.0
.0
.058
.008
.002
.002
.395
.156
.0
.083
.002
.01
.014
.0
.0
.0
.006
.002
.011
.088
.0
.0
.0
.99
.0
.0
.0
.0
.004
.0
.001
.002
.0
.0
1.0
.283
.284
1.0
.002
.054
.687
.016
.009
.0
.088
.004
.0
.035
--
.001
.002
.001
.056
.007
.1
.125
.062
.042
.006
.325
.751
.0
.001
.002
.046
.026
.058
.003
.001
.023
.005
.0
.981
.002
.001
.005
.001
.002
.162
.774
.271
.643
.337
.0
.017
.004
.014
.074
.378
.0
.022
.931
1.0
.001
.0
.0
.001
.023
.016
.29
.012
.006
.0
.001
.0
.0
.132
.0
.0
.001
.985
.017
.998
1.0
.91
1.0
.999
1.0
.034
.016
.0
.001
.27
--
.005
.002
.01
.013
.015
.726
.018
.001
.041
.002
.017
.0
.003
.019
.004
.004
.027
.07
.913
.018
.023
.005
.0
.0
.022
.01
.009
.0
.0
.01
.345
.005
.0
.069
.045
.006
.0
.022
--
.29
.285
.004
--
1.0
.001
.001
.04
.001
.001
.0
.0
.018
.0
.0
.001
.0
.001
.005
.005
.001
.049
.152
.0
.031
.065
.025
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
Cux2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
T
C
G
T
C
C
T
T
G
T
G
C
A
T
G
C
A
C
T
C
A
A
C
G
C
C
A
T
G
C
A
T
T
T
A
C
G
T
A
G
T
C
G
C
G
A
G
C
T
C
C
C
T
G
A
C
T
G
C
T
A
A
C
C
A
A
C
T
T
G
C
C
T
G
C
C
C
T
C
A
A
G
A
A
C
C
C
G
G
T
A
T
G
C
T
T
G
T
T
G
C
G
G
C
A
G
A
C
T
C
A
G
C
T
C
T
T
G
T
G
C
A
A
C
T
T
C
A
A
G
A
C
A
G
A
G
A
T
T
T
A
T
T
A
C
T
G
G
A
C
A
T
T
G
G
T
A
C
T
G
A
A
A
A
G
A
A
C
C
C
G
A
T
G
A
A
A
C
G
C
A
A
A
G
C
G
T
C
A
C
A
T
G
A
A
G
A
T
A
T
G
A
C
A
G
C
A
G
C
A
A
A
G
G
G
G
G
C
C
T
A
T
C
G
C
G
T
G
T
A
G
A
A
A
G
T
G
G
A
A
A
A
C
C
A
T
C
T
G
T
C
G
A
T
G
C
C
G
G
C
C
G
T
C
A
A
G
G
G
C
T
A
C
T
C
C
A
A
T
T
T
T
T
C
G
G
T
A
T
A
G
A
A
T
G
G
A
C
G
T
C
G
G
C
C
T
A
T
A
C
A
T
T
A
A
T
G
T
T
G
T
A
T
C
A
A
C
G
T
T
A
A
A
A
C
G
A
T
G
G
G
G
A
A
C
T
A
T
A
T
A
A
G
A
A
G
T
C
A
A
T
T
T
T
  40,017,015
  40,017,194
  40,017,373
  40,017,809
  40,020,375
  40,020,436
  40,020,446
  40,020,586
  40,020,734
  40,022,521
  40,022,568
  40,022,589
  40,022,932
  40,023,338
  40,023,580
  40,025,092
  40,025,965
  40,026,031
  40,027,492
  40,027,508
  40,027,533
  40,027,881
  40,027,955
  40,027,992
  40,028,009
  40,028,207
  40,028,299
  40,028,658
  40,028,687
  40,028,746
  40,029,584
  40,031,244
  40,031,266
  40,031,353
  40,031,472
  40,031,526
  40,031,608
  40,031,702
  40,031,896
  40,032,023
  40,032,899
  40,032,925
  40,034,328
  40,034,379
  40,035,029
  40,035,901
  40,036,081
  40,036,210
  40,036,764
  40,037,949
  40,038,516
  40,039,093
  40,039,280
  40,039,373
  40,039,469
  40,039,584
  40,039,988
  40,039,998
  40,040,260
  40,040,272
  40,040,273
  40,040,453
  40,040,681
  40,041,119
  40,041,971
  40,042,630
  40,043,261
  40,043,441
  40,043,634
  40,043,698
  40,044,193
  40,044,697
  40,045,190
  40,045,506
  40,047,741
  40,047,895
  40,050,418
  40,051,791
  40,051,793
  40,054,369
  40,055,774
  40,056,237
  40,056,269
  40,056,278
  40,056,536
  40,056,889
  40,056,998
  40,057,004
  40,057,010
  40,061,619
  40,061,888
  40,061,895
  40,062,047
  40,063,573
  40,063,806
  40,063,825
  40,063,932
  40,063,957
  40,064,475
  40,064,846
  40,065,137
  40,065,223
  40,065,434
  40,066,049
  40,066,267
  40,067,099
  40,067,343
  40,067,365
  40,067,683
  40,067,847
  40,068,327
  40,068,579
  40,068,630
  40,068,658
  40,069,115
  40,069,179
  40,069,677
  40,069,716
  40,070,476
  40,070,893
  40,070,908
  40,070,920
  40,071,442
  40,071,686
  40,072,387
  40,072,898
  40,073,400
  40,073,556
  40,073,840
  40,074,590
  40,074,811
  40,074,921
  40,074,991
  40,075,193
  40,076,237
  40,077,096
  40,078,719
  40,078,896
  40,078,928
  40,079,064
  40,079,082
  40,079,287
  40,079,323
  40,079,378
  40,079,452
  40,079,533
  40,079,655
  40,079,767
  40,079,981
  40,080,025
  40,080,143
  40,082,613
  40,084,376
  40,084,541
  40,084,632
  40,084,686
  40,084,765
  40,084,822
  40,084,902
  40,085,377
  40,085,414
  40,085,470
  40,085,491
  40,085,532
  40,085,664
  40,086,390
  40,086,515
  40,086,517
  40,086,843
  40,086,917
  40,086,925
  40,087,108
  40,087,482
  40,087,834
  40,087,968
  40,088,270
  40,088,434
  40,088,897
  40,089,195
  40,089,392
  40,089,523
  40,089,524
  40,089,650
  40,089,745
  40,089,827
  40,089,905
  40,089,953
  40,089,976
  40,090,118
  40,090,195
  40,090,259
  40,093,197
  40,093,652
  40,093,963
  40,097,212
  40,103,783
  40,104,158
  40,104,494
  40,104,696
  40,105,046
  40,105,599
  40,105,695
  40,105,735
  40,105,778
  40,106,464
  40,108,316
  40,110,056
  40,110,514
  40,110,624
  40,113,656
  40,114,567
  40,115,002
  40,115,003
  40,115,033
  40,115,879
  40,115,923
  40,116,464
  40,116,568
  40,116,636
  40,118,278
  40,118,998
  40,119,626
  40,122,908
  40,124,471
  40,124,647
  40,125,256
  40,125,332
  40,126,517
  40,126,965
  40,127,297
  40,127,385
  40,127,462
  40,127,476
  40,127,479
  40,127,491
  40,127,636
  40,127,872
  40,128,126
  40,128,170
  40,128,219
  40,128,332
  40,128,469
  40,129,015
  40,129,223
  40,129,228
  40,129,278
  40,129,935
  40,130,056
  40,130,408
  40,130,793
  40,131,803
  40,132,165
  40,132,514
  40,133,093
  40,133,119
  40,133,361
  40,133,535
  40,133,619
  40,133,627
  40,133,685
  40,134,561
  40,134,733
  40,135,453
  40,135,659
  40,135,905
  40,139,700
  40,140,673
  40,140,936
  40,141,809
  40,142,588
  40,143,923
  40,144,345
  40,145,620
  40,145,754
  40,145,815
  40,146,105
  40,148,151
  40,149,171
  40,152,179
  40,154,023
  40,154,103
  40,155,522
  40,155,806
  40,155,868
  40,156,323
  40,156,509
  40,157,638
  40,157,873
  40,161,034
  40,161,072
  40,161,098
  40,161,130
  40,161,179
  40,161,193
  40,161,419
  40,161,673
  40,161,692
  40,161,768
  40,162,499
  40,162,543
  40,163,062
  40,163,458
  40,163,515
  40,163,594
  40,163,938
  40,164,061
  40,164,585
  40,164,800
  40,164,885
  40,165,400
  40,167,297
  40,177,044
  40,177,496
  40,185,254
  40,185,265
  40,187,225
  40,187,726
  40,187,979
  40,189,231
  40,192,823
  40,193,507
  40,194,332
  40,194,647
  40,195,905
  40,197,656
  40,198,667
  40,198,668
  40,199,464
  40,200,902
  40,202,742
  40,202,907
  40,204,073
  40,205,564
  40,205,880
  40,205,965
  40,205,974
  40,206,539
  40,206,951
  40,207,328
  40,207,606
  40,207,607
  40,207,917
  40,208,428
  40,210,015
  40,210,179
  40,211,104
  40,211,362
  40,211,417
  40,213,216
  40,213,488
  40,214,141
  40,214,537
  40,215,029
  40,215,503
  40,215,791
  40,215,859
  40,216,505
  40,216,706
  40,217,413
  40,217,586
  40,217,664
  40,217,913
  40,219,120
  40,220,881
  40,220,919
  40,220,923
A
C
C
T
A
C
T
T
C
C
C
C
A
G
G
G
A
T
C
T
C
T
G
G
T
A
T
T
C
C
A
G
G
C
C
C
G
A
A
C
A/G
G/T
C
T
A
A
A
G
A
T
C
A
T
T
C
C
G
T
G
A
T
C
G
G
A
T
T
G
T
C
A
A
G
T
A
T
A
T
G
C
G
G
G
A
G
C
C/G
C/G
C/G
A
A
C
G
C
C
T
G
C
G/A
G
G
A
T
A
C
T
G
C
C
T
C
T
T
A
T
C
A
A
C
T
C
A
T
C
G
T
C
C
T
G
G
T
G
T
G
A
G
T
G
C
G
C
G
C
C
G
T
C
A
C
T
T
G
C
C
A
A
C
C
C/T
C
A
G
G
G
G
A
G
G
T
T
T
A
G
A
T
G
G
G
A
T
T
G
G
G
A
T
A
C
T
C
T
G
C
A
G
G
A
G
C
G
C
A
G
A
C
A
G
G
T
G
G
C
C
A
A
A
A
A
T
T
C
C
C
A
A
T
A
C
A
C
A/G
G/A
A/G
A/G
T
T
A
C
A
G
C
T
G
A
A
G
G
C/T
G
A
A
T
T
G
C
A
C/T
C/T
C
C
T
A
A
C
A
C
G
T
A
A
A
A
G
A
C
A
T
C
G
C
C
C
C
C
T
A
C
C
G
C
T
A
T
G
G
A
C
G
T
C
C
T
A
A
T
G
G
G
C
G
T
G
T/A
C
G
G
C
A
C
C
A
C
G
T/C
T
G
G
T
A
C
C
G
G
G
G
T
A
C
A
C
A
A
T
G
C
T
C
G
C
G
C
G
G
A
G
G
A
C
T
T
G
C
C
C
C