Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 187,000 (bp)   Positions: 401
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.001
.154
.0
.916
.086
.108
.893
.0
.0
.094
.717
.006
.003
.0
.6
.038
.023
.671
.168
1.0
.001
.964
.009
.012
.065
.547
.0
.086
.909
.0
.001
.002
.186
.0
.005
.004
.002
.061
.003
.951
.0
.0
.141
.002
.0
.0
.0
.139
.006
.003
.203
.266
.069
.017
.05
.015
.062
.049
--
--
--
--
--
--
.018
.998
.941
.315
.3
.002
.006
.012
.024
.178
.261
.43
--
--
--
--
--
--
--
.003
.004
.03
.081
.085
.056
.004
.009
.0
.027
.092
.057
.03
.0
.002
.831
.0
.0
.036
.011
.0
.002
.048
.578
.287
.035
.053
.005
.013
--
.008
.0
.001
--
.678
.998
.001
.0
.0
.001
.083
.0
.119
.01
.006
.115
.076
.335
.882
.899
.122
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.306
.002
.011
.279
.005
.0
.098
.019
.002
--
--
--
.189
.999
.005
.008
.001
.0
.345
.104
.35
.409
.072
.069
.168
.13
.133
.001
.001
.138
.099
.265
.0
.029
--
.0
1.0
1.0
.217
.138
.0
.002
.001
.003
.06
.001
.01
.003
.002
.0
.0
.0
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.752
.0
.05
.02
.012
.001
.054
.246
.003
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.239
.015
.001
.0
.017
.0
.0
.0
.0
.014
.947
.0
.177
.758
.95
.0
.029
.023
.0
.0
.0
.002
.004
.276
.02
.002
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.02
.566
.299
.093
.0
.0
.0
.001
.0
.003
.001
.001
.03
.359
.0
.0
.0
.001
.0
.001
--
--
--
.172
.026
.026
--
--
.048
.002
.0
.01
.056
.0
.029
.002
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.007
.005
.004
.113
.001
.763
.0
.11
.001
.07
.001
.001
.433
--
--
.005
.012
.003
--
--
.143
--
--
.0
.003
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
Colec12
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rbms2-ps1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
A
C
G
G
G
C
T
T
T
G
A
C
A
T
A
G
A
T
G
T
T
T
T
G
C
C
A
C
T
A
C
G
C
T
A
C
T
C
A
G
T
G
5
A
G
C
G
T
A
-
C
C
C
T
A
T
T
T
A
A
G
G
C
T
C
A
A
A
T
-
-
A
-
-
-
T
A
T
C
-
-
-
C
-
A
-
C
C
C
C
G
2
C
A
6
G
G
A
A
C
G
G
-
-
G
G
A
C
G
G
-
T
C
-
G
C
C
2
C
C
-
A
A
-
C
G
-
C
G
T
A
C
T
G
A
C
T
A
2
C
G
A
A
-
T
G
G
G
T
8
G
G
T
C
C
T
C
G
G
T
T
T
C
C
A
T
-
C
A
C
G
C
C
C
C
G
T
C
G
T
T
G
T
T
A
-
A
G
A
A
7
A
C
T
C
T
A
T
T
C
T
T
A
A
C
A
A
T
G
G
T
C
T
C
T
G
C
G
T
A
G
T
T
A
T
G
G
G
G
C
T
G
A
G
A
G
A
A
-
G
T
T
G
T
G
G
A
T
C
15
A
T
T
T
-
G
G
T
G
G
T
A
-
A
27
C
T
T
A
T
G
G
A
G
G
G
A
G
C
C
A
G
G
3
A
G
A
C
T
A
T
C
G
2
G
T
A
G
T
T
G
G
T
C
T
C
C
A
T
T
A
G
G
C
T
A
A
C
A
C
T
T
G
A
C
G
A
T
G
A
T
G
A
G
C
T
-
G
C
C
T
G
G
T
C
T
C
A
A
A
G
C
T
C
T
C
C
T
-
T
A
G
T
G
C
G
A
C
T
A
A
T
C
T
G
A
C
G
C
C
25
T
C
T
G
A
A
T
A
C
A
T
G
A
T
A
A
8
T
  867,053
  867,151
  867,198
  867,585
  867,747
  867,749
  867,761
  868,127
  868,337
  868,441
  868,772
  868,821
  869,156
  869,189
  869,347
  869,714
  869,906
  869,968
  870,100
  870,121
  870,172
  870,345
  870,565
  870,569
  870,662
  870,755
  870,768
  870,908
  871,024
  871,136
  871,138
  871,330
  871,843
  871,890
  871,942
  871,981
  872,244
  872,271
  872,485
  872,556
  872,579
  872,612
  872,705
  872,724
  872,964
  873,013
  873,071
  873,194
  873,306
  873,321
  873,467
  873,643
  874,089
  874,322
  874,993
  875,172
  876,480
  876,482
  876,775
  877,111
  877,507
  877,537
  877,691
  877,924
  878,768
  879,246
  879,263
  879,658
  879,692
  879,748
  881,021
  881,034
  881,075
  881,120
  881,124
  881,146
  881,183
  881,205
  881,206
  881,209
  881,223
  881,235
  881,251
  891,118
  892,432
  892,470
  892,620
  892,699
  892,752
  892,793
  893,797
  893,888
  894,315
  894,549
  894,797
  895,194
  896,298
  896,326
  896,671
  896,853
  897,001
  897,851
  897,970
  898,149
  898,152
  898,297
  899,146
  900,255
  901,745
  902,067
  902,098
  903,076
  903,773
  904,263
  904,582
  905,854
  906,269
  906,554
  906,724
  907,362
  908,231
  908,292
  908,543
  909,062
  909,296
  909,331
  909,610
  910,749
  911,028
  911,791
  911,855
  911,894
  911,905
  912,418
  912,833
  912,845
  913,512
  914,081
  915,769
  915,837
  915,896
  917,197
  918,091
  919,693
  919,709
  921,180
  921,551
  922,094
  923,249
  924,410
  924,488
  925,565
  926,451
  926,922
  928,526
  929,011
  929,447
  929,776
  930,085
  930,789
  931,943
  932,429
  932,706
  933,115
  933,334
  933,655
  933,719
  933,758
  933,975
  933,976
  934,373
  934,924
  935,433
  936,250
  936,590
  941,156
  941,238
  946,139
  950,737
  951,533
  955,908
  956,960
  961,570
  961,571
  967,106
  968,894
  969,628
  969,763
  973,026
  973,192
  973,380
  973,428
  973,430
  973,444
  973,696
  973,839
  974,099
  974,126
  974,485
  974,537
  974,577
  974,614
  974,679
  974,707
  974,784
  974,883
  974,893
  974,998
  975,000
  975,178
  975,403
  975,462
  975,480
  975,485
  975,486
  975,515
  975,539
  975,666
  975,692
  975,739
  975,808
  975,813
  975,815
  976,011
  976,792
  977,013
  977,014
  977,563
  977,712
  977,722
  977,733
  977,743
  977,811
  977,918
  992,199
  992,770
  993,517
  993,640
  993,716
  994,885
  994,958
  994,974
  995,337
  995,378
  995,380
  995,638
  995,725
  995,864
  995,870
  995,997
  996,079
  996,409
  996,971
  997,066
  997,480
  997,709
  997,862
  998,136
  998,238
  999,598
  999,611
  1,000,413
  1,000,489
  1,000,493
  1,000,585
  1,000,693
  1,000,740
  1,000,827
  1,000,949
  1,000,961
  1,000,977
  1,001,062
  1,001,294
  1,001,688
  1,001,734
  1,001,787
  1,001,791
  1,002,107
  1,002,606
  1,002,666
  1,002,740
  1,002,791
  1,003,495
  1,003,754
  1,003,784
  1,004,321
  1,004,464
  1,005,522
  1,005,662
  1,005,828
  1,005,934
  1,005,968
  1,006,028
  1,006,834
  1,007,225
  1,007,620
  1,007,865
  1,007,879
  1,008,020
  1,008,120
  1,008,122
  1,008,338
  1,009,183
  1,009,214
  1,009,879
  1,009,881
  1,010,125
  1,010,788
  1,011,194
  1,011,431
  1,012,460
  1,012,609
  1,012,616
  1,012,754
  1,013,151
  1,013,835
  1,014,167
  1,015,533
  1,015,560
  1,015,566
  1,015,636
  1,015,686
  1,015,689
  1,015,691
  1,015,895
  1,016,343
  1,016,366
  1,016,508
  1,016,641
  1,016,761
  1,017,263
  1,018,044
  1,018,133
  1,018,358
  1,018,475
  1,018,906
  1,019,866
  1,020,074
  1,020,761
  1,020,787
  1,021,843
  1,022,113
  1,022,303
  1,022,465
  1,022,699
  1,023,577
  1,024,187
  1,024,260
  1,024,499
  1,024,931
  1,024,952
  1,025,260
  1,025,945
  1,026,423
  1,026,627
  1,026,694
  1,027,202
  1,029,029
  1,030,287
  1,030,880
  1,030,976
  1,031,057
  1,033,497
  1,034,008
  1,034,873
  1,035,110
  1,035,267
  1,035,911
  1,036,165
  1,036,220
  1,036,969
  1,036,996
  1,037,106
  1,037,198
  1,037,320
  1,038,211
  1,038,227
  1,038,231
  1,038,256
  1,038,305
  1,038,319
  1,038,412
  1,038,642
  1,038,683
  1,038,828
  1,038,958
  1,039,669
  1,040,051
  1,040,644
  1,041,005
  1,041,091
  1,041,443
  1,042,174
  1,042,793
  1,044,214
  1,045,965
  1,047,079
  1,047,633
  1,048,034
  1,049,164
  1,051,075
G
C
C
G
C
A
A
G
C
C
C
A
G
T
G
C
G
A
T
A
A
G
C
C
C
C
T
T
G
G
C
G
T
A
G
C
C
A
A
-
G
A
A
A
-
G
A
T
A
C
G
T
T
T
A
G
G
C
C
G
G
G
A
A
T
C
T
G
G
G
-
T
A
C
T
A
A
A
T
A
G
T
A
A
T
2
G
6
T
T
T
T
A
-
T
G
-
A
A
G
G
T
C
T
A
4
A
A
G
A
T
A
A
C
A
C
A
G
T
2/-
A
G
T
G
-
2
T
A
3
A
A
A
G
T
C
T
G
A
C
G
-
G
C
C
G
A
C
A
A
T
C
-
-
A
C
T
T
A
T
C
A
G
C
C
T
T
-
C
T
A
G
T
C
T
T
T
A
A
G
T
A
C
-
A
T/A
C
T
3
G
A
G
-
-
G
T
C
T
C
G
-
G
T
A
C
T
G
A
T
G
C
T
A
C
T
C
A
A
T
T
A
C
T
T
C
C
G
C
A
G/A
G/T
G/A
C/T
T/A
C
G
A
G
A
G
G
C
A
C
C
C
A
A
A
G
C
T
-
G
C
C
C
G
C
A
T/C
G/A
A
C
C
A
-
-
A
C
G
G
A
A
C
G
A
T
T
G
A
T
-
G
A
T
-
C
T
G
T
C
G
A
T
A
-
A
G
C
-
A
C
A
T
C
-
C
T
T
G
C
C
G
A
A
A
C
G
G
G
G
C/T
T/A
T/A
A
G
T
A
G
-
A
T
A
T
G
A
T
G
8
A
T
T
C
C
A
A
T
C
A
G
G
G
A
G
A
T
C
A
T
C
7
G
G
A
G
A
T
A
T
T
C
G
G
C
T
A
A
G
G
A
T
A
-
C
G
C
A
G
-
-
G
T
G
C
A
C
C
G
T
-
A